Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0CDW1

Protein Details
Accession Q0CDW1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-69NGLWLRQLEWRHHRRRRRNHHHRVVAVSGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
53-59HRRRRRN
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12.333, cyto 12, nucl 9.5, cyto_pero 7.999, pero 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002022  Pec_lyase  
IPR012334  Pectin_lyas_fold  
IPR011050  Pectin_lyase_fold/virulence  
IPR045032  PEL  
Gene Ontology GO:0005576  C:extracellular region  
GO:0030570  F:pectate lyase activity  
GO:0000272  P:polysaccharide catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00544  Pectate_lyase_4  
Amino Acid Sequences MPVRTGAGGSHGYFSHAQACLQQREPILTLHPINPYTDTPNGLWLRQLEWRHHRRRRRNHHHRVVAVSGDDPKVVVVSGNIKQTADQARVGSNTSIIGKDANAVLEGFGVLVKEKENVIIQNLGIKKVLADNGDAIGVQYSNNVWIDHCDVSSDMDHDKDYYDGLIDLTHAADYVTVSNCYIHDHWKASLVGHSDSNGDEDTGHLRVTYANNHWANINSRGPSLRFGTGHIYNSYYENVSDAINTRQGAQVLVESNQFVGVKKPLYSTDGGYAVARDNDFGDGENAAPAGTLTSVPYDYELVGADGVKAAVVGVAGQTL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.22
3 0.2
4 0.19
5 0.24
6 0.31
7 0.33
8 0.35
9 0.37
10 0.33
11 0.36
12 0.37
13 0.32
14 0.28
15 0.28
16 0.28
17 0.27
18 0.31
19 0.28
20 0.28
21 0.3
22 0.29
23 0.28
24 0.28
25 0.28
26 0.23
27 0.31
28 0.31
29 0.28
30 0.29
31 0.25
32 0.25
33 0.29
34 0.32
35 0.33
36 0.42
37 0.52
38 0.6
39 0.69
40 0.77
41 0.81
42 0.89
43 0.91
44 0.92
45 0.93
46 0.94
47 0.95
48 0.94
49 0.88
50 0.82
51 0.73
52 0.63
53 0.53
54 0.43
55 0.35
56 0.26
57 0.21
58 0.15
59 0.12
60 0.1
61 0.09
62 0.08
63 0.06
64 0.1
65 0.14
66 0.17
67 0.18
68 0.17
69 0.18
70 0.23
71 0.26
72 0.23
73 0.22
74 0.2
75 0.21
76 0.22
77 0.23
78 0.18
79 0.14
80 0.13
81 0.12
82 0.12
83 0.1
84 0.1
85 0.08
86 0.09
87 0.09
88 0.08
89 0.07
90 0.07
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.05
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.05
100 0.06
101 0.06
102 0.07
103 0.08
104 0.09
105 0.1
106 0.11
107 0.11
108 0.15
109 0.16
110 0.15
111 0.14
112 0.13
113 0.12
114 0.12
115 0.15
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.09
122 0.08
123 0.06
124 0.05
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.07
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.09
137 0.09
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.07
147 0.06
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.03
159 0.03
160 0.04
161 0.05
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.1
168 0.1
169 0.13
170 0.15
171 0.16
172 0.17
173 0.2
174 0.2
175 0.18
176 0.2
177 0.18
178 0.17
179 0.15
180 0.16
181 0.13
182 0.12
183 0.13
184 0.1
185 0.08
186 0.07
187 0.07
188 0.09
189 0.09
190 0.08
191 0.07
192 0.07
193 0.09
194 0.11
195 0.15
196 0.15
197 0.23
198 0.24
199 0.24
200 0.25
201 0.25
202 0.27
203 0.28
204 0.29
205 0.21
206 0.22
207 0.24
208 0.24
209 0.25
210 0.24
211 0.22
212 0.19
213 0.2
214 0.25
215 0.26
216 0.28
217 0.25
218 0.24
219 0.21
220 0.22
221 0.22
222 0.17
223 0.13
224 0.12
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.11
230 0.14
231 0.14
232 0.14
233 0.15
234 0.16
235 0.15
236 0.14
237 0.15
238 0.13
239 0.14
240 0.14
241 0.12
242 0.12
243 0.13
244 0.13
245 0.11
246 0.12
247 0.15
248 0.16
249 0.17
250 0.19
251 0.19
252 0.22
253 0.24
254 0.23
255 0.23
256 0.23
257 0.23
258 0.21
259 0.2
260 0.18
261 0.19
262 0.16
263 0.13
264 0.12
265 0.13
266 0.13
267 0.13
268 0.12
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.09
273 0.07
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.08
281 0.09
282 0.09
283 0.11
284 0.11
285 0.11
286 0.11
287 0.11
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.07
295 0.06
296 0.05
297 0.04
298 0.04
299 0.04