FuNGI

Q0TZA0

Protein Details

Accession

Q0TZA0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
241-263	ATVAKHTKPRKGGRRGKRKAEDP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
245-259	KHTKPRKGGRRGKRK

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013907 Sds3
Gene Ontology	GO:0070822 C:Sin3-type complex GO:0042826 F:histone deacetylase binding GO:0016575 P:histone deacetylation GO:0000122 P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II
KEGG	pno:SNOG_15222 -
Pfam	View protein in Pfam PF08598 Sds3

Amino Acid Sequences

MLSALSAPSVAATGPTPVIVASGGYDDIADNGSSSLSELGDASDDQSEPTPRPTTAGEMDDDDSEAETERLENTPRKLGRTATDTSLAEALYTRTPSKLMHSRTVDQDESAPPTPSVMTDDADATLDDAVDADNPLHSLSLIAASEAASLESVGKKRKRTSAEGSPVEEPEEDEPARKRSGTANLPAANGSLAGVTDSAEQVDIDEELEVAEERLSQLAHEEMELEQRQANIAAETVGELATVAKHTKPRKGGRRGKRKAEDPFALSEQFVGGEAQDGEGEEEHDEEQSAAQDEEVAKKKNAIDELAKIEKKFKLFREKLCDEQIAQHERELEMLKQPSCVHPEYLAMMKCIDDRRAEKIAYETKLLEYKQKNLEIITIAERHQMHSQYIQTVRHVREEILEECNQRVFELQRGRRSLGCDDTQYMIKLPEKRSDQIRHQTAYNLEVSILSGVAKYVGFPAAPNISTARPVDIDDDFRSMKVSR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.09
2	0.09
3	0.09
4	0.08
5	0.09
6	0.08
7	0.07
8	0.06
9	0.07
10	0.07
11	0.07
12	0.08
13	0.07
14	0.08
15	0.09
16	0.08
17	0.07
18	0.07
19	0.07
20	0.07
21	0.07
22	0.08
23	0.07
24	0.07
25	0.07
26	0.07
27	0.09
28	0.09
29	0.09
30	0.1
31	0.1
32	0.11
33	0.14
34	0.16
35	0.16
36	0.21
37	0.23
38	0.21
39	0.24
40	0.24
41	0.27
42	0.29
43	0.29
44	0.26
45	0.26
46	0.27
47	0.25
48	0.23
49	0.18
50	0.14
51	0.12
52	0.11
53	0.08
54	0.07
55	0.07
56	0.09
57	0.1
58	0.15
59	0.2
60	0.23
61	0.32
62	0.34
63	0.37
64	0.39
65	0.4
66	0.41
67	0.41
68	0.41
69	0.36
70	0.39
71	0.35
72	0.33
73	0.31
74	0.25
75	0.2
76	0.17
77	0.15
78	0.12
79	0.14
80	0.14
81	0.13
82	0.15
83	0.16
84	0.23
85	0.3
86	0.32
87	0.39
88	0.44
89	0.47
90	0.52
91	0.57
92	0.5
93	0.42
94	0.4
95	0.33
96	0.33
97	0.31
98	0.26
99	0.2
100	0.2
101	0.19
102	0.17
103	0.18
104	0.14
105	0.13
106	0.12
107	0.13
108	0.12
109	0.13
110	0.12
111	0.09
112	0.07
113	0.06
114	0.05
115	0.05
116	0.04
117	0.04
118	0.05
119	0.04
120	0.04
121	0.05
122	0.05
123	0.05
124	0.05
125	0.05
126	0.05
127	0.06
128	0.06
129	0.06
130	0.06
131	0.06
132	0.06
133	0.06
134	0.06
135	0.04
136	0.04
137	0.06
138	0.08
139	0.11
140	0.19
141	0.24
142	0.3
143	0.35
144	0.42
145	0.47
146	0.52
147	0.57
148	0.59
149	0.65
150	0.62
151	0.6
152	0.54
153	0.49
154	0.42
155	0.34
156	0.25
157	0.16
158	0.16
159	0.13
160	0.14
161	0.16
162	0.18
163	0.19
164	0.18
165	0.18
166	0.19
167	0.27
168	0.29
169	0.32
170	0.35
171	0.36
172	0.36
173	0.35
174	0.31
175	0.22
176	0.17
177	0.13
178	0.06
179	0.04
180	0.04
181	0.04
182	0.04
183	0.04
184	0.04
185	0.04
186	0.04
187	0.04
188	0.04
189	0.05
190	0.04
191	0.04
192	0.04
193	0.04
194	0.03
195	0.04
196	0.04
197	0.04
198	0.03
199	0.03
200	0.03
201	0.04
202	0.04
203	0.04
204	0.05
205	0.05
206	0.05
207	0.05
208	0.06
209	0.05
210	0.1
211	0.1
212	0.1
213	0.1
214	0.1
215	0.11
216	0.1
217	0.1
218	0.06
219	0.06
220	0.05
221	0.04
222	0.05
223	0.05
224	0.04
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.03
229	0.04
230	0.05
231	0.06
232	0.12
233	0.15
234	0.2
235	0.29
236	0.38
237	0.48
238	0.58
239	0.67
240	0.71
241	0.8
242	0.83
243	0.85
244	0.83
245	0.8
246	0.76
247	0.73
248	0.65
249	0.56
250	0.51
251	0.43
252	0.37
253	0.29
254	0.22
255	0.15
256	0.11
257	0.09
258	0.06
259	0.04
260	0.04
261	0.04
262	0.05
263	0.04
264	0.05
265	0.04
266	0.05
267	0.05
268	0.04
269	0.05
270	0.05
271	0.05
272	0.05
273	0.05
274	0.05
275	0.05
276	0.06
277	0.06
278	0.05
279	0.07
280	0.07
281	0.13
282	0.17
283	0.19
284	0.18
285	0.21
286	0.22
287	0.24
288	0.25
289	0.22
290	0.2
291	0.22
292	0.27
293	0.32
294	0.32
295	0.29
296	0.32
297	0.32
298	0.33
299	0.35
300	0.36
301	0.4
302	0.45
303	0.52
304	0.57
305	0.59
306	0.59
307	0.58
308	0.54
309	0.43
310	0.43
311	0.43
312	0.38
313	0.35
314	0.31
315	0.28
316	0.26
317	0.27
318	0.23
319	0.17
320	0.18
321	0.21
322	0.2
323	0.22
324	0.23
325	0.24
326	0.27
327	0.27
328	0.23
329	0.2
330	0.21
331	0.2
332	0.24
333	0.22
334	0.18
335	0.17
336	0.16
337	0.18
338	0.2
339	0.2
340	0.2
341	0.21
342	0.27
343	0.31
344	0.3
345	0.28
346	0.32
347	0.37
348	0.34
349	0.33
350	0.28
351	0.27
352	0.31
353	0.31
354	0.33
355	0.29
356	0.34
357	0.39
358	0.41
359	0.4
360	0.36
361	0.37
362	0.3
363	0.29
364	0.26
365	0.21
366	0.19
367	0.23
368	0.23
369	0.23
370	0.26
371	0.26
372	0.24
373	0.26
374	0.28
375	0.29
376	0.33
377	0.32
378	0.33
379	0.39
380	0.39
381	0.4
382	0.39
383	0.33
384	0.32
385	0.35
386	0.32
387	0.3
388	0.32
389	0.27
390	0.27
391	0.29
392	0.25
393	0.21
394	0.22
395	0.19
396	0.23
397	0.32
398	0.38
399	0.44
400	0.48
401	0.51
402	0.5
403	0.53
404	0.5
405	0.46
406	0.43
407	0.38
408	0.37
409	0.37
410	0.36
411	0.33
412	0.29
413	0.26
414	0.28
415	0.32
416	0.33
417	0.38
418	0.41
419	0.45
420	0.53
421	0.57
422	0.62
423	0.65
424	0.69
425	0.63
426	0.59
427	0.6
428	0.53
429	0.48
430	0.4
431	0.3
432	0.23
433	0.2
434	0.19
435	0.14
436	0.12
437	0.08
438	0.07
439	0.06
440	0.07
441	0.07
442	0.07
443	0.08
444	0.09
445	0.09
446	0.09
447	0.14
448	0.17
449	0.18
450	0.19
451	0.2
452	0.2
453	0.24
454	0.24
455	0.23
456	0.19
457	0.21
458	0.23
459	0.23
460	0.26
461	0.25
462	0.29
463	0.27
464	0.26

Q0TZA0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer