Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0CJ12

Protein Details
Accession Q0CJ12    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
109-128PYNFVKRHPQLRTRYTRRITHydrophilic
459-487IRAIRAENGRQRQKKARRRAEIGNDRLLNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
467-477GRQRQKKARRR
Subcellular Location(s) mito 10, nucl 9, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004875  DDE_SF_endonuclease_dom  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR006600  HTH_CenpB_DNA-bd_dom  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03184  DDE_1  
PF03221  HTH_Tnp_Tc5  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51253  HTH_CENPB  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MHLSKESRIQMAISAYQKGQVKSIKRAVALFAVPESTVRDRLHGAKSRSETRANGHKLTEFEEELLLKRLLDADTRGFPIRPEFLRGMAQVLLRSRLQDPTAAIGTNWPYNFVKRHPQLRTRYTRRITYQRAKQEDPKVIGPWFETVRATIQEHGIHEDDIWNFDETGFAMGVCSTSKVITAVERSERPRRVIQGNREWVTIIETIGSRGVYLPPVIILKASVQQAAWFQEPKLPRDWWISTSQNGWTTDEIGLLWLKNVFEPLSKRYMTGAKRLLILDGHSSHLTAEFDDFCKQNAIICLCMPAHTSHLLQPLDVGVFGPLKEAYGKLLEDLMAAGNNHIDKEDFLSLYPDAHKQIFTSANICSGFRGAGLKPLDPEHVLSKLTFQLRTPTPPLVEGSVSSAFQTPQNTRQLNRKVRSLQNSLNRKRQLSSSPIAHIQHLEKAAQMAMQTTLLLQQEIRAIRAENGRQRQKKARRRAEIGNDRLLNVQEGENRVQQLDTQLNEQPAESTLAPRRRAPQRCSGCGTIGHTIRNCPSRWL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.26
3 0.31
4 0.36
5 0.33
6 0.35
7 0.36
8 0.4
9 0.46
10 0.54
11 0.53
12 0.51
13 0.51
14 0.48
15 0.45
16 0.4
17 0.32
18 0.25
19 0.21
20 0.19
21 0.18
22 0.2
23 0.18
24 0.23
25 0.22
26 0.24
27 0.27
28 0.33
29 0.41
30 0.45
31 0.45
32 0.48
33 0.54
34 0.59
35 0.6
36 0.59
37 0.53
38 0.53
39 0.59
40 0.57
41 0.54
42 0.49
43 0.47
44 0.44
45 0.45
46 0.42
47 0.33
48 0.27
49 0.26
50 0.24
51 0.22
52 0.25
53 0.21
54 0.16
55 0.15
56 0.16
57 0.15
58 0.16
59 0.18
60 0.18
61 0.2
62 0.24
63 0.26
64 0.24
65 0.23
66 0.26
67 0.29
68 0.26
69 0.29
70 0.27
71 0.28
72 0.31
73 0.3
74 0.28
75 0.25
76 0.24
77 0.21
78 0.22
79 0.23
80 0.2
81 0.22
82 0.21
83 0.22
84 0.22
85 0.22
86 0.21
87 0.22
88 0.23
89 0.21
90 0.19
91 0.19
92 0.21
93 0.22
94 0.21
95 0.2
96 0.2
97 0.24
98 0.27
99 0.28
100 0.36
101 0.4
102 0.49
103 0.53
104 0.61
105 0.66
106 0.73
107 0.8
108 0.78
109 0.81
110 0.78
111 0.77
112 0.76
113 0.77
114 0.77
115 0.76
116 0.76
117 0.75
118 0.77
119 0.74
120 0.74
121 0.72
122 0.7
123 0.64
124 0.58
125 0.51
126 0.44
127 0.41
128 0.33
129 0.29
130 0.22
131 0.2
132 0.17
133 0.15
134 0.17
135 0.18
136 0.18
137 0.16
138 0.18
139 0.19
140 0.19
141 0.21
142 0.2
143 0.17
144 0.16
145 0.18
146 0.15
147 0.14
148 0.15
149 0.13
150 0.12
151 0.11
152 0.12
153 0.09
154 0.1
155 0.08
156 0.06
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.09
168 0.11
169 0.13
170 0.17
171 0.21
172 0.26
173 0.34
174 0.37
175 0.39
176 0.41
177 0.43
178 0.48
179 0.52
180 0.56
181 0.57
182 0.63
183 0.6
184 0.56
185 0.51
186 0.42
187 0.37
188 0.28
189 0.18
190 0.1
191 0.09
192 0.09
193 0.1
194 0.09
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.07
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.1
208 0.11
209 0.1
210 0.1
211 0.11
212 0.12
213 0.14
214 0.15
215 0.12
216 0.12
217 0.16
218 0.18
219 0.19
220 0.22
221 0.2
222 0.21
223 0.26
224 0.28
225 0.26
226 0.3
227 0.3
228 0.26
229 0.28
230 0.27
231 0.26
232 0.25
233 0.23
234 0.18
235 0.18
236 0.17
237 0.15
238 0.12
239 0.09
240 0.08
241 0.07
242 0.07
243 0.06
244 0.06
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.08
249 0.1
250 0.13
251 0.17
252 0.17
253 0.17
254 0.19
255 0.25
256 0.24
257 0.29
258 0.31
259 0.27
260 0.29
261 0.28
262 0.27
263 0.2
264 0.2
265 0.16
266 0.12
267 0.13
268 0.11
269 0.11
270 0.1
271 0.11
272 0.1
273 0.08
274 0.08
275 0.07
276 0.08
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.11
281 0.1
282 0.11
283 0.14
284 0.13
285 0.12
286 0.12
287 0.14
288 0.13
289 0.13
290 0.13
291 0.1
292 0.11
293 0.12
294 0.13
295 0.13
296 0.2
297 0.19
298 0.18
299 0.17
300 0.16
301 0.14
302 0.13
303 0.1
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.07
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.07
319 0.07
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.05
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.09
331 0.11
332 0.1
333 0.1
334 0.12
335 0.12
336 0.13
337 0.14
338 0.13
339 0.13
340 0.14
341 0.14
342 0.12
343 0.16
344 0.18
345 0.17
346 0.17
347 0.15
348 0.19
349 0.19
350 0.19
351 0.15
352 0.13
353 0.12
354 0.1
355 0.13
356 0.09
357 0.15
358 0.16
359 0.17
360 0.18
361 0.19
362 0.2
363 0.18
364 0.2
365 0.16
366 0.16
367 0.16
368 0.15
369 0.16
370 0.19
371 0.21
372 0.2
373 0.18
374 0.24
375 0.25
376 0.31
377 0.32
378 0.3
379 0.28
380 0.28
381 0.29
382 0.24
383 0.22
384 0.17
385 0.18
386 0.16
387 0.15
388 0.15
389 0.14
390 0.13
391 0.15
392 0.19
393 0.18
394 0.24
395 0.32
396 0.34
397 0.36
398 0.45
399 0.53
400 0.59
401 0.59
402 0.61
403 0.6
404 0.66
405 0.72
406 0.69
407 0.67
408 0.67
409 0.74
410 0.73
411 0.74
412 0.71
413 0.65
414 0.6
415 0.57
416 0.53
417 0.5
418 0.49
419 0.44
420 0.43
421 0.47
422 0.46
423 0.41
424 0.38
425 0.33
426 0.31
427 0.28
428 0.24
429 0.19
430 0.19
431 0.18
432 0.16
433 0.14
434 0.1
435 0.1
436 0.09
437 0.09
438 0.08
439 0.11
440 0.11
441 0.11
442 0.1
443 0.1
444 0.16
445 0.16
446 0.17
447 0.15
448 0.16
449 0.2
450 0.28
451 0.34
452 0.37
453 0.47
454 0.56
455 0.61
456 0.68
457 0.75
458 0.78
459 0.81
460 0.83
461 0.84
462 0.84
463 0.84
464 0.86
465 0.87
466 0.86
467 0.82
468 0.8
469 0.7
470 0.61
471 0.57
472 0.48
473 0.38
474 0.29
475 0.26
476 0.21
477 0.24
478 0.26
479 0.27
480 0.28
481 0.27
482 0.25
483 0.23
484 0.25
485 0.26
486 0.24
487 0.24
488 0.27
489 0.29
490 0.29
491 0.28
492 0.23
493 0.19
494 0.22
495 0.18
496 0.21
497 0.28
498 0.35
499 0.38
500 0.42
501 0.49
502 0.55
503 0.64
504 0.64
505 0.66
506 0.68
507 0.72
508 0.75
509 0.69
510 0.62
511 0.57
512 0.55
513 0.53
514 0.47
515 0.46
516 0.41
517 0.43
518 0.47
519 0.49