Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0U973

Protein Details
Accession Q0U973    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
252-273GPNNKIRRGRRGGKRPARQSVKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
250-269ASGPNNKIRRGRRGGKRPAR
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 10, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0003727  F:single-stranded RNA binding  
GO:0045182  F:translation regulator activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:2000767  P:positive regulation of cytoplasmic translation  
KEGG pno:SNOG_11691  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MSYTNGRPKKSSQSLTASQLTGLKKGPKASIIVGPDDDHFIGLEGVSISLISHFSPYAKKKLIEERTGKLCIPNGSKLPVRWIYKYMQAGEKDPDDEDTFEQLPFDSLVLLYTHSAFLQYEPLLDRIVGRLKGKYHSALPTIEEITTFSAFIPPLLDYSARVLAHEMANPWACNYSAYLEYAKVDDAFEDALDKAMKDLLAHRIQNGKHYYATITNLGVRWSQNYYDNLKNLSITSFKLRDPADSEKKVASGPNNKIRRGRRGGKRPARQSVKSSQDTTGTQDETSSEQSQHLERVIICFNCREAHHIARDCLAKPVCFNCSVAGHASRDCTEGPDELCVSKKQAQAARVCYNCNEKGHIAKDCTAHHKGDGPEDQASAVHSLQLPWKGGHIARNCKAETKTPSTNNERAPPVCYNCTEEGHLARDCSAPAAGAYNSGPRDVSGRNRHFRRAQHDRVAKRIEVMGNGEGLRTCDREVRKGELTRTGLVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.67
3 0.66
4 0.55
5 0.47
6 0.46
7 0.4
8 0.35
9 0.34
10 0.34
11 0.33
12 0.37
13 0.38
14 0.36
15 0.38
16 0.38
17 0.39
18 0.36
19 0.36
20 0.33
21 0.31
22 0.28
23 0.28
24 0.25
25 0.18
26 0.15
27 0.13
28 0.11
29 0.1
30 0.1
31 0.07
32 0.07
33 0.06
34 0.06
35 0.05
36 0.06
37 0.07
38 0.06
39 0.07
40 0.08
41 0.1
42 0.18
43 0.23
44 0.31
45 0.36
46 0.38
47 0.43
48 0.54
49 0.6
50 0.62
51 0.63
52 0.61
53 0.62
54 0.63
55 0.57
56 0.5
57 0.45
58 0.42
59 0.41
60 0.4
61 0.37
62 0.38
63 0.41
64 0.39
65 0.43
66 0.44
67 0.44
68 0.41
69 0.41
70 0.4
71 0.43
72 0.47
73 0.43
74 0.41
75 0.39
76 0.39
77 0.39
78 0.38
79 0.32
80 0.28
81 0.27
82 0.22
83 0.22
84 0.21
85 0.21
86 0.2
87 0.18
88 0.18
89 0.15
90 0.14
91 0.12
92 0.11
93 0.07
94 0.06
95 0.07
96 0.07
97 0.08
98 0.07
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.09
103 0.08
104 0.08
105 0.11
106 0.1
107 0.11
108 0.12
109 0.13
110 0.13
111 0.13
112 0.13
113 0.12
114 0.17
115 0.19
116 0.19
117 0.22
118 0.24
119 0.27
120 0.3
121 0.29
122 0.28
123 0.29
124 0.3
125 0.28
126 0.28
127 0.27
128 0.25
129 0.22
130 0.18
131 0.15
132 0.15
133 0.14
134 0.12
135 0.09
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.08
141 0.08
142 0.09
143 0.09
144 0.08
145 0.11
146 0.15
147 0.14
148 0.13
149 0.14
150 0.15
151 0.16
152 0.16
153 0.14
154 0.13
155 0.15
156 0.14
157 0.14
158 0.13
159 0.12
160 0.11
161 0.11
162 0.1
163 0.1
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.12
169 0.11
170 0.09
171 0.08
172 0.07
173 0.07
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.09
186 0.14
187 0.19
188 0.19
189 0.21
190 0.26
191 0.26
192 0.33
193 0.34
194 0.28
195 0.24
196 0.24
197 0.24
198 0.2
199 0.22
200 0.17
201 0.14
202 0.14
203 0.13
204 0.14
205 0.14
206 0.12
207 0.12
208 0.12
209 0.13
210 0.15
211 0.18
212 0.22
213 0.24
214 0.25
215 0.25
216 0.23
217 0.23
218 0.19
219 0.17
220 0.13
221 0.11
222 0.14
223 0.15
224 0.14
225 0.19
226 0.19
227 0.19
228 0.22
229 0.29
230 0.33
231 0.32
232 0.33
233 0.29
234 0.29
235 0.29
236 0.26
237 0.24
238 0.25
239 0.3
240 0.38
241 0.43
242 0.45
243 0.51
244 0.54
245 0.57
246 0.57
247 0.6
248 0.61
249 0.66
250 0.75
251 0.78
252 0.82
253 0.8
254 0.81
255 0.79
256 0.73
257 0.67
258 0.65
259 0.63
260 0.58
261 0.53
262 0.44
263 0.4
264 0.37
265 0.36
266 0.3
267 0.22
268 0.19
269 0.16
270 0.16
271 0.15
272 0.18
273 0.15
274 0.13
275 0.13
276 0.15
277 0.15
278 0.16
279 0.14
280 0.12
281 0.11
282 0.13
283 0.16
284 0.15
285 0.15
286 0.15
287 0.15
288 0.16
289 0.16
290 0.18
291 0.19
292 0.23
293 0.3
294 0.32
295 0.31
296 0.32
297 0.35
298 0.31
299 0.33
300 0.3
301 0.23
302 0.22
303 0.24
304 0.23
305 0.21
306 0.21
307 0.17
308 0.16
309 0.17
310 0.18
311 0.18
312 0.17
313 0.16
314 0.18
315 0.16
316 0.17
317 0.16
318 0.15
319 0.14
320 0.14
321 0.14
322 0.14
323 0.14
324 0.13
325 0.16
326 0.14
327 0.17
328 0.22
329 0.23
330 0.27
331 0.31
332 0.35
333 0.39
334 0.46
335 0.49
336 0.45
337 0.44
338 0.42
339 0.44
340 0.43
341 0.39
342 0.35
343 0.29
344 0.34
345 0.37
346 0.38
347 0.34
348 0.34
349 0.37
350 0.37
351 0.42
352 0.4
353 0.36
354 0.32
355 0.36
356 0.33
357 0.36
358 0.36
359 0.32
360 0.29
361 0.28
362 0.27
363 0.21
364 0.21
365 0.17
366 0.13
367 0.11
368 0.1
369 0.11
370 0.15
371 0.18
372 0.19
373 0.17
374 0.18
375 0.2
376 0.22
377 0.28
378 0.33
379 0.39
380 0.43
381 0.49
382 0.48
383 0.5
384 0.5
385 0.51
386 0.5
387 0.49
388 0.52
389 0.52
390 0.59
391 0.62
392 0.66
393 0.64
394 0.63
395 0.6
396 0.53
397 0.51
398 0.5
399 0.47
400 0.45
401 0.41
402 0.4
403 0.38
404 0.39
405 0.36
406 0.33
407 0.31
408 0.31
409 0.3
410 0.25
411 0.23
412 0.22
413 0.2
414 0.18
415 0.15
416 0.11
417 0.1
418 0.13
419 0.11
420 0.12
421 0.13
422 0.16
423 0.17
424 0.17
425 0.17
426 0.14
427 0.18
428 0.21
429 0.3
430 0.36
431 0.45
432 0.55
433 0.59
434 0.68
435 0.71
436 0.74
437 0.75
438 0.75
439 0.74
440 0.75
441 0.8
442 0.76
443 0.78
444 0.76
445 0.67
446 0.59
447 0.55
448 0.47
449 0.4
450 0.39
451 0.31
452 0.28
453 0.27
454 0.25
455 0.2
456 0.2
457 0.2
458 0.18
459 0.19
460 0.23
461 0.27
462 0.34
463 0.38
464 0.42
465 0.48
466 0.52
467 0.55
468 0.57
469 0.57