Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R6B3

Protein Details
Accession C4R6B3    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
128-154HLLKGRMRTCERKDKRRLTFRVKINGKBasic
156-175KTVQCRKQKLWGYDKKREARHydrophilic
558-583GDLNRAFRARKREAKRALNKYKADDAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
562-574RAFRARKREAKRA
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034138  NOP8_RRM  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG ppa:PAS_chr3_1036  -  
CDD cd12226  RRM_NOL8  
Amino Acid Sequences MTEKIHRIYIGNISADLASDIGNLETRLKRYGTLEKPLELHKKPLLDSYFAYISLKLSDQNFAKLKGSLNGLNYKGSRVVVDMARPDFYQKWLEDSRRPDLYKDDRLKRAKVAQVRLERIRQKNVVTHLLKGRMRTCERKDKRRLTFRVKINGKLKTVQCRKQKLWGYDKKREARDLVYTFSGTEWRDGFDHVVDRLSRKRKHSETNLEDQDVEIETIEEEKNMSILDSFLRGYDFEKPVNREDDRNSNDTTTFDFETGQVDAEAPLLKIGKHNSVVNVDTMKVPEVSGKVVIFDENGEVKELEDVIEIDQTKGSVGASNHTAYEHNSKYSSSNDENSDCSDGVNRVNNSKTSKREGGSKGSSRSSDSSDNSSNDSSDDNSDDSPDESSDQSSDDSSDDSSDDDSDDSDDGQLTNYASSRNAGTKGSRQLKDSKGSEDLDTEFLPNFTKRTPSSSKTEALRELLNPANSSFKLFGVDDSNDDIDVNKEIEPSVEERIAIEQQFKDKVEQSSKKTRNLGLFFTHDDSPFLAAQSQVNKHQGFNAASKDKFLDWFQAKRGDLNRAFRARKREAKRALNKYKADDALL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.23
3 0.2
4 0.13
5 0.08
6 0.07
7 0.07
8 0.07
9 0.08
10 0.09
11 0.14
12 0.18
13 0.2
14 0.24
15 0.24
16 0.26
17 0.31
18 0.4
19 0.41
20 0.47
21 0.49
22 0.48
23 0.5
24 0.56
25 0.59
26 0.51
27 0.51
28 0.46
29 0.46
30 0.44
31 0.5
32 0.45
33 0.39
34 0.38
35 0.37
36 0.34
37 0.3
38 0.3
39 0.22
40 0.2
41 0.19
42 0.18
43 0.16
44 0.16
45 0.21
46 0.22
47 0.29
48 0.31
49 0.32
50 0.33
51 0.32
52 0.33
53 0.3
54 0.33
55 0.29
56 0.31
57 0.35
58 0.34
59 0.37
60 0.36
61 0.34
62 0.31
63 0.28
64 0.24
65 0.19
66 0.22
67 0.19
68 0.23
69 0.25
70 0.25
71 0.26
72 0.26
73 0.28
74 0.24
75 0.25
76 0.27
77 0.23
78 0.28
79 0.34
80 0.39
81 0.42
82 0.47
83 0.51
84 0.53
85 0.53
86 0.48
87 0.5
88 0.53
89 0.56
90 0.6
91 0.62
92 0.63
93 0.68
94 0.7
95 0.67
96 0.67
97 0.64
98 0.62
99 0.62
100 0.62
101 0.64
102 0.68
103 0.67
104 0.68
105 0.69
106 0.67
107 0.66
108 0.61
109 0.56
110 0.55
111 0.55
112 0.56
113 0.48
114 0.48
115 0.46
116 0.5
117 0.48
118 0.47
119 0.46
120 0.45
121 0.5
122 0.54
123 0.56
124 0.59
125 0.67
126 0.73
127 0.8
128 0.81
129 0.85
130 0.86
131 0.88
132 0.86
133 0.86
134 0.83
135 0.83
136 0.78
137 0.76
138 0.73
139 0.7
140 0.63
141 0.61
142 0.57
143 0.58
144 0.62
145 0.62
146 0.64
147 0.67
148 0.66
149 0.69
150 0.72
151 0.7
152 0.71
153 0.73
154 0.73
155 0.74
156 0.8
157 0.79
158 0.75
159 0.7
160 0.62
161 0.56
162 0.55
163 0.48
164 0.41
165 0.35
166 0.31
167 0.27
168 0.24
169 0.24
170 0.15
171 0.16
172 0.13
173 0.13
174 0.13
175 0.14
176 0.15
177 0.13
178 0.14
179 0.12
180 0.15
181 0.14
182 0.16
183 0.24
184 0.32
185 0.36
186 0.39
187 0.48
188 0.52
189 0.61
190 0.68
191 0.71
192 0.68
193 0.72
194 0.7
195 0.62
196 0.55
197 0.45
198 0.36
199 0.26
200 0.19
201 0.09
202 0.06
203 0.05
204 0.07
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.05
209 0.06
210 0.05
211 0.05
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.14
222 0.15
223 0.17
224 0.21
225 0.24
226 0.26
227 0.31
228 0.31
229 0.28
230 0.3
231 0.36
232 0.36
233 0.36
234 0.35
235 0.3
236 0.29
237 0.27
238 0.25
239 0.19
240 0.15
241 0.13
242 0.12
243 0.11
244 0.12
245 0.12
246 0.1
247 0.07
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.07
252 0.05
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.08
257 0.1
258 0.12
259 0.14
260 0.15
261 0.16
262 0.18
263 0.18
264 0.17
265 0.16
266 0.13
267 0.12
268 0.11
269 0.1
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.09
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.07
281 0.06
282 0.07
283 0.06
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.06
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.07
303 0.07
304 0.08
305 0.1
306 0.11
307 0.11
308 0.12
309 0.12
310 0.11
311 0.18
312 0.17
313 0.16
314 0.16
315 0.17
316 0.18
317 0.2
318 0.23
319 0.19
320 0.22
321 0.23
322 0.24
323 0.24
324 0.24
325 0.24
326 0.18
327 0.16
328 0.14
329 0.12
330 0.13
331 0.18
332 0.17
333 0.18
334 0.19
335 0.23
336 0.27
337 0.32
338 0.34
339 0.35
340 0.39
341 0.37
342 0.44
343 0.44
344 0.47
345 0.48
346 0.49
347 0.46
348 0.44
349 0.44
350 0.38
351 0.36
352 0.32
353 0.3
354 0.27
355 0.28
356 0.3
357 0.3
358 0.3
359 0.28
360 0.24
361 0.2
362 0.19
363 0.15
364 0.12
365 0.13
366 0.11
367 0.11
368 0.11
369 0.11
370 0.11
371 0.11
372 0.1
373 0.1
374 0.09
375 0.1
376 0.09
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.08
387 0.08
388 0.07
389 0.08
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.07
396 0.07
397 0.06
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.08
403 0.08
404 0.08
405 0.09
406 0.11
407 0.12
408 0.14
409 0.15
410 0.18
411 0.23
412 0.33
413 0.41
414 0.41
415 0.42
416 0.48
417 0.51
418 0.57
419 0.53
420 0.47
421 0.42
422 0.42
423 0.4
424 0.34
425 0.3
426 0.24
427 0.22
428 0.19
429 0.15
430 0.13
431 0.15
432 0.13
433 0.13
434 0.12
435 0.17
436 0.18
437 0.25
438 0.32
439 0.34
440 0.41
441 0.44
442 0.48
443 0.47
444 0.5
445 0.46
446 0.41
447 0.38
448 0.32
449 0.32
450 0.31
451 0.28
452 0.24
453 0.22
454 0.25
455 0.23
456 0.25
457 0.21
458 0.17
459 0.19
460 0.18
461 0.19
462 0.19
463 0.2
464 0.18
465 0.21
466 0.21
467 0.18
468 0.17
469 0.16
470 0.12
471 0.13
472 0.13
473 0.1
474 0.1
475 0.1
476 0.1
477 0.12
478 0.13
479 0.16
480 0.15
481 0.14
482 0.15
483 0.18
484 0.2
485 0.2
486 0.22
487 0.19
488 0.23
489 0.27
490 0.28
491 0.29
492 0.31
493 0.37
494 0.43
495 0.48
496 0.52
497 0.59
498 0.65
499 0.68
500 0.69
501 0.68
502 0.66
503 0.63
504 0.6
505 0.54
506 0.52
507 0.48
508 0.45
509 0.42
510 0.33
511 0.3
512 0.27
513 0.24
514 0.2
515 0.17
516 0.15
517 0.13
518 0.16
519 0.23
520 0.26
521 0.29
522 0.36
523 0.36
524 0.36
525 0.39
526 0.42
527 0.38
528 0.39
529 0.42
530 0.42
531 0.41
532 0.42
533 0.41
534 0.35
535 0.35
536 0.32
537 0.33
538 0.32
539 0.37
540 0.4
541 0.46
542 0.45
543 0.48
544 0.51
545 0.52
546 0.52
547 0.56
548 0.6
549 0.62
550 0.68
551 0.67
552 0.72
553 0.71
554 0.75
555 0.75
556 0.76
557 0.77
558 0.81
559 0.86
560 0.88
561 0.89
562 0.88
563 0.85
564 0.81
565 0.79