FuNGI

Q0D0F4

Protein Details

Accession

Q0D0F4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
104-123	GVAPRAKMNQQRARRFRSAQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
410-443	RRRRQVEERKAANEKRRKQEAQDREERSKRQRRG

Subcellular Location(s)

nucl 11, cyto 9, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing GO:0000956 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process GO:0051984 P:positive regulation of chromosome segregation GO:0106354 P:tRNA surveillance
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSNKYPKIISSVIEERPYEVNGEEVPVDTTRPNPNGEEMDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPPPVNEQEMMLEIFKYTDRVVNMVRPRKLLMIAVDGVAPRAKMNQQRARRFRSAQEAKEADEKKEEFRKLQAKQNGNKADQDLQEEVIQKTWDSNVITPGTPFMDILAASLRYWIAYKLNTDPAWEKLKIIISDATVPGEGEHKIMEFVRSQRADPEHDPNTRHVIYGLDADLIMLGLATHEPYFRVLREDVFFQESKARTCHLCGQVGHKAEECRGRAKEKSGEFDEKQNGTSLKPFIWLNVSILREYLAVELHVPNQPFPFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIRENGIDTLIAIWRDNIPVMGGYLTKDGHVDFKKAQLILQGLAKQEDAIFRRRRQVEERKAANEKRRKQEAQDREERSKRQRRGSPSYDAYEPPANNRSRGGGSGGPAPPSGLELITPARGELSRQTRELTQSMVVNRGAVYRANMANKSAAAVLKSKLMKGSQEDTSEDVEEPSTDEPAEQTSPSVLGKRKADEPNGGEETPGSETPKPNKDDEMPPDTVRLWEEGYADRYYEQKFGVDPEDKEFRHKVARAYAEGLAWVLLYYFQGCPSWTWYYPYHYAPFAADFVDIADMIPSFEKGTPFKPFEQLMGVLPASSNHAIPEVFHDLMKDPDSEIIDFYPEDFAVDLNGKKFAWQGVVLLPFIDEKRLLNAMEKKYPLLSDEERLRNCVGRDVLLISDRHPLYQDLVGNFYSKKQGAPKYKLNMRVSEGLAGKVEKDESYIPHSSLVSSLEEYGMPTLEEDRSLTVNYEIPKSSHIHKSMLLRGVKFPPPALDQGDIQAVKSKANHSGRSFGGAPFRNNGNRGGRINYAPDRPNPFAAHLDPNFVPGANAAAGAPPMMPAGWAPPASGSTGYSRGPPPPPRGGSRGGGGYPPRGGYGGGGDYYGRSQGSYYGGGGNPGNQYGYRPNPPGRGGQDYRGGGYQRGGYSNRDHYSSRNSGGYGRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.47
3	0.49
4	0.47
5	0.41
6	0.39
7	0.41
8	0.42
9	0.41
10	0.4
11	0.37
12	0.37
13	0.36
14	0.3
15	0.23
16	0.2
17	0.16
18	0.17
19	0.15
20	0.13
21	0.15
22	0.13
23	0.15
24	0.14
25	0.18
26	0.24
27	0.26
28	0.28
29	0.28
30	0.32
31	0.35
32	0.36
33	0.36
34	0.32
35	0.32
36	0.29
37	0.28
38	0.23
39	0.19
40	0.17
41	0.12
42	0.09
43	0.07
44	0.08
45	0.08
46	0.09
47	0.1
48	0.12
49	0.17
50	0.2
51	0.2
52	0.28
53	0.36
54	0.44
55	0.5
56	0.5
57	0.54
58	0.57
59	0.6
60	0.52
61	0.46
62	0.39
63	0.34
64	0.32
65	0.24
66	0.18
67	0.14
68	0.14
69	0.12
70	0.12
71	0.11
72	0.14
73	0.14
74	0.18
75	0.2
76	0.28
77	0.37
78	0.44
79	0.46
80	0.45
81	0.46
82	0.45
83	0.44
84	0.39
85	0.32
86	0.29
87	0.26
88	0.25
89	0.24
90	0.21
91	0.2
92	0.18
93	0.15
94	0.1
95	0.13
96	0.19
97	0.26
98	0.36
99	0.45
100	0.54
101	0.65
102	0.74
103	0.79
104	0.8
105	0.77
106	0.73
107	0.75
108	0.74
109	0.67
110	0.68
111	0.61
112	0.56
113	0.6
114	0.56
115	0.47
116	0.45
117	0.42
118	0.39
119	0.46
120	0.47
121	0.4
122	0.47
123	0.54
124	0.52
125	0.61
126	0.62
127	0.63
128	0.67
129	0.74
130	0.73
131	0.67
132	0.64
133	0.58
134	0.56
135	0.48
136	0.46
137	0.37
138	0.31
139	0.31
140	0.31
141	0.28
142	0.24
143	0.22
144	0.18
145	0.17
146	0.17
147	0.18
148	0.17
149	0.18
150	0.2
151	0.22
152	0.22
153	0.21
154	0.22
155	0.19
156	0.17
157	0.15
158	0.11
159	0.1
160	0.09
161	0.1
162	0.11
163	0.1
164	0.1
165	0.11
166	0.1
167	0.09
168	0.1
169	0.11
170	0.12
171	0.13
172	0.16
173	0.2
174	0.27
175	0.26
176	0.29
177	0.3
178	0.32
179	0.36
180	0.33
181	0.29
182	0.26
183	0.32
184	0.28
185	0.29
186	0.25
187	0.21
188	0.24
189	0.23
190	0.21
191	0.15
192	0.15
193	0.13
194	0.13
195	0.12
196	0.09
197	0.09
198	0.08
199	0.09
200	0.1
201	0.11
202	0.13
203	0.16
204	0.24
205	0.25
206	0.25
207	0.3
208	0.33
209	0.37
210	0.37
211	0.43
212	0.4
213	0.43
214	0.45
215	0.42
216	0.46
217	0.4
218	0.37
219	0.29
220	0.24
221	0.2
222	0.21
223	0.18
224	0.11
225	0.1
226	0.1
227	0.09
228	0.08
229	0.06
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.04
235	0.04
236	0.05
237	0.05
238	0.08
239	0.1
240	0.11
241	0.15
242	0.15
243	0.17
244	0.19
245	0.21
246	0.21
247	0.23
248	0.23
249	0.2
250	0.26
251	0.24
252	0.25
253	0.24
254	0.24
255	0.21
256	0.24
257	0.32
258	0.3
259	0.33
260	0.32
261	0.37
262	0.41
263	0.43
264	0.41
265	0.35
266	0.32
267	0.31
268	0.36
269	0.31
270	0.32
271	0.32
272	0.36
273	0.36
274	0.4
275	0.44
276	0.41
277	0.46
278	0.45
279	0.49
280	0.46
281	0.5
282	0.5
283	0.44
284	0.41
285	0.37
286	0.32
287	0.26
288	0.28
289	0.23
290	0.17
291	0.18
292	0.18
293	0.16
294	0.18
295	0.18
296	0.16
297	0.2
298	0.2
299	0.18
300	0.18
301	0.17
302	0.14
303	0.14
304	0.12
305	0.07
306	0.06
307	0.08
308	0.08
309	0.1
310	0.13
311	0.13
312	0.13
313	0.13
314	0.13
315	0.12
316	0.15
317	0.16
318	0.14
319	0.15
320	0.16
321	0.16
322	0.17
323	0.18
324	0.15
325	0.11
326	0.1
327	0.09
328	0.08
329	0.07
330	0.06
331	0.05
332	0.05
333	0.06
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.07
338	0.07
339	0.08
340	0.08
341	0.08
342	0.07
343	0.08
344	0.12
345	0.15
346	0.16
347	0.15
348	0.16
349	0.16
350	0.15
351	0.14
352	0.1
353	0.05
354	0.06
355	0.07
356	0.06
357	0.06
358	0.07
359	0.07
360	0.08
361	0.08
362	0.07
363	0.06
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.07
370	0.08
371	0.07
372	0.08
373	0.08
374	0.14
375	0.15
376	0.17
377	0.17
378	0.21
379	0.23
380	0.23
381	0.23
382	0.19
383	0.19
384	0.18
385	0.2
386	0.18
387	0.16
388	0.16
389	0.16
390	0.13
391	0.12
392	0.15
393	0.14
394	0.2
395	0.26
396	0.28
397	0.36
398	0.39
399	0.42
400	0.48
401	0.57
402	0.59
403	0.63
404	0.65
405	0.62
406	0.67
407	0.69
408	0.69
409	0.67
410	0.65
411	0.64
412	0.68
413	0.65
414	0.64
415	0.68
416	0.68
417	0.67
418	0.69
419	0.65
420	0.65
421	0.68
422	0.67
423	0.67
424	0.67
425	0.66
426	0.65
427	0.66
428	0.67
429	0.71
430	0.7
431	0.68
432	0.62
433	0.58
434	0.51
435	0.45
436	0.39
437	0.34
438	0.29
439	0.24
440	0.28
441	0.25
442	0.24
443	0.24
444	0.23
445	0.2
446	0.2
447	0.2
448	0.14
449	0.14
450	0.19
451	0.19
452	0.18
453	0.17
454	0.16
455	0.13
456	0.12
457	0.11
458	0.06
459	0.05
460	0.05
461	0.06
462	0.07
463	0.07
464	0.06
465	0.07
466	0.07
467	0.07
468	0.12
469	0.19
470	0.2
471	0.21
472	0.22
473	0.23
474	0.26
475	0.26
476	0.21
477	0.16
478	0.16
479	0.16
480	0.18
481	0.16
482	0.13
483	0.13
484	0.12
485	0.11
486	0.09
487	0.09
488	0.09
489	0.12
490	0.14
491	0.14
492	0.14
493	0.14
494	0.13
495	0.13
496	0.11
497	0.09
498	0.08
499	0.09
500	0.09
501	0.13
502	0.14
503	0.14
504	0.14
505	0.14
506	0.15
507	0.17
508	0.2
509	0.18
510	0.19
511	0.2
512	0.2
513	0.2
514	0.19
515	0.16
516	0.13
517	0.1
518	0.08
519	0.09
520	0.07
521	0.06
522	0.05
523	0.05
524	0.05
525	0.07
526	0.07
527	0.06
528	0.06
529	0.06
530	0.07
531	0.08
532	0.11
533	0.12
534	0.16
535	0.18
536	0.2
537	0.27
538	0.3
539	0.32
540	0.33
541	0.33
542	0.34
543	0.36
544	0.34
545	0.26
546	0.22
547	0.21
548	0.18
549	0.17
550	0.13
551	0.12
552	0.15
553	0.2
554	0.27
555	0.28
556	0.28
557	0.3
558	0.31
559	0.35
560	0.38
561	0.38
562	0.34
563	0.32
564	0.32
565	0.29
566	0.26
567	0.21
568	0.16
569	0.11
570	0.1
571	0.11
572	0.11
573	0.14
574	0.13
575	0.13
576	0.12
577	0.14
578	0.14
579	0.15
580	0.13
581	0.11
582	0.11
583	0.13
584	0.17
585	0.18
586	0.17
587	0.2
588	0.26
589	0.25
590	0.29
591	0.28
592	0.26
593	0.29
594	0.3
595	0.29
596	0.3
597	0.33
598	0.31
599	0.32
600	0.31
601	0.25
602	0.22
603	0.19
604	0.12
605	0.09
606	0.07
607	0.04
608	0.03
609	0.03
610	0.05
611	0.05
612	0.05
613	0.06
614	0.07
615	0.07
616	0.12
617	0.16
618	0.15
619	0.19
620	0.21
621	0.25
622	0.28
623	0.3
624	0.28
625	0.24
626	0.24
627	0.21
628	0.2
629	0.15
630	0.12
631	0.09
632	0.07
633	0.07
634	0.07
635	0.06
636	0.05
637	0.05
638	0.04
639	0.04
640	0.05
641	0.05
642	0.06
643	0.07
644	0.09
645	0.11
646	0.14
647	0.19
648	0.23
649	0.24
650	0.27
651	0.26
652	0.25
653	0.26
654	0.24
655	0.18
656	0.18
657	0.16
658	0.12
659	0.11
660	0.1
661	0.11
662	0.11
663	0.1
664	0.08
665	0.09
666	0.09
667	0.09
668	0.14
669	0.15
670	0.15
671	0.15
672	0.15
673	0.15
674	0.17
675	0.18
676	0.14
677	0.1
678	0.12
679	0.13
680	0.13
681	0.13
682	0.11
683	0.11
684	0.1
685	0.1
686	0.09
687	0.07
688	0.07
689	0.06
690	0.06
691	0.06
692	0.09
693	0.1
694	0.1
695	0.11
696	0.11
697	0.12
698	0.13
699	0.12
700	0.12
701	0.11
702	0.12
703	0.14
704	0.16
705	0.15
706	0.14
707	0.13
708	0.13
709	0.12
710	0.12
711	0.09
712	0.08
713	0.11
714	0.13
715	0.13
716	0.18
717	0.26
718	0.29
719	0.34
720	0.35
721	0.33
722	0.32
723	0.32
724	0.26
725	0.25
726	0.23
727	0.23
728	0.31
729	0.37
730	0.37
731	0.39
732	0.39
733	0.36
734	0.34
735	0.33
736	0.26
737	0.2
738	0.2
739	0.19
740	0.19
741	0.19
742	0.19
743	0.15
744	0.21
745	0.2
746	0.19
747	0.19
748	0.19
749	0.18
750	0.22
751	0.24
752	0.17
753	0.2
754	0.2
755	0.2
756	0.2
757	0.19
758	0.2
759	0.17
760	0.19
761	0.24
762	0.33
763	0.41
764	0.48
765	0.55
766	0.6
767	0.66
768	0.72
769	0.68
770	0.63
771	0.58
772	0.56
773	0.48
774	0.45
775	0.39
776	0.31
777	0.28
778	0.24
779	0.2
780	0.16
781	0.16
782	0.1
783	0.12
784	0.12
785	0.13
786	0.19
787	0.21
788	0.2
789	0.21
790	0.21
791	0.19
792	0.19
793	0.18
794	0.14
795	0.13
796	0.13
797	0.11
798	0.11
799	0.11
800	0.11
801	0.09
802	0.07
803	0.07
804	0.08
805	0.08
806	0.09
807	0.09
808	0.1
809	0.11
810	0.12
811	0.12
812	0.12
813	0.15
814	0.16
815	0.19
816	0.18
817	0.18
818	0.2
819	0.22
820	0.26
821	0.31
822	0.32
823	0.31
824	0.34
825	0.4
826	0.44
827	0.49
828	0.47
829	0.41
830	0.43
831	0.46
832	0.47
833	0.41
834	0.36
835	0.32
836	0.32
837	0.34
838	0.32
839	0.28
840	0.24
841	0.24
842	0.29
843	0.25
844	0.22
845	0.25
846	0.22
847	0.22
848	0.24
849	0.25
850	0.29
851	0.36
852	0.42
853	0.39
854	0.44
855	0.42
856	0.45
857	0.44
858	0.37
859	0.39
860	0.36
861	0.35
862	0.34
863	0.39
864	0.38
865	0.38
866	0.43
867	0.41
868	0.42
869	0.43
870	0.43
871	0.41
872	0.39
873	0.45
874	0.43
875	0.43
876	0.41
877	0.45
878	0.49
879	0.48
880	0.5
881	0.45
882	0.43
883	0.4
884	0.4
885	0.43
886	0.36
887	0.38
888	0.33
889	0.33
890	0.3
891	0.25
892	0.22
893	0.13
894	0.15
895	0.1
896	0.1
897	0.08
898	0.08
899	0.08
900	0.08
901	0.08
902	0.06
903	0.06
904	0.05
905	0.06
906	0.05
907	0.08
908	0.12
909	0.12
910	0.12
911	0.13
912	0.14
913	0.15
914	0.16
915	0.15
916	0.15
917	0.19
918	0.19
919	0.22
920	0.24
921	0.28
922	0.35
923	0.41
924	0.44
925	0.5
926	0.55
927	0.57
928	0.59
929	0.59
930	0.54
931	0.5
932	0.47
933	0.39
934	0.39
935	0.35
936	0.34
937	0.31
938	0.29
939	0.25
940	0.22
941	0.21
942	0.16
943	0.18
944	0.17
945	0.14
946	0.14
947	0.13
948	0.14
949	0.15
950	0.16
951	0.12
952	0.1
953	0.1
954	0.12
955	0.16
956	0.16
957	0.16
958	0.19
959	0.19
960	0.22
961	0.22
962	0.22
963	0.2
964	0.2
965	0.2
966	0.15
967	0.19
968	0.24
969	0.31
970	0.35
971	0.4
972	0.44
973	0.49
974	0.52
975	0.56
976	0.54
977	0.57
978	0.53
979	0.52
980	0.55
981	0.5
982	0.5
983	0.46
984	0.42
985	0.34
986	0.33
987	0.33
988	0.28
989	0.31
990	0.31
991	0.31
992	0.36
993	0.44
994	0.43
995	0.42
996	0.4
997	0.4
998	0.48
999	0.5
1000	0.47
1001	0.41
1002	0.39

Q0D0F4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer