FuNGI

Q0CH88

Protein Details

Accession

Q0CH88

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1010-1050	SAWPDLPVPKRKKGQNIPSWKKHADKKKLRQATKKHAAAQL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
969-990	IPRSLRLGDKHGEGKKERLARR
1018-1044	PKRKKGQNIPSWKKHADKKKLRQATKK

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 9, nucl 8.5, cyto 8.5, pero 6, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR028241 RAVE2/Rogdi IPR015324 Ribosomal_Rsm22-like
Gene Ontology	GO:0005739 C:mitochondrion GO:0008168 F:methyltransferase activity GO:0032259 P:methylation GO:0006412 P:translation
Pfam	View protein in Pfam PF10259 Rogdi_lz PF09243 Rsm22

Amino Acid Sequences

MATWAYPPLPAEHLDREADSALARELEWLLRSLQDSLTSLREGLRECAVLLAPKEPGSTLVLSSLRSEHVKGFVTRVGTKIVKGDIQLRLNSLASPRGSGNTRLCLSSSPTAPELVLHQLVSVRNLVNQSLDIVDVSAWTGDPLNANFIFSQLHLLHETISEARQLLKGENDNTRGKWWDTSAEEEMFDPPLPPYLSFQLLIADSALVLYLRTLESATPTHTPTAFATDISLTGFNLRDRLFGTRHRAHDEAGDVFTWKGEEVKHQETGRWKLGRRYASSASSETADKHADRKDAIYGVIDKINENEVELAELMDELNLLDDYHGAINFDGPDYDDAVSQTIGQRDHQMLEARVRMARQQFGDVLPDGYLNATETELYTQLYGEPIIRHEEPEGALNIEETESDTLLREDGKGGWEEVQYERFESDAEVPLVYDMEVGPLEDESAAMQRTREVAEQLGGEVMLEQFEDEANPDSTPRLHPLTVEGKFSTDPSTVFLPKDTVTGPISVILSDYSNKHIADVAHRVFGGTRVPYSTTTPPPRAQMPQLPIPLEASQRHMSEMEANAYIATLYPGMYASVLSVLTEVRKRLGSDWIRQLLTQEGGPHVLDASAGGAGVLAWRDVLRAEWELMVPDHPQSSPYPVGRSTVVTGSETLRLRASLMLENTSFLPRLPDYVHIREKPTLDDQRAPPKRKQYDVIIAPHSLLGIEEEYMRKEHVENLWNLLNPNGGVLILLEKGHQKGFEAIAGARDMLLKRHISSPGSVQYEDFLQSPGGGKYVNKEAGMIIAPCTNHEKCPMFNVAGHSKGRKDYCHFEQRYIRPPFLQRILGIKDRNHEDVKFSYVAVQRGVDRREKDGIVQGAAATDAAFVGYEHLHDSPAEQSEATEEPTSTTAEGSERPSAEGAEQFHALTLPRIVYPPMKRRGHVIFDLCTSAGKIERWTVPRSYSRRAFKDARKAQWGDLWALGAKTRIPRSLRLGDKHGEGKKERLARRAVERAEMNETEEMQLEEAGSAWPDLPVPKRKKGQNIPSWKKHADKKKLRQATKKHAAAQLAHDDSLA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.29
3	0.28
4	0.26
5	0.24
6	0.2
7	0.16
8	0.13
9	0.12
10	0.11
11	0.11
12	0.12
13	0.13
14	0.14
15	0.14
16	0.14
17	0.16
18	0.17
19	0.17
20	0.17
21	0.18
22	0.19
23	0.2
24	0.22
25	0.21
26	0.2
27	0.2
28	0.22
29	0.22
30	0.23
31	0.23
32	0.2
33	0.2
34	0.21
35	0.2
36	0.21
37	0.2
38	0.19
39	0.18
40	0.19
41	0.19
42	0.17
43	0.17
44	0.17
45	0.17
46	0.15
47	0.19
48	0.19
49	0.19
50	0.21
51	0.21
52	0.2
53	0.21
54	0.23
55	0.2
56	0.24
57	0.27
58	0.27
59	0.29
60	0.29
61	0.32
62	0.32
63	0.31
64	0.33
65	0.3
66	0.3
67	0.3
68	0.3
69	0.27
70	0.27
71	0.32
72	0.33
73	0.37
74	0.37
75	0.35
76	0.35
77	0.33
78	0.32
79	0.28
80	0.26
81	0.21
82	0.22
83	0.21
84	0.23
85	0.26
86	0.31
87	0.33
88	0.35
89	0.36
90	0.35
91	0.35
92	0.32
93	0.35
94	0.34
95	0.32
96	0.28
97	0.28
98	0.27
99	0.26
100	0.25
101	0.22
102	0.21
103	0.2
104	0.16
105	0.15
106	0.18
107	0.19
108	0.2
109	0.2
110	0.15
111	0.17
112	0.18
113	0.18
114	0.16
115	0.16
116	0.15
117	0.13
118	0.13
119	0.1
120	0.09
121	0.08
122	0.07
123	0.07
124	0.06
125	0.05
126	0.06
127	0.06
128	0.07
129	0.1
130	0.1
131	0.15
132	0.14
133	0.16
134	0.15
135	0.15
136	0.15
137	0.13
138	0.18
139	0.13
140	0.16
141	0.16
142	0.16
143	0.16
144	0.15
145	0.17
146	0.13
147	0.13
148	0.12
149	0.11
150	0.12
151	0.14
152	0.15
153	0.15
154	0.19
155	0.24
156	0.27
157	0.33
158	0.37
159	0.38
160	0.39
161	0.4
162	0.38
163	0.35
164	0.33
165	0.29
166	0.3
167	0.29
168	0.33
169	0.34
170	0.31
171	0.3
172	0.28
173	0.26
174	0.22
175	0.19
176	0.14
177	0.1
178	0.14
179	0.14
180	0.14
181	0.16
182	0.18
183	0.2
184	0.2
185	0.19
186	0.17
187	0.17
188	0.16
189	0.13
190	0.1
191	0.07
192	0.07
193	0.07
194	0.04
195	0.04
196	0.03
197	0.04
198	0.05
199	0.05
200	0.06
201	0.06
202	0.09
203	0.1
204	0.14
205	0.15
206	0.16
207	0.18
208	0.18
209	0.2
210	0.18
211	0.23
212	0.2
213	0.17
214	0.17
215	0.15
216	0.15
217	0.15
218	0.14
219	0.08
220	0.1
221	0.11
222	0.11
223	0.14
224	0.14
225	0.14
226	0.15
227	0.19
228	0.21
229	0.26
230	0.35
231	0.38
232	0.42
233	0.46
234	0.45
235	0.42
236	0.42
237	0.38
238	0.31
239	0.25
240	0.21
241	0.17
242	0.16
243	0.15
244	0.12
245	0.09
246	0.08
247	0.08
248	0.15
249	0.21
250	0.24
251	0.3
252	0.3
253	0.34
254	0.4
255	0.46
256	0.47
257	0.46
258	0.45
259	0.46
260	0.53
261	0.56
262	0.53
263	0.53
264	0.49
265	0.48
266	0.49
267	0.43
268	0.37
269	0.32
270	0.28
271	0.22
272	0.2
273	0.19
274	0.17
275	0.2
276	0.22
277	0.23
278	0.23
279	0.24
280	0.24
281	0.22
282	0.22
283	0.2
284	0.18
285	0.17
286	0.19
287	0.18
288	0.14
289	0.14
290	0.16
291	0.13
292	0.12
293	0.11
294	0.09
295	0.09
296	0.09
297	0.08
298	0.06
299	0.06
300	0.05
301	0.04
302	0.04
303	0.03
304	0.04
305	0.04
306	0.04
307	0.04
308	0.04
309	0.05
310	0.06
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.07
315	0.07
316	0.07
317	0.06
318	0.06
319	0.07
320	0.08
321	0.09
322	0.08
323	0.08
324	0.09
325	0.09
326	0.09
327	0.11
328	0.12
329	0.12
330	0.12
331	0.15
332	0.16
333	0.16
334	0.19
335	0.2
336	0.19
337	0.22
338	0.23
339	0.21
340	0.21
341	0.2
342	0.22
343	0.22
344	0.24
345	0.21
346	0.21
347	0.21
348	0.21
349	0.23
350	0.19
351	0.16
352	0.13
353	0.12
354	0.09
355	0.08
356	0.07
357	0.06
358	0.06
359	0.05
360	0.05
361	0.05
362	0.06
363	0.07
364	0.07
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.07
371	0.07
372	0.08
373	0.12
374	0.12
375	0.13
376	0.13
377	0.14
378	0.13
379	0.15
380	0.14
381	0.1
382	0.1
383	0.09
384	0.09
385	0.07
386	0.07
387	0.06
388	0.06
389	0.05
390	0.06
391	0.06
392	0.06
393	0.06
394	0.07
395	0.06
396	0.06
397	0.07
398	0.08
399	0.08
400	0.09
401	0.1
402	0.1
403	0.12
404	0.12
405	0.14
406	0.13
407	0.13
408	0.12
409	0.11
410	0.11
411	0.1
412	0.11
413	0.11
414	0.11
415	0.1
416	0.1
417	0.1
418	0.1
419	0.09
420	0.07
421	0.04
422	0.04
423	0.04
424	0.04
425	0.04
426	0.04
427	0.04
428	0.04
429	0.04
430	0.03
431	0.05
432	0.05
433	0.05
434	0.06
435	0.06
436	0.08
437	0.09
438	0.09
439	0.09
440	0.09
441	0.1
442	0.1
443	0.1
444	0.08
445	0.07
446	0.06
447	0.05
448	0.04
449	0.03
450	0.03
451	0.03
452	0.03
453	0.03
454	0.03
455	0.04
456	0.06
457	0.07
458	0.07
459	0.07
460	0.08
461	0.09
462	0.1
463	0.12
464	0.13
465	0.12
466	0.12
467	0.17
468	0.24
469	0.24
470	0.25
471	0.22
472	0.2
473	0.21
474	0.21
475	0.19
476	0.12
477	0.11
478	0.11
479	0.14
480	0.14
481	0.14
482	0.14
483	0.13
484	0.12
485	0.13
486	0.12
487	0.11
488	0.11
489	0.11
490	0.11
491	0.1
492	0.1
493	0.09
494	0.09
495	0.07
496	0.06
497	0.07
498	0.08
499	0.09
500	0.11
501	0.11
502	0.11
503	0.13
504	0.13
505	0.15
506	0.2
507	0.18
508	0.17
509	0.17
510	0.17
511	0.15
512	0.15
513	0.14
514	0.08
515	0.08
516	0.08
517	0.09
518	0.11
519	0.14
520	0.17
521	0.22
522	0.26
523	0.3
524	0.31
525	0.31
526	0.33
527	0.32
528	0.31
529	0.29
530	0.28
531	0.3
532	0.31
533	0.29
534	0.27
535	0.26
536	0.24
537	0.21
538	0.18
539	0.18
540	0.18
541	0.18
542	0.18
543	0.17
544	0.16
545	0.16
546	0.16
547	0.13
548	0.11
549	0.1
550	0.09
551	0.09
552	0.08
553	0.06
554	0.05
555	0.03
556	0.03
557	0.03
558	0.04
559	0.04
560	0.04
561	0.04
562	0.04
563	0.04
564	0.04
565	0.04
566	0.04
567	0.04
568	0.06
569	0.08
570	0.08
571	0.09
572	0.1
573	0.11
574	0.12
575	0.21
576	0.24
577	0.28
578	0.34
579	0.37
580	0.36
581	0.36
582	0.35
583	0.28
584	0.24
585	0.19
586	0.13
587	0.09
588	0.1
589	0.1
590	0.09
591	0.07
592	0.06
593	0.05
594	0.04
595	0.04
596	0.03
597	0.03
598	0.03
599	0.03
600	0.02
601	0.03
602	0.03
603	0.02
604	0.03
605	0.03
606	0.03
607	0.04
608	0.04
609	0.06
610	0.07
611	0.08
612	0.08
613	0.08
614	0.09
615	0.09
616	0.1
617	0.08
618	0.08
619	0.08
620	0.08
621	0.09
622	0.09
623	0.13
624	0.17
625	0.17
626	0.19
627	0.18
628	0.2
629	0.2
630	0.2
631	0.17
632	0.15
633	0.15
634	0.13
635	0.14
636	0.13
637	0.18
638	0.17
639	0.16
640	0.14
641	0.14
642	0.14
643	0.14
644	0.15
645	0.13
646	0.13
647	0.14
648	0.14
649	0.15
650	0.15
651	0.15
652	0.13
653	0.1
654	0.11
655	0.09
656	0.11
657	0.12
658	0.17
659	0.22
660	0.29
661	0.36
662	0.35
663	0.38
664	0.4
665	0.39
666	0.36
667	0.39
668	0.38
669	0.35
670	0.39
671	0.4
672	0.48
673	0.56
674	0.57
675	0.54
676	0.58
677	0.6
678	0.58
679	0.58
680	0.53
681	0.54
682	0.55
683	0.55
684	0.47
685	0.42
686	0.38
687	0.34
688	0.27
689	0.17
690	0.12
691	0.07
692	0.05
693	0.05
694	0.06
695	0.07
696	0.08
697	0.09
698	0.09
699	0.09
700	0.09
701	0.13
702	0.17
703	0.22
704	0.22
705	0.25
706	0.27
707	0.27
708	0.27
709	0.23
710	0.19
711	0.13
712	0.12
713	0.08
714	0.06
715	0.05
716	0.05
717	0.05
718	0.05
719	0.06
720	0.06
721	0.08
722	0.1
723	0.11
724	0.1
725	0.1
726	0.12
727	0.13
728	0.13
729	0.13
730	0.12
731	0.13
732	0.13
733	0.12
734	0.09
735	0.11
736	0.1
737	0.1
738	0.14
739	0.13
740	0.15
741	0.19
742	0.22
743	0.21
744	0.22
745	0.26
746	0.29
747	0.31
748	0.29
749	0.26
750	0.23
751	0.23
752	0.23
753	0.18
754	0.12
755	0.09
756	0.09
757	0.11
758	0.1
759	0.1
760	0.09
761	0.09
762	0.11
763	0.18
764	0.2
765	0.18
766	0.19
767	0.18
768	0.19
769	0.2
770	0.17
771	0.12
772	0.11
773	0.11
774	0.12
775	0.19
776	0.18
777	0.18
778	0.24
779	0.25
780	0.23
781	0.28
782	0.3
783	0.26
784	0.27
785	0.32
786	0.3
787	0.33
788	0.35
789	0.33
790	0.32
791	0.37
792	0.37
793	0.36
794	0.37
795	0.4
796	0.46
797	0.55
798	0.54
799	0.55
800	0.61
801	0.63
802	0.67
803	0.64
804	0.57
805	0.51
806	0.54
807	0.53
808	0.49
809	0.45
810	0.36
811	0.38
812	0.42
813	0.44
814	0.43
815	0.39
816	0.4
817	0.42
818	0.46
819	0.42
820	0.38
821	0.35
822	0.33
823	0.35
824	0.29
825	0.25
826	0.27
827	0.27
828	0.28
829	0.26
830	0.25
831	0.24
832	0.3
833	0.33
834	0.33
835	0.32
836	0.34
837	0.38
838	0.37
839	0.35
840	0.36
841	0.34
842	0.28
843	0.26
844	0.22
845	0.18
846	0.17
847	0.14
848	0.07
849	0.05
850	0.04
851	0.04
852	0.04
853	0.03
854	0.05
855	0.05
856	0.06
857	0.08
858	0.08
859	0.09
860	0.09
861	0.1
862	0.12
863	0.14
864	0.14
865	0.12
866	0.12
867	0.14
868	0.16
869	0.17
870	0.15
871	0.13
872	0.13
873	0.15
874	0.15
875	0.13
876	0.12
877	0.1
878	0.11
879	0.13
880	0.16
881	0.19
882	0.19
883	0.2
884	0.2
885	0.2
886	0.2
887	0.21
888	0.2
889	0.18
890	0.18
891	0.17
892	0.16
893	0.17
894	0.15
895	0.13
896	0.12
897	0.11
898	0.11
899	0.12
900	0.15
901	0.21
902	0.3
903	0.38
904	0.46
905	0.49
906	0.49
907	0.55
908	0.59
909	0.59
910	0.57
911	0.53
912	0.45
913	0.43
914	0.45
915	0.38
916	0.31
917	0.25
918	0.19
919	0.17
920	0.16
921	0.16
922	0.19
923	0.26
924	0.3
925	0.33
926	0.35
927	0.38
928	0.46
929	0.51
930	0.54
931	0.57
932	0.62
933	0.64
934	0.69
935	0.72
936	0.71
937	0.76
938	0.76
939	0.75
940	0.75
941	0.71
942	0.66
943	0.62
944	0.55
945	0.47
946	0.38
947	0.32
948	0.24
949	0.22
950	0.21
951	0.17
952	0.17
953	0.21
954	0.24
955	0.3
956	0.32
957	0.37
958	0.44
959	0.53
960	0.58
961	0.57
962	0.59
963	0.56
964	0.58
965	0.61
966	0.58
967	0.56
968	0.51
969	0.52
970	0.53
971	0.59
972	0.58
973	0.57
974	0.59
975	0.58
976	0.64
977	0.67
978	0.61
979	0.59
980	0.57
981	0.53
982	0.53
983	0.47
984	0.41
985	0.33
986	0.32
987	0.26
988	0.24
989	0.2
990	0.14
991	0.14
992	0.11
993	0.09
994	0.08
995	0.08
996	0.07
997	0.07
998	0.07
999	0.07
1000	0.08
1001	0.13
1002	0.2
1003	0.3
1004	0.36
1005	0.45
1006	0.54
1007	0.61
1008	0.71
1009	0.77
1010	0.81
1011	0.81
1012	0.86
1013	0.87
1014	0.88
1015	0.89
1016	0.85
1017	0.82
1018	0.81
1019	0.81
1020	0.81
1021	0.82
1022	0.83
1023	0.85
1024	0.9
1025	0.91
1026	0.92
1027	0.92
1028	0.92
1029	0.91
1030	0.88
1031	0.84
1032	0.79
1033	0.74
1034	0.68
1035	0.64
1036	0.62
1037	0.54

Q0CH88

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer