Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0CT49

Protein Details
Accession Q0CT49    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
223-257PDSEFPRISRKEKKRLRREKKERKKQAKLSGSDGSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
229-250RISRKEKKRLRREKKERKKQAK
Subcellular Location(s) plas 23, E.R. 2, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007568  RTA1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF04479  RTA1  
Amino Acid Sequences MGAGWECLAFVFRALLTRNQSSDGYNTAFNLLFYLAPLWINAFIYMTLGRLVYFFLPDRRLAGISATKYGVIFIWLDVVSFIVQAAGAIISSPTDVSTRIVMIGVHIYMGGIGLQQLFIIVFTVLCIRLHRQLHVLEQTRGFELGKADGSSRPWRWLFYAIYFGLVMITVRIIFRLCQFSRGTDPNNPVLTHEFYEYVFDAVPMLLALVALNLIHPGMVLRGPDSEFPRISRKEKKRLRREKKERKKQAKLSGSDGSHGVGFESLSIQESGAWEDRGTLGGSRSVVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.2
3 0.25
4 0.29
5 0.3
6 0.32
7 0.33
8 0.31
9 0.31
10 0.29
11 0.25
12 0.22
13 0.22
14 0.21
15 0.2
16 0.18
17 0.16
18 0.13
19 0.1
20 0.1
21 0.1
22 0.08
23 0.08
24 0.08
25 0.09
26 0.09
27 0.09
28 0.09
29 0.08
30 0.08
31 0.09
32 0.09
33 0.09
34 0.08
35 0.08
36 0.08
37 0.07
38 0.09
39 0.08
40 0.1
41 0.11
42 0.15
43 0.17
44 0.17
45 0.19
46 0.2
47 0.2
48 0.18
49 0.2
50 0.21
51 0.2
52 0.22
53 0.21
54 0.19
55 0.18
56 0.18
57 0.14
58 0.1
59 0.09
60 0.06
61 0.09
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.07
67 0.06
68 0.06
69 0.04
70 0.03
71 0.03
72 0.04
73 0.03
74 0.03
75 0.03
76 0.03
77 0.03
78 0.03
79 0.03
80 0.04
81 0.04
82 0.05
83 0.06
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.06
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.04
96 0.04
97 0.03
98 0.02
99 0.03
100 0.03
101 0.03
102 0.03
103 0.03
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.03
109 0.03
110 0.04
111 0.05
112 0.05
113 0.06
114 0.08
115 0.14
116 0.16
117 0.16
118 0.19
119 0.19
120 0.22
121 0.29
122 0.3
123 0.25
124 0.25
125 0.25
126 0.22
127 0.21
128 0.18
129 0.12
130 0.09
131 0.09
132 0.08
133 0.08
134 0.09
135 0.09
136 0.12
137 0.17
138 0.17
139 0.21
140 0.21
141 0.21
142 0.22
143 0.25
144 0.23
145 0.19
146 0.23
147 0.18
148 0.18
149 0.17
150 0.15
151 0.11
152 0.09
153 0.08
154 0.03
155 0.04
156 0.03
157 0.03
158 0.04
159 0.04
160 0.05
161 0.08
162 0.15
163 0.15
164 0.19
165 0.2
166 0.22
167 0.27
168 0.31
169 0.32
170 0.29
171 0.33
172 0.34
173 0.36
174 0.33
175 0.3
176 0.29
177 0.28
178 0.24
179 0.22
180 0.17
181 0.15
182 0.17
183 0.15
184 0.13
185 0.1
186 0.09
187 0.08
188 0.07
189 0.07
190 0.04
191 0.04
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.02
196 0.03
197 0.02
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.04
205 0.05
206 0.06
207 0.06
208 0.08
209 0.1
210 0.14
211 0.18
212 0.21
213 0.21
214 0.24
215 0.32
216 0.36
217 0.42
218 0.49
219 0.55
220 0.61
221 0.7
222 0.78
223 0.81
224 0.88
225 0.92
226 0.92
227 0.94
228 0.95
229 0.97
230 0.97
231 0.97
232 0.97
233 0.96
234 0.95
235 0.94
236 0.92
237 0.85
238 0.8
239 0.77
240 0.67
241 0.57
242 0.48
243 0.38
244 0.29
245 0.24
246 0.18
247 0.1
248 0.09
249 0.08
250 0.08
251 0.07
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.09
256 0.1
257 0.14
258 0.15
259 0.16
260 0.14
261 0.15
262 0.15
263 0.16
264 0.16
265 0.14
266 0.13
267 0.15