Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F9XCX2

Protein Details
Accession F9XCX2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-25ATMTKPKSSKATKQKELPVALHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
194-197RKKR
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 11, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045161  Utp18  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0034388  C:Pwp2p-containing subcomplex of 90S preribosome  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000292  P:RNA fragment catabolic process  
KEGG ztr:MYCGRDRAFT_100444  -  
Amino Acid Sequences MSRTATMTKPKSSKATKQKELPVALLDQQEESEEESEVEIKVDGEIEKDETEEELERLVFGDSAGFKAGLKDFDEEGNAEEEDDTGLEGLDDAALFFTDLGPEGAANQIRVSGDSDDGSDDNTLRSRHAPAWEDSDDERTMVSLASVPRLRKLRRTEAEDVVSGKDYTRRLRKQFELLNPVPQWAQNAMQKPARKKRRLSDDNDASSDDEAMSDEDMDNDLPTSAPLSKLLQNAESLVRQSEPGTGKKRKLRPEVIDIQRQKDIPGVQPSAITSLSFHPTLPLLLSSGPSSTLYLHHLSASPPAPSPNPLLTSLHIHGSQLTTTAFHPTDSRIFLSARRRYFHIWNLATGRVEKISRVYGQQHEQKSMERFKLSPDGAYMALLGSTKKGGGVINILDSSTLQWTSQVRIEARGGIAEFAWWRNSAGMCIASKSGEITEWDVRSQRVVARWQDEGAVGTTTLGLGGQHEFVKSSIGTDRWIAIGSSSGIVNIYDRRVWAAEHHTKKPSTTSAVAHQEVPETPAPTKTLDHLTTPTSHLVFSPDGQILAMASKWKRDAMRLVHLPSCTVYRNWPTSSTPLGRITGVAWASGGVAAGGDTVAVLAVANEQGKIRIWEVR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.76
3 0.76
4 0.8
5 0.84
6 0.83
7 0.78
8 0.69
9 0.61
10 0.54
11 0.49
12 0.43
13 0.34
14 0.26
15 0.23
16 0.21
17 0.19
18 0.18
19 0.14
20 0.12
21 0.11
22 0.12
23 0.13
24 0.12
25 0.12
26 0.09
27 0.09
28 0.08
29 0.1
30 0.09
31 0.09
32 0.11
33 0.12
34 0.12
35 0.12
36 0.13
37 0.12
38 0.14
39 0.14
40 0.12
41 0.12
42 0.12
43 0.11
44 0.11
45 0.11
46 0.09
47 0.07
48 0.11
49 0.1
50 0.11
51 0.12
52 0.12
53 0.11
54 0.14
55 0.17
56 0.16
57 0.17
58 0.19
59 0.19
60 0.2
61 0.21
62 0.18
63 0.18
64 0.18
65 0.16
66 0.13
67 0.12
68 0.11
69 0.1
70 0.09
71 0.07
72 0.05
73 0.05
74 0.04
75 0.04
76 0.04
77 0.04
78 0.04
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.05
87 0.06
88 0.06
89 0.05
90 0.06
91 0.1
92 0.11
93 0.11
94 0.1
95 0.12
96 0.12
97 0.13
98 0.15
99 0.12
100 0.13
101 0.13
102 0.13
103 0.13
104 0.13
105 0.13
106 0.12
107 0.1
108 0.11
109 0.14
110 0.14
111 0.14
112 0.16
113 0.19
114 0.22
115 0.28
116 0.3
117 0.29
118 0.36
119 0.35
120 0.35
121 0.33
122 0.33
123 0.27
124 0.23
125 0.21
126 0.14
127 0.13
128 0.1
129 0.09
130 0.08
131 0.09
132 0.15
133 0.19
134 0.19
135 0.25
136 0.33
137 0.35
138 0.4
139 0.48
140 0.53
141 0.57
142 0.64
143 0.64
144 0.62
145 0.63
146 0.56
147 0.49
148 0.4
149 0.34
150 0.26
151 0.21
152 0.19
153 0.19
154 0.26
155 0.34
156 0.41
157 0.46
158 0.54
159 0.58
160 0.62
161 0.66
162 0.66
163 0.66
164 0.59
165 0.6
166 0.53
167 0.49
168 0.41
169 0.34
170 0.28
171 0.2
172 0.23
173 0.2
174 0.23
175 0.26
176 0.31
177 0.35
178 0.43
179 0.51
180 0.58
181 0.61
182 0.64
183 0.69
184 0.76
185 0.79
186 0.78
187 0.78
188 0.77
189 0.73
190 0.67
191 0.59
192 0.48
193 0.39
194 0.32
195 0.21
196 0.11
197 0.08
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.08
214 0.1
215 0.14
216 0.16
217 0.18
218 0.17
219 0.17
220 0.18
221 0.18
222 0.16
223 0.13
224 0.11
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.15
229 0.16
230 0.22
231 0.3
232 0.35
233 0.41
234 0.49
235 0.56
236 0.59
237 0.65
238 0.67
239 0.64
240 0.67
241 0.7
242 0.68
243 0.69
244 0.63
245 0.56
246 0.5
247 0.45
248 0.37
249 0.3
250 0.27
251 0.22
252 0.25
253 0.24
254 0.21
255 0.21
256 0.21
257 0.2
258 0.18
259 0.13
260 0.09
261 0.1
262 0.12
263 0.12
264 0.11
265 0.1
266 0.1
267 0.1
268 0.09
269 0.07
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.06
274 0.06
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.08
280 0.1
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.11
285 0.11
286 0.14
287 0.14
288 0.12
289 0.11
290 0.12
291 0.12
292 0.13
293 0.15
294 0.13
295 0.14
296 0.15
297 0.16
298 0.15
299 0.19
300 0.18
301 0.17
302 0.15
303 0.13
304 0.13
305 0.12
306 0.11
307 0.08
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.1
312 0.1
313 0.1
314 0.1
315 0.11
316 0.14
317 0.14
318 0.15
319 0.13
320 0.13
321 0.18
322 0.26
323 0.31
324 0.32
325 0.32
326 0.34
327 0.37
328 0.41
329 0.42
330 0.42
331 0.36
332 0.36
333 0.37
334 0.35
335 0.32
336 0.28
337 0.23
338 0.15
339 0.15
340 0.12
341 0.12
342 0.13
343 0.14
344 0.16
345 0.19
346 0.21
347 0.28
348 0.34
349 0.34
350 0.35
351 0.35
352 0.36
353 0.37
354 0.39
355 0.35
356 0.3
357 0.28
358 0.28
359 0.35
360 0.31
361 0.26
362 0.21
363 0.2
364 0.18
365 0.18
366 0.15
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.06
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.09
379 0.09
380 0.1
381 0.1
382 0.1
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.08
387 0.08
388 0.06
389 0.09
390 0.1
391 0.12
392 0.15
393 0.18
394 0.17
395 0.19
396 0.2
397 0.19
398 0.18
399 0.17
400 0.14
401 0.11
402 0.1
403 0.09
404 0.09
405 0.08
406 0.1
407 0.09
408 0.09
409 0.1
410 0.11
411 0.1
412 0.11
413 0.12
414 0.11
415 0.12
416 0.12
417 0.11
418 0.11
419 0.11
420 0.09
421 0.08
422 0.09
423 0.12
424 0.16
425 0.17
426 0.18
427 0.19
428 0.19
429 0.2
430 0.2
431 0.19
432 0.19
433 0.24
434 0.28
435 0.29
436 0.3
437 0.3
438 0.29
439 0.26
440 0.23
441 0.17
442 0.13
443 0.1
444 0.08
445 0.08
446 0.07
447 0.06
448 0.05
449 0.04
450 0.04
451 0.05
452 0.07
453 0.08
454 0.08
455 0.09
456 0.09
457 0.11
458 0.1
459 0.11
460 0.13
461 0.13
462 0.14
463 0.15
464 0.15
465 0.14
466 0.15
467 0.13
468 0.09
469 0.1
470 0.1
471 0.09
472 0.08
473 0.08
474 0.08
475 0.08
476 0.09
477 0.1
478 0.11
479 0.11
480 0.12
481 0.14
482 0.14
483 0.15
484 0.18
485 0.26
486 0.33
487 0.39
488 0.45
489 0.49
490 0.49
491 0.5
492 0.5
493 0.45
494 0.41
495 0.39
496 0.36
497 0.39
498 0.45
499 0.45
500 0.42
501 0.37
502 0.33
503 0.29
504 0.3
505 0.25
506 0.19
507 0.19
508 0.2
509 0.21
510 0.21
511 0.22
512 0.21
513 0.26
514 0.25
515 0.27
516 0.27
517 0.29
518 0.29
519 0.3
520 0.31
521 0.24
522 0.22
523 0.2
524 0.21
525 0.2
526 0.19
527 0.2
528 0.17
529 0.16
530 0.16
531 0.15
532 0.12
533 0.11
534 0.11
535 0.13
536 0.14
537 0.17
538 0.19
539 0.24
540 0.26
541 0.3
542 0.38
543 0.39
544 0.48
545 0.51
546 0.54
547 0.53
548 0.52
549 0.48
550 0.41
551 0.37
552 0.3
553 0.25
554 0.28
555 0.32
556 0.37
557 0.38
558 0.41
559 0.41
560 0.43
561 0.5
562 0.47
563 0.44
564 0.42
565 0.41
566 0.38
567 0.34
568 0.3
569 0.28
570 0.23
571 0.18
572 0.14
573 0.13
574 0.13
575 0.12
576 0.11
577 0.05
578 0.04
579 0.04
580 0.04
581 0.04
582 0.03
583 0.03
584 0.03
585 0.03
586 0.03
587 0.03
588 0.03
589 0.04
590 0.07
591 0.08
592 0.09
593 0.09
594 0.11
595 0.14
596 0.16