Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F9XP98

Protein Details
Accession F9XP98    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-49VKINVSKPRPASPKRERPRPTEKPAESHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-43KPVKINVSKPRPASPKRERPRPT
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019474  Ub_conjug_fac_E4_core  
IPR045132  UBE4  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000151  C:ubiquitin ligase complex  
GO:0034450  F:ubiquitin-ubiquitin ligase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
KEGG ztr:MYCGRDRAFT_77616  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04564  U-box  
PF10408  Ufd2P_core  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
CDD cd16657  RING-Ubox_UBE4A  
Amino Acid Sequences MAQTPSLKQEQPSTPAPTERKPVKINVSKPRPASPKRERPRPTEKPAESIDTWQDKTLRQVFRVTLKVEEVKDLHGNNLIFLPSTRDDLTEQNRPELLNVDVLEGAITEAAGQAPGGNIFEYLLTCFKRVSRTIRSARAEDTAKLEILKETRRLCMSYCVFAVTMPEMFGENVAVTNALVDHLLADPESDLGICTDFLTQASALLEEDESIKEAIVNAAEELSRRLAHLDMLGDYTMYVRAMRNILRFPKIVDAVTQSPMWAPPDIEAQNIETSTILGPFFRLSPMQQNVANSYFSAPRTRDRGFIANGQNAIRMTLRTLQDELFTMADTVVRASPATRERILNWFALCVNKNHKKRAMRVDYRTVSGDGFLVNVTNALDRLSEPFMDASFSKIEKIDVDYLRRDPRVDISDETKINADQKASDEFYSHKAEGKSNFISEVFFLTVAAHHYGTEAAQTRMTTMRKSVKRAEKDQEQFEAERHKYINDPRYLARYEEQLKKIKQSIDNSWSTIHATYGVLMDDVTQSRSMQFMRYVIVWLLRLASRQNLPKEKLQLPLPAEQPEVFKCLPEYFLEDIVENFKFITQEIPKILTPQQCDEIVQMCVTFLRNSEYVKNPGVKSGLVTILYYGIMPYGNSSRGVLGDLLIGSAFANKHLLHALMKFYIEAESTGTHTQFFDKFNIRYEIFQVIKRIWVNTQYRENLAKEARVNTNFFVQFVNMLVNDATFVLDESLSSFIKIHDLSKEMKDAAYLQGLSEEERKAKQEMLEDHKSRAKSYMGLTRETMETLILFTETLAESFTMKEIVTRLADMLDYNLALMVGPKSSNLKVENPTEYGFNPKALLSDIISVYTNLAAKQNFIEAIARDARSYSKENFAKATEIMTTRALKSPDELRIWQKLGSDAAEAKAMDDQEEEDLGDIPDDFLDPLLATLMTDPVILPVSKETIDRATIRSHLLSDPTDPFNRAPLKIEEVVDNIELREKIEAWKRDQKAARAAERMDTSDG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.53
3 0.56
4 0.53
5 0.58
6 0.58
7 0.6
8 0.58
9 0.62
10 0.64
11 0.68
12 0.72
13 0.73
14 0.77
15 0.76
16 0.75
17 0.77
18 0.76
19 0.75
20 0.76
21 0.76
22 0.77
23 0.81
24 0.87
25 0.85
26 0.84
27 0.87
28 0.86
29 0.85
30 0.85
31 0.77
32 0.73
33 0.7
34 0.68
35 0.59
36 0.53
37 0.53
38 0.48
39 0.46
40 0.44
41 0.42
42 0.36
43 0.43
44 0.47
45 0.44
46 0.39
47 0.44
48 0.44
49 0.49
50 0.54
51 0.47
52 0.41
53 0.41
54 0.45
55 0.4
56 0.41
57 0.35
58 0.33
59 0.36
60 0.34
61 0.3
62 0.3
63 0.29
64 0.24
65 0.25
66 0.21
67 0.16
68 0.16
69 0.2
70 0.16
71 0.2
72 0.19
73 0.19
74 0.21
75 0.28
76 0.34
77 0.37
78 0.37
79 0.37
80 0.38
81 0.37
82 0.36
83 0.3
84 0.26
85 0.21
86 0.2
87 0.18
88 0.16
89 0.16
90 0.15
91 0.12
92 0.11
93 0.06
94 0.05
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.05
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.09
110 0.13
111 0.14
112 0.14
113 0.16
114 0.18
115 0.24
116 0.29
117 0.36
118 0.4
119 0.49
120 0.57
121 0.65
122 0.68
123 0.65
124 0.62
125 0.6
126 0.53
127 0.45
128 0.41
129 0.34
130 0.29
131 0.26
132 0.25
133 0.22
134 0.24
135 0.27
136 0.29
137 0.29
138 0.33
139 0.35
140 0.36
141 0.34
142 0.39
143 0.37
144 0.34
145 0.32
146 0.29
147 0.26
148 0.25
149 0.25
150 0.17
151 0.14
152 0.11
153 0.11
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.08
158 0.07
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.04
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.05
172 0.06
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.07
194 0.08
195 0.07
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.07
200 0.08
201 0.08
202 0.07
203 0.08
204 0.06
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.09
209 0.1
210 0.1
211 0.1
212 0.11
213 0.11
214 0.11
215 0.13
216 0.12
217 0.11
218 0.12
219 0.12
220 0.1
221 0.1
222 0.09
223 0.08
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.09
228 0.13
229 0.16
230 0.2
231 0.25
232 0.3
233 0.33
234 0.33
235 0.32
236 0.35
237 0.33
238 0.3
239 0.25
240 0.26
241 0.24
242 0.26
243 0.24
244 0.18
245 0.17
246 0.18
247 0.18
248 0.13
249 0.11
250 0.1
251 0.17
252 0.17
253 0.17
254 0.17
255 0.17
256 0.17
257 0.17
258 0.16
259 0.09
260 0.1
261 0.09
262 0.1
263 0.08
264 0.06
265 0.07
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.1
271 0.18
272 0.21
273 0.23
274 0.24
275 0.25
276 0.27
277 0.28
278 0.27
279 0.19
280 0.18
281 0.18
282 0.18
283 0.21
284 0.2
285 0.22
286 0.28
287 0.29
288 0.3
289 0.31
290 0.36
291 0.33
292 0.39
293 0.4
294 0.37
295 0.37
296 0.34
297 0.32
298 0.27
299 0.25
300 0.18
301 0.13
302 0.12
303 0.16
304 0.18
305 0.18
306 0.19
307 0.18
308 0.19
309 0.19
310 0.18
311 0.13
312 0.11
313 0.09
314 0.08
315 0.08
316 0.07
317 0.07
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.11
323 0.14
324 0.18
325 0.19
326 0.2
327 0.22
328 0.28
329 0.3
330 0.27
331 0.24
332 0.21
333 0.2
334 0.22
335 0.22
336 0.19
337 0.27
338 0.34
339 0.39
340 0.45
341 0.51
342 0.54
343 0.61
344 0.68
345 0.69
346 0.69
347 0.7
348 0.73
349 0.68
350 0.63
351 0.57
352 0.47
353 0.36
354 0.27
355 0.21
356 0.11
357 0.09
358 0.07
359 0.06
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.04
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.08
369 0.09
370 0.09
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.1
375 0.1
376 0.09
377 0.1
378 0.1
379 0.11
380 0.11
381 0.11
382 0.1
383 0.13
384 0.18
385 0.18
386 0.21
387 0.23
388 0.27
389 0.3
390 0.3
391 0.28
392 0.23
393 0.25
394 0.26
395 0.26
396 0.24
397 0.23
398 0.28
399 0.27
400 0.27
401 0.23
402 0.2
403 0.19
404 0.18
405 0.15
406 0.11
407 0.12
408 0.15
409 0.16
410 0.15
411 0.14
412 0.14
413 0.18
414 0.21
415 0.19
416 0.2
417 0.2
418 0.23
419 0.24
420 0.28
421 0.25
422 0.22
423 0.22
424 0.18
425 0.17
426 0.14
427 0.14
428 0.09
429 0.07
430 0.07
431 0.06
432 0.07
433 0.08
434 0.09
435 0.07
436 0.06
437 0.07
438 0.07
439 0.07
440 0.09
441 0.09
442 0.09
443 0.09
444 0.09
445 0.1
446 0.15
447 0.16
448 0.14
449 0.17
450 0.26
451 0.28
452 0.33
453 0.41
454 0.45
455 0.5
456 0.56
457 0.58
458 0.58
459 0.59
460 0.57
461 0.51
462 0.45
463 0.39
464 0.34
465 0.35
466 0.26
467 0.23
468 0.21
469 0.19
470 0.2
471 0.26
472 0.32
473 0.27
474 0.29
475 0.28
476 0.32
477 0.32
478 0.3
479 0.25
480 0.22
481 0.26
482 0.3
483 0.34
484 0.36
485 0.36
486 0.38
487 0.41
488 0.4
489 0.39
490 0.37
491 0.38
492 0.38
493 0.38
494 0.36
495 0.33
496 0.29
497 0.25
498 0.21
499 0.14
500 0.09
501 0.08
502 0.07
503 0.07
504 0.06
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.06
513 0.06
514 0.08
515 0.08
516 0.08
517 0.09
518 0.09
519 0.1
520 0.1
521 0.1
522 0.09
523 0.1
524 0.09
525 0.08
526 0.08
527 0.08
528 0.08
529 0.08
530 0.1
531 0.13
532 0.18
533 0.24
534 0.29
535 0.31
536 0.34
537 0.4
538 0.4
539 0.4
540 0.38
541 0.37
542 0.33
543 0.35
544 0.34
545 0.28
546 0.27
547 0.24
548 0.23
549 0.19
550 0.2
551 0.15
552 0.13
553 0.13
554 0.13
555 0.13
556 0.12
557 0.16
558 0.13
559 0.14
560 0.14
561 0.13
562 0.13
563 0.15
564 0.14
565 0.1
566 0.08
567 0.07
568 0.07
569 0.07
570 0.13
571 0.11
572 0.14
573 0.15
574 0.18
575 0.17
576 0.2
577 0.25
578 0.23
579 0.24
580 0.23
581 0.25
582 0.22
583 0.23
584 0.21
585 0.19
586 0.15
587 0.13
588 0.11
589 0.08
590 0.08
591 0.09
592 0.08
593 0.07
594 0.09
595 0.1
596 0.12
597 0.16
598 0.2
599 0.22
600 0.25
601 0.29
602 0.26
603 0.27
604 0.27
605 0.23
606 0.2
607 0.18
608 0.17
609 0.13
610 0.12
611 0.1
612 0.1
613 0.1
614 0.09
615 0.06
616 0.05
617 0.04
618 0.04
619 0.06
620 0.07
621 0.08
622 0.09
623 0.09
624 0.09
625 0.09
626 0.1
627 0.09
628 0.07
629 0.07
630 0.06
631 0.06
632 0.05
633 0.05
634 0.04
635 0.06
636 0.05
637 0.05
638 0.08
639 0.07
640 0.09
641 0.09
642 0.1
643 0.1
644 0.12
645 0.13
646 0.12
647 0.12
648 0.11
649 0.11
650 0.1
651 0.09
652 0.08
653 0.07
654 0.07
655 0.1
656 0.11
657 0.11
658 0.11
659 0.11
660 0.13
661 0.15
662 0.16
663 0.18
664 0.22
665 0.23
666 0.26
667 0.31
668 0.29
669 0.28
670 0.28
671 0.31
672 0.27
673 0.28
674 0.26
675 0.22
676 0.26
677 0.26
678 0.24
679 0.19
680 0.26
681 0.29
682 0.32
683 0.39
684 0.36
685 0.39
686 0.41
687 0.41
688 0.38
689 0.35
690 0.33
691 0.29
692 0.31
693 0.34
694 0.33
695 0.34
696 0.29
697 0.34
698 0.31
699 0.28
700 0.24
701 0.18
702 0.16
703 0.14
704 0.15
705 0.08
706 0.08
707 0.08
708 0.07
709 0.07
710 0.07
711 0.06
712 0.05
713 0.05
714 0.05
715 0.05
716 0.05
717 0.06
718 0.08
719 0.08
720 0.08
721 0.09
722 0.08
723 0.11
724 0.12
725 0.13
726 0.13
727 0.15
728 0.18
729 0.2
730 0.23
731 0.2
732 0.19
733 0.19
734 0.18
735 0.17
736 0.17
737 0.15
738 0.12
739 0.13
740 0.14
741 0.15
742 0.16
743 0.16
744 0.15
745 0.17
746 0.2
747 0.19
748 0.21
749 0.22
750 0.26
751 0.31
752 0.37
753 0.45
754 0.45
755 0.47
756 0.49
757 0.48
758 0.42
759 0.38
760 0.31
761 0.25
762 0.28
763 0.32
764 0.3
765 0.31
766 0.31
767 0.3
768 0.29
769 0.26
770 0.21
771 0.14
772 0.12
773 0.09
774 0.09
775 0.07
776 0.06
777 0.05
778 0.07
779 0.06
780 0.06
781 0.07
782 0.07
783 0.07
784 0.08
785 0.08
786 0.08
787 0.07
788 0.09
789 0.09
790 0.12
791 0.12
792 0.12
793 0.12
794 0.12
795 0.12
796 0.11
797 0.11
798 0.09
799 0.08
800 0.07
801 0.07
802 0.06
803 0.06
804 0.07
805 0.06
806 0.06
807 0.06
808 0.08
809 0.12
810 0.13
811 0.17
812 0.19
813 0.24
814 0.29
815 0.33
816 0.36
817 0.35
818 0.34
819 0.32
820 0.3
821 0.32
822 0.28
823 0.24
824 0.21
825 0.19
826 0.19
827 0.18
828 0.19
829 0.13
830 0.16
831 0.15
832 0.15
833 0.16
834 0.15
835 0.14
836 0.14
837 0.13
838 0.11
839 0.15
840 0.14
841 0.14
842 0.15
843 0.16
844 0.15
845 0.15
846 0.17
847 0.13
848 0.18
849 0.22
850 0.21
851 0.19
852 0.2
853 0.22
854 0.23
855 0.27
856 0.26
857 0.31
858 0.34
859 0.36
860 0.38
861 0.37
862 0.36
863 0.32
864 0.3
865 0.24
866 0.23
867 0.23
868 0.24
869 0.25
870 0.24
871 0.28
872 0.28
873 0.24
874 0.27
875 0.31
876 0.34
877 0.36
878 0.38
879 0.39
880 0.44
881 0.46
882 0.43
883 0.39
884 0.34
885 0.32
886 0.29
887 0.26
888 0.21
889 0.2
890 0.21
891 0.19
892 0.17
893 0.18
894 0.17
895 0.14
896 0.13
897 0.13
898 0.12
899 0.12
900 0.11
901 0.09
902 0.1
903 0.1
904 0.09
905 0.08
906 0.07
907 0.07
908 0.07
909 0.07
910 0.06
911 0.06
912 0.06
913 0.06
914 0.07
915 0.06
916 0.06
917 0.06
918 0.07
919 0.07
920 0.07
921 0.07
922 0.07
923 0.1
924 0.1
925 0.1
926 0.11
927 0.14
928 0.14
929 0.15
930 0.17
931 0.18
932 0.23
933 0.24
934 0.24
935 0.26
936 0.27
937 0.3
938 0.29
939 0.28
940 0.26
941 0.28
942 0.27
943 0.28
944 0.3
945 0.32
946 0.33
947 0.33
948 0.31
949 0.35
950 0.38
951 0.35
952 0.36
953 0.34
954 0.39
955 0.4
956 0.41
957 0.35
958 0.33
959 0.34
960 0.3
961 0.26
962 0.2
963 0.21
964 0.19
965 0.18
966 0.18
967 0.16
968 0.22
969 0.31
970 0.37
971 0.4
972 0.5
973 0.53
974 0.6
975 0.66
976 0.66
977 0.66
978 0.69
979 0.68
980 0.65
981 0.63
982 0.6
983 0.56