Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0CR49

Protein Details
Accession Q0CR49    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
156-184TESPSSDSRKKKKKSSPNKTKSKSDKKEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
100-107KGALRRKR
164-188RKKKKKSSPNKTKSKSDKKEAGSPK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, mito_nucl 13.666, cyto_nucl 10.833, mito 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
Amino Acid Sequences MVRPKPNSSFASNRMTRSNFTGESLLSTFRPTTSKLPAKPEPATDDEPISSEEDVESNACSSQGSGARRSPSLPKITLEEKLAKSSEGQAEDKDGKNSAKGALRRKRGPEVLGTAGESDDDDMFRGMRSSQSAKRTFQSRTRVFGRTSSSVVPSQTESPSSDSRKKKKKSSPNKTKSKSDKKEAGSPKEFKVPMNIDIPSPVKSRPSPQFKMPGLPDVISSSFATSSAQVFDDDSGSTTPLSSLSSSVVDALDTMSETADDPIAADQTVCPWCKEPVDPESLMRFQAQSKQRIREQQRFCESHKTSSAEKEWREKGYPEINWDRFDERIKRHFDDIESLLVPESTSYYRNILDASLKSGQAKNFRLTLDGDGLETISCGYYGTQGAAKM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.56
3 0.51
4 0.49
5 0.49
6 0.4
7 0.38
8 0.37
9 0.3
10 0.31
11 0.29
12 0.26
13 0.2
14 0.21
15 0.19
16 0.18
17 0.2
18 0.2
19 0.24
20 0.33
21 0.41
22 0.44
23 0.52
24 0.57
25 0.61
26 0.61
27 0.6
28 0.56
29 0.53
30 0.52
31 0.46
32 0.41
33 0.35
34 0.33
35 0.29
36 0.25
37 0.19
38 0.15
39 0.13
40 0.11
41 0.11
42 0.1
43 0.1
44 0.08
45 0.08
46 0.08
47 0.08
48 0.07
49 0.11
50 0.16
51 0.19
52 0.23
53 0.27
54 0.3
55 0.31
56 0.34
57 0.36
58 0.38
59 0.42
60 0.4
61 0.37
62 0.39
63 0.41
64 0.42
65 0.39
66 0.39
67 0.34
68 0.35
69 0.34
70 0.29
71 0.28
72 0.3
73 0.31
74 0.27
75 0.27
76 0.23
77 0.28
78 0.32
79 0.33
80 0.29
81 0.27
82 0.23
83 0.23
84 0.24
85 0.23
86 0.25
87 0.3
88 0.39
89 0.45
90 0.52
91 0.57
92 0.62
93 0.65
94 0.63
95 0.59
96 0.54
97 0.5
98 0.45
99 0.4
100 0.34
101 0.27
102 0.22
103 0.2
104 0.14
105 0.1
106 0.07
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.07
113 0.06
114 0.07
115 0.11
116 0.16
117 0.22
118 0.3
119 0.35
120 0.37
121 0.4
122 0.44
123 0.45
124 0.47
125 0.52
126 0.47
127 0.49
128 0.52
129 0.51
130 0.47
131 0.47
132 0.45
133 0.37
134 0.35
135 0.31
136 0.28
137 0.26
138 0.25
139 0.22
140 0.18
141 0.18
142 0.16
143 0.16
144 0.15
145 0.17
146 0.22
147 0.26
148 0.34
149 0.4
150 0.49
151 0.58
152 0.63
153 0.69
154 0.74
155 0.8
156 0.83
157 0.85
158 0.87
159 0.88
160 0.92
161 0.87
162 0.87
163 0.87
164 0.87
165 0.83
166 0.79
167 0.77
168 0.69
169 0.73
170 0.71
171 0.68
172 0.64
173 0.6
174 0.53
175 0.52
176 0.49
177 0.4
178 0.38
179 0.32
180 0.28
181 0.27
182 0.26
183 0.19
184 0.21
185 0.22
186 0.18
187 0.17
188 0.14
189 0.15
190 0.16
191 0.22
192 0.28
193 0.36
194 0.37
195 0.4
196 0.48
197 0.46
198 0.5
199 0.45
200 0.4
201 0.32
202 0.29
203 0.25
204 0.19
205 0.18
206 0.14
207 0.14
208 0.1
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.08
219 0.08
220 0.07
221 0.08
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.06
227 0.06
228 0.07
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.07
237 0.06
238 0.06
239 0.05
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.09
255 0.13
256 0.13
257 0.14
258 0.15
259 0.17
260 0.19
261 0.21
262 0.22
263 0.22
264 0.27
265 0.27
266 0.28
267 0.31
268 0.3
269 0.29
270 0.25
271 0.22
272 0.18
273 0.26
274 0.3
275 0.35
276 0.4
277 0.46
278 0.51
279 0.6
280 0.67
281 0.68
282 0.7
283 0.7
284 0.73
285 0.71
286 0.68
287 0.69
288 0.63
289 0.6
290 0.58
291 0.52
292 0.45
293 0.48
294 0.52
295 0.49
296 0.5
297 0.52
298 0.51
299 0.52
300 0.52
301 0.47
302 0.46
303 0.47
304 0.45
305 0.45
306 0.5
307 0.49
308 0.47
309 0.49
310 0.44
311 0.38
312 0.43
313 0.43
314 0.41
315 0.46
316 0.5
317 0.51
318 0.53
319 0.54
320 0.49
321 0.47
322 0.41
323 0.38
324 0.31
325 0.28
326 0.24
327 0.21
328 0.18
329 0.12
330 0.13
331 0.1
332 0.11
333 0.13
334 0.15
335 0.16
336 0.17
337 0.17
338 0.16
339 0.2
340 0.19
341 0.23
342 0.24
343 0.25
344 0.28
345 0.31
346 0.35
347 0.38
348 0.42
349 0.4
350 0.41
351 0.4
352 0.39
353 0.37
354 0.36
355 0.32
356 0.27
357 0.24
358 0.2
359 0.2
360 0.17
361 0.15
362 0.11
363 0.07
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.09
368 0.1
369 0.12