FuNGI

Q0CSH2

Protein Details

Accession

Q0CSH2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
15-37	AQMANRKIKDIRRRRPNTSGAGA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
26-28	RRR

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025574 Nucleoporin_FG_rpt IPR011993 PH-like_dom_sf IPR000156 Ran_bind_dom
Gene Ontology	GO:0005643 C:nuclear pore GO:0046907 P:intracellular transport
Pfam	View protein in Pfam PF13634 Nucleoporin_FG PF00638 Ran_BP1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50196 RANBD1
CDD	cd13170 RanBD_NUP50

Amino Acid Sequences

MSSTPDDKPQRATAAQMANRKIKDIRRRRPNTSGAGASFGGPFNSLDPNTVSGTPGAPQPATNGFTFGQSQSFPGASSTPSQPSQNGSSPFAFGQASGSSSFNFGFGGSGAASNPFASMNTGGSGQSSDGGSFSGFKGNLFNIPATSSPAPAQQSLPSGGLFGAGQQQNNTSGGLFGNTSTPSTQPASAAPIAGGIFGQTSGSTTPPTNIFGQSTTNKPTAFGQSTAFGDSMQTSPDSKQSKPSIFGAGTTSSGFGASSGFASPGAGSLFGTPTSKPAETPAKNLFGAKPAEQSTPSTSLFGATTQPSSATTPAPSTTPAAASTTPAPSTSLFGAATPSAASPAAPFQNLFGTPAPSTTHKPAEKEEKKPEESQPKPAFQFGASTSGATPSLFSKSETAAAPSAPAGGLFQPPSTGSLFAPKPAAAAEQDKTASSAGNPFASLFAQKPADTSKPTTEQKPLPSPAPFSGLFTPKPSDEAKKSESAKSTTPAPLFSAPTTTTTPSAPSLFAQPSPAFSTSTTDKPQAPASPVPAPAPSPLKINSPVSTSKPSTTTENAVDSLSKATPSKLPANLDKKEKDDVEMVHRMRILNESFQRELSRLNPATDDFDRLIEFYTRVRETIGAPVGGKRKSRDDGGVSTAEPASKKTKPFGLPSDAASAAKGGTPPPPKLFGASTPTTATKRKSTEDETSAAPAEKRVNGDSTTASIFAQSFSKSKTSESGPESTTASAAKPSTPDTSKPALFSTTPTTSPAKPLFSAPTTTKEASGSKPLFSTTPKPASTAPSTGSTPANPFVLKPTGGQSSTSAAPPPGLPKFGSGTTDFFAQFKQQAEKDAEKEKAKRKAEDFDSEEEDEAEWERRDAEEREKKLKELQSQSVKRSKFVPGKGFVFEDEASDATEKEDKAAPAASSSGASVFDKKSASPVKSNNIFGHLSATPSEAEEDDADDTEEASDGDEGDATKESSFGATSEDDNARDAETSEAESKAVSGSVAEFSANESGDDGDLTKAIQNSKKATEPASGGRSLFDRVQYDQDGKPKRQNEEEPKNPFSGLFNNTKFSSPVNSTSSTPNPFTFGKPQSEQGDASASKPATPNIFGAAKPAGSLFGSPTPSASGASTPSIFAANQGTDKTWKPNSPIKFANSTSTPASNGESGAADTSKPFSTLFGGDGASDSKAATGSGTPSLGFSFGGPSQQSSSFLAPSSVSSATPSRASTPGVTSDTGAEESGDGDAAEKLPQVDLARSRAGEENEDVVIETRARGLKFVDKSWESQGVGFLRVLKDRTTSRGRVILRADPSGNVVLNAALMKAIEYKVSGNNVQFLVPKAEGPPEQWALRVKKEDVERLGAAMQETKT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.51
3	0.53
4	0.55
5	0.56
6	0.56
7	0.56
8	0.55
9	0.55
10	0.6
11	0.63
12	0.67
13	0.71
14	0.79
15	0.83
16	0.86
17	0.85
18	0.82
19	0.79
20	0.74
21	0.64
22	0.6
23	0.52
24	0.43
25	0.36
26	0.28
27	0.21
28	0.15
29	0.14
30	0.12
31	0.17
32	0.16
33	0.17
34	0.18
35	0.2
36	0.22
37	0.22
38	0.22
39	0.17
40	0.18
41	0.17
42	0.18
43	0.19
44	0.16
45	0.16
46	0.19
47	0.23
48	0.25
49	0.24
50	0.24
51	0.22
52	0.24
53	0.26
54	0.23
55	0.2
56	0.18
57	0.19
58	0.19
59	0.18
60	0.16
61	0.16
62	0.16
63	0.15
64	0.18
65	0.21
66	0.23
67	0.26
68	0.28
69	0.28
70	0.32
71	0.36
72	0.39
73	0.39
74	0.38
75	0.37
76	0.37
77	0.35
78	0.32
79	0.26
80	0.19
81	0.18
82	0.14
83	0.15
84	0.14
85	0.15
86	0.13
87	0.15
88	0.15
89	0.13
90	0.12
91	0.1
92	0.09
93	0.08
94	0.09
95	0.08
96	0.08
97	0.08
98	0.1
99	0.1
100	0.09
101	0.1
102	0.08
103	0.08
104	0.1
105	0.11
106	0.11
107	0.11
108	0.12
109	0.12
110	0.12
111	0.12
112	0.1
113	0.11
114	0.1
115	0.09
116	0.09
117	0.09
118	0.09
119	0.1
120	0.1
121	0.14
122	0.14
123	0.14
124	0.17
125	0.18
126	0.21
127	0.22
128	0.22
129	0.16
130	0.18
131	0.19
132	0.22
133	0.22
134	0.2
135	0.19
136	0.23
137	0.25
138	0.24
139	0.26
140	0.22
141	0.24
142	0.25
143	0.25
144	0.2
145	0.18
146	0.16
147	0.15
148	0.12
149	0.1
150	0.16
151	0.16
152	0.17
153	0.17
154	0.19
155	0.21
156	0.22
157	0.21
158	0.13
159	0.12
160	0.11
161	0.12
162	0.1
163	0.09
164	0.11
165	0.11
166	0.12
167	0.13
168	0.13
169	0.15
170	0.17
171	0.18
172	0.16
173	0.17
174	0.21
175	0.2
176	0.2
177	0.16
178	0.15
179	0.14
180	0.13
181	0.12
182	0.06
183	0.06
184	0.06
185	0.06
186	0.04
187	0.06
188	0.07
189	0.08
190	0.1
191	0.1
192	0.13
193	0.14
194	0.17
195	0.18
196	0.19
197	0.2
198	0.19
199	0.24
200	0.25
201	0.28
202	0.3
203	0.31
204	0.29
205	0.29
206	0.31
207	0.33
208	0.33
209	0.3
210	0.27
211	0.27
212	0.28
213	0.28
214	0.25
215	0.17
216	0.14
217	0.15
218	0.13
219	0.11
220	0.11
221	0.11
222	0.12
223	0.2
224	0.23
225	0.22
226	0.31
227	0.37
228	0.4
229	0.42
230	0.43
231	0.42
232	0.39
233	0.39
234	0.33
235	0.27
236	0.24
237	0.21
238	0.19
239	0.12
240	0.12
241	0.11
242	0.08
243	0.07
244	0.06
245	0.06
246	0.06
247	0.07
248	0.06
249	0.07
250	0.07
251	0.07
252	0.07
253	0.06
254	0.06
255	0.07
256	0.08
257	0.09
258	0.1
259	0.09
260	0.11
261	0.16
262	0.16
263	0.15
264	0.2
265	0.3
266	0.31
267	0.37
268	0.4
269	0.39
270	0.4
271	0.41
272	0.36
273	0.31
274	0.33
275	0.28
276	0.27
277	0.26
278	0.27
279	0.26
280	0.28
281	0.27
282	0.29
283	0.28
284	0.24
285	0.21
286	0.21
287	0.19
288	0.17
289	0.16
290	0.12
291	0.13
292	0.12
293	0.13
294	0.13
295	0.14
296	0.15
297	0.14
298	0.14
299	0.14
300	0.15
301	0.15
302	0.15
303	0.16
304	0.15
305	0.15
306	0.14
307	0.15
308	0.14
309	0.16
310	0.16
311	0.16
312	0.16
313	0.15
314	0.15
315	0.14
316	0.16
317	0.14
318	0.14
319	0.12
320	0.11
321	0.13
322	0.11
323	0.11
324	0.09
325	0.08
326	0.07
327	0.07
328	0.07
329	0.06
330	0.1
331	0.11
332	0.11
333	0.11
334	0.11
335	0.15
336	0.15
337	0.17
338	0.14
339	0.15
340	0.15
341	0.16
342	0.18
343	0.18
344	0.22
345	0.24
346	0.32
347	0.31
348	0.34
349	0.39
350	0.48
351	0.52
352	0.56
353	0.62
354	0.61
355	0.63
356	0.65
357	0.68
358	0.67
359	0.63
360	0.65
361	0.61
362	0.59
363	0.56
364	0.53
365	0.45
366	0.34
367	0.35
368	0.25
369	0.24
370	0.19
371	0.18
372	0.16
373	0.16
374	0.16
375	0.13
376	0.12
377	0.08
378	0.12
379	0.11
380	0.12
381	0.13
382	0.14
383	0.17
384	0.16
385	0.17
386	0.15
387	0.14
388	0.14
389	0.12
390	0.11
391	0.08
392	0.08
393	0.06
394	0.06
395	0.08
396	0.08
397	0.08
398	0.08
399	0.09
400	0.11
401	0.11
402	0.11
403	0.1
404	0.16
405	0.16
406	0.17
407	0.18
408	0.16
409	0.15
410	0.14
411	0.16
412	0.11
413	0.14
414	0.14
415	0.15
416	0.15
417	0.15
418	0.16
419	0.15
420	0.13
421	0.1
422	0.13
423	0.12
424	0.12
425	0.12
426	0.11
427	0.11
428	0.12
429	0.12
430	0.09
431	0.11
432	0.12
433	0.12
434	0.13
435	0.16
436	0.19
437	0.21
438	0.23
439	0.25
440	0.31
441	0.34
442	0.36
443	0.39
444	0.4
445	0.43
446	0.47
447	0.45
448	0.41
449	0.4
450	0.4
451	0.35
452	0.34
453	0.28
454	0.24
455	0.26
456	0.25
457	0.25
458	0.24
459	0.25
460	0.2
461	0.23
462	0.23
463	0.24
464	0.25
465	0.3
466	0.31
467	0.36
468	0.38
469	0.4
470	0.41
471	0.38
472	0.36
473	0.33
474	0.33
475	0.31
476	0.29
477	0.25
478	0.24
479	0.23
480	0.23
481	0.21
482	0.2
483	0.16
484	0.18
485	0.19
486	0.18
487	0.17
488	0.15
489	0.17
490	0.16
491	0.16
492	0.14
493	0.12
494	0.15
495	0.15
496	0.15
497	0.17
498	0.15
499	0.16
500	0.19
501	0.19
502	0.16
503	0.15
504	0.18
505	0.18
506	0.22
507	0.22
508	0.22
509	0.22
510	0.23
511	0.25
512	0.23
513	0.25
514	0.22
515	0.24
516	0.24
517	0.24
518	0.23
519	0.21
520	0.2
521	0.19
522	0.2
523	0.17
524	0.17
525	0.17
526	0.19
527	0.22
528	0.24
529	0.22
530	0.23
531	0.25
532	0.25
533	0.29
534	0.28
535	0.26
536	0.26
537	0.26
538	0.27
539	0.26
540	0.26
541	0.22
542	0.22
543	0.21
544	0.19
545	0.18
546	0.14
547	0.14
548	0.11
549	0.1
550	0.09
551	0.09
552	0.12
553	0.15
554	0.19
555	0.2
556	0.23
557	0.31
558	0.38
559	0.41
560	0.45
561	0.43
562	0.41
563	0.42
564	0.39
565	0.33
566	0.29
567	0.26
568	0.26
569	0.31
570	0.29
571	0.26
572	0.27
573	0.25
574	0.23
575	0.24
576	0.2
577	0.18
578	0.22
579	0.24
580	0.24
581	0.25
582	0.25
583	0.22
584	0.22
585	0.18
586	0.22
587	0.19
588	0.19
589	0.19
590	0.19
591	0.23
592	0.22
593	0.23
594	0.15
595	0.15
596	0.14
597	0.13
598	0.14
599	0.1
600	0.1
601	0.09
602	0.13
603	0.12
604	0.12
605	0.13
606	0.12
607	0.13
608	0.17
609	0.17
610	0.13
611	0.13
612	0.16
613	0.2
614	0.22
615	0.23
616	0.2
617	0.24
618	0.26
619	0.27
620	0.27
621	0.26
622	0.26
623	0.27
624	0.26
625	0.22
626	0.21
627	0.19
628	0.16
629	0.13
630	0.13
631	0.14
632	0.16
633	0.17
634	0.18
635	0.24
636	0.27
637	0.31
638	0.33
639	0.34
640	0.32
641	0.32
642	0.33
643	0.27
644	0.24
645	0.2
646	0.16
647	0.1
648	0.09
649	0.08
650	0.06
651	0.11
652	0.14
653	0.16
654	0.18
655	0.2
656	0.2
657	0.21
658	0.22
659	0.18
660	0.21
661	0.2
662	0.2
663	0.18
664	0.2
665	0.21
666	0.23
667	0.23
668	0.22
669	0.24
670	0.25
671	0.28
672	0.31
673	0.34
674	0.34
675	0.34
676	0.29
677	0.28
678	0.26
679	0.22
680	0.17
681	0.13
682	0.12
683	0.12
684	0.12
685	0.12
686	0.13
687	0.13
688	0.15
689	0.13
690	0.13
691	0.12
692	0.11
693	0.1
694	0.09
695	0.08
696	0.08
697	0.08
698	0.08
699	0.08
700	0.1
701	0.12
702	0.12
703	0.13
704	0.15
705	0.16
706	0.21
707	0.23
708	0.24
709	0.23
710	0.23
711	0.24
712	0.21
713	0.19
714	0.14
715	0.11
716	0.1
717	0.09
718	0.08
719	0.09
720	0.11
721	0.14
722	0.15
723	0.17
724	0.2
725	0.24
726	0.24
727	0.24
728	0.23
729	0.21
730	0.2
731	0.2
732	0.2
733	0.18
734	0.18
735	0.2
736	0.22
737	0.2
738	0.25
739	0.25
740	0.21
741	0.2
742	0.21
743	0.21
744	0.2
745	0.23
746	0.19
747	0.22
748	0.25
749	0.24
750	0.23
751	0.22
752	0.23
753	0.21
754	0.28
755	0.24
756	0.2
757	0.2
758	0.2
759	0.2
760	0.21
761	0.24
762	0.22
763	0.27
764	0.27
765	0.28
766	0.29
767	0.32
768	0.32
769	0.29
770	0.24
771	0.21
772	0.21
773	0.21
774	0.21
775	0.17
776	0.16
777	0.15
778	0.15
779	0.12
780	0.12
781	0.13
782	0.14
783	0.14
784	0.13
785	0.15
786	0.17
787	0.17
788	0.18
789	0.15
790	0.16
791	0.17
792	0.16
793	0.14
794	0.11
795	0.11
796	0.11
797	0.14
798	0.12
799	0.13
800	0.12
801	0.13
802	0.16
803	0.16
804	0.18
805	0.15
806	0.16
807	0.15
808	0.17
809	0.16
810	0.14
811	0.13
812	0.13
813	0.14
814	0.14
815	0.17
816	0.16
817	0.2
818	0.24
819	0.27
820	0.29
821	0.32
822	0.35
823	0.36
824	0.42
825	0.46
826	0.51
827	0.52
828	0.53
829	0.51
830	0.55
831	0.55
832	0.55
833	0.51
834	0.45
835	0.45
836	0.4
837	0.37
838	0.29
839	0.24
840	0.17
841	0.14
842	0.13
843	0.09
844	0.08
845	0.08
846	0.09
847	0.12
848	0.14
849	0.23
850	0.3
851	0.35
852	0.43
853	0.44
854	0.45
855	0.48
856	0.52
857	0.5
858	0.48
859	0.51
860	0.54
861	0.57
862	0.62
863	0.62
864	0.57
865	0.5
866	0.46
867	0.46
868	0.43
869	0.45
870	0.46
871	0.44
872	0.45
873	0.46
874	0.44
875	0.36
876	0.31
877	0.25
878	0.19
879	0.14
880	0.12
881	0.11
882	0.11
883	0.1
884	0.08
885	0.11
886	0.1
887	0.11
888	0.14
889	0.13
890	0.14
891	0.15
892	0.14
893	0.12
894	0.13
895	0.11
896	0.09
897	0.09
898	0.08
899	0.08
900	0.08
901	0.11
902	0.1
903	0.13
904	0.13
905	0.13
906	0.19
907	0.24
908	0.27
909	0.3
910	0.34
911	0.4
912	0.45
913	0.48
914	0.42
915	0.4
916	0.38
917	0.32
918	0.31
919	0.23
920	0.19
921	0.16
922	0.16
923	0.12
924	0.12
925	0.13
926	0.08
927	0.09
928	0.08
929	0.09
930	0.08
931	0.08
932	0.08
933	0.07
934	0.07
935	0.06
936	0.06
937	0.05
938	0.05
939	0.05
940	0.04
941	0.05
942	0.05
943	0.05
944	0.06
945	0.07
946	0.07
947	0.07
948	0.07
949	0.07
950	0.07
951	0.07
952	0.06
953	0.08
954	0.08
955	0.09
956	0.13
957	0.15
958	0.14
959	0.15
960	0.15
961	0.13
962	0.13
963	0.13
964	0.1
965	0.09
966	0.11
967	0.12
968	0.12
969	0.11
970	0.11
971	0.1
972	0.09
973	0.09
974	0.06
975	0.05
976	0.05
977	0.06
978	0.07
979	0.06
980	0.06
981	0.07
982	0.09
983	0.09
984	0.08
985	0.08
986	0.08
987	0.08
988	0.08
989	0.07
990	0.06
991	0.06
992	0.06
993	0.08
994	0.1
995	0.14
996	0.18
997	0.21
998	0.25
999	0.28
1000	0.32
1001	0.32
1002	0.32
1003	0.31
1004	0.31
1005	0.32
1006	0.32
1007	0.31
1008	0.27
1009	0.26
1010	0.25
1011	0.24
1012	0.22
1013	0.19
1014	0.18
1015	0.19
1016	0.23
1017	0.24
1018	0.27
1019	0.28
1020	0.35
1021	0.39
1022	0.4
1023	0.46
1024	0.48
1025	0.5
1026	0.54
1027	0.61
1028	0.64
1029	0.67
1030	0.72
1031	0.72
1032	0.69
1033	0.65
1034	0.58
1035	0.48
1036	0.4
1037	0.35
1038	0.31
1039	0.31
1040	0.3
1041	0.33
1042	0.34
1043	0.34
1044	0.32
1045	0.28
1046	0.28
1047	0.23
1048	0.27
1049	0.27
1050	0.28
1051	0.29
1052	0.34
1053	0.38
1054	0.37
1055	0.36
1056	0.31
1057	0.31
1058	0.3
1059	0.32
1060	0.35
1061	0.34
1062	0.37
1063	0.36
1064	0.41
1065	0.4
1066	0.42
1067	0.38
1068	0.31
1069	0.32
1070	0.26
1071	0.25
1072	0.25
1073	0.22
1074	0.21
1075	0.22
1076	0.23
1077	0.2
1078	0.21
1079	0.2
1080	0.19
1081	0.21
1082	0.19
1083	0.21
1084	0.2
1085	0.17
1086	0.16
1087	0.15
1088	0.12
1089	0.11
1090	0.11
1091	0.11
1092	0.14
1093	0.16
1094	0.16
1095	0.16
1096	0.17
1097	0.17
1098	0.17
1099	0.15
1100	0.12
1101	0.12
1102	0.15
1103	0.15
1104	0.13
1105	0.13
1106	0.13
1107	0.12
1108	0.13
1109	0.14
1110	0.13
1111	0.14
1112	0.15
1113	0.16
1114	0.18
1115	0.21
1116	0.26
1117	0.29
1118	0.31
1119	0.36
1120	0.42
1121	0.46
1122	0.5
1123	0.54
1124	0.52
1125	0.53
1126	0.5
1127	0.51
1128	0.45
1129	0.43
1130	0.39
1131	0.34
1132	0.31
1133	0.25
1134	0.26
1135	0.21
1136	0.19
1137	0.16
1138	0.14
1139	0.13
1140	0.13
1141	0.12
1142	0.1
1143	0.1
1144	0.12
1145	0.12
1146	0.12
1147	0.12
1148	0.11
1149	0.14
1150	0.15
1151	0.15
1152	0.13
1153	0.13
1154	0.12
1155	0.13
1156	0.13
1157	0.11
1158	0.1
1159	0.09
1160	0.08
1161	0.08
1162	0.08
1163	0.08
1164	0.08
1165	0.09
1166	0.11
1167	0.12
1168	0.11
1169	0.12
1170	0.12
1171	0.12
1172	0.11
1173	0.09
1174	0.11
1175	0.11
1176	0.15
1177	0.15
1178	0.16
1179	0.19
1180	0.2
1181	0.22
1182	0.21
1183	0.23
1184	0.2
1185	0.2
1186	0.19
1187	0.17
1188	0.17
1189	0.18
1190	0.15
1191	0.13
1192	0.15
1193	0.17
1194	0.18
1195	0.2
1196	0.21
1197	0.2
1198	0.22
1199	0.24
1200	0.23
1201	0.24
1202	0.27
1203	0.27
1204	0.26
1205	0.24
1206	0.23
1207	0.23
1208	0.21
1209	0.18
1210	0.13
1211	0.1
1212	0.1
1213	0.1
1214	0.08
1215	0.06
1216	0.06
1217	0.07
1218	0.07
1219	0.08
1220	0.08
1221	0.09
1222	0.09
1223	0.12
1224	0.13
1225	0.17
1226	0.2
1227	0.24
1228	0.27
1229	0.26
1230	0.29
1231	0.32
1232	0.32
1233	0.3
1234	0.28
1235	0.27
1236	0.23
1237	0.23
1238	0.21
1239	0.17
1240	0.16
1241	0.13
1242	0.11
1243	0.13
1244	0.17
1245	0.17
1246	0.18
1247	0.2
1248	0.27
1249	0.31
1250	0.34
1251	0.39
1252	0.37
1253	0.4
1254	0.44
1255	0.47
1256	0.39
1257	0.36
1258	0.39
1259	0.32
1260	0.31
1261	0.29
1262	0.27
1263	0.24
1264	0.27
1265	0.28
1266	0.24
1267	0.27
1268	0.29
1269	0.35
1270	0.4
1271	0.41
1272	0.43
1273	0.49
1274	0.5
1275	0.51
1276	0.53
1277	0.53
1278	0.48
1279	0.49
1280	0.45
1281	0.37
1282	0.39
1283	0.35
1284	0.3
1285	0.23
1286	0.19
1287	0.14
1288	0.14
1289	0.13
1290	0.1
1291	0.07
1292	0.06
1293	0.07
1294	0.09
1295	0.1
1296	0.1
1297	0.11
1298	0.13
1299	0.17
1300	0.23
1301	0.26
1302	0.25
1303	0.28
1304	0.28
1305	0.29
1306	0.29
1307	0.27
1308	0.28
1309	0.24
1310	0.24
1311	0.22
1312	0.26
1313	0.26
1314	0.27
1315	0.31
1316	0.3
1317	0.3
1318	0.33
1319	0.39
1320	0.39
1321	0.46
1322	0.49
1323	0.44
1324	0.46
1325	0.52
1326	0.57
1327	0.53
1328	0.54
1329	0.47
1330	0.43
1331	0.42
1332	0.36
1333	0.3

Q0CSH2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer