FuNGI

Q0CZN9

Protein Details

Accession

Q0CZN9

Localization Confidence

High

Confidence Score

24.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
270-295	AIEKAKATIKRRERKKNQPHQLNFSA	Hydrophilic
495-518	LLEQWKQEERKKRRAEKGLPSDAE	Hydrophilic
667-708	KTDRSEYKSVTARRKERKEEQGKSTTNKEKARRKNFFMTLGK	Hydrophilic
720-741	TRNVLKAHHERQKRGGRRGNNG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
261-285	NKKTRSKARAIEKAKATIKRRERKK
460-480	KRRDRGKEASMGLRAGEKKEK
504-509	RKKRRA
676-739	VTARRKERKEEQGKSTTNKEKARRKNFFMTLGKAKSKGKRSLVETRNVLKAHHERQKRGGRRGN

Subcellular Location(s)

nucl 20, mito 4, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR027312 Sda1 IPR007949 SDA1_C IPR012977 SDA1_N
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0015031 P:protein transport GO:0042273 P:ribosomal large subunit biogenesis GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus GO:0007089 P:traversing start control point of mitotic cell cycle
Pfam	View protein in Pfam PF08158 NUC130_3NT PF05285 SDA1

Amino Acid Sequences

MVKRKLGALEKVEADLPNLQHKIRRDPKSYIEDFRAQHYQYESHREIFMAAPASATDTGIISLRELIDFIAHVADCYPDITKEFPQQLMDILSQHHLVLEPELREKIVGSLVLLRKKELLDSATLLQTLFPILITTPSKTLRALIFQKILMDLRSSNAKTTNHKLNRTMQTVLFNLVTSDRTSSKGLWAIKLTRELWKRQIWSDAKAVEVMKEASLAENEKVIVGGVRFFLGGDKEREEMEDESSDEEIDVGRVKHQVGINKKTRSKARAIEKAKATIKRRERKKNQPHQLNFSALHLLHDPQGFAETLFSKHLQNTKSKLNLEQKLMVLQLVTRLVGLHKLHIMHLYSYFQKYLTPRQPSVTSFLASLAQASHDLVPPDDLEPLVQKIANEFVSEASASEVATAGLNAIREICARQPLAMNETLLQDLVMYRKSKDKGVVMAARGLLSLFREHNPEMLKRRDRGKEASMGLRAGEKKEKRFGEQESGGIEGLELLEQWKQEERKKRRAEKGLPSDAEDDEDDDEADWANWNVEDDDDSDSSGGWIDVQSDAEIDLSDSDDEKDGPPAKKAKQDENKESAKPEEKKDPLALATTRILTPADLAKLQELRNEAAVNALVSGPKSRRGQNNTSRGTDEALTAAEIEGLAALSAGKATREERIAHAKEGKTDRSEYKSVTARRKERKEEQGKSTTNKEKARRKNFFMTLGKAKSKGKRSLVETRNVLKAHHERQKRGGRRGNNG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.29
3	0.26
4	0.28
5	0.3
6	0.3
7	0.32
8	0.37
9	0.46
10	0.51
11	0.58
12	0.56
13	0.61
14	0.68
15	0.73
16	0.74
17	0.7
18	0.66
19	0.65
20	0.59
21	0.59
22	0.56
23	0.47
24	0.45
25	0.42
26	0.41
27	0.39
28	0.47
29	0.44
30	0.4
31	0.4
32	0.36
33	0.34
34	0.29
35	0.28
36	0.21
37	0.18
38	0.15
39	0.14
40	0.18
41	0.16
42	0.15
43	0.12
44	0.09
45	0.1
46	0.11
47	0.11
48	0.08
49	0.1
50	0.1
51	0.1
52	0.1
53	0.09
54	0.09
55	0.08
56	0.08
57	0.09
58	0.08
59	0.08
60	0.09
61	0.09
62	0.09
63	0.1
64	0.11
65	0.09
66	0.11
67	0.14
68	0.18
69	0.25
70	0.28
71	0.29
72	0.29
73	0.28
74	0.28
75	0.28
76	0.25
77	0.19
78	0.17
79	0.17
80	0.16
81	0.16
82	0.14
83	0.12
84	0.11
85	0.14
86	0.16
87	0.16
88	0.19
89	0.2
90	0.2
91	0.19
92	0.19
93	0.17
94	0.14
95	0.13
96	0.1
97	0.18
98	0.23
99	0.28
100	0.28
101	0.28
102	0.28
103	0.29
104	0.29
105	0.25
106	0.22
107	0.19
108	0.21
109	0.23
110	0.22
111	0.21
112	0.2
113	0.16
114	0.14
115	0.12
116	0.09
117	0.06
118	0.05
119	0.05
120	0.1
121	0.12
122	0.13
123	0.17
124	0.19
125	0.21
126	0.21
127	0.24
128	0.21
129	0.27
130	0.3
131	0.32
132	0.33
133	0.32
134	0.32
135	0.31
136	0.3
137	0.23
138	0.2
139	0.15
140	0.14
141	0.22
142	0.22
143	0.22
144	0.26
145	0.29
146	0.34
147	0.4
148	0.49
149	0.49
150	0.53
151	0.56
152	0.6
153	0.64
154	0.62
155	0.58
156	0.5
157	0.46
158	0.42
159	0.39
160	0.3
161	0.22
162	0.19
163	0.16
164	0.15
165	0.12
166	0.13
167	0.12
168	0.15
169	0.17
170	0.17
171	0.19
172	0.24
173	0.25
174	0.25
175	0.28
176	0.29
177	0.3
178	0.34
179	0.32
180	0.35
181	0.38
182	0.4
183	0.43
184	0.45
185	0.46
186	0.42
187	0.51
188	0.45
189	0.45
190	0.45
191	0.39
192	0.33
193	0.33
194	0.31
195	0.21
196	0.2
197	0.17
198	0.12
199	0.11
200	0.11
201	0.09
202	0.1
203	0.11
204	0.09
205	0.09
206	0.09
207	0.09
208	0.09
209	0.08
210	0.07
211	0.06
212	0.06
213	0.06
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.07
218	0.09
219	0.11
220	0.13
221	0.14
222	0.15
223	0.15
224	0.16
225	0.18
226	0.16
227	0.16
228	0.14
229	0.13
230	0.14
231	0.14
232	0.13
233	0.1
234	0.09
235	0.06
236	0.06
237	0.07
238	0.06
239	0.08
240	0.09
241	0.1
242	0.14
243	0.16
244	0.22
245	0.28
246	0.37
247	0.44
248	0.5
249	0.53
250	0.56
251	0.6
252	0.59
253	0.58
254	0.57
255	0.58
256	0.61
257	0.61
258	0.63
259	0.59
260	0.62
261	0.6
262	0.6
263	0.55
264	0.54
265	0.6
266	0.62
267	0.69
268	0.73
269	0.77
270	0.81
271	0.87
272	0.89
273	0.89
274	0.91
275	0.86
276	0.83
277	0.77
278	0.69
279	0.58
280	0.48
281	0.41
282	0.3
283	0.26
284	0.18
285	0.15
286	0.14
287	0.14
288	0.12
289	0.09
290	0.11
291	0.09
292	0.08
293	0.09
294	0.07
295	0.08
296	0.1
297	0.11
298	0.11
299	0.14
300	0.19
301	0.2
302	0.24
303	0.27
304	0.31
305	0.36
306	0.36
307	0.41
308	0.45
309	0.47
310	0.44
311	0.43
312	0.38
313	0.34
314	0.32
315	0.25
316	0.16
317	0.11
318	0.1
319	0.07
320	0.07
321	0.06
322	0.06
323	0.06
324	0.1
325	0.11
326	0.1
327	0.11
328	0.12
329	0.12
330	0.14
331	0.15
332	0.11
333	0.12
334	0.13
335	0.13
336	0.13
337	0.13
338	0.11
339	0.13
340	0.15
341	0.23
342	0.28
343	0.32
344	0.32
345	0.34
346	0.37
347	0.35
348	0.38
349	0.3
350	0.23
351	0.18
352	0.18
353	0.15
354	0.13
355	0.12
356	0.07
357	0.06
358	0.06
359	0.06
360	0.06
361	0.06
362	0.07
363	0.07
364	0.07
365	0.07
366	0.07
367	0.07
368	0.06
369	0.05
370	0.06
371	0.07
372	0.07
373	0.07
374	0.06
375	0.06
376	0.09
377	0.09
378	0.08
379	0.08
380	0.08
381	0.08
382	0.08
383	0.07
384	0.06
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.05
389	0.04
390	0.04
391	0.04
392	0.03
393	0.04
394	0.04
395	0.04
396	0.04
397	0.05
398	0.05
399	0.06
400	0.07
401	0.1
402	0.1
403	0.11
404	0.13
405	0.14
406	0.16
407	0.16
408	0.16
409	0.13
410	0.14
411	0.13
412	0.11
413	0.1
414	0.06
415	0.06
416	0.07
417	0.09
418	0.09
419	0.1
420	0.16
421	0.18
422	0.2
423	0.24
424	0.25
425	0.25
426	0.31
427	0.33
428	0.28
429	0.29
430	0.27
431	0.23
432	0.2
433	0.17
434	0.11
435	0.08
436	0.09
437	0.08
438	0.09
439	0.13
440	0.13
441	0.16
442	0.19
443	0.23
444	0.27
445	0.35
446	0.39
447	0.39
448	0.47
449	0.5
450	0.52
451	0.52
452	0.5
453	0.48
454	0.46
455	0.46
456	0.4
457	0.35
458	0.3
459	0.29
460	0.26
461	0.22
462	0.28
463	0.27
464	0.3
465	0.38
466	0.39
467	0.39
468	0.43
469	0.45
470	0.44
471	0.42
472	0.39
473	0.32
474	0.31
475	0.27
476	0.21
477	0.17
478	0.09
479	0.07
480	0.05
481	0.04
482	0.04
483	0.05
484	0.05
485	0.06
486	0.12
487	0.16
488	0.22
489	0.33
490	0.41
491	0.51
492	0.61
493	0.7
494	0.75
495	0.81
496	0.84
497	0.84
498	0.85
499	0.84
500	0.74
501	0.67
502	0.6
503	0.49
504	0.42
505	0.31
506	0.22
507	0.14
508	0.13
509	0.11
510	0.08
511	0.08
512	0.07
513	0.07
514	0.06
515	0.05
516	0.06
517	0.06
518	0.06
519	0.06
520	0.06
521	0.07
522	0.08
523	0.11
524	0.1
525	0.11
526	0.1
527	0.1
528	0.09
529	0.09
530	0.07
531	0.04
532	0.04
533	0.05
534	0.06
535	0.06
536	0.06
537	0.06
538	0.06
539	0.06
540	0.06
541	0.05
542	0.05
543	0.06
544	0.06
545	0.06
546	0.07
547	0.08
548	0.09
549	0.09
550	0.14
551	0.2
552	0.21
553	0.25
554	0.31
555	0.35
556	0.42
557	0.46
558	0.51
559	0.55
560	0.64
561	0.67
562	0.68
563	0.7
564	0.64
565	0.62
566	0.58
567	0.57
568	0.53
569	0.49
570	0.51
571	0.48
572	0.5
573	0.5
574	0.46
575	0.38
576	0.38
577	0.33
578	0.27
579	0.26
580	0.24
581	0.21
582	0.19
583	0.18
584	0.14
585	0.15
586	0.14
587	0.14
588	0.14
589	0.14
590	0.17
591	0.21
592	0.22
593	0.23
594	0.22
595	0.21
596	0.23
597	0.23
598	0.19
599	0.16
600	0.16
601	0.13
602	0.11
603	0.1
604	0.08
605	0.09
606	0.14
607	0.14
608	0.2
609	0.25
610	0.31
611	0.4
612	0.48
613	0.57
614	0.63
615	0.72
616	0.7
617	0.69
618	0.65
619	0.56
620	0.51
621	0.41
622	0.32
623	0.22
624	0.17
625	0.14
626	0.12
627	0.1
628	0.08
629	0.07
630	0.06
631	0.05
632	0.04
633	0.04
634	0.03
635	0.03
636	0.03
637	0.04
638	0.04
639	0.05
640	0.07
641	0.09
642	0.13
643	0.17
644	0.19
645	0.24
646	0.34
647	0.37
648	0.4
649	0.47
650	0.44
651	0.49
652	0.53
653	0.53
654	0.47
655	0.49
656	0.5
657	0.49
658	0.51
659	0.45
660	0.46
661	0.5
662	0.54
663	0.59
664	0.63
665	0.66
666	0.73
667	0.8
668	0.83
669	0.84
670	0.87
671	0.88
672	0.86
673	0.85
674	0.85
675	0.82
676	0.77
677	0.77
678	0.75
679	0.73
680	0.73
681	0.74
682	0.74
683	0.79
684	0.84
685	0.84
686	0.82
687	0.84
688	0.81
689	0.81
690	0.78
691	0.75
692	0.73
693	0.71
694	0.67
695	0.62
696	0.64
697	0.62
698	0.65
699	0.66
700	0.65
701	0.66
702	0.69
703	0.75
704	0.74
705	0.75
706	0.73
707	0.69
708	0.67
709	0.6
710	0.53
711	0.52
712	0.54
713	0.55
714	0.57
715	0.6
716	0.59
717	0.69
718	0.79
719	0.8
720	0.81
721	0.81

Q0CZN9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer