Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0CTJ4

Protein Details
Accession Q0CTJ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MAKARTKKRTHARPQNATAAAKHydrophilic
369-405VKNLDKSWEQRKKEKEERKRQQKENIEKKKQAKVQAKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
231-251GIPKRIRRLDPKEIRNKEKAK
378-404QRKKEKEERKRQQKENIEKKKQAKVQA
Subcellular Location(s) mito 17.5, mito_nucl 14, nucl 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR045112  PPAN-like  
Gene Ontology GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MAKARTKKRTHARPQNATAAAKGSAATMSKTPKSMVIRVGGSQVGTSVSQLVQDVRTMMEPDTAVRLKERKSNRLRDYTVMAGPLGVTHLMLFSKSATGNTNMRLALTPRGPTLHFKVENYSLCRDVERALKRPRGGGQDHKTPPLLVMNNFNSPNATETSKVPKRLESLTTTVFQSLFPPINPQATPLHSIRRVMLLNRELSGKNGEDEKEEDSYVLNLRHYAITTRKTGIPKRIRRLDPKEIRNKEKAKSAVPNLGKLEDAADYLLDPSAAGYTSASETELDTDAEVEVAESTTKKVLTKRELQRMKSGDKEKAQKKLDAAPGVEKRAVKLVELGPRMRLRLIKVEEGLCEGRIMWHDYIKKSEAEVKNLDKSWEQRKKEKEERKRQQKENIEKKKQAKVQAKAEGKEVPEDDDDDEEDVDMDDDDWLSDDFDDENQDEVEGDEDDSMEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.89
2 0.88
3 0.83
4 0.73
5 0.63
6 0.54
7 0.44
8 0.34
9 0.27
10 0.18
11 0.15
12 0.15
13 0.15
14 0.17
15 0.23
16 0.25
17 0.26
18 0.26
19 0.31
20 0.36
21 0.39
22 0.39
23 0.38
24 0.38
25 0.38
26 0.39
27 0.33
28 0.28
29 0.23
30 0.18
31 0.14
32 0.12
33 0.11
34 0.1
35 0.09
36 0.1
37 0.11
38 0.12
39 0.11
40 0.12
41 0.12
42 0.11
43 0.13
44 0.14
45 0.13
46 0.14
47 0.14
48 0.14
49 0.2
50 0.2
51 0.19
52 0.23
53 0.27
54 0.28
55 0.36
56 0.43
57 0.47
58 0.56
59 0.66
60 0.7
61 0.74
62 0.75
63 0.7
64 0.67
65 0.61
66 0.53
67 0.43
68 0.34
69 0.24
70 0.21
71 0.17
72 0.12
73 0.08
74 0.06
75 0.05
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.07
80 0.06
81 0.09
82 0.09
83 0.11
84 0.12
85 0.16
86 0.19
87 0.21
88 0.24
89 0.21
90 0.21
91 0.22
92 0.21
93 0.23
94 0.22
95 0.22
96 0.2
97 0.22
98 0.23
99 0.26
100 0.29
101 0.33
102 0.32
103 0.32
104 0.35
105 0.39
106 0.43
107 0.42
108 0.39
109 0.32
110 0.31
111 0.3
112 0.27
113 0.23
114 0.27
115 0.28
116 0.34
117 0.41
118 0.46
119 0.46
120 0.49
121 0.52
122 0.5
123 0.5
124 0.52
125 0.5
126 0.54
127 0.56
128 0.54
129 0.5
130 0.42
131 0.38
132 0.34
133 0.3
134 0.21
135 0.26
136 0.26
137 0.3
138 0.3
139 0.29
140 0.24
141 0.21
142 0.22
143 0.17
144 0.16
145 0.12
146 0.15
147 0.25
148 0.29
149 0.34
150 0.33
151 0.33
152 0.35
153 0.37
154 0.38
155 0.32
156 0.32
157 0.29
158 0.29
159 0.27
160 0.25
161 0.21
162 0.18
163 0.15
164 0.14
165 0.12
166 0.11
167 0.14
168 0.15
169 0.17
170 0.17
171 0.18
172 0.18
173 0.19
174 0.22
175 0.2
176 0.24
177 0.23
178 0.24
179 0.22
180 0.24
181 0.23
182 0.21
183 0.25
184 0.23
185 0.22
186 0.22
187 0.24
188 0.2
189 0.2
190 0.21
191 0.16
192 0.13
193 0.15
194 0.14
195 0.13
196 0.14
197 0.15
198 0.14
199 0.13
200 0.12
201 0.1
202 0.11
203 0.11
204 0.11
205 0.09
206 0.08
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.11
211 0.13
212 0.15
213 0.17
214 0.19
215 0.22
216 0.27
217 0.31
218 0.38
219 0.44
220 0.5
221 0.57
222 0.64
223 0.66
224 0.7
225 0.75
226 0.75
227 0.74
228 0.75
229 0.77
230 0.75
231 0.75
232 0.74
233 0.7
234 0.62
235 0.6
236 0.54
237 0.48
238 0.47
239 0.45
240 0.44
241 0.41
242 0.42
243 0.36
244 0.33
245 0.28
246 0.22
247 0.2
248 0.12
249 0.11
250 0.07
251 0.06
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.04
256 0.03
257 0.03
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.03
262 0.04
263 0.05
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.07
269 0.08
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.05
282 0.07
283 0.08
284 0.1
285 0.14
286 0.22
287 0.28
288 0.38
289 0.46
290 0.55
291 0.61
292 0.62
293 0.66
294 0.64
295 0.62
296 0.61
297 0.57
298 0.54
299 0.53
300 0.6
301 0.57
302 0.62
303 0.61
304 0.55
305 0.53
306 0.54
307 0.53
308 0.47
309 0.43
310 0.42
311 0.43
312 0.42
313 0.43
314 0.35
315 0.29
316 0.31
317 0.3
318 0.22
319 0.23
320 0.25
321 0.29
322 0.33
323 0.33
324 0.32
325 0.34
326 0.34
327 0.32
328 0.3
329 0.26
330 0.31
331 0.34
332 0.33
333 0.34
334 0.35
335 0.33
336 0.34
337 0.32
338 0.23
339 0.19
340 0.15
341 0.14
342 0.14
343 0.18
344 0.15
345 0.2
346 0.24
347 0.26
348 0.31
349 0.31
350 0.3
351 0.28
352 0.36
353 0.35
354 0.36
355 0.4
356 0.41
357 0.45
358 0.45
359 0.45
360 0.4
361 0.42
362 0.47
363 0.51
364 0.51
365 0.54
366 0.62
367 0.7
368 0.77
369 0.82
370 0.82
371 0.84
372 0.89
373 0.92
374 0.93
375 0.91
376 0.91
377 0.91
378 0.91
379 0.91
380 0.91
381 0.89
382 0.88
383 0.87
384 0.86
385 0.82
386 0.81
387 0.79
388 0.77
389 0.77
390 0.78
391 0.77
392 0.69
393 0.66
394 0.61
395 0.52
396 0.48
397 0.4
398 0.33
399 0.27
400 0.28
401 0.25
402 0.23
403 0.22
404 0.18
405 0.17
406 0.13
407 0.12
408 0.11
409 0.09
410 0.08
411 0.07
412 0.06
413 0.06
414 0.06
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.08
420 0.08
421 0.09
422 0.12
423 0.12
424 0.13
425 0.13
426 0.13
427 0.12
428 0.12
429 0.12
430 0.1
431 0.09
432 0.08