Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0CH49

Protein Details
Accession Q0CH49    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
173-195VDARRVERKKPGHVKARKMPTWVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
73-80ARGKGKRK
176-197RRVERKKPGHVKARKMPTWVKR
Subcellular Location(s) cyto 18.5, cyto_nucl 12, nucl 4.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020568  Ribosomal_S5_D2-typ_fold  
IPR014721  Ribosomal_S5_D2-typ_fold_subgr  
IPR000754  Ribosomal_S9  
IPR020574  Ribosomal_S9_CS  
Gene Ontology GO:0005763  C:mitochondrial small ribosomal subunit  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00380  Ribosomal_S9  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00360  RIBOSOMAL_S9  
Amino Acid Sequences MAWFKLPQFRDFVGEPVPTKKYKNLVKILQRLNRIDPALVPDEVRETLKSFLRPGNPYGNKPAPATVDEMGRARGKGKRKTSSAVVHLVEGEGEVMINGKTLAEAFPRLHDRESATWPLRCTSRLDKYNVWANVRGGGVTGQAEAVTLALARALLVHEPALKPVLRKAGVITVDARRVERKKPGHVKARKMPTWVKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.3
3 0.3
4 0.34
5 0.31
6 0.33
7 0.36
8 0.41
9 0.45
10 0.53
11 0.56
12 0.61
13 0.68
14 0.74
15 0.78
16 0.75
17 0.74
18 0.68
19 0.64
20 0.6
21 0.51
22 0.42
23 0.34
24 0.32
25 0.29
26 0.25
27 0.21
28 0.16
29 0.18
30 0.18
31 0.18
32 0.15
33 0.13
34 0.16
35 0.19
36 0.2
37 0.21
38 0.24
39 0.29
40 0.3
41 0.32
42 0.4
43 0.4
44 0.41
45 0.47
46 0.46
47 0.42
48 0.4
49 0.39
50 0.3
51 0.27
52 0.28
53 0.21
54 0.18
55 0.17
56 0.17
57 0.17
58 0.16
59 0.15
60 0.15
61 0.19
62 0.26
63 0.33
64 0.41
65 0.46
66 0.48
67 0.51
68 0.55
69 0.56
70 0.51
71 0.48
72 0.4
73 0.33
74 0.3
75 0.26
76 0.19
77 0.13
78 0.09
79 0.03
80 0.03
81 0.02
82 0.03
83 0.03
84 0.03
85 0.03
86 0.03
87 0.03
88 0.03
89 0.04
90 0.04
91 0.06
92 0.07
93 0.1
94 0.13
95 0.14
96 0.15
97 0.16
98 0.18
99 0.19
100 0.23
101 0.27
102 0.26
103 0.27
104 0.27
105 0.28
106 0.26
107 0.25
108 0.26
109 0.27
110 0.33
111 0.36
112 0.4
113 0.4
114 0.43
115 0.5
116 0.48
117 0.43
118 0.37
119 0.32
120 0.31
121 0.29
122 0.24
123 0.17
124 0.13
125 0.11
126 0.09
127 0.09
128 0.06
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.04
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.09
145 0.1
146 0.11
147 0.14
148 0.14
149 0.15
150 0.18
151 0.26
152 0.24
153 0.24
154 0.25
155 0.29
156 0.29
157 0.3
158 0.3
159 0.26
160 0.3
161 0.31
162 0.31
163 0.33
164 0.35
165 0.4
166 0.46
167 0.49
168 0.55
169 0.64
170 0.72
171 0.74
172 0.8
173 0.84
174 0.84
175 0.87
176 0.81
177 0.78