Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0UU43

Protein Details
Accession Q0UU43    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
204-232GGRGFRGKWDQNKRGRGRGRGRGRGRGDFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
194-230RERDDRGGHGGGRGFRGKWDQNKRGRGRGRGRGRGRG
Subcellular Location(s) mito 10, cyto 9.5, cyto_nucl 8.5, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045348  CPSF4/Yth1  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005847  C:mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006378  P:mRNA polyadenylation  
GO:0098789  P:pre-mRNA cleavage required for polyadenylation  
KEGG pno:SNOG_04721  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MAEVQARSVSMAPDQDVEKAGQPMYKFNFSEFLSREYRFGLDPNRPACKFLVCKHWLRGLCKKGETCEFLHEYNLRRMPECSYYARTQTCSNGDDCLYLHIDPEAKRPSCPHYDRGFCPLGPYCALKHNKKEKLCPFYLCGFCPEGKGCKYGAHARFPTDLKKPEVRIEKSPEELEAERLERERAMMRREEEERERDDRGGHGGGRGFRGKWDQNKRGRGRGRGRGRGRGDF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.18
4 0.18
5 0.18
6 0.19
7 0.19
8 0.19
9 0.18
10 0.24
11 0.28
12 0.32
13 0.3
14 0.29
15 0.34
16 0.32
17 0.39
18 0.34
19 0.34
20 0.32
21 0.33
22 0.32
23 0.28
24 0.29
25 0.22
26 0.24
27 0.25
28 0.28
29 0.34
30 0.38
31 0.45
32 0.44
33 0.45
34 0.42
35 0.43
36 0.41
37 0.39
38 0.44
39 0.41
40 0.45
41 0.48
42 0.53
43 0.51
44 0.52
45 0.58
46 0.54
47 0.55
48 0.55
49 0.52
50 0.5
51 0.5
52 0.47
53 0.39
54 0.38
55 0.35
56 0.31
57 0.32
58 0.31
59 0.29
60 0.33
61 0.36
62 0.31
63 0.29
64 0.29
65 0.29
66 0.3
67 0.3
68 0.27
69 0.27
70 0.29
71 0.32
72 0.33
73 0.31
74 0.29
75 0.29
76 0.28
77 0.24
78 0.23
79 0.2
80 0.18
81 0.17
82 0.15
83 0.14
84 0.12
85 0.1
86 0.1
87 0.09
88 0.11
89 0.11
90 0.17
91 0.21
92 0.2
93 0.21
94 0.23
95 0.27
96 0.33
97 0.35
98 0.36
99 0.36
100 0.4
101 0.41
102 0.45
103 0.42
104 0.33
105 0.32
106 0.26
107 0.21
108 0.18
109 0.18
110 0.14
111 0.2
112 0.27
113 0.28
114 0.36
115 0.45
116 0.51
117 0.53
118 0.62
119 0.62
120 0.63
121 0.62
122 0.55
123 0.49
124 0.48
125 0.47
126 0.38
127 0.32
128 0.27
129 0.24
130 0.24
131 0.22
132 0.2
133 0.19
134 0.2
135 0.18
136 0.18
137 0.22
138 0.29
139 0.31
140 0.35
141 0.35
142 0.36
143 0.39
144 0.39
145 0.4
146 0.38
147 0.38
148 0.35
149 0.4
150 0.39
151 0.43
152 0.51
153 0.5
154 0.5
155 0.53
156 0.52
157 0.5
158 0.48
159 0.41
160 0.36
161 0.32
162 0.28
163 0.23
164 0.21
165 0.19
166 0.19
167 0.19
168 0.15
169 0.16
170 0.2
171 0.22
172 0.25
173 0.29
174 0.3
175 0.35
176 0.38
177 0.43
178 0.42
179 0.43
180 0.44
181 0.42
182 0.42
183 0.38
184 0.36
185 0.31
186 0.29
187 0.27
188 0.23
189 0.22
190 0.24
191 0.25
192 0.28
193 0.3
194 0.25
195 0.26
196 0.33
197 0.38
198 0.45
199 0.53
200 0.58
201 0.65
202 0.75
203 0.79
204 0.81
205 0.82
206 0.82
207 0.81
208 0.82
209 0.84
210 0.84
211 0.84
212 0.84