Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F9XII3

Protein Details
Accession F9XII3    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-35DPAKLERKRGPKQVGPKVQTHydrophilic
230-255EPIIETTFKRQPKKKKDFTSALGIKKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
239-245RQPKKKK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007590  Saf4/Yju2  
IPR043701  Yju2  
Gene Ontology GO:0071006  C:U2-type catalytic step 1 spliceosome  
GO:0071007  C:U2-type catalytic step 2 spliceosome  
GO:0000384  F:first spliceosomal transesterification activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0030620  F:U2 snRNA binding  
GO:0000349  P:generation of catalytic spliceosome for first transesterification step  
GO:0000350  P:generation of catalytic spliceosome for second transesterification step  
KEGG ztr:MYCGRDRAFT_74966  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04502  Saf4_Yju2  
Amino Acid Sequences MSERKVLSKYYPPDFDPAKLERKRGPKQVGPKVQTVRLMAPFSMRCTSCGEYVYKGRKFNARKETTDEKYYAITIFRFYIRCTRCSAEITFKTDPKNMDYTCEKGAKRNFEPWREAKLAEETEEERLDRIAKEEEERDAMKDLEKKTLDAKTEMAIADALDDVRHRNAARERIGKDGEISTVPVADKRDEEAEQIEREIEEQARLAFQSATGDKVRRLGEQLGDDLLLDEPIIETTFKRQPKKKKDFTSALGIKKKPSLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.48
3 0.45
4 0.43
5 0.46
6 0.45
7 0.49
8 0.49
9 0.57
10 0.63
11 0.67
12 0.7
13 0.68
14 0.75
15 0.8
16 0.83
17 0.77
18 0.76
19 0.72
20 0.67
21 0.63
22 0.56
23 0.49
24 0.44
25 0.42
26 0.33
27 0.34
28 0.31
29 0.3
30 0.33
31 0.29
32 0.25
33 0.29
34 0.31
35 0.27
36 0.28
37 0.26
38 0.25
39 0.33
40 0.41
41 0.4
42 0.41
43 0.42
44 0.48
45 0.52
46 0.57
47 0.6
48 0.57
49 0.56
50 0.6
51 0.66
52 0.62
53 0.61
54 0.52
55 0.42
56 0.37
57 0.35
58 0.28
59 0.21
60 0.16
61 0.13
62 0.13
63 0.15
64 0.14
65 0.15
66 0.23
67 0.24
68 0.25
69 0.28
70 0.29
71 0.29
72 0.32
73 0.33
74 0.33
75 0.34
76 0.39
77 0.38
78 0.39
79 0.39
80 0.38
81 0.37
82 0.31
83 0.34
84 0.27
85 0.28
86 0.28
87 0.29
88 0.3
89 0.34
90 0.31
91 0.32
92 0.36
93 0.39
94 0.39
95 0.45
96 0.47
97 0.46
98 0.52
99 0.48
100 0.49
101 0.44
102 0.41
103 0.33
104 0.32
105 0.28
106 0.23
107 0.21
108 0.16
109 0.16
110 0.16
111 0.15
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.1
119 0.11
120 0.12
121 0.13
122 0.14
123 0.15
124 0.14
125 0.13
126 0.13
127 0.14
128 0.18
129 0.18
130 0.21
131 0.21
132 0.21
133 0.24
134 0.27
135 0.26
136 0.22
137 0.22
138 0.16
139 0.18
140 0.17
141 0.14
142 0.1
143 0.08
144 0.07
145 0.07
146 0.06
147 0.04
148 0.05
149 0.06
150 0.06
151 0.09
152 0.08
153 0.14
154 0.19
155 0.26
156 0.33
157 0.38
158 0.39
159 0.43
160 0.44
161 0.39
162 0.35
163 0.29
164 0.24
165 0.17
166 0.16
167 0.11
168 0.11
169 0.11
170 0.11
171 0.12
172 0.12
173 0.12
174 0.13
175 0.16
176 0.16
177 0.17
178 0.18
179 0.2
180 0.19
181 0.19
182 0.17
183 0.14
184 0.14
185 0.15
186 0.12
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.11
193 0.08
194 0.08
195 0.12
196 0.12
197 0.16
198 0.18
199 0.2
200 0.2
201 0.25
202 0.27
203 0.23
204 0.26
205 0.26
206 0.27
207 0.28
208 0.29
209 0.24
210 0.22
211 0.21
212 0.18
213 0.14
214 0.1
215 0.07
216 0.06
217 0.05
218 0.06
219 0.07
220 0.06
221 0.07
222 0.13
223 0.21
224 0.28
225 0.37
226 0.46
227 0.56
228 0.67
229 0.78
230 0.82
231 0.85
232 0.88
233 0.88
234 0.84
235 0.84
236 0.81
237 0.79
238 0.77
239 0.69
240 0.62