Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F9XPQ7

Protein Details
Accession F9XPQ7    Localization Confidence High Confidence Score 22.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-41EEAISRKDKKAQRDAERHKAGKTKKRKHDETEDNDELKBasic
51-76EEDAVSKPKKSSKKRKVDTKDTTAGNHydrophilic
83-108EEKVDTTASRPKKRKKKSAAATTGDDHydrophilic
241-272LEEQRKRRAEVERKEKERKEKKEGKKTAGAAKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-30RKDKKAQRDAERHKAGKTKKRK
57-66KPKKSSKKRK
92-100RPKKRKKKS
226-280KTQGRQDKIKVKNERLEEQRKRRAEVERKEKERKEKKEGKKTAGAAKAQGVHPSR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG ztr:MYCGRDRAFT_88390  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MSTEEAISRKDKKAQRDAERHKAGKTKKRKHDETEDNDELKVEAVKQEDGEEDAVSKPKKSSKKRKVDTKDTTAGNALEVKEEEKVDTTASRPKKRKKKSAAATTGDDTTTVQDDTPKDAEKATTKSKFIVFIGNLPYKTTDATLTAHFKSLQPFNLRHRTDPQTKRSKGFAFLEFENYDRMKTCLKLFHHSMFDPEAKEVGGTGKGNGKAGRKINVELTAGGGGKTQGRQDKIKVKNERLEEQRKRRAEVERKEKERKEKKEGKKTAGAAKAQGVHPSRLRRGVDF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.72
3 0.77
4 0.82
5 0.84
6 0.89
7 0.82
8 0.77
9 0.75
10 0.74
11 0.73
12 0.75
13 0.75
14 0.76
15 0.84
16 0.87
17 0.87
18 0.88
19 0.88
20 0.86
21 0.85
22 0.8
23 0.71
24 0.62
25 0.53
26 0.42
27 0.32
28 0.25
29 0.15
30 0.11
31 0.12
32 0.13
33 0.13
34 0.14
35 0.14
36 0.15
37 0.15
38 0.12
39 0.11
40 0.12
41 0.18
42 0.17
43 0.18
44 0.19
45 0.26
46 0.36
47 0.46
48 0.56
49 0.61
50 0.72
51 0.8
52 0.88
53 0.9
54 0.91
55 0.89
56 0.86
57 0.82
58 0.72
59 0.64
60 0.55
61 0.45
62 0.35
63 0.29
64 0.21
65 0.15
66 0.14
67 0.13
68 0.13
69 0.13
70 0.12
71 0.11
72 0.11
73 0.11
74 0.11
75 0.13
76 0.19
77 0.28
78 0.36
79 0.44
80 0.54
81 0.64
82 0.73
83 0.81
84 0.84
85 0.86
86 0.87
87 0.89
88 0.88
89 0.82
90 0.75
91 0.66
92 0.57
93 0.46
94 0.35
95 0.25
96 0.16
97 0.13
98 0.09
99 0.07
100 0.1
101 0.1
102 0.13
103 0.15
104 0.15
105 0.15
106 0.15
107 0.17
108 0.18
109 0.21
110 0.26
111 0.27
112 0.27
113 0.29
114 0.29
115 0.29
116 0.26
117 0.26
118 0.19
119 0.19
120 0.23
121 0.24
122 0.23
123 0.21
124 0.22
125 0.17
126 0.17
127 0.14
128 0.09
129 0.08
130 0.1
131 0.12
132 0.14
133 0.14
134 0.15
135 0.15
136 0.15
137 0.17
138 0.18
139 0.2
140 0.2
141 0.23
142 0.29
143 0.39
144 0.39
145 0.38
146 0.42
147 0.44
148 0.51
149 0.55
150 0.58
151 0.58
152 0.6
153 0.61
154 0.6
155 0.55
156 0.5
157 0.46
158 0.41
159 0.34
160 0.32
161 0.34
162 0.29
163 0.27
164 0.25
165 0.21
166 0.18
167 0.15
168 0.16
169 0.13
170 0.15
171 0.17
172 0.21
173 0.23
174 0.29
175 0.32
176 0.35
177 0.37
178 0.36
179 0.35
180 0.32
181 0.31
182 0.26
183 0.22
184 0.18
185 0.14
186 0.14
187 0.12
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.15
193 0.16
194 0.19
195 0.22
196 0.24
197 0.28
198 0.31
199 0.37
200 0.34
201 0.35
202 0.37
203 0.37
204 0.34
205 0.28
206 0.26
207 0.21
208 0.19
209 0.17
210 0.13
211 0.1
212 0.11
213 0.13
214 0.16
215 0.2
216 0.24
217 0.28
218 0.35
219 0.44
220 0.51
221 0.59
222 0.64
223 0.66
224 0.69
225 0.71
226 0.72
227 0.71
228 0.74
229 0.74
230 0.75
231 0.78
232 0.75
233 0.73
234 0.71
235 0.72
236 0.71
237 0.71
238 0.72
239 0.73
240 0.78
241 0.84
242 0.85
243 0.86
244 0.86
245 0.84
246 0.84
247 0.84
248 0.87
249 0.88
250 0.89
251 0.86
252 0.84
253 0.81
254 0.79
255 0.76
256 0.67
257 0.59
258 0.55
259 0.52
260 0.45
261 0.47
262 0.41
263 0.39
264 0.43
265 0.49
266 0.5
267 0.53