Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0CIV2

Protein Details
Accession Q0CIV2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-59PGPEQHPSFRIRKRKRGTRDQAIEQLYHydrophilic
584-604LQSTRKSRTTHPYNPNNSAECHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
43-48IRKRKR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR039601  Rrn5  
IPR001005  SANT/Myb  
Gene Ontology GO:0000500  C:RNA polymerase I upstream activating factor complex  
GO:0042790  P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I  
CDD cd00167  SANT  
Amino Acid Sequences MSSSSLYDPEEDDDASTSNSDIDIDPNQHHAPPGPEQHPSFRIRKRKRGTRDQAIEQLYQSLPRQSVEAYAALFAENQTASDDAPPAPAAVPATGESEAWHSTQHGVVTWTSREKEILHQILERRGVNGVAEIARAVGTKSELEVQEYLRLLHRGVERQHLHDRHSRTVILGEVPAATEISARCCRALDPYATLLSLADKQAEDVAGQRRHHHLWIVDHQTAEKVEAQLDTLPDGVAAGGDLPPSSVYTSARLLNMKMWVRLSERCFMNFGGDRLDDNWVNVAYAEETPSLTADALGEFYALAVSLTRRLVHSALFFAMARLRNMRETGNPKAQVVRTRDVHAALNVLEMRRDRADYWVGLARRCSLEVADLRHRVGWEPVPLSYDEVEGILSGEIPFDTEAVAGTRSASRQRRPSQTDDENDGEDTGERHSEDESEPGSEAASVLSSPIVSSDEEELPADLEEEHAEQVDEQASRREERRLWEMMGRPVPASVAVEIKDEDELESKLQRPTGERKTKEDLVSWRDRTLYRSEWEEYGHEVFDLTMGPTLPTMAWISTRRNQNRPTPTQAAKTSRTTPPPVLRLQSTRKSRTTHPYNPNNSAECERPETIMKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.14
4 0.11
5 0.1
6 0.1
7 0.1
8 0.09
9 0.12
10 0.15
11 0.18
12 0.19
13 0.24
14 0.26
15 0.26
16 0.26
17 0.27
18 0.27
19 0.31
20 0.38
21 0.35
22 0.4
23 0.42
24 0.48
25 0.51
26 0.53
27 0.55
28 0.56
29 0.64
30 0.67
31 0.76
32 0.8
33 0.84
34 0.88
35 0.9
36 0.91
37 0.91
38 0.9
39 0.86
40 0.84
41 0.78
42 0.69
43 0.58
44 0.52
45 0.41
46 0.36
47 0.3
48 0.26
49 0.22
50 0.21
51 0.22
52 0.18
53 0.21
54 0.2
55 0.19
56 0.15
57 0.15
58 0.14
59 0.13
60 0.13
61 0.1
62 0.1
63 0.08
64 0.08
65 0.09
66 0.09
67 0.1
68 0.11
69 0.12
70 0.1
71 0.12
72 0.12
73 0.11
74 0.11
75 0.12
76 0.11
77 0.1
78 0.11
79 0.1
80 0.13
81 0.12
82 0.12
83 0.12
84 0.14
85 0.15
86 0.14
87 0.13
88 0.11
89 0.13
90 0.14
91 0.14
92 0.13
93 0.13
94 0.14
95 0.17
96 0.19
97 0.23
98 0.22
99 0.23
100 0.23
101 0.23
102 0.29
103 0.35
104 0.36
105 0.33
106 0.36
107 0.38
108 0.42
109 0.45
110 0.39
111 0.3
112 0.27
113 0.25
114 0.21
115 0.18
116 0.15
117 0.11
118 0.1
119 0.09
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.08
124 0.06
125 0.07
126 0.07
127 0.08
128 0.13
129 0.13
130 0.15
131 0.17
132 0.17
133 0.2
134 0.2
135 0.2
136 0.18
137 0.18
138 0.16
139 0.2
140 0.22
141 0.25
142 0.27
143 0.35
144 0.35
145 0.4
146 0.5
147 0.46
148 0.47
149 0.48
150 0.51
151 0.47
152 0.48
153 0.43
154 0.34
155 0.33
156 0.3
157 0.24
158 0.18
159 0.13
160 0.1
161 0.1
162 0.09
163 0.07
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.12
168 0.15
169 0.16
170 0.16
171 0.16
172 0.17
173 0.2
174 0.24
175 0.2
176 0.2
177 0.22
178 0.22
179 0.22
180 0.21
181 0.16
182 0.14
183 0.13
184 0.1
185 0.09
186 0.08
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.08
191 0.11
192 0.19
193 0.23
194 0.24
195 0.27
196 0.31
197 0.32
198 0.34
199 0.32
200 0.27
201 0.28
202 0.35
203 0.38
204 0.35
205 0.33
206 0.32
207 0.3
208 0.27
209 0.23
210 0.17
211 0.11
212 0.1
213 0.1
214 0.11
215 0.11
216 0.11
217 0.1
218 0.08
219 0.07
220 0.06
221 0.06
222 0.05
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.04
231 0.04
232 0.05
233 0.06
234 0.06
235 0.08
236 0.11
237 0.12
238 0.14
239 0.14
240 0.14
241 0.15
242 0.21
243 0.2
244 0.2
245 0.19
246 0.19
247 0.21
248 0.25
249 0.26
250 0.27
251 0.26
252 0.26
253 0.26
254 0.24
255 0.26
256 0.23
257 0.2
258 0.16
259 0.16
260 0.15
261 0.15
262 0.17
263 0.13
264 0.11
265 0.12
266 0.09
267 0.09
268 0.08
269 0.08
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.05
279 0.05
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.03
290 0.03
291 0.03
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.06
296 0.08
297 0.09
298 0.1
299 0.1
300 0.09
301 0.09
302 0.1
303 0.09
304 0.08
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.12
309 0.13
310 0.13
311 0.15
312 0.16
313 0.18
314 0.23
315 0.27
316 0.33
317 0.32
318 0.31
319 0.34
320 0.35
321 0.36
322 0.36
323 0.35
324 0.3
325 0.33
326 0.33
327 0.31
328 0.3
329 0.23
330 0.19
331 0.14
332 0.14
333 0.11
334 0.1
335 0.1
336 0.09
337 0.11
338 0.11
339 0.12
340 0.11
341 0.13
342 0.16
343 0.14
344 0.17
345 0.2
346 0.2
347 0.19
348 0.2
349 0.18
350 0.17
351 0.17
352 0.15
353 0.1
354 0.13
355 0.15
356 0.2
357 0.24
358 0.25
359 0.25
360 0.26
361 0.26
362 0.22
363 0.22
364 0.2
365 0.17
366 0.17
367 0.16
368 0.17
369 0.17
370 0.17
371 0.15
372 0.13
373 0.09
374 0.08
375 0.08
376 0.06
377 0.06
378 0.05
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.06
393 0.07
394 0.09
395 0.17
396 0.23
397 0.29
398 0.38
399 0.46
400 0.55
401 0.59
402 0.65
403 0.65
404 0.67
405 0.65
406 0.61
407 0.55
408 0.47
409 0.41
410 0.34
411 0.25
412 0.18
413 0.14
414 0.1
415 0.09
416 0.08
417 0.08
418 0.08
419 0.1
420 0.1
421 0.12
422 0.12
423 0.12
424 0.12
425 0.12
426 0.11
427 0.09
428 0.09
429 0.06
430 0.05
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.06
438 0.06
439 0.07
440 0.1
441 0.11
442 0.12
443 0.12
444 0.12
445 0.11
446 0.11
447 0.1
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.07
452 0.07
453 0.07
454 0.07
455 0.06
456 0.08
457 0.1
458 0.1
459 0.09
460 0.14
461 0.16
462 0.2
463 0.22
464 0.26
465 0.27
466 0.31
467 0.36
468 0.35
469 0.36
470 0.39
471 0.42
472 0.44
473 0.45
474 0.41
475 0.35
476 0.31
477 0.29
478 0.23
479 0.2
480 0.13
481 0.12
482 0.11
483 0.13
484 0.13
485 0.13
486 0.13
487 0.12
488 0.12
489 0.11
490 0.11
491 0.12
492 0.15
493 0.17
494 0.19
495 0.21
496 0.22
497 0.25
498 0.33
499 0.42
500 0.5
501 0.51
502 0.55
503 0.61
504 0.66
505 0.63
506 0.6
507 0.57
508 0.55
509 0.6
510 0.56
511 0.5
512 0.47
513 0.46
514 0.43
515 0.42
516 0.39
517 0.33
518 0.35
519 0.36
520 0.34
521 0.35
522 0.33
523 0.31
524 0.27
525 0.24
526 0.19
527 0.16
528 0.14
529 0.13
530 0.12
531 0.08
532 0.08
533 0.08
534 0.08
535 0.08
536 0.09
537 0.08
538 0.09
539 0.1
540 0.09
541 0.14
542 0.18
543 0.25
544 0.31
545 0.42
546 0.48
547 0.55
548 0.61
549 0.67
550 0.73
551 0.73
552 0.76
553 0.73
554 0.71
555 0.7
556 0.72
557 0.69
558 0.64
559 0.63
560 0.61
561 0.6
562 0.61
563 0.6
564 0.6
565 0.61
566 0.62
567 0.62
568 0.61
569 0.59
570 0.61
571 0.64
572 0.65
573 0.66
574 0.67
575 0.67
576 0.67
577 0.69
578 0.71
579 0.72
580 0.73
581 0.74
582 0.77
583 0.8
584 0.83
585 0.81
586 0.73
587 0.68
588 0.62
589 0.56
590 0.5
591 0.48
592 0.42
593 0.38