FuNGI

Q0CC40

Protein Details

Accession

Q0CC40

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
548-579	GYPSAKTRKFNWSEKAKRRKTTGSGRMRHLKE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
560-578	SEKAKRRKTTGSGRMRHLK

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011331 Ribosomal_L37ae/L37e IPR001569 Ribosomal_L37e IPR011332 Ribosomal_zn-bd IPR021715 Slu7_dom IPR039974 Splicing_factor_SLU7
Gene Ontology	GO:0005840 C:ribosome GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0046872 F:metal ion binding GO:0030628 F:pre-mRNA 3'-splice site binding GO:0019843 F:rRNA binding GO:0003735 F:structural constituent of ribosome GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome GO:0006412 P:translation
Pfam	View protein in Pfam PF01907 Ribosomal_L37e PF11708 Slu7

Amino Acid Sequences

MSRKPADVASKERNEYIPSFISKKPFYVPDDESANDYLEHQRLQKQASSDQSKWYERGKRAGPAATKYRKGACENCGAMTHKTKECLSRPRKHGAKWTGKDIQADEVVQTVDLGWDAKRDRWNGYDPSEYRQVVEEYEELEKLKRATKQDAEQEKIADGELDDEDAPKEEARYAEESDMGRQQSTATRNLRIREDTAKYLLNLDLDSAKYDPKTRRMVDMGAQEDQAAALVAEENFVRASGDAAEFERAQRYAWEAQERGSQKIHLQANPTSGEILRKKEEQESVAKREAHKKALLEKYGGSEHLAPTPLRETMVTENERFVEYDETGAIKGAPKKAAKSKYPEDVLTNNHTTVWGSWWHNFEWGYACCYSTVKNSYCTGEDGKKAFEEADKMLMLPESDEKEEAAAEVENGESSNEHDTQAENGSRQDESTTRPKKRTLLEVQSGISEEELESSQRDTFDTPSDDDNDNQPFSGIASSIIQDEYVQIRYPSLPSVSLAIEKQRRPDIPRMGIGMHMGCSDGLTCGEIFDCSGRRSFHIQKSTCANCGYPSAKTRKFNWSEKAKRRKTTGSGRMRHLKEVHRRFQNGFQVGTPKGARGPENH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.46
3	0.43
4	0.38
5	0.36
6	0.38
7	0.39
8	0.44
9	0.41
10	0.42
11	0.42
12	0.43
13	0.43
14	0.45
15	0.46
16	0.43
17	0.46
18	0.44
19	0.41
20	0.36
21	0.33
22	0.26
23	0.24
24	0.24
25	0.22
26	0.24
27	0.24
28	0.29
29	0.32
30	0.35
31	0.37
32	0.36
33	0.4
34	0.47
35	0.52
36	0.48
37	0.52
38	0.56
39	0.56
40	0.55
41	0.58
42	0.57
43	0.53
44	0.6
45	0.57
46	0.57
47	0.58
48	0.62
49	0.58
50	0.57
51	0.62
52	0.62
53	0.61
54	0.58
55	0.6
56	0.58
57	0.59
58	0.58
59	0.53
60	0.54
61	0.51
62	0.48
63	0.46
64	0.44
65	0.41
66	0.43
67	0.44
68	0.37
69	0.4
70	0.41
71	0.44
72	0.49
73	0.56
74	0.58
75	0.62
76	0.65
77	0.72
78	0.76
79	0.73
80	0.76
81	0.76
82	0.77
83	0.71
84	0.74
85	0.71
86	0.67
87	0.64
88	0.55
89	0.48
90	0.39
91	0.35
92	0.26
93	0.2
94	0.17
95	0.14
96	0.12
97	0.08
98	0.06
99	0.06
100	0.07
101	0.05
102	0.1
103	0.12
104	0.17
105	0.23
106	0.25
107	0.29
108	0.32
109	0.39
110	0.39
111	0.42
112	0.46
113	0.42
114	0.44
115	0.48
116	0.43
117	0.38
118	0.35
119	0.31
120	0.23
121	0.24
122	0.19
123	0.15
124	0.16
125	0.16
126	0.14
127	0.14
128	0.16
129	0.15
130	0.19
131	0.22
132	0.26
133	0.33
134	0.38
135	0.44
136	0.52
137	0.59
138	0.58
139	0.54
140	0.51
141	0.43
142	0.37
143	0.3
144	0.2
145	0.12
146	0.1
147	0.08
148	0.08
149	0.08
150	0.08
151	0.08
152	0.09
153	0.1
154	0.08
155	0.09
156	0.09
157	0.1
158	0.12
159	0.15
160	0.16
161	0.16
162	0.19
163	0.19
164	0.19
165	0.23
166	0.2
167	0.17
168	0.15
169	0.16
170	0.18
171	0.21
172	0.27
173	0.26
174	0.32
175	0.36
176	0.39
177	0.41
178	0.39
179	0.39
180	0.38
181	0.39
182	0.35
183	0.34
184	0.32
185	0.29
186	0.28
187	0.25
188	0.18
189	0.14
190	0.12
191	0.11
192	0.1
193	0.11
194	0.1
195	0.1
196	0.11
197	0.17
198	0.2
199	0.26
200	0.34
201	0.34
202	0.38
203	0.39
204	0.4
205	0.39
206	0.41
207	0.37
208	0.3
209	0.28
210	0.24
211	0.21
212	0.18
213	0.13
214	0.07
215	0.04
216	0.03
217	0.04
218	0.03
219	0.04
220	0.04
221	0.04
222	0.04
223	0.05
224	0.05
225	0.04
226	0.05
227	0.05
228	0.06
229	0.06
230	0.07
231	0.09
232	0.09
233	0.09
234	0.1
235	0.09
236	0.09
237	0.09
238	0.12
239	0.14
240	0.17
241	0.21
242	0.19
243	0.2
244	0.27
245	0.28
246	0.26
247	0.23
248	0.21
249	0.19
250	0.26
251	0.28
252	0.24
253	0.26
254	0.25
255	0.27
256	0.27
257	0.26
258	0.19
259	0.16
260	0.2
261	0.19
262	0.21
263	0.2
264	0.21
265	0.22
266	0.25
267	0.27
268	0.24
269	0.3
270	0.32
271	0.35
272	0.38
273	0.38
274	0.37
275	0.44
276	0.44
277	0.4
278	0.37
279	0.34
280	0.37
281	0.41
282	0.4
283	0.32
284	0.3
285	0.28
286	0.26
287	0.24
288	0.17
289	0.12
290	0.11
291	0.12
292	0.13
293	0.1
294	0.1
295	0.12
296	0.11
297	0.1
298	0.09
299	0.1
300	0.12
301	0.18
302	0.2
303	0.19
304	0.19
305	0.19
306	0.2
307	0.18
308	0.15
309	0.11
310	0.09
311	0.09
312	0.09
313	0.09
314	0.08
315	0.08
316	0.07
317	0.08
318	0.11
319	0.13
320	0.18
321	0.18
322	0.22
323	0.3
324	0.36
325	0.38
326	0.43
327	0.45
328	0.47
329	0.48
330	0.46
331	0.41
332	0.38
333	0.36
334	0.34
335	0.31
336	0.25
337	0.22
338	0.21
339	0.18
340	0.15
341	0.14
342	0.13
343	0.14
344	0.17
345	0.19
346	0.19
347	0.21
348	0.2
349	0.19
350	0.19
351	0.17
352	0.17
353	0.16
354	0.16
355	0.14
356	0.14
357	0.15
358	0.15
359	0.2
360	0.19
361	0.22
362	0.23
363	0.25
364	0.25
365	0.27
366	0.26
367	0.24
368	0.26
369	0.24
370	0.23
371	0.22
372	0.21
373	0.19
374	0.16
375	0.15
376	0.12
377	0.14
378	0.13
379	0.13
380	0.12
381	0.12
382	0.11
383	0.09
384	0.11
385	0.1
386	0.11
387	0.11
388	0.11
389	0.11
390	0.11
391	0.1
392	0.08
393	0.06
394	0.05
395	0.05
396	0.05
397	0.05
398	0.05
399	0.05
400	0.04
401	0.06
402	0.09
403	0.1
404	0.1
405	0.1
406	0.11
407	0.13
408	0.17
409	0.17
410	0.14
411	0.15
412	0.16
413	0.16
414	0.15
415	0.16
416	0.13
417	0.17
418	0.26
419	0.35
420	0.4
421	0.44
422	0.48
423	0.52
424	0.55
425	0.6
426	0.59
427	0.59
428	0.59
429	0.58
430	0.54
431	0.48
432	0.44
433	0.34
434	0.25
435	0.16
436	0.09
437	0.08
438	0.08
439	0.08
440	0.08
441	0.09
442	0.1
443	0.1
444	0.11
445	0.11
446	0.13
447	0.16
448	0.19
449	0.19
450	0.2
451	0.24
452	0.25
453	0.24
454	0.27
455	0.26
456	0.24
457	0.22
458	0.2
459	0.15
460	0.15
461	0.14
462	0.1
463	0.07
464	0.08
465	0.08
466	0.09
467	0.09
468	0.08
469	0.08
470	0.09
471	0.11
472	0.11
473	0.12
474	0.11
475	0.13
476	0.14
477	0.15
478	0.16
479	0.15
480	0.14
481	0.14
482	0.16
483	0.16
484	0.17
485	0.17
486	0.23
487	0.29
488	0.31
489	0.36
490	0.4
491	0.44
492	0.47
493	0.55
494	0.56
495	0.55
496	0.57
497	0.54
498	0.48
499	0.44
500	0.4
501	0.31
502	0.23
503	0.17
504	0.13
505	0.1
506	0.1
507	0.09
508	0.08
509	0.07
510	0.07
511	0.07
512	0.07
513	0.08
514	0.08
515	0.08
516	0.11
517	0.13
518	0.14
519	0.18
520	0.19
521	0.23
522	0.31
523	0.39
524	0.45
525	0.52
526	0.53
527	0.54
528	0.62
529	0.62
530	0.58
531	0.51
532	0.43
533	0.34
534	0.4
535	0.37
536	0.33
537	0.37
538	0.43
539	0.49
540	0.54
541	0.57
542	0.61
543	0.66
544	0.69
545	0.71
546	0.72
547	0.75
548	0.8
549	0.87
550	0.85
551	0.85
552	0.84
553	0.84
554	0.82
555	0.82
556	0.82
557	0.82
558	0.8
559	0.81
560	0.84
561	0.78
562	0.76
563	0.72
564	0.71
565	0.71
566	0.74
567	0.75
568	0.74
569	0.76
570	0.72
571	0.75
572	0.75
573	0.68
574	0.6
575	0.53
576	0.5
577	0.46
578	0.47
579	0.39
580	0.31
581	0.3
582	0.32

Q0CC40

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer