Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F9XPA3

Protein Details
Accession F9XPA3    Localization Confidence High Confidence Score 18.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MSTDTKTTKKRKSGDDVVPPTKKHydrophilic
48-83APAPLKSALKKKKDTTKKAESKPAKAKKEKKSAAAAHydrophilic
347-387EEKVEEKKEKRKAKSVVDGAEVAPKKKTKKAKVAALHVAHKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
50-79APLKSALKKKKDTTKKAESKPAKAKKEKKS
248-291GAKGGKVRPRNRIEGGILKRGTDRETWGKRVGKEEKRRSGKGKK
349-378KVEEKKEKRKAKSVVDGAEVAPKKKTKKAK
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_mito 10.333, mito_nucl 8.333, mito 8, nucl 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG ztr:MYCGRDRAFT_97226  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MSTDTKTTKKRKSGDDVVPPTKKVKVATTSTRTTRSADAPAPPPAAEAPAPLKSALKKKKDTTKKAESKPAKAKKEKKSAAAAAAQDIISDDEEAGTALTTAQTDALFAGFTDSEDEEAEDDINADTDAIDVAKLPKAPKPKALTGATTSSDPESIPGVVYISRIPHGFYEPQMAAYFSQFGPISAIRLARNRKTGKSQHFAFIQFESASVADIVARTMDKYLLFGHLLQARTIPLDQVKEGLFSKQGAKGGKVRPRNRIEGGILKRGTDRETWGKRVGKEEKRRSGKGKKLEELGYEFEMPEVKGVESVPVQQQAVEGAVEGAIEGKPAVDPKEVIVDEVEEKKIEEKVEEKKEKRKAKSVVDGAEVAPKKKTKKAKVAALHVAHKLIRLFVYIQEQLLSATSLFIITG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.83
3 0.83
4 0.83
5 0.79
6 0.72
7 0.65
8 0.59
9 0.52
10 0.45
11 0.43
12 0.41
13 0.45
14 0.53
15 0.57
16 0.61
17 0.63
18 0.64
19 0.59
20 0.54
21 0.5
22 0.44
23 0.44
24 0.4
25 0.41
26 0.4
27 0.43
28 0.42
29 0.37
30 0.34
31 0.28
32 0.27
33 0.21
34 0.2
35 0.19
36 0.2
37 0.22
38 0.21
39 0.24
40 0.26
41 0.37
42 0.43
43 0.48
44 0.54
45 0.61
46 0.71
47 0.79
48 0.83
49 0.83
50 0.85
51 0.86
52 0.86
53 0.88
54 0.85
55 0.84
56 0.85
57 0.85
58 0.84
59 0.84
60 0.86
61 0.85
62 0.89
63 0.85
64 0.8
65 0.79
66 0.73
67 0.68
68 0.63
69 0.53
70 0.44
71 0.39
72 0.32
73 0.23
74 0.19
75 0.15
76 0.1
77 0.09
78 0.07
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.05
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.06
94 0.05
95 0.05
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.05
112 0.05
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.06
120 0.07
121 0.1
122 0.11
123 0.15
124 0.24
125 0.26
126 0.33
127 0.38
128 0.41
129 0.46
130 0.47
131 0.46
132 0.41
133 0.42
134 0.35
135 0.3
136 0.26
137 0.19
138 0.17
139 0.14
140 0.12
141 0.09
142 0.08
143 0.08
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.08
152 0.09
153 0.09
154 0.12
155 0.13
156 0.13
157 0.16
158 0.15
159 0.16
160 0.16
161 0.16
162 0.13
163 0.12
164 0.13
165 0.08
166 0.11
167 0.09
168 0.09
169 0.11
170 0.1
171 0.11
172 0.1
173 0.12
174 0.12
175 0.18
176 0.23
177 0.24
178 0.33
179 0.35
180 0.36
181 0.43
182 0.5
183 0.52
184 0.54
185 0.52
186 0.48
187 0.47
188 0.46
189 0.39
190 0.31
191 0.24
192 0.17
193 0.16
194 0.12
195 0.09
196 0.08
197 0.06
198 0.05
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.05
208 0.06
209 0.07
210 0.08
211 0.09
212 0.09
213 0.12
214 0.14
215 0.15
216 0.14
217 0.14
218 0.12
219 0.13
220 0.13
221 0.11
222 0.09
223 0.1
224 0.1
225 0.11
226 0.11
227 0.12
228 0.12
229 0.12
230 0.11
231 0.11
232 0.14
233 0.15
234 0.18
235 0.17
236 0.19
237 0.26
238 0.32
239 0.38
240 0.46
241 0.49
242 0.55
243 0.59
244 0.63
245 0.58
246 0.55
247 0.51
248 0.5
249 0.49
250 0.47
251 0.42
252 0.36
253 0.35
254 0.33
255 0.31
256 0.24
257 0.25
258 0.27
259 0.31
260 0.35
261 0.41
262 0.45
263 0.44
264 0.52
265 0.56
266 0.57
267 0.63
268 0.68
269 0.71
270 0.74
271 0.78
272 0.79
273 0.79
274 0.77
275 0.76
276 0.75
277 0.69
278 0.67
279 0.64
280 0.58
281 0.51
282 0.46
283 0.38
284 0.3
285 0.25
286 0.2
287 0.18
288 0.15
289 0.12
290 0.1
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.1
295 0.1
296 0.12
297 0.14
298 0.16
299 0.16
300 0.15
301 0.15
302 0.14
303 0.14
304 0.11
305 0.08
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.05
316 0.07
317 0.1
318 0.11
319 0.11
320 0.12
321 0.2
322 0.2
323 0.2
324 0.18
325 0.18
326 0.2
327 0.23
328 0.23
329 0.15
330 0.16
331 0.17
332 0.19
333 0.18
334 0.17
335 0.2
336 0.29
337 0.39
338 0.49
339 0.53
340 0.6
341 0.69
342 0.76
343 0.78
344 0.78
345 0.76
346 0.76
347 0.8
348 0.78
349 0.73
350 0.67
351 0.61
352 0.52
353 0.52
354 0.44
355 0.35
356 0.33
357 0.34
358 0.35
359 0.42
360 0.52
361 0.53
362 0.62
363 0.71
364 0.75
365 0.79
366 0.83
367 0.85
368 0.8
369 0.75
370 0.67
371 0.6
372 0.51
373 0.45
374 0.36
375 0.29
376 0.24
377 0.21
378 0.2
379 0.2
380 0.27
381 0.25
382 0.25
383 0.23
384 0.22
385 0.2
386 0.2
387 0.17
388 0.1
389 0.09
390 0.08