FuNGI

Q0CH18

Protein Details

Accession

Q0CH18

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
798-819	IVRPIVNRLKKEKNNVPKQLAS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto_nucl 12.5, cyto 6, mito 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR033133 PUM-HD IPR033712 Pumilio_RNA-bd IPR001313 Pumilio_RNA-bd_rpt
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0003723 F:RNA binding GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF00806 PUF
PROSITE	View protein in PROSITE PS50302 PUM PS50303 PUM_HD
CDD	cd07920 Pumilio

Amino Acid Sequences

MTNPNNVHNVRSNGTSNMNSAGMPSERTRGSHTGMGQGFGGNTTSWNSSNIWADNLGDQNSTEAPFEGKSGSSSLLSSSESDGWTVRPNFPWGTVNASANLSRAPNNAMTTSPIQTRADRGVVTLPETSDATYYSLPRTSAIGTSSGHATHKYLGSTGTDTLSPSGDGMPFGGLGGFRNGDSRRHVSTAAFGGSPVGTQFPSKHGFASPLDNQRSDEMTGSMGVSSLPQALPDAVSQGLTRGAYSHTSHNSASFAPQRPAHSPFPSFHSESQGFDGRYGGSLDLSNNLNKLQVNDGAISPPAAANRPQVLAHHQSFEGSLQRLKYPSGNDEANYQAVPGYGADAAAELQYYQARPRVSPTEYSRMDSPFYGNLENAAAAGPHYRNASGSRMSDNHAVVLDRRFRSIPTDQELAQASMVGLPLNQYNLSRYPANLNALNGYYAAPPFSAAALVPKGHRDHDTSIVRSPVLEEFRANNKGPKRHELKDIYGHVVEFSGDQHGSRFIQQKLETANSDEKEQVFREIKGDCLQLMTDVFGNYVVQKLFEHGNQTQKKVLANQMKGHIVMLSLQMYGCRVVQKALEHILTDQQAAMVKELEGHVIKCVRDQNGNHVIQKAIERVPSEHIQFIMNDFRGSVDKLAAHPYGCRVIQRMLEHCKEEDRESILGELHSCTAKLIPDQFGNYVIQHVITNGQEKDRTRMITVVMSNLLNFSKHKFASNVVEKSIEFGTLSQREVIVRTLVFPHDEDFTLLEGSKKPVDINDERLKPLEGVIRDQYGNYVIQKILNMILEPAWGSVVAIVRPIVNRLKKEKNNVPKQLASIEKLMDGPPPASLRPQASATPPNSHKSSPQPSKRSVMDNCQVGAAPPTPPPNDTQINGEEPKN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.42
2	0.39
3	0.33
4	0.31
5	0.29
6	0.24
7	0.22
8	0.22
9	0.18
10	0.2
11	0.2
12	0.22
13	0.23
14	0.25
15	0.31
16	0.31
17	0.35
18	0.36
19	0.36
20	0.39
21	0.39
22	0.38
23	0.32
24	0.28
25	0.24
26	0.19
27	0.19
28	0.1
29	0.1
30	0.12
31	0.14
32	0.14
33	0.16
34	0.17
35	0.19
36	0.24
37	0.24
38	0.24
39	0.22
40	0.22
41	0.24
42	0.26
43	0.24
44	0.19
45	0.18
46	0.18
47	0.19
48	0.19
49	0.15
50	0.12
51	0.13
52	0.13
53	0.14
54	0.13
55	0.12
56	0.12
57	0.13
58	0.14
59	0.14
60	0.14
61	0.14
62	0.14
63	0.15
64	0.15
65	0.16
66	0.17
67	0.16
68	0.17
69	0.16
70	0.16
71	0.23
72	0.25
73	0.25
74	0.26
75	0.3
76	0.3
77	0.32
78	0.34
79	0.27
80	0.32
81	0.31
82	0.3
83	0.28
84	0.29
85	0.26
86	0.24
87	0.25
88	0.19
89	0.18
90	0.18
91	0.19
92	0.2
93	0.22
94	0.23
95	0.21
96	0.24
97	0.25
98	0.27
99	0.25
100	0.26
101	0.27
102	0.27
103	0.3
104	0.3
105	0.3
106	0.26
107	0.25
108	0.26
109	0.25
110	0.26
111	0.23
112	0.19
113	0.18
114	0.19
115	0.18
116	0.13
117	0.13
118	0.13
119	0.13
120	0.15
121	0.16
122	0.17
123	0.17
124	0.17
125	0.18
126	0.17
127	0.17
128	0.17
129	0.17
130	0.15
131	0.17
132	0.18
133	0.17
134	0.17
135	0.16
136	0.16
137	0.17
138	0.19
139	0.18
140	0.17
141	0.17
142	0.18
143	0.19
144	0.19
145	0.16
146	0.15
147	0.15
148	0.15
149	0.14
150	0.12
151	0.1
152	0.11
153	0.1
154	0.09
155	0.09
156	0.08
157	0.07
158	0.07
159	0.07
160	0.06
161	0.06
162	0.08
163	0.08
164	0.08
165	0.13
166	0.15
167	0.18
168	0.24
169	0.27
170	0.29
171	0.31
172	0.32
173	0.27
174	0.3
175	0.3
176	0.26
177	0.21
178	0.17
179	0.16
180	0.14
181	0.14
182	0.1
183	0.08
184	0.07
185	0.09
186	0.1
187	0.13
188	0.17
189	0.18
190	0.19
191	0.18
192	0.21
193	0.22
194	0.28
195	0.3
196	0.36
197	0.38
198	0.37
199	0.38
200	0.36
201	0.37
202	0.31
203	0.25
204	0.16
205	0.14
206	0.14
207	0.13
208	0.1
209	0.08
210	0.07
211	0.06
212	0.06
213	0.07
214	0.06
215	0.06
216	0.07
217	0.07
218	0.08
219	0.08
220	0.09
221	0.07
222	0.08
223	0.08
224	0.08
225	0.1
226	0.09
227	0.09
228	0.08
229	0.09
230	0.12
231	0.14
232	0.19
233	0.2
234	0.23
235	0.24
236	0.24
237	0.24
238	0.21
239	0.24
240	0.25
241	0.25
242	0.26
243	0.29
244	0.31
245	0.34
246	0.39
247	0.4
248	0.37
249	0.36
250	0.34
251	0.36
252	0.38
253	0.37
254	0.32
255	0.35
256	0.32
257	0.3
258	0.33
259	0.33
260	0.28
261	0.25
262	0.25
263	0.17
264	0.17
265	0.16
266	0.12
267	0.08
268	0.08
269	0.08
270	0.1
271	0.12
272	0.11
273	0.11
274	0.11
275	0.12
276	0.12
277	0.13
278	0.13
279	0.13
280	0.14
281	0.15
282	0.15
283	0.14
284	0.13
285	0.12
286	0.1
287	0.08
288	0.08
289	0.08
290	0.09
291	0.11
292	0.13
293	0.14
294	0.14
295	0.15
296	0.19
297	0.25
298	0.24
299	0.24
300	0.22
301	0.21
302	0.21
303	0.21
304	0.19
305	0.14
306	0.15
307	0.14
308	0.16
309	0.16
310	0.17
311	0.19
312	0.18
313	0.19
314	0.21
315	0.21
316	0.2
317	0.22
318	0.22
319	0.2
320	0.17
321	0.14
322	0.1
323	0.09
324	0.09
325	0.06
326	0.06
327	0.05
328	0.05
329	0.05
330	0.04
331	0.05
332	0.04
333	0.04
334	0.03
335	0.04
336	0.05
337	0.06
338	0.07
339	0.1
340	0.11
341	0.12
342	0.16
343	0.2
344	0.21
345	0.27
346	0.31
347	0.37
348	0.37
349	0.39
350	0.37
351	0.33
352	0.33
353	0.26
354	0.23
355	0.16
356	0.17
357	0.15
358	0.13
359	0.12
360	0.11
361	0.11
362	0.09
363	0.06
364	0.05
365	0.04
366	0.06
367	0.06
368	0.07
369	0.08
370	0.08
371	0.09
372	0.11
373	0.14
374	0.15
375	0.16
376	0.17
377	0.18
378	0.2
379	0.23
380	0.21
381	0.18
382	0.16
383	0.15
384	0.14
385	0.17
386	0.21
387	0.18
388	0.19
389	0.19
390	0.19
391	0.24
392	0.26
393	0.26
394	0.24
395	0.26
396	0.24
397	0.27
398	0.27
399	0.22
400	0.18
401	0.14
402	0.09
403	0.08
404	0.08
405	0.05
406	0.04
407	0.04
408	0.05
409	0.05
410	0.06
411	0.05
412	0.07
413	0.09
414	0.11
415	0.11
416	0.11
417	0.14
418	0.16
419	0.18
420	0.17
421	0.16
422	0.15
423	0.15
424	0.14
425	0.12
426	0.1
427	0.08
428	0.07
429	0.07
430	0.05
431	0.05
432	0.05
433	0.05
434	0.04
435	0.04
436	0.05
437	0.06
438	0.07
439	0.07
440	0.1
441	0.11
442	0.12
443	0.14
444	0.16
445	0.18
446	0.26
447	0.29
448	0.28
449	0.28
450	0.28
451	0.26
452	0.22
453	0.21
454	0.16
455	0.14
456	0.13
457	0.12
458	0.14
459	0.19
460	0.23
461	0.23
462	0.24
463	0.27
464	0.33
465	0.36
466	0.42
467	0.44
468	0.43
469	0.51
470	0.5
471	0.5
472	0.51
473	0.5
474	0.44
475	0.38
476	0.34
477	0.26
478	0.21
479	0.17
480	0.09
481	0.07
482	0.07
483	0.06
484	0.06
485	0.07
486	0.08
487	0.09
488	0.13
489	0.18
490	0.17
491	0.22
492	0.23
493	0.25
494	0.26
495	0.28
496	0.25
497	0.23
498	0.27
499	0.22
500	0.23
501	0.21
502	0.19
503	0.19
504	0.19
505	0.21
506	0.18
507	0.18
508	0.19
509	0.18
510	0.19
511	0.19
512	0.19
513	0.13
514	0.12
515	0.12
516	0.1
517	0.1
518	0.09
519	0.07
520	0.06
521	0.06
522	0.06
523	0.06
524	0.06
525	0.07
526	0.07
527	0.06
528	0.06
529	0.08
530	0.1
531	0.11
532	0.16
533	0.16
534	0.26
535	0.28
536	0.3
537	0.31
538	0.31
539	0.32
540	0.3
541	0.36
542	0.34
543	0.36
544	0.37
545	0.38
546	0.38
547	0.36
548	0.33
549	0.25
550	0.17
551	0.14
552	0.12
553	0.09
554	0.07
555	0.07
556	0.07
557	0.07
558	0.08
559	0.08
560	0.08
561	0.08
562	0.09
563	0.11
564	0.13
565	0.15
566	0.17
567	0.17
568	0.16
569	0.16
570	0.18
571	0.17
572	0.16
573	0.13
574	0.1
575	0.12
576	0.12
577	0.12
578	0.09
579	0.09
580	0.1
581	0.1
582	0.12
583	0.1
584	0.1
585	0.12
586	0.14
587	0.14
588	0.17
589	0.21
590	0.21
591	0.26
592	0.27
593	0.33
594	0.4
595	0.43
596	0.41
597	0.38
598	0.36
599	0.31
600	0.32
601	0.27
602	0.19
603	0.19
604	0.18
605	0.19
606	0.24
607	0.25
608	0.25
609	0.23
610	0.21
611	0.2
612	0.19
613	0.19
614	0.2
615	0.17
616	0.15
617	0.14
618	0.15
619	0.15
620	0.16
621	0.15
622	0.11
623	0.11
624	0.13
625	0.17
626	0.17
627	0.16
628	0.15
629	0.17
630	0.19
631	0.19
632	0.19
633	0.17
634	0.2
635	0.24
636	0.28
637	0.32
638	0.35
639	0.38
640	0.39
641	0.37
642	0.38
643	0.36
644	0.34
645	0.31
646	0.27
647	0.24
648	0.23
649	0.23
650	0.19
651	0.17
652	0.15
653	0.13
654	0.11
655	0.1
656	0.1
657	0.09
658	0.1
659	0.11
660	0.13
661	0.15
662	0.17
663	0.19
664	0.2
665	0.21
666	0.21
667	0.21
668	0.18
669	0.16
670	0.13
671	0.12
672	0.1
673	0.1
674	0.11
675	0.11
676	0.16
677	0.16
678	0.18
679	0.22
680	0.23
681	0.28
682	0.3
683	0.31
684	0.27
685	0.28
686	0.27
687	0.28
688	0.28
689	0.25
690	0.22
691	0.2
692	0.19
693	0.19
694	0.17
695	0.13
696	0.13
697	0.14
698	0.19
699	0.2
700	0.23
701	0.23
702	0.26
703	0.35
704	0.43
705	0.43
706	0.37
707	0.39
708	0.35
709	0.37
710	0.33
711	0.23
712	0.14
713	0.12
714	0.19
715	0.19
716	0.2
717	0.18
718	0.18
719	0.18
720	0.19
721	0.2
722	0.15
723	0.13
724	0.14
725	0.16
726	0.16
727	0.17
728	0.17
729	0.16
730	0.16
731	0.16
732	0.15
733	0.14
734	0.14
735	0.13
736	0.13
737	0.14
738	0.13
739	0.16
740	0.17
741	0.17
742	0.16
743	0.18
744	0.26
745	0.28
746	0.35
747	0.41
748	0.43
749	0.44
750	0.45
751	0.44
752	0.36
753	0.34
754	0.32
755	0.24
756	0.26
757	0.27
758	0.29
759	0.28
760	0.28
761	0.26
762	0.22
763	0.22
764	0.19
765	0.19
766	0.16
767	0.17
768	0.17
769	0.17
770	0.18
771	0.16
772	0.15
773	0.13
774	0.12
775	0.12
776	0.12
777	0.1
778	0.08
779	0.07
780	0.07
781	0.08
782	0.1
783	0.09
784	0.1
785	0.1
786	0.12
787	0.13
788	0.17
789	0.24
790	0.28
791	0.35
792	0.42
793	0.53
794	0.58
795	0.68
796	0.74
797	0.76
798	0.81
799	0.84
800	0.83
801	0.75
802	0.71
803	0.68
804	0.63
805	0.55
806	0.48
807	0.39
808	0.33
809	0.31
810	0.28
811	0.24
812	0.21
813	0.18
814	0.18
815	0.2
816	0.2
817	0.22
818	0.26
819	0.26
820	0.28
821	0.31
822	0.3
823	0.34
824	0.41
825	0.41
826	0.45
827	0.46
828	0.49
829	0.5
830	0.49
831	0.49
832	0.51
833	0.58
834	0.6
835	0.66
836	0.68
837	0.7
838	0.75
839	0.74
840	0.73
841	0.68
842	0.67
843	0.64
844	0.6
845	0.55
846	0.49
847	0.44
848	0.36
849	0.33
850	0.25
851	0.19
852	0.19
853	0.25
854	0.26
855	0.27
856	0.29
857	0.32
858	0.36
859	0.36
860	0.37
861	0.35
862	0.4

Q0CH18

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer