Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0CH93

Protein Details
Accession Q0CH93    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MPKRKRDKHSGRRRDIWTPPGEBasic
28-56LYINSNRKKLKVYKADKKSRKSVESKSEEHydrophilic
116-138SNPFLVQKGKRKRPDSNSNTSKGHydrophilic
332-359CRSRQQCADKWRKARRKIVTQRKRGQADHydrophilic
573-593FGSNTPRTKRDIKKEPDDLFAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-14KRKRDKHSGRRR
35-48KKLKVYKADKKSRK
343-350RKARRKIV
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR017930  Myb_dom  
IPR001005  SANT/Myb  
Pfam View protein in Pfam  
PF13921  Myb_DNA-bind_6  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51294  HTH_MYB  
PS50090  MYB_LIKE  
CDD cd00167  SANT  
Amino Acid Sequences MPKRKRDKHSGRRRDIWTPPGEGEEETLYINSNRKKLKVYKADKKSRKSVESKSEEDTPAPAETPVDAPPRSDSEGTDASSTKPPQKSKESSPSSPKNERTERKTSVPANPNAEASNPFLVQKGKRKRPDSNSNTSKGKHTGFFTSDEVKALEKFKIDFCNTHGIHGSTFDAMVQHSAREKGETFPGQDMISKQDFWKEIYGVHPKRDRRSVYRFMRRHFQASQQKPHEWTKLQDQELIELHEKYGPRWAYIAKLIGRSDDDVVQRWKNRLEHRNTMKSGPWSEEEVCQLLEAVQDSWTKLKQQGMDVGKDYYEMDERLVSWGNVSRALGHCRSRQQCADKWRKARRKIVTQRKRGQADAVYDPALETRLASRRSRSLAALSRSASPDRNYKSSKYVEESDEDETEQDDKSNGERTSAKSKAPTPKTPKTKHSEAPEINETPQEREKSSSQVAPKTHEGKTIKTDSEDSSSDESEKSSSSDSESDSSRDSEGSDDEDEKPPKPQQNTKRAQVTQLPKSKKALKGPSDSTSSSSESEDDDQDSSPDSSDDSDSDENDAKPSKVKHRSPSVLHSFGSNTPRTKRDIKKEPDDLFANGE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.83
3 0.81
4 0.75
5 0.68
6 0.59
7 0.53
8 0.48
9 0.39
10 0.33
11 0.26
12 0.21
13 0.17
14 0.16
15 0.14
16 0.16
17 0.22
18 0.25
19 0.31
20 0.35
21 0.37
22 0.46
23 0.53
24 0.61
25 0.65
26 0.71
27 0.74
28 0.81
29 0.89
30 0.9
31 0.89
32 0.88
33 0.86
34 0.85
35 0.83
36 0.82
37 0.81
38 0.79
39 0.75
40 0.69
41 0.67
42 0.59
43 0.51
44 0.43
45 0.35
46 0.28
47 0.25
48 0.21
49 0.15
50 0.14
51 0.15
52 0.18
53 0.21
54 0.2
55 0.2
56 0.23
57 0.27
58 0.3
59 0.29
60 0.25
61 0.26
62 0.29
63 0.29
64 0.28
65 0.24
66 0.23
67 0.29
68 0.32
69 0.34
70 0.38
71 0.42
72 0.47
73 0.55
74 0.59
75 0.62
76 0.69
77 0.69
78 0.7
79 0.75
80 0.77
81 0.76
82 0.79
83 0.76
84 0.75
85 0.77
86 0.78
87 0.76
88 0.75
89 0.72
90 0.69
91 0.7
92 0.66
93 0.66
94 0.66
95 0.65
96 0.61
97 0.57
98 0.52
99 0.45
100 0.41
101 0.33
102 0.27
103 0.24
104 0.19
105 0.18
106 0.18
107 0.22
108 0.27
109 0.35
110 0.43
111 0.5
112 0.59
113 0.65
114 0.73
115 0.79
116 0.84
117 0.82
118 0.82
119 0.8
120 0.77
121 0.75
122 0.67
123 0.62
124 0.56
125 0.51
126 0.43
127 0.38
128 0.37
129 0.34
130 0.36
131 0.34
132 0.33
133 0.3
134 0.28
135 0.25
136 0.21
137 0.21
138 0.2
139 0.18
140 0.15
141 0.16
142 0.19
143 0.25
144 0.26
145 0.25
146 0.26
147 0.35
148 0.33
149 0.34
150 0.33
151 0.26
152 0.24
153 0.24
154 0.22
155 0.13
156 0.12
157 0.1
158 0.09
159 0.08
160 0.1
161 0.09
162 0.09
163 0.11
164 0.13
165 0.13
166 0.15
167 0.16
168 0.15
169 0.21
170 0.22
171 0.22
172 0.22
173 0.23
174 0.21
175 0.21
176 0.2
177 0.19
178 0.19
179 0.18
180 0.16
181 0.2
182 0.2
183 0.2
184 0.22
185 0.17
186 0.17
187 0.22
188 0.33
189 0.31
190 0.36
191 0.41
192 0.43
193 0.49
194 0.56
195 0.55
196 0.53
197 0.59
198 0.63
199 0.66
200 0.72
201 0.72
202 0.67
203 0.71
204 0.65
205 0.62
206 0.53
207 0.53
208 0.53
209 0.56
210 0.62
211 0.58
212 0.58
213 0.58
214 0.6
215 0.56
216 0.48
217 0.42
218 0.42
219 0.45
220 0.43
221 0.42
222 0.37
223 0.34
224 0.33
225 0.33
226 0.25
227 0.17
228 0.16
229 0.16
230 0.16
231 0.13
232 0.19
233 0.16
234 0.15
235 0.16
236 0.16
237 0.16
238 0.18
239 0.22
240 0.17
241 0.2
242 0.2
243 0.19
244 0.2
245 0.18
246 0.17
247 0.17
248 0.16
249 0.16
250 0.19
251 0.22
252 0.23
253 0.24
254 0.27
255 0.29
256 0.37
257 0.43
258 0.47
259 0.53
260 0.59
261 0.65
262 0.62
263 0.59
264 0.53
265 0.48
266 0.42
267 0.34
268 0.28
269 0.23
270 0.23
271 0.22
272 0.2
273 0.17
274 0.15
275 0.13
276 0.11
277 0.08
278 0.07
279 0.06
280 0.05
281 0.06
282 0.07
283 0.07
284 0.09
285 0.09
286 0.1
287 0.12
288 0.14
289 0.15
290 0.16
291 0.23
292 0.24
293 0.25
294 0.25
295 0.23
296 0.2
297 0.19
298 0.17
299 0.11
300 0.1
301 0.08
302 0.07
303 0.07
304 0.08
305 0.08
306 0.09
307 0.08
308 0.07
309 0.1
310 0.1
311 0.11
312 0.1
313 0.11
314 0.13
315 0.17
316 0.2
317 0.21
318 0.24
319 0.31
320 0.34
321 0.36
322 0.4
323 0.42
324 0.44
325 0.51
326 0.58
327 0.57
328 0.64
329 0.71
330 0.74
331 0.77
332 0.81
333 0.78
334 0.79
335 0.82
336 0.84
337 0.84
338 0.85
339 0.85
340 0.84
341 0.79
342 0.68
343 0.61
344 0.54
345 0.48
346 0.41
347 0.34
348 0.25
349 0.22
350 0.21
351 0.17
352 0.14
353 0.09
354 0.07
355 0.08
356 0.14
357 0.18
358 0.2
359 0.22
360 0.26
361 0.3
362 0.31
363 0.29
364 0.3
365 0.33
366 0.35
367 0.36
368 0.32
369 0.32
370 0.32
371 0.32
372 0.28
373 0.24
374 0.29
375 0.29
376 0.35
377 0.35
378 0.36
379 0.41
380 0.42
381 0.44
382 0.41
383 0.4
384 0.36
385 0.35
386 0.35
387 0.31
388 0.27
389 0.24
390 0.19
391 0.16
392 0.14
393 0.12
394 0.1
395 0.08
396 0.08
397 0.09
398 0.16
399 0.15
400 0.17
401 0.2
402 0.24
403 0.32
404 0.34
405 0.35
406 0.32
407 0.4
408 0.47
409 0.51
410 0.57
411 0.57
412 0.65
413 0.73
414 0.75
415 0.77
416 0.75
417 0.75
418 0.72
419 0.71
420 0.71
421 0.63
422 0.63
423 0.61
424 0.54
425 0.48
426 0.45
427 0.38
428 0.32
429 0.35
430 0.31
431 0.26
432 0.28
433 0.29
434 0.31
435 0.34
436 0.35
437 0.34
438 0.38
439 0.39
440 0.4
441 0.45
442 0.44
443 0.42
444 0.45
445 0.42
446 0.4
447 0.45
448 0.46
449 0.4
450 0.37
451 0.39
452 0.33
453 0.35
454 0.32
455 0.28
456 0.26
457 0.25
458 0.24
459 0.22
460 0.2
461 0.16
462 0.16
463 0.14
464 0.12
465 0.12
466 0.14
467 0.16
468 0.17
469 0.19
470 0.2
471 0.2
472 0.2
473 0.21
474 0.19
475 0.17
476 0.15
477 0.14
478 0.14
479 0.15
480 0.16
481 0.17
482 0.19
483 0.26
484 0.28
485 0.27
486 0.31
487 0.35
488 0.4
489 0.45
490 0.52
491 0.55
492 0.64
493 0.72
494 0.75
495 0.78
496 0.73
497 0.71
498 0.7
499 0.69
500 0.67
501 0.69
502 0.66
503 0.6
504 0.66
505 0.68
506 0.66
507 0.67
508 0.67
509 0.66
510 0.68
511 0.7
512 0.67
513 0.65
514 0.59
515 0.52
516 0.45
517 0.4
518 0.33
519 0.28
520 0.24
521 0.22
522 0.24
523 0.22
524 0.2
525 0.19
526 0.18
527 0.17
528 0.19
529 0.17
530 0.14
531 0.13
532 0.12
533 0.12
534 0.14
535 0.13
536 0.16
537 0.17
538 0.17
539 0.21
540 0.24
541 0.22
542 0.25
543 0.27
544 0.22
545 0.27
546 0.33
547 0.39
548 0.46
549 0.54
550 0.6
551 0.68
552 0.75
553 0.75
554 0.79
555 0.78
556 0.72
557 0.64
558 0.57
559 0.5
560 0.47
561 0.48
562 0.43
563 0.4
564 0.42
565 0.45
566 0.49
567 0.56
568 0.6
569 0.64
570 0.69
571 0.73
572 0.77
573 0.83
574 0.81
575 0.77
576 0.71