Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0D0A6

Protein Details
Accession Q0D0A6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-27DDDASNPRKRRRIGHPKASPYLLRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-18RKRRRIGH
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11.5, cyto 7.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001180  CNH_dom  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
IPR019453  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_2  
Gene Ontology GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF10367  Vps39_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50219  CNH  
Amino Acid Sequences MVSDDDASNPRKRRRIGHPKASPYLLRSLFDQIPLTADDPNAEVHITCVEYWNDNLYIGTSAAEILHFVSLPPDPADNTSDSTFILASRLPITFSHSASTSSQLPGIQQIILLPSVNKACILCNGTVTFYMLPELSPAFDNTKVGNCRWIGGLDQNTDPDEPENPVIMIGAQNRIMLVRIGDAARRVRNIEFPSCLAAARRGIIACAADAHGYSLLDVEHQQKIPLFPVSVLNEAIGSGQIEDMPPASSPSLSNHSPPAAGRSHNRSSSLNTLAGMLQPNPQSSARDRSSSVTPELSPESGTPRRSLSQERGRSASPRTSTEHPEEESQSSTGEAAKPLPPLPKQPSAQLKPHVLSPTPNEFLVVRGTDETEPGVGLFVNMDGDVDRGTITFHRYPKSIVIDKGDENNLMQSPEDTREQLVLAVIETEKDGKPFNSLEIQPWDVDPAEAEDHKNWVDFPSTTGDFSHVGLCHTTSPSKLEIYEMGKLLRMVRLKTPLLSPHIPATDSRTQASIEQLQKEKELFEAQEATDSESSRKEDAAGRGWEAERNAEEAKFARDLGKTQSSLLMWSGNQIWRIVRNPLPIQLNDTLQTAQDLDNDRHKVLNRRVIEDTIELIQSTEPKSEAEFLGLNYLKQKASLLLLGDLMSMDPASRTPAVIDGTERALISGNLDPRIALLLVPSLRQEVLQGPQGIWIHAGLAEVAEVYINQSESPRAGAFDGNVLDMVKRFLISWQQKRGYGSITDETYVFDSVDAALLRLLLEQDSSVIVDQRSPVRAELNRLVDNWKGNFERAVVLLEGHRRLYVLSRLYQSRKMSGNVLKTWRRIIEGEEDVGREVSAPGVEMQMRKYLVKIKDAQLVEEYGAWLAQRNPSLGIQVFADSASRVRLEPTDVVPLLKERAPNAVQEYLEHLVFSKNYTQYADDLLSYYLDTVLSVLESSPEARASLAESYSTYRALRPPKPTYMNFITENTPSEPWWQSRLRLLQLLGGGSGSQFSSLPSTSFSYSIPAVLARIEPFQNELVSESVILDGLQGRHREALRLLTHGLGDYDSAVRYCVFGGPRSTSATGSLTEFADRPLQTELFGYLLDEFLRIEDLSERIERTSDLLARFASFFDVGEVLRLVPDDWSVDILSGFLAHVFRVLVAQGRETRIERALSAGLNLRVGTEYIEGVEKVGGWVEDDDGLRRLRGGNAGDGDRRALVTDDSDFGEMTGPRSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.77
3 0.8
4 0.82
5 0.84
6 0.85
7 0.85
8 0.82
9 0.74
10 0.66
11 0.65
12 0.56
13 0.47
14 0.4
15 0.41
16 0.37
17 0.36
18 0.34
19 0.25
20 0.24
21 0.25
22 0.24
23 0.19
24 0.17
25 0.15
26 0.14
27 0.15
28 0.13
29 0.12
30 0.11
31 0.1
32 0.12
33 0.12
34 0.11
35 0.14
36 0.15
37 0.17
38 0.18
39 0.21
40 0.19
41 0.18
42 0.18
43 0.16
44 0.15
45 0.13
46 0.13
47 0.09
48 0.09
49 0.08
50 0.08
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.07
56 0.09
57 0.09
58 0.11
59 0.12
60 0.13
61 0.14
62 0.16
63 0.19
64 0.19
65 0.22
66 0.21
67 0.21
68 0.19
69 0.19
70 0.17
71 0.14
72 0.13
73 0.1
74 0.11
75 0.13
76 0.13
77 0.14
78 0.14
79 0.21
80 0.22
81 0.23
82 0.24
83 0.22
84 0.25
85 0.25
86 0.28
87 0.24
88 0.21
89 0.22
90 0.2
91 0.2
92 0.21
93 0.21
94 0.17
95 0.14
96 0.14
97 0.14
98 0.14
99 0.14
100 0.1
101 0.13
102 0.14
103 0.14
104 0.15
105 0.14
106 0.14
107 0.19
108 0.22
109 0.19
110 0.21
111 0.22
112 0.22
113 0.23
114 0.24
115 0.18
116 0.15
117 0.16
118 0.12
119 0.11
120 0.11
121 0.11
122 0.1
123 0.11
124 0.13
125 0.14
126 0.15
127 0.17
128 0.17
129 0.24
130 0.27
131 0.26
132 0.31
133 0.28
134 0.28
135 0.28
136 0.28
137 0.22
138 0.26
139 0.3
140 0.27
141 0.27
142 0.28
143 0.28
144 0.27
145 0.25
146 0.2
147 0.16
148 0.17
149 0.17
150 0.16
151 0.15
152 0.14
153 0.13
154 0.12
155 0.14
156 0.13
157 0.14
158 0.14
159 0.14
160 0.14
161 0.14
162 0.14
163 0.12
164 0.1
165 0.09
166 0.1
167 0.11
168 0.13
169 0.17
170 0.22
171 0.25
172 0.26
173 0.28
174 0.27
175 0.34
176 0.37
177 0.38
178 0.35
179 0.33
180 0.34
181 0.32
182 0.31
183 0.25
184 0.23
185 0.2
186 0.18
187 0.19
188 0.16
189 0.16
190 0.16
191 0.15
192 0.12
193 0.11
194 0.11
195 0.09
196 0.09
197 0.1
198 0.09
199 0.09
200 0.08
201 0.08
202 0.07
203 0.08
204 0.1
205 0.12
206 0.16
207 0.16
208 0.18
209 0.19
210 0.2
211 0.22
212 0.22
213 0.19
214 0.16
215 0.21
216 0.23
217 0.23
218 0.22
219 0.19
220 0.17
221 0.16
222 0.15
223 0.1
224 0.07
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.06
233 0.08
234 0.08
235 0.09
236 0.1
237 0.13
238 0.18
239 0.19
240 0.21
241 0.22
242 0.22
243 0.23
244 0.22
245 0.23
246 0.21
247 0.23
248 0.27
249 0.32
250 0.38
251 0.4
252 0.42
253 0.4
254 0.41
255 0.44
256 0.42
257 0.35
258 0.28
259 0.26
260 0.24
261 0.24
262 0.21
263 0.15
264 0.16
265 0.17
266 0.17
267 0.19
268 0.2
269 0.21
270 0.23
271 0.31
272 0.29
273 0.31
274 0.32
275 0.32
276 0.36
277 0.36
278 0.34
279 0.28
280 0.26
281 0.26
282 0.27
283 0.24
284 0.2
285 0.17
286 0.22
287 0.24
288 0.26
289 0.24
290 0.25
291 0.27
292 0.3
293 0.36
294 0.38
295 0.44
296 0.5
297 0.52
298 0.52
299 0.51
300 0.51
301 0.49
302 0.46
303 0.39
304 0.35
305 0.36
306 0.37
307 0.41
308 0.43
309 0.43
310 0.38
311 0.38
312 0.37
313 0.34
314 0.31
315 0.26
316 0.21
317 0.17
318 0.15
319 0.14
320 0.12
321 0.11
322 0.11
323 0.13
324 0.14
325 0.17
326 0.22
327 0.22
328 0.29
329 0.34
330 0.39
331 0.39
332 0.45
333 0.52
334 0.53
335 0.57
336 0.55
337 0.54
338 0.47
339 0.5
340 0.45
341 0.36
342 0.33
343 0.33
344 0.34
345 0.31
346 0.3
347 0.26
348 0.23
349 0.24
350 0.23
351 0.18
352 0.12
353 0.11
354 0.13
355 0.12
356 0.13
357 0.12
358 0.09
359 0.08
360 0.07
361 0.07
362 0.05
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.05
376 0.07
377 0.12
378 0.17
379 0.2
380 0.23
381 0.23
382 0.25
383 0.29
384 0.35
385 0.35
386 0.32
387 0.33
388 0.34
389 0.34
390 0.36
391 0.32
392 0.25
393 0.21
394 0.2
395 0.16
396 0.14
397 0.12
398 0.09
399 0.1
400 0.13
401 0.14
402 0.13
403 0.12
404 0.13
405 0.13
406 0.12
407 0.11
408 0.08
409 0.06
410 0.07
411 0.06
412 0.06
413 0.06
414 0.08
415 0.08
416 0.09
417 0.1
418 0.09
419 0.12
420 0.12
421 0.14
422 0.17
423 0.18
424 0.2
425 0.23
426 0.24
427 0.21
428 0.21
429 0.2
430 0.14
431 0.14
432 0.1
433 0.08
434 0.09
435 0.1
436 0.11
437 0.1
438 0.12
439 0.12
440 0.12
441 0.11
442 0.1
443 0.11
444 0.1
445 0.11
446 0.15
447 0.15
448 0.16
449 0.16
450 0.16
451 0.15
452 0.15
453 0.16
454 0.11
455 0.11
456 0.11
457 0.12
458 0.11
459 0.12
460 0.12
461 0.1
462 0.12
463 0.13
464 0.13
465 0.13
466 0.12
467 0.15
468 0.16
469 0.18
470 0.17
471 0.15
472 0.15
473 0.16
474 0.16
475 0.16
476 0.16
477 0.15
478 0.17
479 0.23
480 0.23
481 0.23
482 0.25
483 0.24
484 0.28
485 0.28
486 0.25
487 0.23
488 0.23
489 0.23
490 0.21
491 0.24
492 0.24
493 0.24
494 0.23
495 0.21
496 0.2
497 0.21
498 0.23
499 0.23
500 0.21
501 0.24
502 0.25
503 0.25
504 0.26
505 0.25
506 0.23
507 0.17
508 0.16
509 0.12
510 0.11
511 0.12
512 0.11
513 0.14
514 0.14
515 0.15
516 0.14
517 0.14
518 0.14
519 0.14
520 0.16
521 0.13
522 0.13
523 0.12
524 0.15
525 0.17
526 0.22
527 0.21
528 0.2
529 0.21
530 0.22
531 0.22
532 0.18
533 0.16
534 0.11
535 0.12
536 0.13
537 0.11
538 0.11
539 0.11
540 0.12
541 0.11
542 0.11
543 0.11
544 0.11
545 0.13
546 0.17
547 0.19
548 0.18
549 0.18
550 0.19
551 0.17
552 0.17
553 0.16
554 0.12
555 0.08
556 0.09
557 0.11
558 0.11
559 0.11
560 0.11
561 0.11
562 0.13
563 0.14
564 0.17
565 0.17
566 0.2
567 0.21
568 0.24
569 0.27
570 0.24
571 0.27
572 0.24
573 0.23
574 0.19
575 0.19
576 0.15
577 0.12
578 0.12
579 0.09
580 0.08
581 0.1
582 0.12
583 0.12
584 0.18
585 0.19
586 0.19
587 0.21
588 0.23
589 0.28
590 0.3
591 0.37
592 0.33
593 0.35
594 0.37
595 0.35
596 0.34
597 0.26
598 0.22
599 0.15
600 0.13
601 0.09
602 0.08
603 0.08
604 0.08
605 0.08
606 0.07
607 0.07
608 0.07
609 0.08
610 0.09
611 0.09
612 0.09
613 0.09
614 0.08
615 0.13
616 0.13
617 0.13
618 0.12
619 0.14
620 0.12
621 0.12
622 0.12
623 0.08
624 0.09
625 0.1
626 0.09
627 0.08
628 0.08
629 0.08
630 0.08
631 0.07
632 0.06
633 0.04
634 0.04
635 0.03
636 0.03
637 0.03
638 0.05
639 0.05
640 0.05
641 0.06
642 0.08
643 0.09
644 0.09
645 0.1
646 0.09
647 0.1
648 0.1
649 0.1
650 0.08
651 0.08
652 0.07
653 0.08
654 0.1
655 0.11
656 0.11
657 0.11
658 0.1
659 0.1
660 0.11
661 0.09
662 0.06
663 0.05
664 0.07
665 0.07
666 0.08
667 0.08
668 0.08
669 0.08
670 0.08
671 0.08
672 0.08
673 0.1
674 0.13
675 0.13
676 0.13
677 0.16
678 0.17
679 0.16
680 0.14
681 0.12
682 0.08
683 0.08
684 0.08
685 0.04
686 0.04
687 0.03
688 0.03
689 0.03
690 0.03
691 0.02
692 0.03
693 0.04
694 0.04
695 0.04
696 0.05
697 0.05
698 0.06
699 0.07
700 0.07
701 0.07
702 0.08
703 0.08
704 0.08
705 0.1
706 0.1
707 0.08
708 0.08
709 0.08
710 0.07
711 0.07
712 0.08
713 0.05
714 0.05
715 0.05
716 0.06
717 0.16
718 0.25
719 0.31
720 0.39
721 0.42
722 0.44
723 0.45
724 0.45
725 0.38
726 0.31
727 0.28
728 0.22
729 0.21
730 0.19
731 0.17
732 0.17
733 0.15
734 0.14
735 0.1
736 0.07
737 0.06
738 0.06
739 0.07
740 0.07
741 0.06
742 0.05
743 0.05
744 0.05
745 0.05
746 0.05
747 0.04
748 0.04
749 0.04
750 0.04
751 0.04
752 0.05
753 0.05
754 0.06
755 0.06
756 0.07
757 0.09
758 0.11
759 0.12
760 0.13
761 0.13
762 0.17
763 0.19
764 0.23
765 0.28
766 0.31
767 0.3
768 0.3
769 0.31
770 0.28
771 0.3
772 0.26
773 0.25
774 0.21
775 0.2
776 0.2
777 0.18
778 0.17
779 0.14
780 0.15
781 0.1
782 0.1
783 0.12
784 0.14
785 0.15
786 0.14
787 0.13
788 0.12
789 0.12
790 0.15
791 0.18
792 0.17
793 0.2
794 0.23
795 0.28
796 0.32
797 0.38
798 0.36
799 0.36
800 0.36
801 0.34
802 0.37
803 0.37
804 0.39
805 0.38
806 0.45
807 0.44
808 0.43
809 0.45
810 0.4
811 0.37
812 0.32
813 0.29
814 0.28
815 0.25
816 0.25
817 0.23
818 0.22
819 0.2
820 0.19
821 0.16
822 0.09
823 0.08
824 0.06
825 0.05
826 0.05
827 0.05
828 0.07
829 0.09
830 0.09
831 0.1
832 0.14
833 0.15
834 0.15
835 0.16
836 0.22
837 0.23
838 0.29
839 0.33
840 0.32
841 0.39
842 0.39
843 0.38
844 0.32
845 0.3
846 0.24
847 0.19
848 0.16
849 0.09
850 0.09
851 0.07
852 0.07
853 0.08
854 0.11
855 0.11
856 0.12
857 0.14
858 0.14
859 0.17
860 0.16
861 0.15
862 0.13
863 0.12
864 0.11
865 0.1
866 0.1
867 0.07
868 0.07
869 0.08
870 0.08
871 0.08
872 0.09
873 0.1
874 0.13
875 0.15
876 0.16
877 0.2
878 0.2
879 0.2
880 0.19
881 0.2
882 0.19
883 0.19
884 0.18
885 0.13
886 0.2
887 0.2
888 0.22
889 0.25
890 0.26
891 0.24
892 0.23
893 0.27
894 0.22
895 0.21
896 0.19
897 0.15
898 0.13
899 0.13
900 0.15
901 0.16
902 0.16
903 0.17
904 0.19
905 0.19
906 0.18
907 0.21
908 0.2
909 0.14
910 0.14
911 0.13
912 0.12
913 0.11
914 0.1
915 0.07
916 0.06
917 0.06
918 0.05
919 0.05
920 0.04
921 0.04
922 0.04
923 0.05
924 0.05
925 0.06
926 0.07
927 0.07
928 0.07
929 0.07
930 0.08
931 0.09
932 0.11
933 0.1
934 0.1
935 0.11
936 0.14
937 0.15
938 0.17
939 0.15
940 0.15
941 0.21
942 0.29
943 0.35
944 0.4
945 0.45
946 0.52
947 0.59
948 0.58
949 0.6
950 0.58
951 0.56
952 0.5
953 0.46
954 0.4
955 0.34
956 0.36
957 0.3
958 0.25
959 0.21
960 0.23
961 0.25
962 0.24
963 0.29
964 0.29
965 0.29
966 0.35
967 0.4
968 0.39
969 0.39
970 0.37
971 0.34
972 0.32
973 0.3
974 0.23
975 0.17
976 0.13
977 0.09
978 0.1
979 0.07
980 0.06
981 0.05
982 0.06
983 0.09
984 0.09
985 0.1
986 0.12
987 0.15
988 0.16
989 0.17
990 0.16
991 0.16
992 0.16
993 0.16
994 0.14
995 0.11
996 0.1
997 0.1
998 0.12
999 0.1
1000 0.13
1001 0.13
1002 0.13
1003 0.15
1004 0.16
1005 0.15
1006 0.14
1007 0.14
1008 0.12
1009 0.12
1010 0.12
1011 0.1
1012 0.08
1013 0.08
1014 0.07
1015 0.07
1016 0.08
1017 0.1
1018 0.14
1019 0.15
1020 0.16
1021 0.21
1022 0.22
1023 0.24
1024 0.23
1025 0.29
1026 0.27
1027 0.29
1028 0.29
1029 0.25
1030 0.25
1031 0.22
1032 0.21
1033 0.13
1034 0.11
1035 0.1
1036 0.1
1037 0.09
1038 0.09
1039 0.09
1040 0.09
1041 0.09
1042 0.1
1043 0.12
1044 0.13
1045 0.16
1046 0.2
1047 0.24
1048 0.26
1049 0.3
1050 0.31
1051 0.27
1052 0.28
1053 0.26
1054 0.23
1055 0.21
1056 0.2
1057 0.16
1058 0.17
1059 0.16
1060 0.16
1061 0.2
1062 0.19
1063 0.18
1064 0.21
1065 0.2
1066 0.19
1067 0.2
1068 0.19
1069 0.14
1070 0.14
1071 0.12
1072 0.09
1073 0.09
1074 0.09
1075 0.08
1076 0.07
1077 0.07
1078 0.09
1079 0.08
1080 0.08
1081 0.1
1082 0.11
1083 0.14
1084 0.17
1085 0.17
1086 0.16
1087 0.17
1088 0.17
1089 0.17
1090 0.21
1091 0.23
1092 0.22
1093 0.23
1094 0.23
1095 0.23
1096 0.24
1097 0.21
1098 0.18
1099 0.14
1100 0.12
1101 0.12
1102 0.12
1103 0.11
1104 0.12
1105 0.12
1106 0.09
1107 0.09
1108 0.1
1109 0.09
1110 0.08
1111 0.09
1112 0.09
1113 0.09
1114 0.11
1115 0.1
1116 0.1
1117 0.1
1118 0.09
1119 0.08
1120 0.07
1121 0.07
1122 0.06
1123 0.07
1124 0.06
1125 0.07
1126 0.07
1127 0.07
1128 0.08
1129 0.09
1130 0.12
1131 0.13
1132 0.18
1133 0.21
1134 0.24
1135 0.28
1136 0.29
1137 0.32
1138 0.31
1139 0.32
1140 0.27
1141 0.26
1142 0.26
1143 0.22
1144 0.23
1145 0.25
1146 0.22
1147 0.22
1148 0.21
1149 0.19
1150 0.17
1151 0.17
1152 0.16
1153 0.12
1154 0.11
1155 0.11
1156 0.13
1157 0.12
1158 0.12
1159 0.12
1160 0.1
1161 0.09
1162 0.11
1163 0.09
1164 0.09
1165 0.09
1166 0.1
1167 0.13
1168 0.14
1169 0.15
1170 0.17
1171 0.18
1172 0.17
1173 0.18
1174 0.18
1175 0.18
1176 0.23
1177 0.24
1178 0.27
1179 0.31
1180 0.35
1181 0.37
1182 0.36
1183 0.35
1184 0.3
1185 0.27
1186 0.22
1187 0.19
1188 0.16
1189 0.15
1190 0.17
1191 0.17
1192 0.18
1193 0.18
1194 0.17
1195 0.16
1196 0.18
1197 0.16