Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0CHN2

Protein Details
Accession Q0CHN2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
224-249RVQEALKNRPARKKKGKVAELVREKVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
230-241KNRPARKKKGKV
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12, cyto 7.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001737  KsgA/Erm  
IPR020598  rRNA_Ade_methylase_Trfase_N  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
Gene Ontology GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000179  F:rRNA (adenine-N6,N6-)-dimethyltransferase activity  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF00398  RrnaAD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51689  SAM_RNA_A_N6_MT  
Amino Acid Sequences MAAEVTKRVQGTPAQKRLDVILGDFMKTELPYFDVCISNTPYQISSPLTFKLLATTPAPRVCILMFQREFALRLFAKPGDKLYSRLSVNAQMWAKIDHIMKVGKNNFKPPPLVDSSVVRLVPKNPRPQINYEEWDGLLRICFVRKNKTIRSSFLGKHTVMDLLEANYRTWCAQNDIPVEDGPADDDTEMDTGNAQDDEDMEPEDDMDMDEDDVPDFFKEQANARVQEALKNRPARKKKGKVAELVREKVRQVLEDDTGLADKRARMCDENDFLKLLWAFNQKGFHFN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.51
3 0.52
4 0.51
5 0.49
6 0.39
7 0.3
8 0.29
9 0.26
10 0.26
11 0.25
12 0.22
13 0.19
14 0.18
15 0.17
16 0.09
17 0.11
18 0.11
19 0.13
20 0.16
21 0.16
22 0.17
23 0.2
24 0.25
25 0.25
26 0.25
27 0.24
28 0.22
29 0.2
30 0.23
31 0.22
32 0.19
33 0.19
34 0.2
35 0.2
36 0.2
37 0.19
38 0.2
39 0.18
40 0.18
41 0.18
42 0.21
43 0.24
44 0.25
45 0.27
46 0.23
47 0.23
48 0.21
49 0.26
50 0.25
51 0.29
52 0.28
53 0.27
54 0.29
55 0.28
56 0.29
57 0.22
58 0.26
59 0.16
60 0.17
61 0.19
62 0.19
63 0.21
64 0.21
65 0.23
66 0.23
67 0.24
68 0.26
69 0.27
70 0.3
71 0.29
72 0.3
73 0.29
74 0.29
75 0.28
76 0.32
77 0.28
78 0.23
79 0.23
80 0.23
81 0.21
82 0.19
83 0.19
84 0.14
85 0.16
86 0.18
87 0.18
88 0.24
89 0.3
90 0.33
91 0.35
92 0.41
93 0.41
94 0.41
95 0.42
96 0.36
97 0.35
98 0.32
99 0.33
100 0.27
101 0.26
102 0.26
103 0.27
104 0.26
105 0.2
106 0.17
107 0.19
108 0.27
109 0.31
110 0.37
111 0.38
112 0.44
113 0.47
114 0.5
115 0.51
116 0.48
117 0.44
118 0.37
119 0.34
120 0.28
121 0.25
122 0.21
123 0.15
124 0.09
125 0.07
126 0.06
127 0.06
128 0.09
129 0.11
130 0.18
131 0.24
132 0.31
133 0.36
134 0.44
135 0.46
136 0.46
137 0.48
138 0.47
139 0.43
140 0.42
141 0.41
142 0.32
143 0.3
144 0.27
145 0.24
146 0.18
147 0.16
148 0.11
149 0.08
150 0.11
151 0.11
152 0.1
153 0.09
154 0.1
155 0.1
156 0.11
157 0.1
158 0.12
159 0.13
160 0.18
161 0.2
162 0.2
163 0.21
164 0.19
165 0.19
166 0.15
167 0.13
168 0.09
169 0.08
170 0.07
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.06
180 0.06
181 0.05
182 0.04
183 0.06
184 0.07
185 0.07
186 0.08
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.06
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.07
204 0.08
205 0.1
206 0.13
207 0.21
208 0.26
209 0.27
210 0.27
211 0.33
212 0.31
213 0.36
214 0.37
215 0.37
216 0.39
217 0.46
218 0.51
219 0.56
220 0.65
221 0.69
222 0.76
223 0.8
224 0.82
225 0.84
226 0.85
227 0.84
228 0.84
229 0.84
230 0.82
231 0.77
232 0.72
233 0.64
234 0.58
235 0.53
236 0.45
237 0.36
238 0.31
239 0.29
240 0.26
241 0.24
242 0.24
243 0.2
244 0.2
245 0.18
246 0.16
247 0.14
248 0.15
249 0.2
250 0.24
251 0.27
252 0.29
253 0.32
254 0.4
255 0.44
256 0.45
257 0.41
258 0.38
259 0.34
260 0.36
261 0.33
262 0.25
263 0.25
264 0.28
265 0.28
266 0.31
267 0.38