Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0CDP3

Protein Details
Accession Q0CDP3    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-34MGTIRQKKKNRSSVPKTKAKRTGQLKNGNKKINVHydrophilic
176-198KESSQVAKKKPRHLSKREEEWIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-28QKKKNRSSVPKTKAKRTGQLKNG
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13, mito 2, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019002  Ribosome_biogenesis_Nop16  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09420  Nop16  
Amino Acid Sequences MGTIRQKKKNRSSVPKTKAKRTGQLKNGNKKINVLGNAIIAENWDRKLTLTQNYRRLGLVHRLNAPAGGSEKRATKDGTIVTDPEDPLYIKSSTESIAKTLGLGEAKVERDPETGKIIRVIGNDDEVEIAGRKRRRSNPLNDPLNDLSDNEEDASAGPNKNGPSAIVQQLERQADKESSQVAKKKPRHLSKREEEWIEALIQRHGDNVSAMVRDRKLNPMQQSEGDLKRRIRKWKEMQS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.91
2 0.91
3 0.88
4 0.87
5 0.86
6 0.83
7 0.82
8 0.8
9 0.81
10 0.8
11 0.84
12 0.84
13 0.84
14 0.86
15 0.83
16 0.75
17 0.68
18 0.64
19 0.6
20 0.53
21 0.45
22 0.37
23 0.31
24 0.3
25 0.27
26 0.2
27 0.14
28 0.14
29 0.13
30 0.13
31 0.12
32 0.12
33 0.13
34 0.18
35 0.21
36 0.27
37 0.35
38 0.42
39 0.5
40 0.52
41 0.52
42 0.48
43 0.45
44 0.41
45 0.4
46 0.39
47 0.35
48 0.37
49 0.36
50 0.36
51 0.34
52 0.3
53 0.22
54 0.18
55 0.15
56 0.13
57 0.15
58 0.18
59 0.19
60 0.21
61 0.21
62 0.19
63 0.22
64 0.22
65 0.24
66 0.21
67 0.2
68 0.21
69 0.22
70 0.21
71 0.17
72 0.15
73 0.12
74 0.11
75 0.14
76 0.12
77 0.09
78 0.1
79 0.1
80 0.11
81 0.13
82 0.12
83 0.1
84 0.11
85 0.11
86 0.1
87 0.09
88 0.1
89 0.08
90 0.07
91 0.07
92 0.08
93 0.09
94 0.09
95 0.1
96 0.09
97 0.1
98 0.11
99 0.12
100 0.16
101 0.16
102 0.15
103 0.16
104 0.16
105 0.17
106 0.16
107 0.17
108 0.11
109 0.12
110 0.11
111 0.1
112 0.09
113 0.07
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.1
118 0.13
119 0.17
120 0.24
121 0.32
122 0.41
123 0.48
124 0.56
125 0.62
126 0.69
127 0.73
128 0.66
129 0.64
130 0.56
131 0.51
132 0.42
133 0.31
134 0.24
135 0.17
136 0.17
137 0.12
138 0.11
139 0.08
140 0.08
141 0.1
142 0.1
143 0.09
144 0.09
145 0.12
146 0.12
147 0.13
148 0.13
149 0.11
150 0.13
151 0.17
152 0.21
153 0.21
154 0.21
155 0.22
156 0.27
157 0.29
158 0.25
159 0.22
160 0.21
161 0.2
162 0.2
163 0.2
164 0.19
165 0.21
166 0.26
167 0.32
168 0.37
169 0.45
170 0.52
171 0.6
172 0.66
173 0.73
174 0.77
175 0.8
176 0.83
177 0.83
178 0.86
179 0.84
180 0.76
181 0.67
182 0.58
183 0.5
184 0.41
185 0.34
186 0.25
187 0.19
188 0.17
189 0.16
190 0.16
191 0.15
192 0.13
193 0.11
194 0.12
195 0.13
196 0.13
197 0.15
198 0.18
199 0.2
200 0.24
201 0.26
202 0.32
203 0.36
204 0.42
205 0.48
206 0.5
207 0.52
208 0.5
209 0.52
210 0.51
211 0.52
212 0.51
213 0.5
214 0.5
215 0.56
216 0.61
217 0.67
218 0.68
219 0.72