Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0V259

Protein Details
Accession Q0V259    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-68EAAERSRREKFERKRKAEEDEABasic
70-91REEERREKRRRLAEESRRLREEBasic
95-114AEERKRRKRLGLPDLPPRKKBasic
149-168GETHKQRLRRYKKRVGADNLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
51-114RSRREKFERKRKAEEDEAEREEERREKRRRLAEESRRLREEEEDAEERKRRKRLGLPDLPPRKK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004098  Prp18  
IPR014906  PRP4-like  
IPR036285  PRP4-like_sf  
IPR039979  PRPF18  
Gene Ontology GO:0071021  C:U2-type post-spliceosomal complex  
GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0005682  C:U5 snRNP  
GO:0000350  P:generation of catalytic spliceosome for second transesterification step  
KEGG pno:SNOG_01905  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02840  Prp18  
PF08799  PRP4  
Amino Acid Sequences MDFAKLMSAQIKKGKEAATPPTSHDKKYLKRSEIEAQRQAAYEAEQEAAERSRREKFERKRKAEEDEAEREEERREKRRRLAEESRRLREEEEDAEERKRRKRLGLPDLPPRKKEGEEDGTPVPEDEDIEDEDLVAKLRALQEPARLFGETHKQRLRRYKKRVGADNLAAITTDGPIPTTLQLVPEKDMKINPKIPTDKEGREFLFRQLASYFTMVLKEWDVTLARRDRDVIESYQGQQAYAAMVQARENMRPLFKKMEKFELPDSILEPVVEIVLAAQERRYVDANDGYLRLSIGKAAWPIGVTMVGIHERSAREKLHESDKNAAHIMSDEITRKFLQSIKRCLSFAQTRWPPTDQLQLMG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.38
3 0.42
4 0.45
5 0.46
6 0.45
7 0.48
8 0.53
9 0.54
10 0.51
11 0.54
12 0.54
13 0.56
14 0.65
15 0.7
16 0.65
17 0.66
18 0.7
19 0.71
20 0.73
21 0.73
22 0.68
23 0.61
24 0.57
25 0.53
26 0.48
27 0.38
28 0.29
29 0.22
30 0.16
31 0.14
32 0.12
33 0.12
34 0.14
35 0.16
36 0.18
37 0.18
38 0.2
39 0.27
40 0.32
41 0.4
42 0.48
43 0.56
44 0.64
45 0.74
46 0.78
47 0.81
48 0.81
49 0.81
50 0.8
51 0.76
52 0.73
53 0.69
54 0.64
55 0.57
56 0.52
57 0.45
58 0.39
59 0.38
60 0.37
61 0.4
62 0.46
63 0.52
64 0.6
65 0.68
66 0.72
67 0.74
68 0.78
69 0.79
70 0.82
71 0.82
72 0.8
73 0.73
74 0.67
75 0.58
76 0.5
77 0.43
78 0.36
79 0.33
80 0.3
81 0.29
82 0.33
83 0.37
84 0.39
85 0.43
86 0.46
87 0.43
88 0.47
89 0.54
90 0.6
91 0.66
92 0.7
93 0.7
94 0.74
95 0.81
96 0.77
97 0.69
98 0.63
99 0.55
100 0.46
101 0.44
102 0.41
103 0.38
104 0.36
105 0.39
106 0.36
107 0.33
108 0.32
109 0.28
110 0.2
111 0.13
112 0.11
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.08
117 0.08
118 0.07
119 0.08
120 0.08
121 0.07
122 0.06
123 0.05
124 0.06
125 0.08
126 0.1
127 0.12
128 0.13
129 0.19
130 0.2
131 0.22
132 0.21
133 0.19
134 0.18
135 0.19
136 0.28
137 0.25
138 0.31
139 0.34
140 0.37
141 0.43
142 0.53
143 0.61
144 0.62
145 0.69
146 0.72
147 0.74
148 0.78
149 0.81
150 0.76
151 0.72
152 0.63
153 0.55
154 0.45
155 0.38
156 0.3
157 0.21
158 0.14
159 0.09
160 0.07
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.05
165 0.05
166 0.06
167 0.06
168 0.08
169 0.1
170 0.1
171 0.12
172 0.15
173 0.15
174 0.15
175 0.18
176 0.19
177 0.23
178 0.28
179 0.28
180 0.31
181 0.35
182 0.35
183 0.37
184 0.39
185 0.37
186 0.35
187 0.36
188 0.32
189 0.32
190 0.32
191 0.29
192 0.3
193 0.26
194 0.24
195 0.21
196 0.2
197 0.17
198 0.16
199 0.15
200 0.09
201 0.1
202 0.09
203 0.1
204 0.09
205 0.08
206 0.07
207 0.08
208 0.09
209 0.09
210 0.15
211 0.19
212 0.19
213 0.19
214 0.2
215 0.2
216 0.23
217 0.26
218 0.21
219 0.2
220 0.21
221 0.22
222 0.24
223 0.23
224 0.19
225 0.16
226 0.14
227 0.12
228 0.1
229 0.09
230 0.06
231 0.07
232 0.07
233 0.11
234 0.13
235 0.13
236 0.15
237 0.16
238 0.2
239 0.22
240 0.26
241 0.31
242 0.34
243 0.41
244 0.42
245 0.5
246 0.48
247 0.5
248 0.5
249 0.46
250 0.42
251 0.36
252 0.33
253 0.25
254 0.22
255 0.18
256 0.14
257 0.09
258 0.07
259 0.06
260 0.05
261 0.03
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.06
266 0.08
267 0.09
268 0.11
269 0.14
270 0.13
271 0.16
272 0.19
273 0.21
274 0.21
275 0.21
276 0.19
277 0.18
278 0.17
279 0.14
280 0.11
281 0.1
282 0.08
283 0.11
284 0.11
285 0.12
286 0.12
287 0.11
288 0.12
289 0.11
290 0.11
291 0.08
292 0.07
293 0.08
294 0.09
295 0.09
296 0.1
297 0.13
298 0.14
299 0.18
300 0.23
301 0.22
302 0.26
303 0.32
304 0.36
305 0.43
306 0.47
307 0.48
308 0.52
309 0.54
310 0.52
311 0.47
312 0.43
313 0.32
314 0.27
315 0.25
316 0.18
317 0.18
318 0.18
319 0.18
320 0.21
321 0.21
322 0.21
323 0.22
324 0.25
325 0.32
326 0.37
327 0.46
328 0.51
329 0.55
330 0.54
331 0.53
332 0.57
333 0.56
334 0.51
335 0.52
336 0.52
337 0.52
338 0.56
339 0.58
340 0.53
341 0.48
342 0.54