Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F9XHJ6

Protein Details
Accession F9XHJ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
335-358LSSLASGRRKKRKGAKTSTTNYSMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
341-350GRRKKRKGAK
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 11, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
KEGG ztr:MYCGRDRAFT_74695  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPRRKAFDKKTATTFALVHRAQNDPLIHDENAPSMVFAEKQTRRPNEDDYAGSSAGSQYSGASYRSHKVKQRGDLEDEFGSAVRQNEGEAAQHGVFYDDTRYDYMQHMKDLGTGEGPVTWVEANAPTQKGKGKQKLEDVLRDMDLTETRSVGMSSTTSSVARSLLPEEVLPSEFVQRRSYQDQQDVPDEIAGFQPDMDPRLREVLEALEDEEYVDDEEDIFAELTKDGYEVEKDEWDLYGEQQLFEEDDAGWESDDTIKAPGSPPPSNVSLADLNLPEGEDAKPPEDVQAQPPADPTAGAWLEEFEKFKAADKAGHAKPAKLNPLAPSTLESSVLSSLASGRRKKRKGAKTSTTNYSMTSSALARTGQLTLLDDRFDKFENAYSMAEFPEEEEDDFLADNASAMSGMTAPQLTRSDFDGIMDDFLGSHSKTGKLGRRVKRGGPQSGMEQLDEIRSQLGPARMKTGAKSAAAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.5
3 0.5
4 0.43
5 0.4
6 0.36
7 0.37
8 0.35
9 0.38
10 0.33
11 0.27
12 0.31
13 0.32
14 0.3
15 0.29
16 0.29
17 0.24
18 0.25
19 0.22
20 0.16
21 0.13
22 0.13
23 0.12
24 0.14
25 0.22
26 0.26
27 0.34
28 0.44
29 0.5
30 0.55
31 0.58
32 0.62
33 0.59
34 0.58
35 0.52
36 0.47
37 0.45
38 0.38
39 0.34
40 0.28
41 0.22
42 0.17
43 0.15
44 0.11
45 0.07
46 0.09
47 0.11
48 0.12
49 0.14
50 0.17
51 0.24
52 0.31
53 0.38
54 0.43
55 0.52
56 0.59
57 0.65
58 0.7
59 0.7
60 0.7
61 0.65
62 0.61
63 0.52
64 0.44
65 0.35
66 0.26
67 0.21
68 0.16
69 0.14
70 0.11
71 0.1
72 0.1
73 0.11
74 0.12
75 0.12
76 0.11
77 0.14
78 0.13
79 0.13
80 0.12
81 0.12
82 0.11
83 0.11
84 0.12
85 0.1
86 0.11
87 0.13
88 0.14
89 0.14
90 0.18
91 0.25
92 0.24
93 0.25
94 0.24
95 0.23
96 0.25
97 0.25
98 0.21
99 0.14
100 0.13
101 0.12
102 0.11
103 0.11
104 0.08
105 0.07
106 0.07
107 0.06
108 0.07
109 0.08
110 0.1
111 0.13
112 0.15
113 0.15
114 0.17
115 0.22
116 0.29
117 0.38
118 0.45
119 0.48
120 0.52
121 0.59
122 0.65
123 0.65
124 0.62
125 0.56
126 0.49
127 0.43
128 0.38
129 0.3
130 0.23
131 0.19
132 0.16
133 0.13
134 0.1
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.09
139 0.08
140 0.07
141 0.07
142 0.08
143 0.09
144 0.09
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.1
152 0.1
153 0.1
154 0.1
155 0.11
156 0.11
157 0.1
158 0.09
159 0.15
160 0.18
161 0.19
162 0.21
163 0.22
164 0.26
165 0.31
166 0.37
167 0.35
168 0.38
169 0.4
170 0.4
171 0.41
172 0.37
173 0.31
174 0.26
175 0.21
176 0.15
177 0.12
178 0.1
179 0.07
180 0.06
181 0.07
182 0.07
183 0.08
184 0.09
185 0.09
186 0.1
187 0.13
188 0.13
189 0.12
190 0.12
191 0.11
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.05
201 0.04
202 0.04
203 0.03
204 0.03
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.03
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.05
216 0.05
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.07
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.09
230 0.1
231 0.09
232 0.08
233 0.09
234 0.04
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.07
248 0.1
249 0.15
250 0.16
251 0.17
252 0.19
253 0.21
254 0.22
255 0.21
256 0.21
257 0.16
258 0.16
259 0.16
260 0.13
261 0.11
262 0.1
263 0.1
264 0.07
265 0.07
266 0.08
267 0.08
268 0.09
269 0.09
270 0.1
271 0.1
272 0.12
273 0.13
274 0.14
275 0.14
276 0.21
277 0.21
278 0.21
279 0.21
280 0.2
281 0.18
282 0.17
283 0.14
284 0.12
285 0.11
286 0.11
287 0.11
288 0.1
289 0.12
290 0.13
291 0.14
292 0.09
293 0.11
294 0.11
295 0.14
296 0.17
297 0.17
298 0.18
299 0.21
300 0.3
301 0.29
302 0.37
303 0.35
304 0.34
305 0.38
306 0.4
307 0.42
308 0.36
309 0.37
310 0.31
311 0.35
312 0.33
313 0.28
314 0.25
315 0.22
316 0.21
317 0.2
318 0.17
319 0.14
320 0.13
321 0.13
322 0.1
323 0.07
324 0.09
325 0.14
326 0.21
327 0.26
328 0.35
329 0.46
330 0.5
331 0.59
332 0.67
333 0.72
334 0.76
335 0.8
336 0.81
337 0.81
338 0.84
339 0.81
340 0.75
341 0.66
342 0.56
343 0.48
344 0.38
345 0.28
346 0.23
347 0.17
348 0.13
349 0.14
350 0.13
351 0.11
352 0.11
353 0.11
354 0.1
355 0.1
356 0.12
357 0.13
358 0.14
359 0.15
360 0.15
361 0.15
362 0.16
363 0.17
364 0.16
365 0.14
366 0.18
367 0.19
368 0.21
369 0.21
370 0.19
371 0.19
372 0.18
373 0.17
374 0.13
375 0.11
376 0.12
377 0.12
378 0.12
379 0.12
380 0.11
381 0.12
382 0.12
383 0.11
384 0.07
385 0.06
386 0.06
387 0.05
388 0.05
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.05
394 0.06
395 0.07
396 0.07
397 0.11
398 0.13
399 0.14
400 0.15
401 0.18
402 0.21
403 0.2
404 0.2
405 0.2
406 0.18
407 0.18
408 0.17
409 0.13
410 0.1
411 0.11
412 0.13
413 0.09
414 0.11
415 0.12
416 0.14
417 0.17
418 0.25
419 0.33
420 0.41
421 0.51
422 0.59
423 0.67
424 0.72
425 0.76
426 0.78
427 0.78
428 0.76
429 0.71
430 0.65
431 0.59
432 0.6
433 0.54
434 0.45
435 0.37
436 0.29
437 0.27
438 0.24
439 0.2
440 0.14
441 0.13
442 0.13
443 0.17
444 0.24
445 0.26
446 0.27
447 0.32
448 0.34
449 0.36
450 0.38
451 0.4
452 0.39