Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4QYP5

Protein Details
Accession C4QYP5    Localization Confidence High Confidence Score 19.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MSSKTEHKRRKLYKSRIIRTELQDHydrophilic
67-123LPRSMRRRTASHNIKRVPRRLRPRMIREMTSNNGSILSKKPKHSRGRELYKLKRLHRHydrophilic
210-229KYSNRQKKFKWLPTHVWHAKHydrophilic
579-601QEFQKKWELRPKGKRLNYSKLKIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
72-94RRRTASHNIKRVPRRLRPRMIRE
102-134ILSKKPKHSRGRELYKLKRLHRLLKLATVAKSK
Subcellular Location(s) nucl 20, mito_nucl 12.833, cyto_nucl 11.833, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039182  Pop1  
IPR009723  Pop1_N  
IPR012590  POPLD_dom  
Gene Ontology GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0005697  C:telomerase holoenzyme complex  
GO:0000171  F:ribonuclease MRP activity  
GO:0004526  F:ribonuclease P activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0034965  P:intronic box C/D RNA processing  
GO:0000460  P:maturation of 5.8S rRNA  
GO:0000294  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, RNase MRP-dependent  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
KEGG ppa:PAS_chr1-4_0517  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06978  POP1  
PF08170  POPLD  
Amino Acid Sequences MSSKTEHKRRKLYKSRIIRTELQDPSFKDERLNVEEFLKSREFEVNQLQMAQLKSKKNSSTRCFQSLPRSMRRRTASHNIKRVPRRLRPRMIREMTSNNGSILSKKPKHSRGRELYKLKRLHRLLKLATVAKSKGKPLDLPTGIDLKEKLRIVRSHIAELQNAKDAEVQTYDNMHLKFIKLHQQSLNNKLGSMDNTAVNELAVFKPHALKYSNRQKKFKWLPTHVWHAKRAHMVKRWGFNIALQPSQKCYRATHRNYLHSHCIAWDTSYIGTIILHHSTSLTPLIHLVGQLTKNEAVKPKFLKNHKIWEGIIYHENNSIGQSQIIWQDLPNVKQCILRVHPSLYESFFKLLLKLSPKDVTVFDCRYSLASFQVTGPAALTALGAVMKTADNNENWKQLCSFRDNSMVPTGSSISFYINDPRYLNKPHKYHHNIREDELDLIIAIKEGKVFDSGSFEDLFTYQGRIKSYKNQPSLKDLDLRRNIIVNNDNVDNLGKTLPRNPDDPLVPIHLSKLENGYYQVIVPWYWNLPVWYKLMRFPEVRYGGLRQMHQLNLETNRPTYPFDYPFWYHGFLSSFIQGQEFQKKWELRPKGKRLNYSKLKIHNLPGELLGELGDPFVSDWRYLQVLQYALKVHKECVHLDPSSFDVSNWTTLGHRCLKQLQDVYECVRDVQRQDSEFENADEEKILPIPVKYKGEYQFDPTKIDKVSVVIRDEIPKLPVTLISVEIEGTGHIATNARLYQVPSHDWQSWLENNDQKPVRAKYLVGFITTGTINLATGKHTGIGCMSHEVNQLLNKEKHHHLLLRNVGEVTFRLVKFQDIPL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.91
2 0.92
3 0.89
4 0.86
5 0.83
6 0.78
7 0.77
8 0.73
9 0.66
10 0.62
11 0.55
12 0.56
13 0.53
14 0.47
15 0.4
16 0.38
17 0.41
18 0.42
19 0.43
20 0.36
21 0.34
22 0.38
23 0.36
24 0.36
25 0.31
26 0.25
27 0.25
28 0.3
29 0.28
30 0.29
31 0.36
32 0.35
33 0.34
34 0.34
35 0.33
36 0.3
37 0.3
38 0.33
39 0.31
40 0.34
41 0.38
42 0.45
43 0.52
44 0.57
45 0.66
46 0.65
47 0.69
48 0.69
49 0.71
50 0.67
51 0.65
52 0.67
53 0.67
54 0.69
55 0.69
56 0.7
57 0.67
58 0.73
59 0.73
60 0.69
61 0.67
62 0.7
63 0.71
64 0.72
65 0.78
66 0.77
67 0.8
68 0.83
69 0.84
70 0.83
71 0.82
72 0.83
73 0.84
74 0.87
75 0.88
76 0.88
77 0.9
78 0.86
79 0.8
80 0.75
81 0.72
82 0.66
83 0.6
84 0.51
85 0.4
86 0.36
87 0.32
88 0.28
89 0.29
90 0.34
91 0.36
92 0.43
93 0.53
94 0.6
95 0.71
96 0.78
97 0.81
98 0.81
99 0.85
100 0.87
101 0.88
102 0.88
103 0.87
104 0.86
105 0.8
106 0.79
107 0.75
108 0.75
109 0.72
110 0.71
111 0.65
112 0.64
113 0.65
114 0.6
115 0.57
116 0.52
117 0.47
118 0.45
119 0.45
120 0.43
121 0.41
122 0.4
123 0.4
124 0.4
125 0.47
126 0.42
127 0.42
128 0.39
129 0.39
130 0.36
131 0.34
132 0.3
133 0.21
134 0.26
135 0.25
136 0.26
137 0.28
138 0.3
139 0.35
140 0.43
141 0.44
142 0.43
143 0.47
144 0.46
145 0.43
146 0.44
147 0.38
148 0.35
149 0.32
150 0.27
151 0.25
152 0.23
153 0.21
154 0.2
155 0.19
156 0.15
157 0.17
158 0.18
159 0.2
160 0.19
161 0.19
162 0.18
163 0.18
164 0.21
165 0.22
166 0.3
167 0.28
168 0.33
169 0.37
170 0.45
171 0.51
172 0.55
173 0.58
174 0.48
175 0.46
176 0.41
177 0.38
178 0.31
179 0.28
180 0.23
181 0.17
182 0.18
183 0.18
184 0.17
185 0.14
186 0.13
187 0.11
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.15
193 0.15
194 0.19
195 0.2
196 0.24
197 0.32
198 0.43
199 0.52
200 0.55
201 0.6
202 0.59
203 0.67
204 0.74
205 0.74
206 0.73
207 0.7
208 0.72
209 0.73
210 0.81
211 0.78
212 0.72
213 0.69
214 0.61
215 0.58
216 0.57
217 0.57
218 0.54
219 0.53
220 0.58
221 0.57
222 0.6
223 0.57
224 0.51
225 0.45
226 0.39
227 0.4
228 0.34
229 0.33
230 0.28
231 0.28
232 0.3
233 0.33
234 0.34
235 0.28
236 0.3
237 0.35
238 0.44
239 0.5
240 0.55
241 0.59
242 0.64
243 0.66
244 0.68
245 0.64
246 0.55
247 0.49
248 0.39
249 0.34
250 0.26
251 0.22
252 0.17
253 0.12
254 0.1
255 0.11
256 0.1
257 0.08
258 0.07
259 0.07
260 0.09
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.1
267 0.11
268 0.09
269 0.08
270 0.09
271 0.1
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.1
276 0.11
277 0.11
278 0.13
279 0.14
280 0.15
281 0.17
282 0.23
283 0.21
284 0.26
285 0.3
286 0.35
287 0.41
288 0.45
289 0.52
290 0.51
291 0.6
292 0.59
293 0.58
294 0.52
295 0.48
296 0.43
297 0.37
298 0.36
299 0.27
300 0.23
301 0.2
302 0.2
303 0.16
304 0.16
305 0.14
306 0.09
307 0.08
308 0.08
309 0.08
310 0.1
311 0.1
312 0.09
313 0.08
314 0.15
315 0.18
316 0.2
317 0.22
318 0.22
319 0.22
320 0.24
321 0.25
322 0.24
323 0.25
324 0.27
325 0.25
326 0.25
327 0.25
328 0.25
329 0.26
330 0.22
331 0.21
332 0.17
333 0.16
334 0.15
335 0.14
336 0.13
337 0.13
338 0.13
339 0.16
340 0.16
341 0.18
342 0.19
343 0.19
344 0.2
345 0.2
346 0.2
347 0.21
348 0.22
349 0.2
350 0.19
351 0.19
352 0.18
353 0.18
354 0.15
355 0.11
356 0.1
357 0.1
358 0.09
359 0.12
360 0.11
361 0.1
362 0.09
363 0.08
364 0.07
365 0.06
366 0.06
367 0.03
368 0.03
369 0.03
370 0.03
371 0.03
372 0.03
373 0.03
374 0.03
375 0.05
376 0.07
377 0.07
378 0.13
379 0.15
380 0.19
381 0.19
382 0.2
383 0.2
384 0.21
385 0.23
386 0.23
387 0.24
388 0.21
389 0.26
390 0.26
391 0.26
392 0.26
393 0.24
394 0.19
395 0.17
396 0.17
397 0.11
398 0.11
399 0.1
400 0.08
401 0.08
402 0.09
403 0.14
404 0.14
405 0.15
406 0.15
407 0.17
408 0.2
409 0.24
410 0.31
411 0.33
412 0.36
413 0.37
414 0.47
415 0.54
416 0.6
417 0.64
418 0.66
419 0.6
420 0.58
421 0.58
422 0.49
423 0.41
424 0.31
425 0.22
426 0.12
427 0.1
428 0.09
429 0.05
430 0.04
431 0.03
432 0.04
433 0.04
434 0.05
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.1
439 0.1
440 0.11
441 0.12
442 0.11
443 0.1
444 0.1
445 0.11
446 0.08
447 0.09
448 0.1
449 0.12
450 0.14
451 0.16
452 0.18
453 0.26
454 0.35
455 0.43
456 0.48
457 0.52
458 0.52
459 0.56
460 0.58
461 0.51
462 0.49
463 0.42
464 0.43
465 0.42
466 0.42
467 0.36
468 0.34
469 0.32
470 0.29
471 0.31
472 0.23
473 0.2
474 0.19
475 0.18
476 0.16
477 0.17
478 0.12
479 0.1
480 0.09
481 0.08
482 0.09
483 0.14
484 0.2
485 0.21
486 0.22
487 0.23
488 0.26
489 0.26
490 0.27
491 0.23
492 0.21
493 0.2
494 0.19
495 0.18
496 0.17
497 0.17
498 0.16
499 0.16
500 0.14
501 0.14
502 0.15
503 0.15
504 0.12
505 0.12
506 0.12
507 0.1
508 0.09
509 0.09
510 0.08
511 0.08
512 0.08
513 0.09
514 0.1
515 0.11
516 0.13
517 0.15
518 0.17
519 0.18
520 0.22
521 0.25
522 0.28
523 0.27
524 0.27
525 0.34
526 0.33
527 0.33
528 0.3
529 0.29
530 0.3
531 0.32
532 0.31
533 0.25
534 0.26
535 0.26
536 0.25
537 0.24
538 0.22
539 0.22
540 0.25
541 0.23
542 0.21
543 0.21
544 0.21
545 0.22
546 0.21
547 0.22
548 0.22
549 0.23
550 0.28
551 0.28
552 0.3
553 0.3
554 0.3
555 0.25
556 0.24
557 0.24
558 0.19
559 0.19
560 0.17
561 0.16
562 0.13
563 0.14
564 0.14
565 0.16
566 0.22
567 0.21
568 0.22
569 0.29
570 0.32
571 0.36
572 0.43
573 0.5
574 0.52
575 0.62
576 0.7
577 0.73
578 0.77
579 0.82
580 0.8
581 0.81
582 0.81
583 0.77
584 0.74
585 0.72
586 0.73
587 0.67
588 0.64
589 0.59
590 0.51
591 0.45
592 0.38
593 0.31
594 0.24
595 0.2
596 0.14
597 0.09
598 0.07
599 0.06
600 0.05
601 0.04
602 0.04
603 0.06
604 0.07
605 0.07
606 0.08
607 0.1
608 0.12
609 0.12
610 0.13
611 0.14
612 0.15
613 0.16
614 0.18
615 0.2
616 0.19
617 0.24
618 0.24
619 0.23
620 0.27
621 0.29
622 0.29
623 0.3
624 0.34
625 0.29
626 0.29
627 0.28
628 0.25
629 0.26
630 0.23
631 0.18
632 0.17
633 0.18
634 0.19
635 0.18
636 0.16
637 0.14
638 0.16
639 0.22
640 0.25
641 0.26
642 0.28
643 0.33
644 0.35
645 0.4
646 0.43
647 0.42
648 0.39
649 0.4
650 0.41
651 0.38
652 0.36
653 0.3
654 0.28
655 0.26
656 0.24
657 0.29
658 0.3
659 0.28
660 0.3
661 0.32
662 0.32
663 0.3
664 0.29
665 0.25
666 0.2
667 0.19
668 0.18
669 0.15
670 0.13
671 0.12
672 0.12
673 0.1
674 0.11
675 0.14
676 0.19
677 0.23
678 0.23
679 0.3
680 0.36
681 0.42
682 0.42
683 0.46
684 0.49
685 0.46
686 0.5
687 0.44
688 0.42
689 0.36
690 0.36
691 0.29
692 0.24
693 0.28
694 0.27
695 0.28
696 0.26
697 0.28
698 0.31
699 0.33
700 0.31
701 0.27
702 0.24
703 0.22
704 0.2
705 0.19
706 0.17
707 0.16
708 0.16
709 0.15
710 0.14
711 0.13
712 0.12
713 0.12
714 0.09
715 0.08
716 0.06
717 0.05
718 0.06
719 0.07
720 0.07
721 0.11
722 0.12
723 0.13
724 0.14
725 0.16
726 0.21
727 0.24
728 0.28
729 0.28
730 0.32
731 0.33
732 0.33
733 0.33
734 0.34
735 0.35
736 0.34
737 0.37
738 0.38
739 0.38
740 0.46
741 0.46
742 0.42
743 0.46
744 0.47
745 0.46
746 0.42
747 0.42
748 0.37
749 0.43
750 0.42
751 0.35
752 0.31
753 0.25
754 0.25
755 0.23
756 0.2
757 0.12
758 0.1
759 0.09
760 0.11
761 0.11
762 0.1
763 0.11
764 0.12
765 0.15
766 0.14
767 0.15
768 0.15
769 0.16
770 0.17
771 0.2
772 0.21
773 0.21
774 0.24
775 0.24
776 0.25
777 0.27
778 0.29
779 0.33
780 0.35
781 0.36
782 0.39
783 0.43
784 0.47
785 0.49
786 0.53
787 0.5
788 0.56
789 0.61
790 0.58
791 0.55
792 0.49
793 0.43
794 0.38
795 0.32
796 0.29
797 0.27
798 0.24
799 0.25
800 0.25
801 0.28