Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

F9XP98

Protein Details
Accession F9XP98    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-49VKINVSKPRPASPKRERPRPTEKPAESHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-43KPVKINVSKPRPASPKRERPRPT
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019474  Ub_conjug_fac_E4_core  
IPR045132  UBE4  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000151  C:ubiquitin ligase complex  
GO:0034450  F:ubiquitin-ubiquitin ligase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
KEGG ztr:MYCGRDRAFT_77616  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04564  U-box  
PF10408  Ufd2P_core  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
CDD cd16657  RING-Ubox_UBE4A  
Amino Acid Sequences MAQTPSLKQEQPSTPAPTERKPVKINVSKPRPASPKRERPRPTEKPAESIDTWQDKTLRQVFRVTLKVEEVKDLHGNNLIFLPSTRDDLTEQNRPELLNVDVLEGAITEAAGQAPGGNIFEYLLTCFKRVSRTIRSARAEDTAKLEILKETRRLCMSYCVFAVTMPEMFGENVAVTNALVDHLLADPESDLGICTDFLTQASALLEEDESIKEAIVNAAEELSRRLAHLDMLGDYTMYVRAMRNILRFPKIVDAVTQSPMWAPPDIEAQNIETSTILGPFFRLSPMQQNVANSYFSAPRTRDRGFIANGQNAIRMTLRTLQDELFTMADTVVRASPATRERILNWFALCVNKNHKKRAMRVDYRTVSGDGFLVNVTNALDRLSEPFMDASFSKIEKIDVDYLRRDPRVDISDETKINADQKASDEFYSHKAEGKSNFISEVFFLTVAAHHYGTEAAQTRMTTMRKSVKRAEKDQEQFEAERHKYINDPRYLARYEEQLKKIKQSIDNSWSTIHATYGVLMDDVTQSRSMQFMRYVIVWLLRLASRQNLPKEKLQLPLPAEQPEVFKCLPEYFLEDIVENFKFITQEIPKILTPQQCDEIVQMCVTFLRNSEYVKNPGVKSGLVTILYYGIMPYGNSSRGVLGDLLIGSAFANKHLLHALMKFYIEAESTGTHTQFFDKFNIRYEIFQVIKRIWVNTQYRENLAKEARVNTNFFVQFVNMLVNDATFVLDESLSSFIKIHDLSKEMKDAAYLQGLSEEERKAKQEMLEDHKSRAKSYMGLTRETMETLILFTETLAESFTMKEIVTRLADMLDYNLALMVGPKSSNLKVENPTEYGFNPKALLSDIISVYTNLAAKQNFIEAIARDARSYSKENFAKATEIMTTRALKSPDELRIWQKLGSDAAEAKAMDDQEEEDLGDIPDDFLDPLLATLMTDPVILPVSKETIDRATIRSHLLSDPTDPFNRAPLKIEEVVDNIELREKIEAWKRDQKAARAAERMDTSDG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.53
3 0.56
4 0.53
5 0.58
6 0.58
7 0.6
8 0.58
9 0.62
10 0.64
11 0.68
12 0.72
13 0.73
14 0.77
15 0.76
16 0.75
17 0.77
18 0.76
19 0.75
20 0.76
21 0.76
22 0.77
23 0.81
24 0.87
25 0.85
26 0.84
27 0.87
28 0.86
29 0.85
30 0.85
31 0.77
32 0.73
33 0.7
34 0.68
35 0.59
36 0.53
37 0.53
38 0.48
39 0.46
40 0.44
41 0.42
42 0.36
43 0.43
44 0.47
45 0.44
46 0.39
47 0.44
48 0.44
49 0.49
50 0.54
51 0.47
52 0.41
53 0.41
54 0.45
55 0.4
56 0.41
57 0.35
58 0.33
59 0.36
60 0.34
61 0.3
62 0.3
63 0.29
64 0.24
65 0.25
66 0.21
67 0.16
68 0.16
69 0.2
70 0.16
71 0.2
72 0.19
73 0.19
74 0.21
75 0.28
76 0.34
77 0.37
78 0.37
79 0.37
80 0.38
81 0.37
82 0.36
83 0.3
84 0.26
85 0.21
86 0.2
87 0.18
88 0.16
89 0.16
90 0.15
91 0.12
92 0.11
93 0.06
94 0.05
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.05
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.09
110 0.13
111 0.14
112 0.14
113 0.16
114 0.18
115 0.24
116 0.29
117 0.36
118 0.4
119 0.49
120 0.57
121 0.65
122 0.68
123 0.65
124 0.62
125 0.6
126 0.53
127 0.45
128 0.41
129 0.34
130 0.29
131 0.26
132 0.25
133 0.22
134 0.24
135 0.27
136 0.29
137 0.29
138 0.33
139 0.35
140 0.36
141 0.34
142 0.39
143 0.37
144 0.34
145 0.32
146 0.29
147 0.26
148 0.25
149 0.25
150 0.17
151 0.14
152 0.11
153 0.11
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.08
158 0.07
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.04
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.05
172 0.06
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.07
194 0.08
195 0.07
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.07
200 0.08
201 0.08
202 0.07
203 0.08
204 0.06
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.09
209 0.1
210 0.1
211 0.1
212 0.11
213 0.11
214 0.11
215 0.13
216 0.12
217 0.11
218 0.12
219 0.12
220 0.1
221 0.1
222 0.09
223 0.08
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.09
228 0.13
229 0.16
230 0.2
231 0.25
232 0.3
233 0.33
234 0.33
235 0.32
236 0.35
237 0.33
238 0.3
239 0.25
240 0.26
241 0.24
242 0.26
243 0.24
244 0.18
245 0.17
246 0.18
247 0.18
248 0.13
249 0.11
250 0.1
251 0.17
252 0.17
253 0.17
254 0.17
255 0.17
256 0.17
257 0.17
258 0.16
259 0.09
260 0.1
261 0.09
262 0.1
263 0.08
264 0.06
265 0.07
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.1
271 0.18
272 0.21
273 0.23
274 0.24
275 0.25
276 0.27
277 0.28
278 0.27
279 0.19
280 0.18
281 0.18
282 0.18
283 0.21
284 0.2
285 0.22
286 0.28
287 0.29
288 0.3
289 0.31
290 0.36
291 0.33
292 0.39
293 0.4
294 0.37
295 0.37
296 0.34
297 0.32
298 0.27
299 0.25
300 0.18
301 0.13
302 0.12
303 0.16
304 0.18
305 0.18
306 0.19
307 0.18
308 0.19
309 0.19
310 0.18
311 0.13
312 0.11
313 0.09
314 0.08
315 0.08
316 0.07
317 0.07
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.11
323 0.14
324 0.18
325 0.19
326 0.2
327 0.22
328 0.28
329 0.3
330 0.27
331 0.24
332 0.21
333 0.2
334 0.22
335 0.22
336 0.19
337 0.27
338 0.34
339 0.39
340 0.45
341 0.51
342 0.54
343 0.61
344 0.68
345 0.69
346 0.69
347 0.7
348 0.73
349 0.68
350 0.63
351 0.57
352 0.47
353 0.36
354 0.27
355 0.21
356 0.11
357 0.09
358 0.07
359 0.06
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.04
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.08
369 0.09
370 0.09
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.1
375 0.1
376 0.09
377 0.1
378 0.1
379 0.11
380 0.11
381 0.11
382 0.1
383 0.13
384 0.18
385 0.18
386 0.21
387 0.23
388 0.27
389 0.3
390 0.3
391 0.28
392 0.23
393 0.25
394 0.26
395 0.26
396 0.24
397 0.23
398 0.28
399 0.27
400 0.27
401 0.23
402 0.2
403 0.19
404 0.18
405 0.15
406 0.11
407 0.12
408 0.15
409 0.16
410 0.15
411 0.14
412 0.14
413 0.18
414 0.21
415 0.19
416 0.2
417 0.2
418 0.23
419 0.24
420 0.28
421 0.25
422 0.22
423 0.22
424 0.18
425 0.17
426 0.14
427 0.14
428 0.09
429 0.07
430 0.07
431 0.06
432 0.07
433 0.08
434 0.09
435 0.07
436 0.06
437 0.07
438 0.07
439 0.07
440 0.09
441 0.09
442 0.09
443 0.09
444 0.09
445 0.1
446 0.15
447 0.16
448 0.14
449 0.17
450 0.26
451 0.28
452 0.33
453 0.41
454 0.45
455 0.5
456 0.56
457 0.58
458 0.58
459 0.59
460 0.57
461 0.51
462 0.45
463 0.39
464 0.34
465 0.35
466 0.26
467 0.23
468 0.21
469 0.19
470 0.2
471 0.26
472 0.32
473 0.27
474 0.29
475 0.28
476 0.32
477 0.32
478 0.3
479 0.25
480 0.22
481 0.26
482 0.3
483 0.34
484 0.36
485 0.36
486 0.38
487 0.41
488 0.4
489 0.39
490 0.37
491 0.38
492 0.38
493 0.38
494 0.36
495 0.33
496 0.29
497 0.25
498 0.21
499 0.14
500 0.09
501 0.08
502 0.07
503 0.07
504 0.06
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.06
513 0.06
514 0.08
515 0.08
516 0.08
517 0.09
518 0.09
519 0.1
520 0.1
521 0.1
522 0.09
523 0.1
524 0.09
525 0.08
526 0.08
527 0.08
528 0.08
529 0.08
530 0.1
531 0.13
532 0.18
533 0.24
534 0.29
535 0.31
536 0.34
537 0.4
538 0.4
539 0.4
540 0.38
541 0.37
542 0.33
543 0.35
544 0.34
545 0.28
546 0.27
547 0.24
548 0.23
549 0.19
550 0.2
551 0.15
552 0.13
553 0.13
554 0.13
555 0.13
556 0.12
557 0.16
558 0.13
559 0.14
560 0.14
561 0.13
562 0.13
563 0.15
564 0.14
565 0.1
566 0.08
567 0.07
568 0.07
569 0.07
570 0.13
571 0.11
572 0.14
573 0.15
574 0.18
575 0.17
576 0.2
577 0.25
578 0.23
579 0.24
580 0.23
581 0.25
582 0.22
583 0.23
584 0.21
585 0.19
586 0.15
587 0.13
588 0.11
589 0.08
590 0.08
591 0.09
592 0.08
593 0.07
594 0.09
595 0.1
596 0.12
597 0.16
598 0.2
599 0.22
600 0.25
601 0.29
602 0.26
603 0.27
604 0.27
605 0.23
606 0.2
607 0.18
608 0.17
609 0.13
610 0.12
611 0.1
612 0.1
613 0.1
614 0.09
615 0.06
616 0.05
617 0.04
618 0.04
619 0.06
620 0.07
621 0.08
622 0.09
623 0.09
624 0.09
625 0.09
626 0.1
627 0.09
628 0.07
629 0.07
630 0.06
631 0.06
632 0.05
633 0.05
634 0.04
635 0.06
636 0.05
637 0.05
638 0.08
639 0.07
640 0.09
641 0.09
642 0.1
643 0.1
644 0.12
645 0.13
646 0.12
647 0.12
648 0.11
649 0.11
650 0.1
651 0.09
652 0.08
653 0.07
654 0.07
655 0.1
656 0.11
657 0.11
658 0.11
659 0.11
660 0.13
661 0.15
662 0.16
663 0.18
664 0.22
665 0.23
666 0.26
667 0.31
668 0.29
669 0.28
670 0.28
671 0.31
672 0.27
673 0.28
674 0.26
675 0.22
676 0.26
677 0.26
678 0.24
679 0.19
680 0.26
681 0.29
682 0.32
683 0.39
684 0.36
685 0.39
686 0.41
687 0.41
688 0.38
689 0.35
690 0.33
691 0.29
692 0.31
693 0.34
694 0.33
695 0.34
696 0.29
697 0.34
698 0.31
699 0.28
700 0.24
701 0.18
702 0.16
703 0.14
704 0.15
705 0.08
706 0.08
707 0.08
708 0.07
709 0.07
710 0.07
711 0.06
712 0.05
713 0.05
714 0.05
715 0.05
716 0.05
717 0.06
718 0.08
719 0.08
720 0.08
721 0.09
722 0.08
723 0.11
724 0.12
725 0.13
726 0.13
727 0.15
728 0.18
729 0.2
730 0.23
731 0.2
732 0.19
733 0.19
734 0.18
735 0.17
736 0.17
737 0.15
738 0.12
739 0.13
740 0.14
741 0.15
742 0.16
743 0.16
744 0.15
745 0.17
746 0.2
747 0.19
748 0.21
749 0.22
750 0.26
751 0.31
752 0.37
753 0.45
754 0.45
755 0.47
756 0.49
757 0.48
758 0.42
759 0.38
760 0.31
761 0.25
762 0.28
763 0.32
764 0.3
765 0.31
766 0.31
767 0.3
768 0.29
769 0.26
770 0.21
771 0.14
772 0.12
773 0.09
774 0.09
775 0.07
776 0.06
777 0.05
778 0.07
779 0.06
780 0.06
781 0.07
782 0.07
783 0.07
784 0.08
785 0.08
786 0.08
787 0.07
788 0.09
789 0.09
790 0.12
791 0.12
792 0.12
793 0.12
794 0.12
795 0.12
796 0.11
797 0.11
798 0.09
799 0.08
800 0.07
801 0.07
802 0.06
803 0.06
804 0.07
805 0.06
806 0.06
807 0.06
808 0.08
809 0.12
810 0.13
811 0.17
812 0.19
813 0.24
814 0.29
815 0.33
816 0.36
817 0.35
818 0.34
819 0.32
820 0.3
821 0.32
822 0.28
823 0.24
824 0.21
825 0.19
826 0.19
827 0.18
828 0.19
829 0.13
830 0.16
831 0.15
832 0.15
833 0.16
834 0.15
835 0.14
836 0.14
837 0.13
838 0.11
839 0.15
840 0.14
841 0.14
842 0.15
843 0.16
844 0.15
845 0.15
846 0.17
847 0.13
848 0.18
849 0.22
850 0.21
851 0.19
852 0.2
853 0.22
854 0.23
855 0.27
856 0.26
857 0.31
858 0.34
859 0.36
860 0.38
861 0.37
862 0.36
863 0.32
864 0.3
865 0.24
866 0.23
867 0.23
868 0.24
869 0.25
870 0.24
871 0.28
872 0.28
873 0.24
874 0.27
875 0.31
876 0.34
877 0.36
878 0.38
879 0.39
880 0.44
881 0.46
882 0.43
883 0.39
884 0.34
885 0.32
886 0.29
887 0.26
888 0.21
889 0.2
890 0.21
891 0.19
892 0.17
893 0.18
894 0.17
895 0.14
896 0.13
897 0.13
898 0.12
899 0.12
900 0.11
901 0.09
902 0.1
903 0.1
904 0.09
905 0.08
906 0.07
907 0.07
908 0.07
909 0.07
910 0.06
911 0.06
912 0.06
913 0.06
914 0.07
915 0.06
916 0.06
917 0.06
918 0.07
919 0.07
920 0.07
921 0.07
922 0.07
923 0.1
924 0.1
925 0.1
926 0.11
927 0.14
928 0.14
929 0.15
930 0.17
931 0.18
932 0.23
933 0.24
934 0.24
935 0.26
936 0.27
937 0.3
938 0.29
939 0.28
940 0.26
941 0.28
942 0.27
943 0.28
944 0.3
945 0.32
946 0.33
947 0.33
948 0.31
949 0.35
950 0.38
951 0.35
952 0.36
953 0.34
954 0.39
955 0.4
956 0.41
957 0.35
958 0.33
959 0.34
960 0.3
961 0.26
962 0.2
963 0.21
964 0.19
965 0.18
966 0.18
967 0.16
968 0.22
969 0.31
970 0.37
971 0.4
972 0.5
973 0.53
974 0.6
975 0.66
976 0.66
977 0.66
978 0.69
979 0.68
980 0.65
981 0.63
982 0.6
983 0.56