Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0D0W0

Protein Details
Accession Q0D0W0    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
127-179ADGERSQRKREGRREKKSRRMRELEDAGSDDEGRSRKKDRKKRREATPEDEELBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
116-171GRHKRKRTGDEADGERSQRKREGRREKKSRRMRELEDAGSDDEGRSRKKDRKKRRE
187-188RR
197-208ALKKPTKRRFRK
444-444R
449-454QKGSRK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSASPEPKPDTVADPHVEADQSEEPAQAPTPGAGDEDEGQGETPAVAAESQSPAANDDEQAAEGNEDEEKGDGESDDESILSEVDEAQFEDFDPENVDIEDRPQLAIDEDNLKLIGRHKRKRTGDEADGERSQRKREGRREKKSRRMRELEDAGSDDEGRSRKKDRKKRREATPEDEELLDPETRRRRALDRAMDEALKKPTKRRFRKADGIDLEQMADAEIEDMRKRMTHAAQMDAINRREGKPAMHKLKMLPEVVSLLNRNQYVNSLVDPEINLLEAVKFFLEPLDDGSLPAYNIQRDLMTSLSKLPINKEALIASGIGKVIVFYTRSKRPEPGIKRMAERLLAEWTRPILQRSDDYSKRVYQEAEFDPRKLATRPAASAQVTAAEARARELLPPRLANRARADMTHTSYTVVPRPTVVQESKFARPLGASGEDRFRRMRARQIAAQKGSRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.33
3 0.31
4 0.29
5 0.23
6 0.23
7 0.19
8 0.2
9 0.19
10 0.18
11 0.17
12 0.19
13 0.19
14 0.15
15 0.13
16 0.11
17 0.11
18 0.11
19 0.11
20 0.1
21 0.12
22 0.12
23 0.13
24 0.13
25 0.12
26 0.12
27 0.11
28 0.11
29 0.08
30 0.07
31 0.05
32 0.05
33 0.05
34 0.05
35 0.07
36 0.09
37 0.11
38 0.11
39 0.11
40 0.13
41 0.15
42 0.15
43 0.14
44 0.13
45 0.13
46 0.13
47 0.13
48 0.12
49 0.1
50 0.09
51 0.09
52 0.08
53 0.07
54 0.07
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.06
69 0.06
70 0.05
71 0.06
72 0.07
73 0.06
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.1
78 0.1
79 0.1
80 0.12
81 0.12
82 0.12
83 0.12
84 0.13
85 0.09
86 0.11
87 0.14
88 0.12
89 0.12
90 0.11
91 0.12
92 0.12
93 0.13
94 0.13
95 0.13
96 0.13
97 0.13
98 0.13
99 0.13
100 0.13
101 0.18
102 0.26
103 0.33
104 0.42
105 0.5
106 0.6
107 0.67
108 0.73
109 0.76
110 0.74
111 0.71
112 0.7
113 0.65
114 0.61
115 0.56
116 0.5
117 0.47
118 0.41
119 0.37
120 0.36
121 0.39
122 0.44
123 0.52
124 0.62
125 0.68
126 0.77
127 0.86
128 0.9
129 0.92
130 0.93
131 0.93
132 0.91
133 0.88
134 0.82
135 0.8
136 0.76
137 0.67
138 0.58
139 0.49
140 0.4
141 0.32
142 0.27
143 0.17
144 0.14
145 0.14
146 0.15
147 0.16
148 0.23
149 0.3
150 0.41
151 0.52
152 0.6
153 0.69
154 0.79
155 0.84
156 0.89
157 0.92
158 0.89
159 0.86
160 0.82
161 0.73
162 0.63
163 0.54
164 0.43
165 0.32
166 0.26
167 0.19
168 0.12
169 0.15
170 0.21
171 0.22
172 0.23
173 0.25
174 0.27
175 0.35
176 0.43
177 0.46
178 0.43
179 0.45
180 0.46
181 0.44
182 0.41
183 0.36
184 0.33
185 0.29
186 0.26
187 0.29
188 0.37
189 0.46
190 0.55
191 0.62
192 0.65
193 0.7
194 0.79
195 0.76
196 0.77
197 0.7
198 0.64
199 0.56
200 0.46
201 0.38
202 0.28
203 0.23
204 0.13
205 0.09
206 0.05
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.07
215 0.1
216 0.11
217 0.16
218 0.17
219 0.19
220 0.22
221 0.23
222 0.25
223 0.26
224 0.25
225 0.22
226 0.21
227 0.2
228 0.2
229 0.2
230 0.2
231 0.24
232 0.33
233 0.38
234 0.39
235 0.39
236 0.38
237 0.44
238 0.45
239 0.37
240 0.27
241 0.21
242 0.21
243 0.21
244 0.2
245 0.14
246 0.12
247 0.14
248 0.14
249 0.14
250 0.12
251 0.13
252 0.14
253 0.13
254 0.13
255 0.12
256 0.12
257 0.12
258 0.12
259 0.11
260 0.09
261 0.09
262 0.08
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.07
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.12
281 0.12
282 0.09
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.09
287 0.11
288 0.1
289 0.09
290 0.1
291 0.11
292 0.13
293 0.15
294 0.15
295 0.16
296 0.21
297 0.23
298 0.23
299 0.23
300 0.2
301 0.19
302 0.19
303 0.17
304 0.12
305 0.1
306 0.09
307 0.08
308 0.07
309 0.06
310 0.06
311 0.07
312 0.08
313 0.11
314 0.17
315 0.24
316 0.29
317 0.31
318 0.35
319 0.4
320 0.49
321 0.53
322 0.58
323 0.58
324 0.58
325 0.59
326 0.6
327 0.55
328 0.48
329 0.41
330 0.33
331 0.33
332 0.3
333 0.26
334 0.24
335 0.23
336 0.24
337 0.24
338 0.24
339 0.19
340 0.21
341 0.25
342 0.31
343 0.38
344 0.37
345 0.4
346 0.42
347 0.43
348 0.43
349 0.41
350 0.36
351 0.28
352 0.32
353 0.34
354 0.4
355 0.38
356 0.36
357 0.36
358 0.35
359 0.37
360 0.31
361 0.31
362 0.28
363 0.31
364 0.33
365 0.34
366 0.4
367 0.37
368 0.36
369 0.31
370 0.26
371 0.22
372 0.19
373 0.16
374 0.12
375 0.11
376 0.12
377 0.14
378 0.12
379 0.16
380 0.22
381 0.28
382 0.31
383 0.36
384 0.36
385 0.44
386 0.46
387 0.49
388 0.49
389 0.49
390 0.45
391 0.41
392 0.46
393 0.42
394 0.46
395 0.43
396 0.37
397 0.32
398 0.32
399 0.35
400 0.34
401 0.31
402 0.25
403 0.23
404 0.26
405 0.28
406 0.34
407 0.34
408 0.32
409 0.36
410 0.41
411 0.45
412 0.47
413 0.43
414 0.36
415 0.32
416 0.31
417 0.29
418 0.3
419 0.27
420 0.26
421 0.36
422 0.37
423 0.4
424 0.41
425 0.39
426 0.41
427 0.44
428 0.51
429 0.51
430 0.56
431 0.61
432 0.69
433 0.75
434 0.74