Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F9XKC4

Protein Details
Accession F9XKC4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
348-376ANYGQKPAVVPKKKKKKVPRKGIDGVDTPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
358-369PKKKKKKVPRKG
Subcellular Location(s) cyto 11, cyto_nucl 10.5, nucl 8, mito 3, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004600  TFIIH_Tfb4/GTF2H3  
IPR036465  vWFA_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000439  C:transcription factor TFIIH core complex  
GO:0005675  C:transcription factor TFIIH holo complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG ztr:MYCGRDRAFT_75897  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03850  Tfb4  
Amino Acid Sequences MNAVDATERGSGQQDGEPPSLLTIILDTNPHAWALLEDSLSLSKVVVNLLVFVNAHIAINHANRVAVLASHSERAEWLYPTAPSSHSHRTNGDDVEMADSTATMNGGANHPPPDDPNKYRPFAQIEHALANNLRKLIERTSTSSLSATPATMMAGALTMALSYISKQSAALPTTTSSAQFNYSDPNAGPAGGNDLAADNKGPNNLLGLTSRILILSVSGDLADQYIPIMNSIFACQRLSIPIDILKLAGDTVFLQQAADATGGIYMALDEQSRAGFLQYLMFAYLPDQTARNHLIMPGESEGVDFRAACFCHRRVVDIGFVCSICLSIFCEPMQDGQCLTCGSHLSMANYGQKPAVVPKKKKKKVPRKGIDGVDTPSSRAGTPLPA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.26
3 0.27
4 0.27
5 0.24
6 0.24
7 0.22
8 0.19
9 0.14
10 0.09
11 0.1
12 0.1
13 0.11
14 0.11
15 0.12
16 0.13
17 0.13
18 0.12
19 0.1
20 0.09
21 0.12
22 0.13
23 0.12
24 0.11
25 0.13
26 0.14
27 0.14
28 0.13
29 0.09
30 0.08
31 0.09
32 0.09
33 0.1
34 0.09
35 0.1
36 0.11
37 0.12
38 0.11
39 0.1
40 0.11
41 0.1
42 0.1
43 0.08
44 0.09
45 0.12
46 0.14
47 0.16
48 0.14
49 0.14
50 0.13
51 0.14
52 0.13
53 0.1
54 0.09
55 0.12
56 0.13
57 0.16
58 0.16
59 0.15
60 0.15
61 0.18
62 0.19
63 0.16
64 0.16
65 0.15
66 0.16
67 0.17
68 0.18
69 0.16
70 0.16
71 0.22
72 0.3
73 0.33
74 0.36
75 0.37
76 0.4
77 0.43
78 0.42
79 0.36
80 0.28
81 0.23
82 0.23
83 0.2
84 0.15
85 0.11
86 0.09
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.04
91 0.05
92 0.06
93 0.08
94 0.1
95 0.11
96 0.13
97 0.14
98 0.14
99 0.16
100 0.22
101 0.28
102 0.31
103 0.39
104 0.43
105 0.45
106 0.47
107 0.48
108 0.47
109 0.41
110 0.4
111 0.38
112 0.33
113 0.34
114 0.31
115 0.28
116 0.24
117 0.24
118 0.21
119 0.15
120 0.13
121 0.12
122 0.15
123 0.17
124 0.2
125 0.21
126 0.24
127 0.28
128 0.29
129 0.29
130 0.27
131 0.24
132 0.21
133 0.19
134 0.14
135 0.09
136 0.08
137 0.07
138 0.07
139 0.06
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.03
144 0.03
145 0.02
146 0.02
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.04
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.07
155 0.11
156 0.12
157 0.12
158 0.11
159 0.12
160 0.14
161 0.14
162 0.13
163 0.1
164 0.1
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.12
169 0.12
170 0.12
171 0.11
172 0.13
173 0.11
174 0.1
175 0.1
176 0.07
177 0.1
178 0.09
179 0.09
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.04
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.07
199 0.07
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.03
211 0.03
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.09
223 0.09
224 0.1
225 0.12
226 0.11
227 0.11
228 0.12
229 0.12
230 0.12
231 0.12
232 0.1
233 0.08
234 0.08
235 0.06
236 0.05
237 0.05
238 0.06
239 0.07
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.07
244 0.07
245 0.06
246 0.05
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.03
253 0.03
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.05
262 0.06
263 0.06
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.09
268 0.09
269 0.08
270 0.08
271 0.1
272 0.09
273 0.09
274 0.1
275 0.1
276 0.15
277 0.18
278 0.18
279 0.16
280 0.17
281 0.18
282 0.17
283 0.19
284 0.16
285 0.14
286 0.13
287 0.13
288 0.12
289 0.11
290 0.11
291 0.08
292 0.08
293 0.11
294 0.12
295 0.15
296 0.21
297 0.21
298 0.28
299 0.28
300 0.31
301 0.31
302 0.33
303 0.37
304 0.33
305 0.34
306 0.28
307 0.28
308 0.24
309 0.2
310 0.18
311 0.1
312 0.09
313 0.1
314 0.1
315 0.12
316 0.12
317 0.14
318 0.14
319 0.19
320 0.21
321 0.19
322 0.18
323 0.16
324 0.19
325 0.18
326 0.17
327 0.14
328 0.14
329 0.14
330 0.19
331 0.2
332 0.2
333 0.22
334 0.25
335 0.32
336 0.31
337 0.31
338 0.26
339 0.25
340 0.24
341 0.31
342 0.38
343 0.4
344 0.49
345 0.59
346 0.7
347 0.79
348 0.88
349 0.9
350 0.9
351 0.91
352 0.93
353 0.92
354 0.91
355 0.91
356 0.88
357 0.84
358 0.77
359 0.7
360 0.66
361 0.56
362 0.47
363 0.4
364 0.34
365 0.27
366 0.24