Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0CKH2

Protein Details
Accession Q0CKH2    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
89-111AASNKNAKRREAKKKAKETQDGSHydrophilic
143-172LEAEKEKKARNLKKKLRQARDLRDKKNQGEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
90-105ASNKNAKRREAKKKAK
147-167KEKKARNLKKKLRQARDLRDK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 14, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039333  PYM1  
IPR015362  WIBG_mago-bd  
IPR036348  WIBG_N_sf  
Gene Ontology GO:1903259  P:exon-exon junction complex disassembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF09282  Mago-bind  
Amino Acid Sequences MASSQPGGVSSSGITVDSVTGERYIPSSVRADGSKRREIRVRPGYRPPEDVELYKNRAAEAWKNRGKTGIPGAEGLKPDNDTAAKAGSAASNKNAKRREAKKKAKETQDGSERTAQGKNVKDIENWRAPAPKEPQPESEPVDLEAEKEKKARNLKKKLRQARDLRDKKNQGEALLPEQLEKVIKIQELIRQLDALGFDANGDKKTDV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.08
3 0.08
4 0.08
5 0.09
6 0.08
7 0.09
8 0.09
9 0.09
10 0.1
11 0.12
12 0.11
13 0.14
14 0.15
15 0.16
16 0.19
17 0.21
18 0.25
19 0.32
20 0.38
21 0.44
22 0.45
23 0.49
24 0.53
25 0.56
26 0.61
27 0.64
28 0.64
29 0.61
30 0.69
31 0.72
32 0.68
33 0.67
34 0.59
35 0.54
36 0.49
37 0.44
38 0.39
39 0.37
40 0.38
41 0.36
42 0.34
43 0.27
44 0.26
45 0.28
46 0.3
47 0.33
48 0.38
49 0.41
50 0.43
51 0.43
52 0.44
53 0.41
54 0.37
55 0.36
56 0.3
57 0.26
58 0.26
59 0.27
60 0.27
61 0.27
62 0.24
63 0.17
64 0.14
65 0.13
66 0.13
67 0.12
68 0.09
69 0.09
70 0.09
71 0.08
72 0.07
73 0.08
74 0.08
75 0.09
76 0.09
77 0.12
78 0.19
79 0.2
80 0.27
81 0.3
82 0.32
83 0.4
84 0.49
85 0.57
86 0.61
87 0.7
88 0.73
89 0.8
90 0.85
91 0.83
92 0.81
93 0.73
94 0.7
95 0.67
96 0.59
97 0.52
98 0.48
99 0.41
100 0.36
101 0.33
102 0.28
103 0.25
104 0.25
105 0.26
106 0.26
107 0.26
108 0.26
109 0.28
110 0.33
111 0.32
112 0.31
113 0.29
114 0.3
115 0.29
116 0.34
117 0.35
118 0.36
119 0.37
120 0.38
121 0.42
122 0.4
123 0.43
124 0.41
125 0.38
126 0.31
127 0.26
128 0.26
129 0.21
130 0.19
131 0.22
132 0.19
133 0.19
134 0.21
135 0.22
136 0.27
137 0.37
138 0.46
139 0.51
140 0.6
141 0.7
142 0.77
143 0.86
144 0.89
145 0.88
146 0.88
147 0.88
148 0.88
149 0.88
150 0.88
151 0.84
152 0.84
153 0.82
154 0.76
155 0.75
156 0.66
157 0.56
158 0.51
159 0.48
160 0.42
161 0.39
162 0.35
163 0.26
164 0.24
165 0.24
166 0.2
167 0.17
168 0.15
169 0.14
170 0.14
171 0.15
172 0.17
173 0.21
174 0.27
175 0.29
176 0.28
177 0.25
178 0.24
179 0.24
180 0.23
181 0.19
182 0.13
183 0.1
184 0.09
185 0.13
186 0.15
187 0.15