FuNGI

Q0D1D6

Protein Details

Accession

Q0D1D6

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-55	MVKLGKNSKRTPVRLRHKIEKASAAKQRKQRKLAKKNPEWRSKIKKDPGIPNLFP	Hydrophilic
379-402	FPNAEKSSKKGKKKQEEQARLVLL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
6-50	KNSKRTPVRLRHKIEKASAAKQRKQRKLAKKNPEWRSKIKKDPGI
67-71	KRRLK
386-392	SKKGKKK

Subcellular Location(s)

nucl 16, mito 5, cyto 5, cyto_mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR030378 G_CP_dom IPR014813 Gnl3_N_dom IPR006073 GTP-bd IPR023179 GTP-bd_ortho_bundle_sf IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0030687 C:preribosome, large subunit precursor GO:0005525 F:GTP binding GO:0003924 F:GTPase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0000463 P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF08701 GN3L_Grn1 PF01926 MMR_HSR1
PROSITE	View protein in PROSITE PS51721 G_CP
CDD	cd04178 Nucleostemin_like

Amino Acid Sequences

MVKLGKNSKRTPVRLRHKIEKASAAKQRKQRKLAKKNPEWRSKIKKDPGIPNLFPHKDKILQEIEEKRRLKAEEQMRIREEARARRAAEKAQQSGQQADPNAPQVQDAIDSDDMLDDEMDEDVGDSANPMAALLASARARAAEYDEQSDEEDDEMDEDDEDMDGMEEDHEDGGATLDDSIAPQLVANSFSKESSRRQFDKVFKQVVDAADVVLYVLDARDPEGTRSKEVEREVVAAANGQKRLILILNKIDLVPPPVLKGWLVHLRRYFPTLPLKATNGGGNAHTFDHKQLTVKGTSETLFRALKTFAHNKQMKRAISVGVIGYPNVGKSSVINALTARLNKGSSNACPTGAEAGVTTSLREVKLDSKLKLIDSPGIVFPNAEKSSKKGKKKQEEQARLVLLNAIPPKQIEDPIPAVTLLIKRLSASEGLMSKLLQLYNLPPLFPSGGDQTTDFLIHVARKRGRLGKGGVPNLDAAAMTVINDWRDGRIQGWVNAPVIPVVTTTEGATAAEGVDTKQVVTEWAQEFKIEGLWGDGADDEEMAE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.83
2	0.87
3	0.87
4	0.86
5	0.86
6	0.81
7	0.8
8	0.76
9	0.74
10	0.75
11	0.75
12	0.73
13	0.74
14	0.79
15	0.78
16	0.82
17	0.83
18	0.85
19	0.86
20	0.9
21	0.92
22	0.92
23	0.92
24	0.92
25	0.93
26	0.89
27	0.88
28	0.88
29	0.86
30	0.86
31	0.86
32	0.84
33	0.82
34	0.85
35	0.85
36	0.83
37	0.75
38	0.72
39	0.72
40	0.68
41	0.61
42	0.54
43	0.49
44	0.46
45	0.46
46	0.46
47	0.41
48	0.4
49	0.46
50	0.53
51	0.55
52	0.58
53	0.57
54	0.52
55	0.52
56	0.51
57	0.46
58	0.45
59	0.47
60	0.48
61	0.54
62	0.6
63	0.56
64	0.57
65	0.55
66	0.53
67	0.5
68	0.49
69	0.49
70	0.48
71	0.48
72	0.51
73	0.53
74	0.53
75	0.54
76	0.52
77	0.5
78	0.48
79	0.5
80	0.47
81	0.47
82	0.44
83	0.4
84	0.32
85	0.31
86	0.28
87	0.28
88	0.28
89	0.23
90	0.21
91	0.17
92	0.17
93	0.15
94	0.14
95	0.14
96	0.12
97	0.12
98	0.12
99	0.12
100	0.11
101	0.1
102	0.09
103	0.04
104	0.05
105	0.05
106	0.05
107	0.04
108	0.04
109	0.04
110	0.05
111	0.04
112	0.04
113	0.04
114	0.05
115	0.04
116	0.04
117	0.04
118	0.04
119	0.04
120	0.04
121	0.08
122	0.07
123	0.08
124	0.08
125	0.08
126	0.09
127	0.09
128	0.14
129	0.15
130	0.17
131	0.2
132	0.21
133	0.21
134	0.22
135	0.22
136	0.17
137	0.12
138	0.11
139	0.07
140	0.07
141	0.07
142	0.07
143	0.06
144	0.06
145	0.06
146	0.05
147	0.05
148	0.04
149	0.04
150	0.04
151	0.04
152	0.04
153	0.04
154	0.04
155	0.04
156	0.04
157	0.04
158	0.04
159	0.04
160	0.04
161	0.04
162	0.04
163	0.04
164	0.04
165	0.04
166	0.04
167	0.04
168	0.04
169	0.04
170	0.04
171	0.05
172	0.07
173	0.08
174	0.1
175	0.11
176	0.11
177	0.14
178	0.16
179	0.22
180	0.28
181	0.36
182	0.37
183	0.41
184	0.49
185	0.55
186	0.62
187	0.63
188	0.6
189	0.51
190	0.5
191	0.48
192	0.41
193	0.35
194	0.25
195	0.17
196	0.12
197	0.11
198	0.09
199	0.06
200	0.05
201	0.03
202	0.02
203	0.03
204	0.03
205	0.04
206	0.06
207	0.07
208	0.1
209	0.17
210	0.18
211	0.2
212	0.23
213	0.24
214	0.26
215	0.26
216	0.27
217	0.21
218	0.21
219	0.19
220	0.17
221	0.15
222	0.12
223	0.14
224	0.15
225	0.14
226	0.12
227	0.12
228	0.11
229	0.12
230	0.13
231	0.12
232	0.11
233	0.13
234	0.14
235	0.14
236	0.14
237	0.14
238	0.12
239	0.12
240	0.11
241	0.09
242	0.09
243	0.09
244	0.1
245	0.09
246	0.09
247	0.11
248	0.19
249	0.2
250	0.22
251	0.24
252	0.27
253	0.27
254	0.31
255	0.28
256	0.24
257	0.3
258	0.28
259	0.29
260	0.28
261	0.28
262	0.26
263	0.25
264	0.22
265	0.15
266	0.14
267	0.12
268	0.11
269	0.11
270	0.1
271	0.1
272	0.09
273	0.09
274	0.11
275	0.11
276	0.12
277	0.13
278	0.16
279	0.16
280	0.17
281	0.16
282	0.15
283	0.15
284	0.15
285	0.13
286	0.13
287	0.13
288	0.12
289	0.13
290	0.12
291	0.14
292	0.18
293	0.24
294	0.24
295	0.34
296	0.39
297	0.38
298	0.46
299	0.52
300	0.47
301	0.43
302	0.41
303	0.32
304	0.28
305	0.28
306	0.19
307	0.14
308	0.14
309	0.11
310	0.1
311	0.08
312	0.08
313	0.07
314	0.07
315	0.05
316	0.05
317	0.08
318	0.12
319	0.12
320	0.12
321	0.12
322	0.14
323	0.17
324	0.17
325	0.15
326	0.13
327	0.13
328	0.13
329	0.16
330	0.16
331	0.16
332	0.21
333	0.21
334	0.2
335	0.2
336	0.2
337	0.19
338	0.16
339	0.15
340	0.08
341	0.08
342	0.09
343	0.09
344	0.08
345	0.07
346	0.09
347	0.09
348	0.09
349	0.1
350	0.12
351	0.21
352	0.26
353	0.26
354	0.28
355	0.3
356	0.3
357	0.31
358	0.29
359	0.23
360	0.19
361	0.2
362	0.18
363	0.18
364	0.17
365	0.14
366	0.14
367	0.18
368	0.19
369	0.19
370	0.18
371	0.21
372	0.33
373	0.41
374	0.51
375	0.52
376	0.61
377	0.7
378	0.8
379	0.86
380	0.86
381	0.87
382	0.82
383	0.8
384	0.72
385	0.61
386	0.52
387	0.43
388	0.32
389	0.27
390	0.24
391	0.17
392	0.15
393	0.15
394	0.18
395	0.17
396	0.19
397	0.17
398	0.19
399	0.21
400	0.22
401	0.23
402	0.19
403	0.18
404	0.18
405	0.17
406	0.15
407	0.13
408	0.12
409	0.11
410	0.13
411	0.14
412	0.12
413	0.12
414	0.14
415	0.14
416	0.15
417	0.15
418	0.14
419	0.14
420	0.15
421	0.15
422	0.11
423	0.11
424	0.12
425	0.2
426	0.21
427	0.2
428	0.18
429	0.2
430	0.2
431	0.19
432	0.19
433	0.15
434	0.16
435	0.17
436	0.17
437	0.16
438	0.17
439	0.17
440	0.14
441	0.1
442	0.11
443	0.15
444	0.19
445	0.27
446	0.3
447	0.33
448	0.4
449	0.48
450	0.5
451	0.52
452	0.53
453	0.53
454	0.58
455	0.6
456	0.54
457	0.48
458	0.43
459	0.36
460	0.31
461	0.22
462	0.13
463	0.09
464	0.07
465	0.07
466	0.08
467	0.09
468	0.09
469	0.11
470	0.11
471	0.12
472	0.15
473	0.15
474	0.14
475	0.21
476	0.24
477	0.26
478	0.3
479	0.31
480	0.3
481	0.3
482	0.29
483	0.22
484	0.19
485	0.15
486	0.11
487	0.11
488	0.12
489	0.11
490	0.11
491	0.12
492	0.12
493	0.11
494	0.11
495	0.09
496	0.07
497	0.07
498	0.07
499	0.07
500	0.09
501	0.09
502	0.09
503	0.1
504	0.1
505	0.11
506	0.13
507	0.2
508	0.2
509	0.24
510	0.25
511	0.24
512	0.25
513	0.23
514	0.23
515	0.16
516	0.13
517	0.12
518	0.12
519	0.12
520	0.11
521	0.11
522	0.1
523	0.1

Q0D1D6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer