Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F9XLP8

Protein Details
Accession F9XLP8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
309-339KTTVKSEKSGKHKNGDKIKRRKSRVNGTATSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
315-332EKSGKHKNGDKIKRRKSR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.833, cyto 6, cyto_mito 5.499
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG ztr:MYCGRDRAFT_76477  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MDDNFIHRYMAESLFFDHSTNNGFFIAQAQTDRYMWETSLKRKEFEALLRNKAGTEYMIVGEPQPVADKTLAAQGVKTGIYVVRKQERQSVKDKSQRSYAPGVSHEGNWELTTLATYFIVGEQIYQAPSVFDVVGNRLLSAASSLNKAVEIANDLPRYTPATGYHYLPQTVKRAANTAGSVAGSPVGSREGSVVPGVDSQSVRSGSILADTSLPAAAPTTSFQETRLLRDSLRLAFQHGDEYTDENPLSGEPGSLKFATSNAAVKKRRADEEAAVAKARAEKESATTSRAVSPKVEKVPSPPAVFTEAKTTVKSEKSGKHKNGDKIKRRKSRVNGTATSPTTPASATSANAPNSAI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.25
3 0.22
4 0.19
5 0.17
6 0.21
7 0.2
8 0.18
9 0.15
10 0.14
11 0.14
12 0.16
13 0.17
14 0.13
15 0.14
16 0.15
17 0.17
18 0.17
19 0.18
20 0.18
21 0.17
22 0.17
23 0.23
24 0.27
25 0.34
26 0.45
27 0.46
28 0.44
29 0.44
30 0.48
31 0.45
32 0.47
33 0.48
34 0.45
35 0.49
36 0.51
37 0.5
38 0.45
39 0.41
40 0.33
41 0.24
42 0.18
43 0.14
44 0.12
45 0.13
46 0.13
47 0.12
48 0.13
49 0.12
50 0.1
51 0.11
52 0.1
53 0.12
54 0.12
55 0.11
56 0.11
57 0.16
58 0.17
59 0.15
60 0.15
61 0.13
62 0.15
63 0.15
64 0.14
65 0.09
66 0.1
67 0.14
68 0.17
69 0.24
70 0.3
71 0.33
72 0.35
73 0.43
74 0.49
75 0.5
76 0.56
77 0.57
78 0.58
79 0.63
80 0.66
81 0.61
82 0.61
83 0.59
84 0.55
85 0.52
86 0.46
87 0.42
88 0.38
89 0.39
90 0.32
91 0.3
92 0.26
93 0.21
94 0.18
95 0.15
96 0.13
97 0.1
98 0.08
99 0.08
100 0.07
101 0.06
102 0.06
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.06
107 0.05
108 0.05
109 0.06
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.06
115 0.06
116 0.07
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.08
121 0.11
122 0.11
123 0.11
124 0.1
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.07
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.09
135 0.08
136 0.06
137 0.09
138 0.1
139 0.14
140 0.15
141 0.15
142 0.15
143 0.15
144 0.17
145 0.15
146 0.14
147 0.11
148 0.16
149 0.18
150 0.2
151 0.22
152 0.21
153 0.22
154 0.22
155 0.23
156 0.21
157 0.22
158 0.22
159 0.19
160 0.2
161 0.2
162 0.21
163 0.18
164 0.15
165 0.12
166 0.11
167 0.1
168 0.08
169 0.07
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.06
182 0.07
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.1
188 0.11
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.08
193 0.1
194 0.1
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.04
204 0.04
205 0.05
206 0.09
207 0.1
208 0.11
209 0.12
210 0.18
211 0.19
212 0.22
213 0.26
214 0.23
215 0.22
216 0.25
217 0.27
218 0.22
219 0.25
220 0.21
221 0.19
222 0.19
223 0.2
224 0.2
225 0.17
226 0.17
227 0.14
228 0.17
229 0.15
230 0.16
231 0.16
232 0.12
233 0.12
234 0.1
235 0.11
236 0.08
237 0.08
238 0.07
239 0.09
240 0.12
241 0.12
242 0.12
243 0.11
244 0.11
245 0.13
246 0.13
247 0.17
248 0.2
249 0.29
250 0.32
251 0.35
252 0.42
253 0.45
254 0.47
255 0.46
256 0.45
257 0.39
258 0.45
259 0.47
260 0.41
261 0.37
262 0.33
263 0.3
264 0.29
265 0.27
266 0.19
267 0.15
268 0.14
269 0.17
270 0.25
271 0.26
272 0.24
273 0.25
274 0.25
275 0.3
276 0.32
277 0.29
278 0.26
279 0.3
280 0.35
281 0.4
282 0.42
283 0.36
284 0.4
285 0.47
286 0.5
287 0.47
288 0.4
289 0.35
290 0.39
291 0.39
292 0.34
293 0.32
294 0.3
295 0.29
296 0.3
297 0.3
298 0.3
299 0.32
300 0.36
301 0.37
302 0.4
303 0.49
304 0.58
305 0.63
306 0.67
307 0.72
308 0.77
309 0.8
310 0.83
311 0.84
312 0.84
313 0.88
314 0.89
315 0.89
316 0.89
317 0.89
318 0.89
319 0.88
320 0.86
321 0.8
322 0.76
323 0.77
324 0.69
325 0.61
326 0.5
327 0.41
328 0.33
329 0.28
330 0.23
331 0.18
332 0.17
333 0.15
334 0.22
335 0.27
336 0.28