Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0CL38

Protein Details
Accession Q0CL38    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-51STPTTRPPSKVQQPKPQALPNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
269-274RAKARR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, pero 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047260  ERCC1-like_central_dom  
IPR004579  ERCC1/RAD10/SWI10  
IPR011335  Restrct_endonuc-II-like  
IPR010994  RuvA_2-like  
Gene Ontology GO:0000110  C:nucleotide-excision repair factor 1 complex  
GO:0035861  C:site of double-strand break  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0031593  F:polyubiquitin modification-dependent protein binding  
GO:0045002  P:double-strand break repair via single-strand annealing  
GO:0007534  P:gene conversion at mating-type locus  
Pfam View protein in Pfam  
PF03834  Rad10  
CDD cd22325  ERCC1_C-like  
Amino Acid Sequences MAEDFGDDADFNDLLDAEKKTTDSAPERTASTPTTRPPSKVQQPKPQALPNRTAPSAILVSTRQKGNPILDFIKIVPWEYADIPADYVVGTTTCALFLSLKYHRLHPEYIYSRIRQLAGKYLLRILLIIVDIPNHEDSLKELSKTSLVNNLTLVLCWSAPEAAHYLELFKSSEKSQPTAIRTQQAQSYKESLVEFVTTPRSINKSDAASLISTFGSLQNAVNAQPEQISAVPGWGEKKVRKWCNAVREDFRVDPGKRAATKTGGEGESRAKARRTRPAASESLDVPDDNEAMLAAEMGEGRTESGKNADRNPTQEEEMSEGIMAALAKLRENGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.13
3 0.14
4 0.12
5 0.14
6 0.15
7 0.16
8 0.18
9 0.24
10 0.27
11 0.31
12 0.34
13 0.35
14 0.37
15 0.36
16 0.38
17 0.33
18 0.33
19 0.32
20 0.34
21 0.42
22 0.42
23 0.45
24 0.49
25 0.56
26 0.61
27 0.67
28 0.7
29 0.71
30 0.77
31 0.81
32 0.81
33 0.79
34 0.78
35 0.72
36 0.69
37 0.67
38 0.64
39 0.57
40 0.5
41 0.42
42 0.37
43 0.33
44 0.27
45 0.2
46 0.17
47 0.22
48 0.25
49 0.27
50 0.24
51 0.26
52 0.29
53 0.31
54 0.32
55 0.32
56 0.3
57 0.29
58 0.3
59 0.27
60 0.27
61 0.23
62 0.2
63 0.15
64 0.14
65 0.15
66 0.14
67 0.16
68 0.13
69 0.13
70 0.12
71 0.12
72 0.11
73 0.09
74 0.08
75 0.06
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.06
83 0.06
84 0.07
85 0.12
86 0.14
87 0.2
88 0.22
89 0.26
90 0.3
91 0.33
92 0.34
93 0.3
94 0.37
95 0.35
96 0.4
97 0.4
98 0.37
99 0.36
100 0.36
101 0.35
102 0.28
103 0.26
104 0.27
105 0.29
106 0.29
107 0.28
108 0.27
109 0.26
110 0.24
111 0.22
112 0.14
113 0.09
114 0.07
115 0.07
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.07
120 0.07
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.07
125 0.14
126 0.15
127 0.13
128 0.13
129 0.14
130 0.16
131 0.16
132 0.16
133 0.16
134 0.16
135 0.16
136 0.16
137 0.17
138 0.15
139 0.14
140 0.13
141 0.07
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.05
146 0.05
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.08
156 0.07
157 0.08
158 0.09
159 0.14
160 0.14
161 0.15
162 0.19
163 0.23
164 0.26
165 0.31
166 0.31
167 0.31
168 0.31
169 0.31
170 0.31
171 0.31
172 0.3
173 0.26
174 0.27
175 0.24
176 0.25
177 0.23
178 0.19
179 0.15
180 0.14
181 0.12
182 0.1
183 0.13
184 0.11
185 0.11
186 0.13
187 0.15
188 0.16
189 0.17
190 0.19
191 0.18
192 0.19
193 0.19
194 0.18
195 0.16
196 0.14
197 0.14
198 0.1
199 0.09
200 0.08
201 0.08
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.08
207 0.08
208 0.1
209 0.1
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.07
217 0.07
218 0.08
219 0.08
220 0.1
221 0.11
222 0.16
223 0.18
224 0.27
225 0.36
226 0.43
227 0.47
228 0.55
229 0.58
230 0.64
231 0.69
232 0.67
233 0.63
234 0.62
235 0.61
236 0.53
237 0.51
238 0.49
239 0.42
240 0.39
241 0.38
242 0.38
243 0.36
244 0.39
245 0.38
246 0.34
247 0.34
248 0.33
249 0.35
250 0.3
251 0.28
252 0.27
253 0.27
254 0.28
255 0.3
256 0.3
257 0.29
258 0.34
259 0.41
260 0.49
261 0.53
262 0.52
263 0.55
264 0.58
265 0.58
266 0.55
267 0.51
268 0.41
269 0.37
270 0.33
271 0.27
272 0.21
273 0.18
274 0.14
275 0.11
276 0.1
277 0.07
278 0.06
279 0.06
280 0.05
281 0.04
282 0.04
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.08
289 0.09
290 0.1
291 0.17
292 0.23
293 0.27
294 0.34
295 0.42
296 0.44
297 0.48
298 0.52
299 0.5
300 0.46
301 0.44
302 0.4
303 0.36
304 0.32
305 0.29
306 0.23
307 0.18
308 0.15
309 0.13
310 0.11
311 0.07
312 0.09
313 0.09
314 0.1