Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0CIS6

Protein Details
Accession Q0CIS6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-28IQLPRPATRHHVQRPHQFSRHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 13, cyto 6, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000743  Glyco_hydro_28  
IPR006626  PbH1  
IPR012334  Pectin_lyas_fold  
IPR011050  Pectin_lyase_fold/virulence  
Gene Ontology GO:0005576  C:extracellular region  
GO:0004650  F:polygalacturonase activity  
GO:0071555  P:cell wall organization  
GO:0045490  P:pectin catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00295  Glyco_hydro_28  
Amino Acid Sequences MDQKATEYIQLPRPATRHHVQRPHQFSRARTQLLTQPDVEANTDGADTIRSSHITFNNWTVYNGDDSISLKGNSTDITITNSHFYNGLGIALGSIGQYKDQFETIERFTVKNIDYHNTLHAVYFKTWTDDQNGYPPNGGGGGLGYASDMVFQNLRASGLRGSAISISQCTRFSGAPGEGNCTNSQFQIRDITLANLTGTTKVSSVASFQCSAVAPCTNIGLFHTDLTLSNGTIAGEYLCGNVEDPRGFECTGAPCVGGSATGEC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.46
3 0.48
4 0.51
5 0.55
6 0.63
7 0.68
8 0.75
9 0.8
10 0.8
11 0.8
12 0.74
13 0.68
14 0.68
15 0.68
16 0.61
17 0.53
18 0.49
19 0.47
20 0.49
21 0.48
22 0.38
23 0.32
24 0.3
25 0.3
26 0.28
27 0.22
28 0.16
29 0.13
30 0.12
31 0.1
32 0.08
33 0.08
34 0.07
35 0.08
36 0.1
37 0.1
38 0.12
39 0.17
40 0.2
41 0.22
42 0.24
43 0.26
44 0.29
45 0.28
46 0.28
47 0.24
48 0.22
49 0.2
50 0.19
51 0.16
52 0.12
53 0.12
54 0.13
55 0.15
56 0.13
57 0.12
58 0.12
59 0.12
60 0.11
61 0.11
62 0.1
63 0.09
64 0.12
65 0.13
66 0.13
67 0.15
68 0.14
69 0.14
70 0.13
71 0.12
72 0.1
73 0.09
74 0.08
75 0.06
76 0.05
77 0.05
78 0.04
79 0.05
80 0.03
81 0.04
82 0.04
83 0.05
84 0.05
85 0.06
86 0.07
87 0.08
88 0.08
89 0.09
90 0.13
91 0.13
92 0.17
93 0.17
94 0.17
95 0.16
96 0.2
97 0.19
98 0.18
99 0.19
100 0.17
101 0.18
102 0.19
103 0.2
104 0.17
105 0.17
106 0.14
107 0.15
108 0.14
109 0.13
110 0.14
111 0.13
112 0.14
113 0.15
114 0.15
115 0.17
116 0.17
117 0.17
118 0.21
119 0.23
120 0.2
121 0.19
122 0.18
123 0.14
124 0.12
125 0.12
126 0.05
127 0.04
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.05
139 0.06
140 0.06
141 0.07
142 0.06
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.09
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.07
152 0.08
153 0.09
154 0.1
155 0.11
156 0.11
157 0.12
158 0.12
159 0.12
160 0.15
161 0.15
162 0.18
163 0.18
164 0.22
165 0.21
166 0.23
167 0.22
168 0.21
169 0.2
170 0.17
171 0.19
172 0.15
173 0.16
174 0.19
175 0.19
176 0.18
177 0.18
178 0.19
179 0.16
180 0.16
181 0.15
182 0.1
183 0.11
184 0.1
185 0.1
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.1
190 0.09
191 0.12
192 0.13
193 0.16
194 0.16
195 0.16
196 0.16
197 0.16
198 0.17
199 0.17
200 0.16
201 0.13
202 0.13
203 0.14
204 0.12
205 0.12
206 0.12
207 0.13
208 0.13
209 0.12
210 0.12
211 0.11
212 0.12
213 0.16
214 0.16
215 0.12
216 0.11
217 0.12
218 0.11
219 0.11
220 0.1
221 0.07
222 0.06
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.08
228 0.1
229 0.13
230 0.13
231 0.14
232 0.16
233 0.18
234 0.18
235 0.18
236 0.19
237 0.19
238 0.22
239 0.21
240 0.19
241 0.16
242 0.16
243 0.16
244 0.13