FuNGI

Q0CVF7

Protein Details

Accession

Q0CVF7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
71-90	PKPTLKYKPRAVGRRSKEER	Basic
305-325	GFLPKQKVKVRRKLSREPASS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
70-138	APKPTLKYKPRAVGRRSKEEREAIEKLEAERHRERLAEAAAIQRGRGGHRGRGGGRGRGDGARRGRGGF

Subcellular Location(s)

mito 22, nucl 3.5, cyto_nucl 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPKAPPRRGAASSAGAGTSRPPATQTPTPAPTGTRAPVQRLQTLKKRTPSGSIGPSAARATPAGPSGDAPKPTLKYKPRAVGRRSKEEREAIEKLEAERHRERLAEAAAIQRGRGGHRGRGGGRGRGDGARRGRGGFAARFADSRASSMSRRSRSVIDLGSRGVSRDVSSDESDTEVRISIDQINLDSDDDETPADGKKGKMAVKSEGRAGAGGGERGLRPVRVERHEHEERVVSVNMESSSSKSAELREQAKAKAKEADNALFVPAEGAEPRVKEEPEDDEDRVMTDVAAHEEGEGEAGGDDGFLPKQKVKVRRKLSREPASSPVEPEPQPEETPAVLDPKSLLRTKEDVEEYERHDKDLELMRELLSREKEEAGKAKEVSAAGEQPEAAAAEGAETAAADGEKKDGEDAEDEAAKDKLAGHLFLVQFPPITPSLVVPDGENPAVEGAADATAPAPGDATDPAIKREEDVELLDDADDAAGGQKTSQIVTATDRQLRAGRVGKLNVHASGRVTMDWGGISFELDRATEVDFLQEALIVSAAPDAAEPEEENKVWAMGQLSGKFTVTPNWEEML

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.42
2	0.35
3	0.27
4	0.24
5	0.21
6	0.22
7	0.18
8	0.16
9	0.18
10	0.22
11	0.29
12	0.35
13	0.4
14	0.42
15	0.44
16	0.47
17	0.45
18	0.43
19	0.4
20	0.4
21	0.35
22	0.35
23	0.35
24	0.39
25	0.44
26	0.46
27	0.49
28	0.5
29	0.56
30	0.58
31	0.64
32	0.65
33	0.67
34	0.7
35	0.65
36	0.65
37	0.63
38	0.62
39	0.59
40	0.54
41	0.49
42	0.43
43	0.42
44	0.37
45	0.31
46	0.24
47	0.17
48	0.15
49	0.15
50	0.16
51	0.15
52	0.14
53	0.15
54	0.19
55	0.24
56	0.25
57	0.25
58	0.29
59	0.31
60	0.35
61	0.43
62	0.46
63	0.49
64	0.56
65	0.63
66	0.67
67	0.73
68	0.77
69	0.78
70	0.78
71	0.81
72	0.79
73	0.76
74	0.74
75	0.7
76	0.68
77	0.65
78	0.6
79	0.51
80	0.48
81	0.43
82	0.37
83	0.39
84	0.36
85	0.36
86	0.37
87	0.38
88	0.36
89	0.35
90	0.34
91	0.31
92	0.31
93	0.26
94	0.22
95	0.23
96	0.25
97	0.24
98	0.23
99	0.2
100	0.19
101	0.2
102	0.26
103	0.25
104	0.26
105	0.31
106	0.38
107	0.37
108	0.45
109	0.46
110	0.45
111	0.44
112	0.41
113	0.38
114	0.36
115	0.38
116	0.36
117	0.38
118	0.38
119	0.37
120	0.36
121	0.34
122	0.33
123	0.35
124	0.29
125	0.28
126	0.24
127	0.24
128	0.23
129	0.23
130	0.24
131	0.19
132	0.19
133	0.18
134	0.18
135	0.18
136	0.26
137	0.34
138	0.34
139	0.36
140	0.38
141	0.38
142	0.38
143	0.41
144	0.37
145	0.32
146	0.3
147	0.28
148	0.28
149	0.25
150	0.22
151	0.18
152	0.14
153	0.11
154	0.11
155	0.13
156	0.14
157	0.15
158	0.15
159	0.15
160	0.16
161	0.16
162	0.15
163	0.13
164	0.1
165	0.09
166	0.09
167	0.1
168	0.1
169	0.1
170	0.1
171	0.1
172	0.11
173	0.11
174	0.11
175	0.1
176	0.09
177	0.08
178	0.08
179	0.08
180	0.07
181	0.07
182	0.07
183	0.08
184	0.09
185	0.09
186	0.12
187	0.17
188	0.2
189	0.23
190	0.26
191	0.32
192	0.37
193	0.38
194	0.37
195	0.34
196	0.31
197	0.26
198	0.23
199	0.18
200	0.13
201	0.11
202	0.09
203	0.09
204	0.08
205	0.1
206	0.11
207	0.09
208	0.1
209	0.15
210	0.21
211	0.25
212	0.3
213	0.31
214	0.39
215	0.43
216	0.42
217	0.38
218	0.33
219	0.3
220	0.28
221	0.25
222	0.17
223	0.13
224	0.14
225	0.13
226	0.12
227	0.11
228	0.09
229	0.11
230	0.11
231	0.11
232	0.1
233	0.12
234	0.14
235	0.19
236	0.21
237	0.23
238	0.25
239	0.28
240	0.36
241	0.36
242	0.34
243	0.36
244	0.34
245	0.33
246	0.34
247	0.32
248	0.25
249	0.24
250	0.22
251	0.15
252	0.14
253	0.1
254	0.07
255	0.06
256	0.04
257	0.06
258	0.06
259	0.07
260	0.09
261	0.11
262	0.11
263	0.11
264	0.12
265	0.14
266	0.17
267	0.2
268	0.19
269	0.17
270	0.17
271	0.17
272	0.16
273	0.12
274	0.07
275	0.05
276	0.05
277	0.06
278	0.06
279	0.05
280	0.05
281	0.05
282	0.05
283	0.05
284	0.04
285	0.03
286	0.03
287	0.03
288	0.03
289	0.03
290	0.03
291	0.03
292	0.03
293	0.04
294	0.06
295	0.07
296	0.12
297	0.18
298	0.29
299	0.38
300	0.48
301	0.57
302	0.65
303	0.72
304	0.76
305	0.81
306	0.81
307	0.76
308	0.7
309	0.66
310	0.63
311	0.55
312	0.47
313	0.39
314	0.34
315	0.29
316	0.28
317	0.24
318	0.21
319	0.21
320	0.19
321	0.18
322	0.13
323	0.14
324	0.13
325	0.13
326	0.1
327	0.1
328	0.1
329	0.11
330	0.15
331	0.16
332	0.17
333	0.17
334	0.2
335	0.21
336	0.26
337	0.25
338	0.23
339	0.26
340	0.28
341	0.29
342	0.36
343	0.34
344	0.3
345	0.29
346	0.27
347	0.27
348	0.32
349	0.28
350	0.21
351	0.21
352	0.21
353	0.23
354	0.23
355	0.23
356	0.17
357	0.17
358	0.16
359	0.18
360	0.19
361	0.19
362	0.25
363	0.25
364	0.27
365	0.26
366	0.25
367	0.25
368	0.24
369	0.23
370	0.18
371	0.17
372	0.13
373	0.13
374	0.12
375	0.1
376	0.1
377	0.08
378	0.06
379	0.05
380	0.04
381	0.04
382	0.04
383	0.04
384	0.03
385	0.03
386	0.03
387	0.03
388	0.03
389	0.03
390	0.04
391	0.05
392	0.05
393	0.06
394	0.06
395	0.06
396	0.07
397	0.09
398	0.1
399	0.11
400	0.12
401	0.12
402	0.13
403	0.13
404	0.11
405	0.1
406	0.1
407	0.12
408	0.12
409	0.12
410	0.12
411	0.17
412	0.18
413	0.19
414	0.2
415	0.16
416	0.15
417	0.14
418	0.16
419	0.11
420	0.12
421	0.1
422	0.1
423	0.14
424	0.15
425	0.15
426	0.13
427	0.15
428	0.16
429	0.16
430	0.15
431	0.11
432	0.1
433	0.1
434	0.09
435	0.06
436	0.04
437	0.05
438	0.04
439	0.04
440	0.04
441	0.05
442	0.05
443	0.05
444	0.04
445	0.04
446	0.06
447	0.06
448	0.1
449	0.14
450	0.15
451	0.17
452	0.2
453	0.19
454	0.19
455	0.2
456	0.19
457	0.16
458	0.17
459	0.16
460	0.14
461	0.14
462	0.13
463	0.11
464	0.09
465	0.08
466	0.06
467	0.04
468	0.05
469	0.06
470	0.06
471	0.06
472	0.08
473	0.09
474	0.1
475	0.12
476	0.11
477	0.12
478	0.17
479	0.24
480	0.28
481	0.32
482	0.32
483	0.33
484	0.36
485	0.36
486	0.38
487	0.37
488	0.38
489	0.39
490	0.43
491	0.43
492	0.45
493	0.46
494	0.43
495	0.38
496	0.34
497	0.29
498	0.29
499	0.27
500	0.21
501	0.2
502	0.17
503	0.16
504	0.14
505	0.13
506	0.11
507	0.1
508	0.1
509	0.09
510	0.1
511	0.1
512	0.1
513	0.1
514	0.09
515	0.11
516	0.12
517	0.11
518	0.12
519	0.11
520	0.12
521	0.11
522	0.11
523	0.1
524	0.08
525	0.08
526	0.06
527	0.06
528	0.06
529	0.06
530	0.05
531	0.05
532	0.06
533	0.07
534	0.08
535	0.09
536	0.11
537	0.16
538	0.16
539	0.17
540	0.16
541	0.15
542	0.14
543	0.16
544	0.14
545	0.15
546	0.21
547	0.23
548	0.26
549	0.27
550	0.27
551	0.26
552	0.25
553	0.27
554	0.26
555	0.27

Q0CVF7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer