Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F9XEL6

Protein Details
Accession F9XEL6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
89-114GGKVASHEEPKRKKRKVTKSNDDAGEBasic
405-426DLTGMVKKKKAKNVEPVCGCRSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
98-104PKRKKRK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11.5, cyto 8.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
KEGG ztr:MYCGRDRAFT_100626  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
Amino Acid Sequences MADGEPTANMAPEDNFPEAGLGARLDQLKAEATQQYSLKNYSAAAEAYSEAAEVQDQVNGEMSLENADVLYQYGRCLYHLAVSQSDVLGGKVASHEEPKRKKRKVTKSNDDAGEGSSSLIGDAINFQKEDDTANKPYFQITGDENWTDSEDSDAADGEEGEAGEAEEEDDDFQTAYEILDMARVLLSRKIAAIEESKVAAKSSTELRILRERLADTHDLQAEISLENERFTDAISDTRDSLTLKQTLYPVESSLVAEAHYKLSLALEFASVTSTSENADGGETVAEVNEEMRGEAALEMEKAIASCRARVTKEETALAELKDESKLKDAKADIKDVKEMVADMEQRLEDLRKPAKSLSALQSGALGPMGDGGADAALQGVLGAMLGESKADAQKRLANATAQANDLTGMVKKKKAKNVEPVCGCRSVGKLPQIR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.17
4 0.17
5 0.16
6 0.15
7 0.13
8 0.1
9 0.09
10 0.12
11 0.14
12 0.13
13 0.13
14 0.14
15 0.15
16 0.15
17 0.18
18 0.19
19 0.19
20 0.24
21 0.26
22 0.28
23 0.29
24 0.3
25 0.28
26 0.24
27 0.23
28 0.2
29 0.2
30 0.17
31 0.14
32 0.13
33 0.13
34 0.13
35 0.12
36 0.1
37 0.08
38 0.07
39 0.07
40 0.07
41 0.07
42 0.07
43 0.08
44 0.08
45 0.1
46 0.1
47 0.1
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.08
52 0.08
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.08
58 0.06
59 0.07
60 0.1
61 0.1
62 0.11
63 0.13
64 0.13
65 0.16
66 0.2
67 0.22
68 0.2
69 0.21
70 0.21
71 0.19
72 0.2
73 0.15
74 0.11
75 0.1
76 0.08
77 0.07
78 0.07
79 0.09
80 0.1
81 0.16
82 0.22
83 0.31
84 0.41
85 0.52
86 0.62
87 0.67
88 0.76
89 0.8
90 0.86
91 0.87
92 0.88
93 0.89
94 0.87
95 0.88
96 0.8
97 0.71
98 0.6
99 0.51
100 0.41
101 0.3
102 0.21
103 0.12
104 0.1
105 0.07
106 0.07
107 0.05
108 0.04
109 0.07
110 0.09
111 0.1
112 0.1
113 0.1
114 0.11
115 0.11
116 0.14
117 0.15
118 0.18
119 0.21
120 0.23
121 0.24
122 0.24
123 0.24
124 0.23
125 0.2
126 0.17
127 0.14
128 0.16
129 0.18
130 0.18
131 0.18
132 0.17
133 0.17
134 0.15
135 0.13
136 0.11
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.07
141 0.06
142 0.06
143 0.05
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.03
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.05
171 0.06
172 0.07
173 0.08
174 0.07
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.1
179 0.11
180 0.11
181 0.11
182 0.12
183 0.12
184 0.11
185 0.11
186 0.1
187 0.08
188 0.08
189 0.1
190 0.12
191 0.15
192 0.15
193 0.18
194 0.24
195 0.25
196 0.25
197 0.24
198 0.22
199 0.2
200 0.23
201 0.22
202 0.17
203 0.19
204 0.18
205 0.16
206 0.15
207 0.14
208 0.11
209 0.09
210 0.08
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.06
220 0.08
221 0.1
222 0.11
223 0.11
224 0.11
225 0.12
226 0.12
227 0.13
228 0.14
229 0.15
230 0.15
231 0.16
232 0.17
233 0.17
234 0.18
235 0.16
236 0.13
237 0.11
238 0.12
239 0.1
240 0.09
241 0.08
242 0.07
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.06
252 0.06
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.03
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.05
281 0.05
282 0.06
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.1
291 0.1
292 0.12
293 0.16
294 0.2
295 0.22
296 0.25
297 0.32
298 0.34
299 0.36
300 0.36
301 0.33
302 0.32
303 0.33
304 0.3
305 0.23
306 0.18
307 0.16
308 0.17
309 0.18
310 0.15
311 0.19
312 0.22
313 0.21
314 0.27
315 0.28
316 0.33
317 0.35
318 0.43
319 0.4
320 0.4
321 0.42
322 0.37
323 0.35
324 0.27
325 0.23
326 0.17
327 0.17
328 0.16
329 0.14
330 0.16
331 0.15
332 0.14
333 0.16
334 0.16
335 0.14
336 0.21
337 0.27
338 0.27
339 0.29
340 0.3
341 0.34
342 0.36
343 0.4
344 0.38
345 0.39
346 0.37
347 0.35
348 0.36
349 0.31
350 0.27
351 0.21
352 0.15
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.05
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.03
363 0.03
364 0.03
365 0.03
366 0.03
367 0.02
368 0.02
369 0.03
370 0.02
371 0.03
372 0.03
373 0.03
374 0.03
375 0.06
376 0.1
377 0.13
378 0.15
379 0.18
380 0.23
381 0.26
382 0.3
383 0.31
384 0.28
385 0.31
386 0.36
387 0.35
388 0.31
389 0.28
390 0.24
391 0.22
392 0.2
393 0.17
394 0.14
395 0.19
396 0.22
397 0.29
398 0.38
399 0.45
400 0.55
401 0.64
402 0.69
403 0.73
404 0.79
405 0.82
406 0.83
407 0.81
408 0.76
409 0.68
410 0.6
411 0.52
412 0.46
413 0.42
414 0.41