Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0CCM6

Protein Details
Accession Q0CCM6    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-28MAPPRGKGPKRHAKGSRAPVKRKNGFATBasic
85-113LQATDSKGPARKKRKVEHKEEKVKKLKTDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-23PRGKGPKRHAKGSRAPVKRK
91-110KGPARKKRKVEHKEEKVKKL
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR010678  UTP25  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0034511  F:U3 snoRNA binding  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF06862  UTP25  
Amino Acid Sequences MAPPRGKGPKRHAKGSRAPVKRKNGFATSRLDEVDSDASSAADEFPTGDLSENEMDHEEAGDDASDSEEEDLNAGQSYNELLQLLQATDSKGPARKKRKVEHKEEKVKKLKTDAVVEGAEEEEKEEEEEAVANDLEQQEPSDEEDANLDEANADEQDSDTEDGTDPFESHFANPKEADLTKKIQAVEAKKWTTAKKETEGLRLVRSVPEGAEASFLPTMKSLANVKLKRKLQTTAKDAIPSISGHAQHLAPYVFDYQDVLYGARTTSNAVPMRDILAAHATNHVLKTRDRVLKNNLRAAKEQDADLDLRDQGFTRPKVLYLLPSKQACVRVVESITRLFQPEQQENKKRFLDTFSAEDDVSWDNKPDDFRELFAGNNDDMFRLGLKFTRKTIKFFAQFYTSDMILASPLGLRTIMDQADAKKRDHDFLSSIEVVIVDHADALQMQNWDHVDYILKHLNLQPKEAHGCDFSRVRPWYLDNQARHVRQLIMLAGFITPEINSVYSAQMQNVAGKVKATPVYEGAISELPLPVSVKQTFSRFDSLSPAKDPDARFKHFTTTVLSTLVRQITAGRGKHRGGVLIVIPSYLDFVRVRNHFATSAQTANLSFGAISEYTEPREVARARSHFMNGRHSVLLYSERFHHFRRYQIRGVRQVVMYGVPENPRFYGEMVGFLGLDAAAVVEAAEGGVRALFSKWDALKLERVVGTKRLGNMMRERGGDTFTFV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.85
3 0.85
4 0.84
5 0.86
6 0.85
7 0.88
8 0.85
9 0.83
10 0.79
11 0.78
12 0.74
13 0.69
14 0.68
15 0.61
16 0.57
17 0.5
18 0.43
19 0.34
20 0.31
21 0.3
22 0.22
23 0.18
24 0.15
25 0.14
26 0.13
27 0.13
28 0.1
29 0.07
30 0.07
31 0.07
32 0.07
33 0.09
34 0.09
35 0.1
36 0.1
37 0.14
38 0.16
39 0.15
40 0.16
41 0.16
42 0.15
43 0.14
44 0.14
45 0.1
46 0.08
47 0.09
48 0.07
49 0.06
50 0.06
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.08
55 0.09
56 0.08
57 0.09
58 0.09
59 0.08
60 0.09
61 0.09
62 0.07
63 0.06
64 0.08
65 0.08
66 0.09
67 0.08
68 0.08
69 0.09
70 0.1
71 0.11
72 0.1
73 0.11
74 0.12
75 0.13
76 0.15
77 0.18
78 0.23
79 0.32
80 0.41
81 0.5
82 0.57
83 0.66
84 0.74
85 0.82
86 0.86
87 0.89
88 0.9
89 0.9
90 0.92
91 0.92
92 0.92
93 0.9
94 0.85
95 0.79
96 0.75
97 0.71
98 0.65
99 0.62
100 0.54
101 0.48
102 0.43
103 0.38
104 0.32
105 0.25
106 0.2
107 0.13
108 0.11
109 0.07
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.07
114 0.07
115 0.08
116 0.08
117 0.09
118 0.08
119 0.08
120 0.09
121 0.1
122 0.1
123 0.09
124 0.1
125 0.09
126 0.1
127 0.12
128 0.12
129 0.11
130 0.11
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.11
135 0.09
136 0.07
137 0.07
138 0.08
139 0.07
140 0.06
141 0.05
142 0.06
143 0.06
144 0.08
145 0.09
146 0.08
147 0.09
148 0.1
149 0.1
150 0.11
151 0.11
152 0.09
153 0.09
154 0.1
155 0.1
156 0.11
157 0.2
158 0.2
159 0.23
160 0.23
161 0.23
162 0.26
163 0.26
164 0.29
165 0.25
166 0.28
167 0.28
168 0.31
169 0.3
170 0.3
171 0.35
172 0.36
173 0.39
174 0.43
175 0.41
176 0.4
177 0.45
178 0.44
179 0.46
180 0.48
181 0.45
182 0.41
183 0.46
184 0.47
185 0.49
186 0.52
187 0.46
188 0.41
189 0.37
190 0.33
191 0.28
192 0.26
193 0.2
194 0.14
195 0.15
196 0.13
197 0.12
198 0.12
199 0.11
200 0.12
201 0.12
202 0.12
203 0.1
204 0.09
205 0.1
206 0.09
207 0.12
208 0.12
209 0.18
210 0.28
211 0.33
212 0.38
213 0.46
214 0.5
215 0.53
216 0.54
217 0.54
218 0.54
219 0.57
220 0.58
221 0.55
222 0.53
223 0.49
224 0.46
225 0.39
226 0.31
227 0.23
228 0.19
229 0.16
230 0.15
231 0.14
232 0.15
233 0.14
234 0.14
235 0.16
236 0.13
237 0.1
238 0.11
239 0.11
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.08
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.08
252 0.09
253 0.09
254 0.16
255 0.18
256 0.18
257 0.19
258 0.19
259 0.2
260 0.19
261 0.18
262 0.11
263 0.12
264 0.12
265 0.12
266 0.13
267 0.12
268 0.12
269 0.13
270 0.14
271 0.12
272 0.12
273 0.16
274 0.23
275 0.31
276 0.32
277 0.37
278 0.44
279 0.51
280 0.56
281 0.59
282 0.55
283 0.5
284 0.51
285 0.5
286 0.46
287 0.37
288 0.33
289 0.26
290 0.23
291 0.2
292 0.19
293 0.15
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.08
298 0.1
299 0.15
300 0.16
301 0.17
302 0.17
303 0.18
304 0.2
305 0.2
306 0.23
307 0.22
308 0.25
309 0.28
310 0.28
311 0.28
312 0.29
313 0.32
314 0.26
315 0.24
316 0.21
317 0.18
318 0.18
319 0.19
320 0.18
321 0.16
322 0.16
323 0.13
324 0.14
325 0.12
326 0.15
327 0.19
328 0.24
329 0.31
330 0.39
331 0.46
332 0.48
333 0.53
334 0.51
335 0.47
336 0.41
337 0.37
338 0.32
339 0.27
340 0.27
341 0.22
342 0.22
343 0.21
344 0.2
345 0.17
346 0.14
347 0.13
348 0.1
349 0.09
350 0.08
351 0.1
352 0.11
353 0.11
354 0.14
355 0.13
356 0.14
357 0.16
358 0.16
359 0.15
360 0.15
361 0.16
362 0.11
363 0.12
364 0.11
365 0.08
366 0.08
367 0.08
368 0.07
369 0.06
370 0.06
371 0.08
372 0.12
373 0.13
374 0.16
375 0.26
376 0.27
377 0.3
378 0.35
379 0.4
380 0.4
381 0.4
382 0.4
383 0.34
384 0.33
385 0.31
386 0.29
387 0.2
388 0.16
389 0.14
390 0.12
391 0.08
392 0.08
393 0.06
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.05
400 0.08
401 0.07
402 0.08
403 0.09
404 0.12
405 0.21
406 0.23
407 0.22
408 0.25
409 0.26
410 0.29
411 0.29
412 0.28
413 0.22
414 0.21
415 0.26
416 0.2
417 0.19
418 0.16
419 0.15
420 0.12
421 0.11
422 0.09
423 0.03
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.05
430 0.06
431 0.06
432 0.08
433 0.09
434 0.09
435 0.09
436 0.09
437 0.1
438 0.1
439 0.14
440 0.17
441 0.16
442 0.17
443 0.21
444 0.28
445 0.26
446 0.28
447 0.25
448 0.24
449 0.28
450 0.27
451 0.25
452 0.2
453 0.2
454 0.22
455 0.23
456 0.2
457 0.25
458 0.26
459 0.26
460 0.25
461 0.27
462 0.31
463 0.37
464 0.43
465 0.37
466 0.43
467 0.49
468 0.48
469 0.46
470 0.41
471 0.33
472 0.27
473 0.27
474 0.21
475 0.14
476 0.13
477 0.12
478 0.1
479 0.09
480 0.08
481 0.06
482 0.04
483 0.05
484 0.05
485 0.05
486 0.06
487 0.07
488 0.09
489 0.12
490 0.12
491 0.12
492 0.14
493 0.14
494 0.15
495 0.15
496 0.15
497 0.12
498 0.12
499 0.13
500 0.13
501 0.17
502 0.16
503 0.15
504 0.16
505 0.17
506 0.17
507 0.16
508 0.15
509 0.12
510 0.11
511 0.11
512 0.1
513 0.08
514 0.09
515 0.09
516 0.09
517 0.13
518 0.13
519 0.16
520 0.19
521 0.22
522 0.24
523 0.26
524 0.3
525 0.26
526 0.26
527 0.31
528 0.32
529 0.31
530 0.32
531 0.3
532 0.27
533 0.32
534 0.32
535 0.34
536 0.38
537 0.4
538 0.41
539 0.41
540 0.45
541 0.42
542 0.42
543 0.37
544 0.33
545 0.3
546 0.28
547 0.27
548 0.22
549 0.25
550 0.24
551 0.18
552 0.15
553 0.14
554 0.19
555 0.26
556 0.28
557 0.28
558 0.33
559 0.34
560 0.38
561 0.38
562 0.33
563 0.27
564 0.27
565 0.24
566 0.21
567 0.2
568 0.16
569 0.15
570 0.12
571 0.13
572 0.1
573 0.11
574 0.09
575 0.11
576 0.18
577 0.2
578 0.25
579 0.25
580 0.27
581 0.25
582 0.26
583 0.29
584 0.26
585 0.26
586 0.21
587 0.21
588 0.19
589 0.19
590 0.18
591 0.13
592 0.09
593 0.07
594 0.09
595 0.08
596 0.09
597 0.11
598 0.13
599 0.14
600 0.16
601 0.16
602 0.15
603 0.22
604 0.23
605 0.25
606 0.32
607 0.33
608 0.35
609 0.39
610 0.43
611 0.42
612 0.45
613 0.49
614 0.43
615 0.44
616 0.41
617 0.38
618 0.34
619 0.3
620 0.32
621 0.24
622 0.23
623 0.24
624 0.29
625 0.32
626 0.34
627 0.42
628 0.39
629 0.47
630 0.54
631 0.57
632 0.6
633 0.66
634 0.72
635 0.71
636 0.73
637 0.68
638 0.59
639 0.52
640 0.45
641 0.37
642 0.29
643 0.22
644 0.21
645 0.21
646 0.22
647 0.23
648 0.23
649 0.22
650 0.22
651 0.22
652 0.23
653 0.19
654 0.2
655 0.19
656 0.18
657 0.17
658 0.15
659 0.14
660 0.08
661 0.08
662 0.04
663 0.04
664 0.03
665 0.03
666 0.03
667 0.03
668 0.03
669 0.03
670 0.03
671 0.03
672 0.03
673 0.04
674 0.04
675 0.05
676 0.06
677 0.07
678 0.08
679 0.15
680 0.16
681 0.21
682 0.25
683 0.27
684 0.33
685 0.34
686 0.39
687 0.35
688 0.37
689 0.36
690 0.38
691 0.39
692 0.36
693 0.37
694 0.39
695 0.39
696 0.43
697 0.48
698 0.51
699 0.51
700 0.49
701 0.49
702 0.42
703 0.42