Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F9XDJ0

Protein Details
Accession F9XDJ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
257-282RESGGDEEKRGRKRRREPGLFDPPEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
264-273EKRGRKRRRE
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 12.5, nucl 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0046695  C:SLIK (SAGA-like) complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0016573  P:histone acetylation  
GO:0001403  P:invasive growth in response to glucose limitation  
GO:0007124  P:pseudohyphal growth  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
KEGG ztr:MYCGRDRAFT_43318  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MAENKAKYRTEIQQMMFVSGETGDPAAETTMMIESIVQQQVMEMLKRATDLAARRGVRTISTDDLIFLIRQDKAKVSRLRTFLSWKDVRKSAKDSDDKGGGGGDAGGVDDFDLAANDPTLGSGPAVGTRNNKNKKAKVGLPWDVSSFYSEQVPEREDEEDEEEEEMNAATLQRLKQADERTKGMNAEEYLHFSECRQASFTFRKGKRFREWAGFGVVTDSKPNDDIVDILGFLTYEIVTLLTEEALHVKAAEDALKRESGGDEEKRGRKRRREPGLFDPPEEARTPVSAKHIQEAYRRLQKPELKSRYMSHVPKGAWQRPLKLI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.48
3 0.42
4 0.33
5 0.24
6 0.17
7 0.15
8 0.09
9 0.09
10 0.06
11 0.06
12 0.07
13 0.06
14 0.06
15 0.06
16 0.06
17 0.07
18 0.07
19 0.07
20 0.06
21 0.07
22 0.13
23 0.14
24 0.13
25 0.12
26 0.12
27 0.15
28 0.17
29 0.16
30 0.13
31 0.12
32 0.13
33 0.14
34 0.14
35 0.11
36 0.14
37 0.17
38 0.22
39 0.29
40 0.3
41 0.31
42 0.33
43 0.33
44 0.29
45 0.29
46 0.27
47 0.23
48 0.23
49 0.22
50 0.2
51 0.2
52 0.19
53 0.15
54 0.12
55 0.11
56 0.12
57 0.14
58 0.15
59 0.2
60 0.24
61 0.33
62 0.38
63 0.42
64 0.47
65 0.49
66 0.51
67 0.49
68 0.51
69 0.46
70 0.48
71 0.48
72 0.45
73 0.47
74 0.5
75 0.51
76 0.49
77 0.51
78 0.48
79 0.52
80 0.54
81 0.52
82 0.5
83 0.49
84 0.44
85 0.38
86 0.32
87 0.22
88 0.16
89 0.12
90 0.07
91 0.04
92 0.04
93 0.03
94 0.03
95 0.03
96 0.03
97 0.03
98 0.03
99 0.03
100 0.03
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.05
107 0.05
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.08
112 0.09
113 0.11
114 0.15
115 0.22
116 0.32
117 0.39
118 0.47
119 0.51
120 0.55
121 0.6
122 0.63
123 0.6
124 0.59
125 0.6
126 0.58
127 0.54
128 0.5
129 0.43
130 0.38
131 0.33
132 0.26
133 0.18
134 0.12
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.11
140 0.1
141 0.11
142 0.11
143 0.1
144 0.11
145 0.13
146 0.12
147 0.11
148 0.11
149 0.1
150 0.09
151 0.08
152 0.07
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.03
157 0.05
158 0.06
159 0.1
160 0.11
161 0.12
162 0.17
163 0.24
164 0.31
165 0.32
166 0.35
167 0.33
168 0.33
169 0.32
170 0.28
171 0.23
172 0.17
173 0.17
174 0.15
175 0.16
176 0.16
177 0.16
178 0.16
179 0.13
180 0.19
181 0.16
182 0.16
183 0.16
184 0.15
185 0.2
186 0.26
187 0.32
188 0.37
189 0.39
190 0.49
191 0.52
192 0.59
193 0.61
194 0.63
195 0.61
196 0.6
197 0.61
198 0.52
199 0.51
200 0.43
201 0.35
202 0.3
203 0.27
204 0.18
205 0.16
206 0.14
207 0.11
208 0.11
209 0.11
210 0.09
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.07
216 0.07
217 0.06
218 0.06
219 0.05
220 0.06
221 0.04
222 0.03
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.05
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.07
237 0.08
238 0.12
239 0.12
240 0.13
241 0.16
242 0.16
243 0.16
244 0.16
245 0.16
246 0.15
247 0.21
248 0.22
249 0.27
250 0.35
251 0.43
252 0.51
253 0.6
254 0.67
255 0.7
256 0.78
257 0.81
258 0.84
259 0.87
260 0.85
261 0.86
262 0.88
263 0.8
264 0.71
265 0.64
266 0.54
267 0.47
268 0.4
269 0.31
270 0.21
271 0.21
272 0.21
273 0.2
274 0.26
275 0.29
276 0.29
277 0.35
278 0.37
279 0.39
280 0.45
281 0.48
282 0.5
283 0.54
284 0.56
285 0.53
286 0.58
287 0.6
288 0.63
289 0.69
290 0.68
291 0.63
292 0.65
293 0.65
294 0.65
295 0.68
296 0.63
297 0.58
298 0.57
299 0.52
300 0.55
301 0.62
302 0.59
303 0.59
304 0.58