Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0CKM7

Protein Details
Accession Q0CKM7    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-55ASAPVHKPLRKGRTNARQGMTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1200-1207NKSKEKTG
1212-1245PSGPIKRPTQPGSYGGRRGGLGVKRAKAPTGAPR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 4, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR034397  Prp24_RRM1  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR031766  RRM_occluded  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF16842  RRM_occluded  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12296  RRM1_Prp24  
cd12299  RRM4_Prp24  
cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MDINSLLSPQESNAQSGRSTSTSIPPSSNASIPSASAPVHKPLRKGRTNARQGMTSSPLAQHVYAPAQLQEPSPPAMSPTVGPNMGGGSGTPPATDLPPPRQPSTPGMDTLADLASMQHHQPQRTNASLLRSTESYESQLSPSTMYPHVSSIAHNTPTPRSSFDIAMSDGPKESARRNYADTSLIPDAQRLATELFARIQENPHDYDAHVSFVRLLHEGFRNHIFPPNKPDEKGNPRQYDLLKDMRTAREEMDKLFALGEDLWADWVGDEGMLAGSVNERIAVMELCQRSVEEEYGSTKLWGIYAAWVSHLYESANMDPSESNWTEEDHLIGREVFSLQSVLDVLQRGTEATRWRINDSHVLWDQLMTWYMRDLARDRSQEKINHMMGLFDMRLQTPHKTWQQTFDTYSHFITEYANANYENIMADAVNRYADAKQKWEARSDFEDKLDQAANAQDSTLEAAIFREYIEWEIGRYRRKRSNFHLVSALYQRALLRFPTDPNLWEEFVMFLIDESLHGHADTTTLSTLDRATRHCPSSGTLWSQYLLSSEREGQSFAKIAGIKHKATSTGLLDVGGMEEVLKVHTAWCSYLRRRAFLSDSTDEDLDVAEVGIRSAIESVQELGEKKYGRSYQGDPLFRLERIYIRYLSESGSWDSARETFKGLVGRLGHSYEFWLTYYEWELISWSKFVQGEATADAARRTPNPSYATAVLKQAIKRTDLDWPEKIMQVYIAHCEDYEDSDELQYAIIETRKAKRMVDTRRAHEAALAQQQAQQLAEQASQAEKRKRDDEASVNGVPTKKLRAEEAAAADAESEAATLRRDREHSTVIVKNLPHQTTEHKVRQFFRHCGTINSLKMLPGEDGNSETAIIEFNSRDEALVAQTRDQKLIDENTIEVQLGSNSTLFVTNFPPTADEKYIRDLFHEFGEIIDIRFPSLKYNTHRRFCYVQFKTGEAAQNATKLDGTVVGNNLHLVAKISDPSRKQDRHGPMYEGREIHVSNVDWKANEDDLKELFSKYGHVELVRIPRKVDGGSKGFGYVVFSTKEEAQAALALHEHEFRSRPLHVKVSAPQGAKRSATTIVSQVGKSMSPSGDVNGTKESGETDASARERTARTLALMNVPDTVNDARIRSLVEPYGQLIKVVLRPDHQGAIVEFADVHAAGKASLELSGQEIAPGRPLRVGTVPEMLKQSAEKKSGPGPQANKSKEKTGGFLAPSGPIKRPTQPGSYGGRRGGLGVKRAKAPTGAPREHNGDKKGMTTTTTTMTSDSATSAEGGKPQKSNDDFRAMIQKGRGE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.23
3 0.25
4 0.28
5 0.21
6 0.24
7 0.23
8 0.29
9 0.33
10 0.35
11 0.35
12 0.33
13 0.37
14 0.38
15 0.37
16 0.31
17 0.29
18 0.27
19 0.26
20 0.26
21 0.22
22 0.2
23 0.22
24 0.23
25 0.28
26 0.37
27 0.39
28 0.45
29 0.53
30 0.62
31 0.65
32 0.7
33 0.73
34 0.74
35 0.81
36 0.83
37 0.76
38 0.71
39 0.65
40 0.63
41 0.57
42 0.48
43 0.4
44 0.33
45 0.33
46 0.3
47 0.28
48 0.23
49 0.22
50 0.22
51 0.22
52 0.21
53 0.19
54 0.19
55 0.2
56 0.2
57 0.2
58 0.2
59 0.21
60 0.21
61 0.19
62 0.19
63 0.2
64 0.2
65 0.17
66 0.2
67 0.22
68 0.21
69 0.21
70 0.19
71 0.19
72 0.18
73 0.16
74 0.11
75 0.09
76 0.11
77 0.11
78 0.1
79 0.1
80 0.11
81 0.14
82 0.19
83 0.22
84 0.28
85 0.36
86 0.42
87 0.45
88 0.46
89 0.48
90 0.49
91 0.51
92 0.47
93 0.4
94 0.38
95 0.35
96 0.32
97 0.3
98 0.24
99 0.16
100 0.12
101 0.1
102 0.1
103 0.11
104 0.12
105 0.17
106 0.22
107 0.25
108 0.3
109 0.37
110 0.41
111 0.43
112 0.47
113 0.43
114 0.45
115 0.47
116 0.44
117 0.41
118 0.35
119 0.33
120 0.32
121 0.31
122 0.27
123 0.25
124 0.24
125 0.21
126 0.23
127 0.21
128 0.2
129 0.19
130 0.2
131 0.2
132 0.2
133 0.2
134 0.19
135 0.21
136 0.2
137 0.2
138 0.23
139 0.28
140 0.28
141 0.28
142 0.29
143 0.31
144 0.34
145 0.34
146 0.31
147 0.29
148 0.3
149 0.3
150 0.3
151 0.28
152 0.27
153 0.29
154 0.27
155 0.23
156 0.21
157 0.2
158 0.2
159 0.19
160 0.23
161 0.27
162 0.31
163 0.34
164 0.38
165 0.41
166 0.41
167 0.42
168 0.38
169 0.35
170 0.33
171 0.32
172 0.28
173 0.25
174 0.24
175 0.2
176 0.2
177 0.15
178 0.13
179 0.13
180 0.14
181 0.15
182 0.15
183 0.16
184 0.17
185 0.17
186 0.19
187 0.22
188 0.24
189 0.26
190 0.26
191 0.25
192 0.24
193 0.28
194 0.25
195 0.24
196 0.21
197 0.18
198 0.18
199 0.18
200 0.2
201 0.15
202 0.15
203 0.16
204 0.21
205 0.22
206 0.24
207 0.26
208 0.26
209 0.26
210 0.34
211 0.32
212 0.3
213 0.38
214 0.44
215 0.45
216 0.45
217 0.5
218 0.52
219 0.59
220 0.66
221 0.67
222 0.63
223 0.61
224 0.65
225 0.61
226 0.58
227 0.53
228 0.51
229 0.42
230 0.41
231 0.43
232 0.41
233 0.42
234 0.37
235 0.34
236 0.33
237 0.33
238 0.31
239 0.3
240 0.26
241 0.24
242 0.23
243 0.2
244 0.13
245 0.12
246 0.11
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.05
253 0.06
254 0.05
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.03
262 0.04
263 0.05
264 0.05
265 0.04
266 0.05
267 0.05
268 0.06
269 0.06
270 0.07
271 0.13
272 0.14
273 0.14
274 0.14
275 0.14
276 0.15
277 0.17
278 0.17
279 0.12
280 0.12
281 0.15
282 0.16
283 0.17
284 0.15
285 0.14
286 0.13
287 0.12
288 0.11
289 0.09
290 0.1
291 0.12
292 0.12
293 0.12
294 0.13
295 0.13
296 0.13
297 0.13
298 0.1
299 0.09
300 0.12
301 0.12
302 0.15
303 0.14
304 0.15
305 0.14
306 0.15
307 0.21
308 0.19
309 0.19
310 0.16
311 0.17
312 0.18
313 0.19
314 0.19
315 0.14
316 0.13
317 0.13
318 0.12
319 0.11
320 0.1
321 0.1
322 0.09
323 0.07
324 0.07
325 0.06
326 0.06
327 0.07
328 0.06
329 0.07
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.11
337 0.14
338 0.18
339 0.23
340 0.24
341 0.28
342 0.29
343 0.31
344 0.36
345 0.33
346 0.36
347 0.32
348 0.32
349 0.28
350 0.27
351 0.24
352 0.18
353 0.18
354 0.11
355 0.1
356 0.09
357 0.11
358 0.12
359 0.13
360 0.14
361 0.2
362 0.27
363 0.32
364 0.33
365 0.36
366 0.41
367 0.42
368 0.45
369 0.46
370 0.4
371 0.37
372 0.35
373 0.3
374 0.25
375 0.24
376 0.19
377 0.12
378 0.11
379 0.09
380 0.11
381 0.13
382 0.16
383 0.15
384 0.23
385 0.29
386 0.34
387 0.35
388 0.41
389 0.44
390 0.45
391 0.46
392 0.41
393 0.38
394 0.34
395 0.33
396 0.26
397 0.21
398 0.18
399 0.16
400 0.16
401 0.16
402 0.14
403 0.15
404 0.14
405 0.14
406 0.14
407 0.13
408 0.1
409 0.07
410 0.06
411 0.05
412 0.05
413 0.06
414 0.07
415 0.06
416 0.06
417 0.07
418 0.09
419 0.15
420 0.15
421 0.18
422 0.23
423 0.3
424 0.31
425 0.36
426 0.36
427 0.35
428 0.41
429 0.42
430 0.39
431 0.33
432 0.34
433 0.28
434 0.29
435 0.25
436 0.18
437 0.13
438 0.14
439 0.13
440 0.11
441 0.1
442 0.08
443 0.07
444 0.08
445 0.08
446 0.06
447 0.05
448 0.05
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.05
453 0.05
454 0.06
455 0.08
456 0.07
457 0.08
458 0.13
459 0.16
460 0.24
461 0.27
462 0.33
463 0.4
464 0.46
465 0.53
466 0.56
467 0.64
468 0.59
469 0.57
470 0.57
471 0.49
472 0.46
473 0.42
474 0.35
475 0.23
476 0.21
477 0.19
478 0.14
479 0.15
480 0.12
481 0.11
482 0.12
483 0.13
484 0.17
485 0.17
486 0.18
487 0.21
488 0.23
489 0.21
490 0.2
491 0.18
492 0.14
493 0.13
494 0.12
495 0.07
496 0.04
497 0.04
498 0.04
499 0.04
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.06
505 0.05
506 0.06
507 0.06
508 0.06
509 0.05
510 0.05
511 0.05
512 0.06
513 0.07
514 0.09
515 0.11
516 0.13
517 0.17
518 0.21
519 0.23
520 0.23
521 0.23
522 0.22
523 0.25
524 0.25
525 0.25
526 0.22
527 0.21
528 0.2
529 0.2
530 0.18
531 0.15
532 0.13
533 0.1
534 0.1
535 0.12
536 0.13
537 0.13
538 0.14
539 0.13
540 0.13
541 0.12
542 0.11
543 0.12
544 0.12
545 0.13
546 0.19
547 0.23
548 0.22
549 0.22
550 0.23
551 0.21
552 0.2
553 0.22
554 0.15
555 0.13
556 0.13
557 0.11
558 0.11
559 0.09
560 0.09
561 0.06
562 0.05
563 0.03
564 0.03
565 0.03
566 0.03
567 0.04
568 0.03
569 0.04
570 0.05
571 0.06
572 0.07
573 0.11
574 0.17
575 0.2
576 0.27
577 0.28
578 0.29
579 0.3
580 0.32
581 0.3
582 0.28
583 0.32
584 0.26
585 0.27
586 0.27
587 0.25
588 0.22
589 0.19
590 0.15
591 0.09
592 0.07
593 0.04
594 0.03
595 0.03
596 0.03
597 0.03
598 0.03
599 0.03
600 0.03
601 0.03
602 0.03
603 0.04
604 0.04
605 0.05
606 0.06
607 0.07
608 0.07
609 0.11
610 0.11
611 0.11
612 0.16
613 0.17
614 0.18
615 0.21
616 0.24
617 0.28
618 0.35
619 0.36
620 0.32
621 0.34
622 0.33
623 0.29
624 0.27
625 0.19
626 0.15
627 0.16
628 0.18
629 0.15
630 0.15
631 0.16
632 0.15
633 0.16
634 0.14
635 0.13
636 0.11
637 0.12
638 0.11
639 0.1
640 0.11
641 0.13
642 0.13
643 0.11
644 0.12
645 0.11
646 0.13
647 0.15
648 0.15
649 0.15
650 0.14
651 0.15
652 0.14
653 0.15
654 0.13
655 0.11
656 0.12
657 0.09
658 0.09
659 0.08
660 0.08
661 0.07
662 0.08
663 0.1
664 0.1
665 0.09
666 0.08
667 0.09
668 0.09
669 0.09
670 0.09
671 0.07
672 0.08
673 0.09
674 0.09
675 0.09
676 0.08
677 0.09
678 0.09
679 0.1
680 0.08
681 0.09
682 0.09
683 0.09
684 0.09
685 0.09
686 0.12
687 0.12
688 0.17
689 0.19
690 0.2
691 0.23
692 0.24
693 0.26
694 0.24
695 0.24
696 0.21
697 0.21
698 0.2
699 0.21
700 0.2
701 0.19
702 0.19
703 0.19
704 0.24
705 0.26
706 0.29
707 0.26
708 0.28
709 0.28
710 0.29
711 0.27
712 0.2
713 0.17
714 0.14
715 0.14
716 0.13
717 0.12
718 0.11
719 0.1
720 0.11
721 0.1
722 0.1
723 0.11
724 0.1
725 0.09
726 0.09
727 0.09
728 0.09
729 0.08
730 0.06
731 0.05
732 0.05
733 0.06
734 0.07
735 0.1
736 0.14
737 0.2
738 0.21
739 0.21
740 0.27
741 0.35
742 0.43
743 0.51
744 0.53
745 0.51
746 0.57
747 0.58
748 0.51
749 0.43
750 0.36
751 0.31
752 0.3
753 0.27
754 0.19
755 0.21
756 0.22
757 0.21
758 0.19
759 0.14
760 0.1
761 0.1
762 0.1
763 0.08
764 0.08
765 0.09
766 0.13
767 0.19
768 0.23
769 0.25
770 0.29
771 0.31
772 0.33
773 0.35
774 0.36
775 0.36
776 0.36
777 0.38
778 0.35
779 0.33
780 0.32
781 0.3
782 0.25
783 0.21
784 0.19
785 0.15
786 0.16
787 0.17
788 0.18
789 0.2
790 0.22
791 0.23
792 0.21
793 0.18
794 0.17
795 0.15
796 0.12
797 0.1
798 0.06
799 0.04
800 0.03
801 0.04
802 0.05
803 0.06
804 0.08
805 0.11
806 0.13
807 0.17
808 0.21
809 0.23
810 0.24
811 0.29
812 0.31
813 0.3
814 0.32
815 0.28
816 0.3
817 0.33
818 0.32
819 0.27
820 0.25
821 0.28
822 0.32
823 0.41
824 0.42
825 0.4
826 0.44
827 0.47
828 0.55
829 0.57
830 0.54
831 0.49
832 0.49
833 0.46
834 0.44
835 0.46
836 0.44
837 0.38
838 0.36
839 0.33
840 0.26
841 0.25
842 0.24
843 0.18
844 0.12
845 0.12
846 0.09
847 0.11
848 0.1
849 0.1
850 0.09
851 0.08
852 0.08
853 0.07
854 0.07
855 0.06
856 0.06
857 0.06
858 0.08
859 0.08
860 0.08
861 0.08
862 0.08
863 0.09
864 0.13
865 0.13
866 0.15
867 0.21
868 0.22
869 0.23
870 0.22
871 0.21
872 0.2
873 0.23
874 0.21
875 0.16
876 0.16
877 0.16
878 0.16
879 0.15
880 0.12
881 0.09
882 0.07
883 0.07
884 0.07
885 0.06
886 0.06
887 0.06
888 0.07
889 0.07
890 0.09
891 0.11
892 0.11
893 0.12
894 0.12
895 0.13
896 0.14
897 0.18
898 0.2
899 0.2
900 0.21
901 0.27
902 0.31
903 0.29
904 0.29
905 0.26
906 0.24
907 0.22
908 0.22
909 0.15
910 0.11
911 0.14
912 0.12
913 0.11
914 0.12
915 0.11
916 0.1
917 0.12
918 0.12
919 0.14
920 0.17
921 0.23
922 0.27
923 0.39
924 0.47
925 0.53
926 0.55
927 0.55
928 0.57
929 0.57
930 0.62
931 0.54
932 0.53
933 0.48
934 0.47
935 0.44
936 0.43
937 0.41
938 0.31
939 0.29
940 0.23
941 0.23
942 0.22
943 0.21
944 0.17
945 0.12
946 0.12
947 0.12
948 0.12
949 0.12
950 0.13
951 0.13
952 0.13
953 0.13
954 0.14
955 0.11
956 0.1
957 0.09
958 0.08
959 0.09
960 0.11
961 0.13
962 0.18
963 0.2
964 0.27
965 0.35
966 0.37
967 0.39
968 0.46
969 0.54
970 0.57
971 0.58
972 0.57
973 0.53
974 0.56
975 0.57
976 0.48
977 0.4
978 0.34
979 0.31
980 0.26
981 0.24
982 0.2
983 0.2
984 0.23
985 0.23
986 0.2
987 0.22
988 0.23
989 0.22
990 0.23
991 0.19
992 0.18
993 0.18
994 0.2
995 0.2
996 0.17
997 0.15
998 0.13
999 0.15
1000 0.13
1001 0.16
1002 0.15
1003 0.14
1004 0.15
1005 0.2
1006 0.3
1007 0.34
1008 0.33
1009 0.3
1010 0.31
1011 0.32
1012 0.33
1013 0.33
1014 0.3
1015 0.29
1016 0.29
1017 0.29
1018 0.28
1019 0.26
1020 0.24
1021 0.22
1022 0.16
1023 0.15
1024 0.15
1025 0.15
1026 0.16
1027 0.17
1028 0.19
1029 0.16
1030 0.15
1031 0.12
1032 0.13
1033 0.13
1034 0.11
1035 0.11
1036 0.1
1037 0.1
1038 0.13
1039 0.13
1040 0.13
1041 0.14
1042 0.15
1043 0.19
1044 0.22
1045 0.26
1046 0.29
1047 0.35
1048 0.35
1049 0.38
1050 0.42
1051 0.46
1052 0.49
1053 0.46
1054 0.44
1055 0.42
1056 0.44
1057 0.41
1058 0.36
1059 0.3
1060 0.27
1061 0.27
1062 0.25
1063 0.23
1064 0.24
1065 0.26
1066 0.24
1067 0.23
1068 0.21
1069 0.2
1070 0.19
1071 0.2
1072 0.15
1073 0.15
1074 0.15
1075 0.15
1076 0.2
1077 0.21
1078 0.22
1079 0.2
1080 0.21
1081 0.19
1082 0.18
1083 0.18
1084 0.13
1085 0.13
1086 0.12
1087 0.11
1088 0.16
1089 0.17
1090 0.18
1091 0.17
1092 0.21
1093 0.21
1094 0.23
1095 0.25
1096 0.21
1097 0.22
1098 0.24
1099 0.26
1100 0.27
1101 0.28
1102 0.25
1103 0.24
1104 0.23
1105 0.21
1106 0.2
1107 0.19
1108 0.17
1109 0.17
1110 0.17
1111 0.16
1112 0.17
1113 0.19
1114 0.17
1115 0.2
1116 0.19
1117 0.19
1118 0.19
1119 0.2
1120 0.25
1121 0.23
1122 0.22
1123 0.19
1124 0.2
1125 0.21
1126 0.24
1127 0.24
1128 0.2
1129 0.25
1130 0.28
1131 0.29
1132 0.26
1133 0.25
1134 0.22
1135 0.24
1136 0.22
1137 0.18
1138 0.15
1139 0.13
1140 0.13
1141 0.1
1142 0.1
1143 0.06
1144 0.07
1145 0.06
1146 0.07
1147 0.07
1148 0.07
1149 0.07
1150 0.07
1151 0.07
1152 0.09
1153 0.1
1154 0.09
1155 0.11
1156 0.12
1157 0.12
1158 0.19
1159 0.2
1160 0.18
1161 0.2
1162 0.2
1163 0.22
1164 0.24
1165 0.27
1166 0.23
1167 0.29
1168 0.3
1169 0.3
1170 0.33
1171 0.3
1172 0.27
1173 0.28
1174 0.32
1175 0.31
1176 0.35
1177 0.33
1178 0.33
1179 0.4
1180 0.47
1181 0.49
1182 0.51
1183 0.49
1184 0.54
1185 0.63
1186 0.66
1187 0.67
1188 0.62
1189 0.63
1190 0.63
1191 0.59
1192 0.53
1193 0.49
1194 0.5
1195 0.43
1196 0.42
1197 0.36
1198 0.34
1199 0.37
1200 0.36
1201 0.34
1202 0.32
1203 0.34
1204 0.38
1205 0.45
1206 0.45
1207 0.47
1208 0.48
1209 0.51
1210 0.56
1211 0.6
1212 0.59
1213 0.53
1214 0.5
1215 0.43
1216 0.41
1217 0.42
1218 0.38
1219 0.38
1220 0.4
1221 0.42
1222 0.46
1223 0.47
1224 0.47
1225 0.42
1226 0.43
1227 0.45
1228 0.48
1229 0.5
1230 0.47
1231 0.51
1232 0.57
1233 0.62
1234 0.64
1235 0.57
1236 0.53
1237 0.48
1238 0.47
1239 0.46
1240 0.4
1241 0.34
1242 0.3
1243 0.3
1244 0.28
1245 0.29
1246 0.26
1247 0.23
1248 0.23
1249 0.22
1250 0.18
1251 0.17
1252 0.13
1253 0.11
1254 0.12
1255 0.13
1256 0.13
1257 0.18
1258 0.22
1259 0.26
1260 0.28
1261 0.3
1262 0.39
1263 0.42
1264 0.48
1265 0.49
1266 0.52
1267 0.49
1268 0.49
1269 0.57
1270 0.49
1271 0.48