FuNGI

Q0CY48

Protein Details

Accession

Q0CY48

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
575-605	YVGFRKTSENRIRKAREKNRGKGKGRNYAGV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
381-384	KRRK
583-619	ENRIRKAREKNRGKGKGRNYAGVKKVDPLKTFNRGRK

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 13, cyto 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR014014 RNA_helicase_DEAD_Q_motif
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0003678 F:DNA helicase activity GO:0033677 F:DNA/RNA helicase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0000463 P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF00271 Helicase_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER PS51195 Q_MOTIF
CDD	cd17961 DEADc_DDX56 cd18787 SF2_C_DEAD

Amino Acid Sequences

MKRKLDANDVPSPEAADDSVKNDVDNLDFESLNLDPRLRQALVKEKFTKPTLVQAKAIPLALEGKDILARAKTGSGKTAAYVLPILQTILQKKANDPSLKATTGLILVPTRELAEQVQNVITTFAAFCGKDVRSVNLTQKVSDAVQRTMLADYPDLIVSTPSRVIANLGSSALSLENLTHLVIDEADLVLSYGYDEDINALAKAIPRGVQTFLMSATLTAEVDTLKGLFCRSPVILKLEDKDDQGSGVSQFVVKCAEDEKFLLTYVIFKLQLIKGKVIIFVGDVDRCYRVKLFLEQFGIKSCVLNSELPVNSRLHVVQEFNKGVYDIIIAADEQEVMGARKSKKSKEAEENDAGEAAGSSDEDEGEAQKPSTTRSDKPSEKRRKTAGKDKDYGISRGIDFQNVACVLNFDLPTTSKSYTHRIGRTGRAGKTGMALSFVVPADQFGKHKPTSFPTAKHDETVLAKITKRQAKLGHEVKPYHFEMKQVDAFRYRMTDALRSITRLAVQEARAREIRQELIKSEKLKRHFEENPEELRQLRHDDELRSARIQPHLKHIPDYLMPSKGKKGISSENVGYVGFRKTSENRIRKAREKNRGKGKGRNYAGVKKVDPLKTFNRGRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.22
3	0.17
4	0.15
5	0.16
6	0.2
7	0.19
8	0.19
9	0.19
10	0.2
11	0.18
12	0.18
13	0.19
14	0.17
15	0.16
16	0.16
17	0.18
18	0.17
19	0.19
20	0.18
21	0.16
22	0.14
23	0.18
24	0.23
25	0.22
26	0.24
27	0.27
28	0.36
29	0.41
30	0.49
31	0.53
32	0.53
33	0.58
34	0.59
35	0.58
36	0.49
37	0.54
38	0.53
39	0.51
40	0.48
41	0.44
42	0.47
43	0.43
44	0.42
45	0.31
46	0.24
47	0.23
48	0.21
49	0.2
50	0.14
51	0.13
52	0.14
53	0.14
54	0.15
55	0.12
56	0.12
57	0.12
58	0.17
59	0.21
60	0.21
61	0.24
62	0.25
63	0.24
64	0.24
65	0.27
66	0.22
67	0.19
68	0.18
69	0.15
70	0.14
71	0.13
72	0.13
73	0.12
74	0.16
75	0.17
76	0.23
77	0.27
78	0.27
79	0.29
80	0.36
81	0.42
82	0.41
83	0.41
84	0.43
85	0.43
86	0.43
87	0.41
88	0.34
89	0.27
90	0.24
91	0.22
92	0.17
93	0.12
94	0.11
95	0.11
96	0.11
97	0.11
98	0.1
99	0.11
100	0.11
101	0.16
102	0.16
103	0.17
104	0.18
105	0.17
106	0.17
107	0.16
108	0.14
109	0.09
110	0.08
111	0.08
112	0.1
113	0.09
114	0.09
115	0.14
116	0.15
117	0.2
118	0.21
119	0.24
120	0.25
121	0.28
122	0.35
123	0.38
124	0.39
125	0.33
126	0.33
127	0.31
128	0.29
129	0.3
130	0.26
131	0.19
132	0.21
133	0.21
134	0.21
135	0.2
136	0.2
137	0.17
138	0.13
139	0.13
140	0.12
141	0.11
142	0.1
143	0.09
144	0.09
145	0.08
146	0.1
147	0.1
148	0.09
149	0.09
150	0.09
151	0.1
152	0.1
153	0.11
154	0.1
155	0.1
156	0.09
157	0.09
158	0.09
159	0.08
160	0.07
161	0.06
162	0.05
163	0.05
164	0.06
165	0.06
166	0.05
167	0.05
168	0.05
169	0.05
170	0.05
171	0.05
172	0.04
173	0.04
174	0.04
175	0.04
176	0.04
177	0.04
178	0.03
179	0.03
180	0.03
181	0.03
182	0.03
183	0.04
184	0.05
185	0.06
186	0.06
187	0.06
188	0.07
189	0.08
190	0.09
191	0.08
192	0.1
193	0.1
194	0.12
195	0.13
196	0.14
197	0.13
198	0.13
199	0.13
200	0.12
201	0.11
202	0.09
203	0.08
204	0.07
205	0.07
206	0.06
207	0.06
208	0.05
209	0.05
210	0.05
211	0.05
212	0.04
213	0.05
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.08
218	0.09
219	0.11
220	0.13
221	0.17
222	0.19
223	0.2
224	0.22
225	0.23
226	0.23
227	0.22
228	0.21
229	0.17
230	0.14
231	0.13
232	0.12
233	0.09
234	0.08
235	0.07
236	0.07
237	0.07
238	0.08
239	0.09
240	0.08
241	0.08
242	0.09
243	0.09
244	0.09
245	0.1
246	0.11
247	0.1
248	0.1
249	0.1
250	0.08
251	0.09
252	0.09
253	0.11
254	0.09
255	0.09
256	0.12
257	0.14
258	0.19
259	0.19
260	0.19
261	0.19
262	0.19
263	0.2
264	0.17
265	0.15
266	0.1
267	0.09
268	0.1
269	0.08
270	0.08
271	0.08
272	0.1
273	0.1
274	0.1
275	0.1
276	0.1
277	0.12
278	0.17
279	0.19
280	0.21
281	0.24
282	0.24
283	0.24
284	0.24
285	0.24
286	0.18
287	0.16
288	0.12
289	0.11
290	0.12
291	0.12
292	0.1
293	0.13
294	0.14
295	0.14
296	0.16
297	0.15
298	0.13
299	0.14
300	0.13
301	0.11
302	0.11
303	0.12
304	0.14
305	0.19
306	0.19
307	0.18
308	0.18
309	0.17
310	0.15
311	0.14
312	0.1
313	0.05
314	0.04
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.03
321	0.03
322	0.03
323	0.04
324	0.05
325	0.1
326	0.11
327	0.18
328	0.22
329	0.25
330	0.34
331	0.39
332	0.45
333	0.51
334	0.56
335	0.57
336	0.57
337	0.55
338	0.47
339	0.41
340	0.33
341	0.23
342	0.16
343	0.09
344	0.05
345	0.03
346	0.04
347	0.03
348	0.03
349	0.04
350	0.04
351	0.05
352	0.06
353	0.07
354	0.06
355	0.08
356	0.08
357	0.1
358	0.17
359	0.2
360	0.23
361	0.29
362	0.38
363	0.45
364	0.54
365	0.63
366	0.67
367	0.69
368	0.73
369	0.75
370	0.76
371	0.76
372	0.78
373	0.77
374	0.74
375	0.72
376	0.67
377	0.65
378	0.57
379	0.51
380	0.42
381	0.33
382	0.25
383	0.26
384	0.25
385	0.19
386	0.17
387	0.15
388	0.17
389	0.15
390	0.15
391	0.09
392	0.1
393	0.1
394	0.12
395	0.12
396	0.09
397	0.1
398	0.11
399	0.12
400	0.15
401	0.16
402	0.16
403	0.19
404	0.24
405	0.3
406	0.37
407	0.38
408	0.4
409	0.44
410	0.47
411	0.54
412	0.55
413	0.49
414	0.46
415	0.44
416	0.38
417	0.36
418	0.31
419	0.22
420	0.17
421	0.16
422	0.12
423	0.13
424	0.13
425	0.1
426	0.08
427	0.09
428	0.09
429	0.11
430	0.12
431	0.13
432	0.19
433	0.2
434	0.24
435	0.26
436	0.29
437	0.37
438	0.41
439	0.42
440	0.42
441	0.49
442	0.47
443	0.45
444	0.41
445	0.35
446	0.32
447	0.31
448	0.28
449	0.23
450	0.22
451	0.26
452	0.33
453	0.36
454	0.35
455	0.38
456	0.4
457	0.44
458	0.53
459	0.56
460	0.56
461	0.56
462	0.58
463	0.55
464	0.54
465	0.51
466	0.46
467	0.39
468	0.34
469	0.31
470	0.34
471	0.37
472	0.33
473	0.34
474	0.32
475	0.33
476	0.31
477	0.3
478	0.25
479	0.22
480	0.22
481	0.24
482	0.22
483	0.27
484	0.27
485	0.26
486	0.27
487	0.25
488	0.25
489	0.22
490	0.23
491	0.22
492	0.23
493	0.27
494	0.27
495	0.31
496	0.31
497	0.3
498	0.3
499	0.29
500	0.32
501	0.32
502	0.33
503	0.31
504	0.36
505	0.41
506	0.44
507	0.48
508	0.5
509	0.51
510	0.57
511	0.57
512	0.59
513	0.6
514	0.63
515	0.64
516	0.63
517	0.63
518	0.58
519	0.56
520	0.48
521	0.44
522	0.39
523	0.35
524	0.31
525	0.31
526	0.32
527	0.33
528	0.4
529	0.43
530	0.44
531	0.41
532	0.42
533	0.39
534	0.44
535	0.49
536	0.43
537	0.47
538	0.52
539	0.52
540	0.51
541	0.49
542	0.46
543	0.41
544	0.46
545	0.4
546	0.38
547	0.39
548	0.39
549	0.43
550	0.43
551	0.42
552	0.38
553	0.41
554	0.43
555	0.47
556	0.51
557	0.47
558	0.45
559	0.44
560	0.4
561	0.35
562	0.27
563	0.24
564	0.18
565	0.18
566	0.2
567	0.23
568	0.34
569	0.44
570	0.51
571	0.55
572	0.65
573	0.72
574	0.76
575	0.83
576	0.83
577	0.83
578	0.85
579	0.88
580	0.88
581	0.9
582	0.89
583	0.87
584	0.86
585	0.86
586	0.8
587	0.79
588	0.75
589	0.74
590	0.74
591	0.71
592	0.62
593	0.59
594	0.63
595	0.61
596	0.56
597	0.54
598	0.54
599	0.58

Q0CY48

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer