Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0CHI5

Protein Details
Accession Q0CHI5    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
158-184DSGRDRRRDRTPPRRGRSPSPRRGRDYBasic
212-236RRDRDYERRDRDRSRDRSRSPDEREBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
161-183RDRRRDRTPPRRGRSPSPRRGRD
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
Amino Acid Sequences MELEPAILPTNSNGTCRSSIALRYRAQDASLVPPVFASHSSVKPRNVDVGVILICQMDPDPIAPPLTGVLSDVTSRHRVPPPADLARHCDLIRFRFAFVEYESRRDADDAYHEMHNKRIGRDDLLKIEVRIIRLLRVNRVLTTYQWARTPPSASWRFDSGRDRRRDRTPPRRGRSPSPRRGRDYSPRRDDRYERDYDRHDRDYERRDRDYDRRDRDYERRDRDRSRDRSRSPDERERDIKDDRPRDDERERRDDERENGPNGEERKDSMTSAHDELDTAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.25
3 0.26
4 0.27
5 0.23
6 0.3
7 0.36
8 0.41
9 0.4
10 0.41
11 0.44
12 0.43
13 0.4
14 0.35
15 0.29
16 0.28
17 0.32
18 0.29
19 0.25
20 0.24
21 0.24
22 0.23
23 0.21
24 0.2
25 0.17
26 0.23
27 0.32
28 0.37
29 0.41
30 0.42
31 0.44
32 0.44
33 0.4
34 0.35
35 0.27
36 0.26
37 0.22
38 0.18
39 0.17
40 0.11
41 0.1
42 0.1
43 0.09
44 0.05
45 0.05
46 0.06
47 0.08
48 0.08
49 0.1
50 0.09
51 0.09
52 0.09
53 0.1
54 0.09
55 0.08
56 0.07
57 0.07
58 0.08
59 0.09
60 0.12
61 0.15
62 0.16
63 0.21
64 0.25
65 0.28
66 0.29
67 0.35
68 0.4
69 0.42
70 0.44
71 0.41
72 0.42
73 0.41
74 0.42
75 0.35
76 0.31
77 0.28
78 0.27
79 0.32
80 0.27
81 0.25
82 0.23
83 0.24
84 0.22
85 0.21
86 0.27
87 0.22
88 0.24
89 0.24
90 0.23
91 0.23
92 0.22
93 0.2
94 0.12
95 0.14
96 0.13
97 0.15
98 0.17
99 0.19
100 0.19
101 0.21
102 0.25
103 0.24
104 0.22
105 0.25
106 0.24
107 0.26
108 0.3
109 0.3
110 0.28
111 0.29
112 0.28
113 0.23
114 0.25
115 0.23
116 0.18
117 0.18
118 0.15
119 0.14
120 0.18
121 0.19
122 0.19
123 0.22
124 0.22
125 0.2
126 0.22
127 0.2
128 0.17
129 0.21
130 0.2
131 0.17
132 0.18
133 0.18
134 0.18
135 0.19
136 0.21
137 0.16
138 0.24
139 0.28
140 0.28
141 0.29
142 0.31
143 0.31
144 0.33
145 0.4
146 0.4
147 0.44
148 0.5
149 0.53
150 0.54
151 0.61
152 0.67
153 0.7
154 0.72
155 0.74
156 0.77
157 0.79
158 0.84
159 0.81
160 0.81
161 0.81
162 0.81
163 0.8
164 0.8
165 0.8
166 0.77
167 0.77
168 0.74
169 0.74
170 0.73
171 0.74
172 0.73
173 0.73
174 0.72
175 0.73
176 0.7
177 0.67
178 0.64
179 0.62
180 0.56
181 0.53
182 0.54
183 0.56
184 0.57
185 0.54
186 0.49
187 0.47
188 0.5
189 0.55
190 0.58
191 0.57
192 0.54
193 0.53
194 0.57
195 0.62
196 0.64
197 0.65
198 0.64
199 0.64
200 0.64
201 0.67
202 0.7
203 0.71
204 0.71
205 0.71
206 0.72
207 0.72
208 0.76
209 0.79
210 0.8
211 0.8
212 0.8
213 0.81
214 0.77
215 0.8
216 0.81
217 0.81
218 0.79
219 0.79
220 0.74
221 0.72
222 0.73
223 0.69
224 0.66
225 0.61
226 0.6
227 0.6
228 0.63
229 0.58
230 0.59
231 0.58
232 0.6
233 0.65
234 0.65
235 0.64
236 0.65
237 0.66
238 0.63
239 0.64
240 0.64
241 0.59
242 0.61
243 0.59
244 0.53
245 0.49
246 0.47
247 0.47
248 0.42
249 0.41
250 0.32
251 0.28
252 0.29
253 0.3
254 0.28
255 0.25
256 0.26
257 0.27
258 0.28
259 0.28
260 0.23