Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0CMH1

Protein Details
Accession Q0CMH1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
237-256GGPSGGASEKKKKDKKKGKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
244-256SEKKKKDKKKGKA
Subcellular Location(s) nucl 9, mito 9, mito_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002778  Signal_recog_particle_SRP19  
IPR036521  SRP19-like_sf  
Gene Ontology GO:0005786  C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting  
GO:0008312  F:7S RNA binding  
GO:0006617  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane, signal sequence recognition  
Pfam View protein in Pfam  
PF01922  SRP19  
Amino Acid Sequences MSRNAQVEEVSDSDPEEVAPSDLNPSILSAAGIPTSSTTSMPMRPAPEPRREIPKYYQCLYPVYFDKSRSRAEGRKVGAELAVENPLARDILDATQMLGLTAGFEPEKLHPKDWANPGRVRVMLKNENGQSVNPKIKNKHHLYILVAQYLKAHPTTEQSPYRLRIQGLPMPEKLPPAPSAPRGWKIGQILPIHSPAYSGGGVSDNPLKDAMAEMQNMGGMPGMPQIPGMPDMSAMMGGPSGGASEKKKKDKKKGKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.13
3 0.11
4 0.1
5 0.09
6 0.1
7 0.09
8 0.12
9 0.12
10 0.13
11 0.11
12 0.11
13 0.11
14 0.11
15 0.11
16 0.08
17 0.08
18 0.08
19 0.08
20 0.07
21 0.07
22 0.09
23 0.1
24 0.1
25 0.12
26 0.15
27 0.17
28 0.2
29 0.23
30 0.24
31 0.27
32 0.37
33 0.4
34 0.46
35 0.49
36 0.5
37 0.57
38 0.57
39 0.59
40 0.58
41 0.62
42 0.59
43 0.56
44 0.56
45 0.47
46 0.48
47 0.43
48 0.39
49 0.33
50 0.33
51 0.33
52 0.34
53 0.38
54 0.39
55 0.4
56 0.4
57 0.43
58 0.43
59 0.47
60 0.51
61 0.47
62 0.47
63 0.45
64 0.4
65 0.34
66 0.28
67 0.21
68 0.15
69 0.14
70 0.09
71 0.09
72 0.08
73 0.08
74 0.07
75 0.06
76 0.05
77 0.05
78 0.06
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.06
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.04
91 0.05
92 0.06
93 0.09
94 0.17
95 0.17
96 0.18
97 0.22
98 0.25
99 0.31
100 0.39
101 0.43
102 0.39
103 0.4
104 0.42
105 0.4
106 0.39
107 0.34
108 0.28
109 0.28
110 0.29
111 0.28
112 0.31
113 0.29
114 0.29
115 0.28
116 0.26
117 0.22
118 0.21
119 0.26
120 0.25
121 0.28
122 0.31
123 0.37
124 0.46
125 0.48
126 0.48
127 0.45
128 0.43
129 0.43
130 0.45
131 0.4
132 0.34
133 0.28
134 0.24
135 0.22
136 0.2
137 0.18
138 0.12
139 0.1
140 0.08
141 0.11
142 0.14
143 0.2
144 0.22
145 0.24
146 0.28
147 0.31
148 0.34
149 0.33
150 0.32
151 0.28
152 0.3
153 0.3
154 0.32
155 0.32
156 0.29
157 0.27
158 0.27
159 0.26
160 0.21
161 0.2
162 0.17
163 0.18
164 0.21
165 0.22
166 0.28
167 0.31
168 0.34
169 0.36
170 0.35
171 0.35
172 0.35
173 0.36
174 0.36
175 0.33
176 0.31
177 0.29
178 0.31
179 0.27
180 0.23
181 0.2
182 0.14
183 0.15
184 0.13
185 0.11
186 0.09
187 0.1
188 0.1
189 0.12
190 0.16
191 0.13
192 0.13
193 0.14
194 0.13
195 0.12
196 0.13
197 0.15
198 0.13
199 0.14
200 0.13
201 0.13
202 0.14
203 0.13
204 0.12
205 0.08
206 0.05
207 0.05
208 0.08
209 0.08
210 0.07
211 0.08
212 0.08
213 0.09
214 0.11
215 0.12
216 0.09
217 0.09
218 0.1
219 0.1
220 0.1
221 0.08
222 0.07
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.04
227 0.04
228 0.06
229 0.1
230 0.15
231 0.25
232 0.35
233 0.46
234 0.56
235 0.65
236 0.75