FuNGI

Q0CPX7

Protein Details

Accession

Q0CPX7

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
20-49	PPMRIRRPRAADPLVRPKRKPVARPPGSTA	Hydrophilic
131-153	ESQFTRPVRLQRRDPRARPHEMN	Hydrophilic
514-536	SGTDTSRKRKSKHISSQPATQPS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
21-46	PMRIRRPRAADPLVRPKRKPVARPPG
407-430	EKKEKEARRVLGKSVRKALKRREK

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MTTPSNDPASRTPTAPNGAPPMRIRRPRAADPLVRPKRKPVARPPGSTAPGTASVAKPAPSRPVAPPTSRPERGILPPSENKFGANGFSGPLLSETYVDYPLVTTKRALREGLKHHIARFASKKNVDPRDESQFTRPVRLQRRDPRARPHEMNAERGQGKSSFESNHQLDEAEREELEARKAAREKEREENLAQIAPAMGQTQKRSNAPKQKTQQVSKTEMTPEEIARTRIKYEEALPWHLEDFDNKNIWVGNYEAALSETHAVFVLENTGKMRMIPVEKWYRFNAKNQFKALTIEEAEKFMAKRVKDPRWFMEKQQEMAQRKELEQFAKQRKVYAGKQGTPAADGLEADEMDFEEDRFADDEEHDDLFNDDEETKAAEKRIKQDQLKANVFDLKDEKEYEEEELREKKEKEARRVLGKSVRKALKRREKNYDYSSGSDANPYTDEESTDESEAERLREEERKAEEEKKQKESASSSKGNITPSGRAKHTDALKKGTTAVSRKRLGSPNASDASGTDTSRKRKSKHISSQPATQPSSRPMSPAAGPSAPAGKKRVRNLPAGAGSDVDGGAGSGAEMSESGKAKKLKLNPPGVSRSGTPQGSRAGSPTPLASRSFSGSRASSPESMRDSCLYPGRRRLPYPCRDSCCHSSIWNWK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.39
3	0.38
4	0.4
5	0.4
6	0.44
7	0.45
8	0.49
9	0.54
10	0.61
11	0.63
12	0.64
13	0.69
14	0.73
15	0.77
16	0.76
17	0.74
18	0.75
19	0.8
20	0.8
21	0.8
22	0.74
23	0.73
24	0.75
25	0.74
26	0.75
27	0.74
28	0.75
29	0.77
30	0.81
31	0.8
32	0.79
33	0.74
34	0.65
35	0.54
36	0.47
37	0.41
38	0.37
39	0.32
40	0.23
41	0.24
42	0.26
43	0.27
44	0.25
45	0.25
46	0.3
47	0.3
48	0.33
49	0.34
50	0.41
51	0.45
52	0.48
53	0.53
54	0.55
55	0.61
56	0.61
57	0.57
58	0.52
59	0.51
60	0.53
61	0.53
62	0.48
63	0.46
64	0.5
65	0.53
66	0.54
67	0.49
68	0.42
69	0.36
70	0.33
71	0.28
72	0.22
73	0.18
74	0.14
75	0.14
76	0.13
77	0.12
78	0.12
79	0.11
80	0.09
81	0.09
82	0.1
83	0.12
84	0.13
85	0.12
86	0.11
87	0.1
88	0.15
89	0.16
90	0.16
91	0.16
92	0.21
93	0.28
94	0.31
95	0.34
96	0.34
97	0.41
98	0.47
99	0.54
100	0.56
101	0.52
102	0.51
103	0.54
104	0.49
105	0.48
106	0.48
107	0.46
108	0.47
109	0.48
110	0.54
111	0.57
112	0.64
113	0.61
114	0.6
115	0.57
116	0.58
117	0.58
118	0.54
119	0.49
120	0.48
121	0.45
122	0.46
123	0.45
124	0.45
125	0.51
126	0.57
127	0.62
128	0.64
129	0.74
130	0.78
131	0.81
132	0.83
133	0.81
134	0.82
135	0.76
136	0.72
137	0.72
138	0.64
139	0.64
140	0.55
141	0.54
142	0.47
143	0.42
144	0.38
145	0.29
146	0.29
147	0.24
148	0.25
149	0.2
150	0.22
151	0.29
152	0.28
153	0.28
154	0.26
155	0.24
156	0.21
157	0.22
158	0.21
159	0.14
160	0.13
161	0.12
162	0.14
163	0.15
164	0.16
165	0.16
166	0.14
167	0.18
168	0.22
169	0.27
170	0.33
171	0.39
172	0.42
173	0.49
174	0.53
175	0.52
176	0.49
177	0.47
178	0.41
179	0.35
180	0.3
181	0.21
182	0.16
183	0.11
184	0.1
185	0.08
186	0.09
187	0.1
188	0.13
189	0.18
190	0.22
191	0.27
192	0.33
193	0.42
194	0.5
195	0.54
196	0.6
197	0.63
198	0.69
199	0.72
200	0.72
201	0.71
202	0.66
203	0.67
204	0.59
205	0.55
206	0.48
207	0.4
208	0.37
209	0.31
210	0.25
211	0.23
212	0.23
213	0.22
214	0.22
215	0.23
216	0.21
217	0.2
218	0.21
219	0.18
220	0.19
221	0.23
222	0.24
223	0.27
224	0.26
225	0.26
226	0.24
227	0.23
228	0.21
229	0.17
230	0.17
231	0.18
232	0.18
233	0.17
234	0.17
235	0.17
236	0.17
237	0.15
238	0.12
239	0.09
240	0.08
241	0.08
242	0.08
243	0.08
244	0.08
245	0.07
246	0.08
247	0.07
248	0.07
249	0.07
250	0.06
251	0.06
252	0.06
253	0.09
254	0.08
255	0.08
256	0.09
257	0.1
258	0.1
259	0.09
260	0.1
261	0.09
262	0.12
263	0.12
264	0.18
265	0.28
266	0.29
267	0.32
268	0.34
269	0.39
270	0.38
271	0.45
272	0.49
273	0.47
274	0.51
275	0.5
276	0.49
277	0.42
278	0.43
279	0.36
280	0.29
281	0.22
282	0.19
283	0.17
284	0.16
285	0.15
286	0.13
287	0.12
288	0.13
289	0.16
290	0.14
291	0.21
292	0.28
293	0.37
294	0.42
295	0.46
296	0.48
297	0.53
298	0.54
299	0.5
300	0.51
301	0.45
302	0.41
303	0.43
304	0.45
305	0.4
306	0.4
307	0.42
308	0.33
309	0.32
310	0.34
311	0.29
312	0.24
313	0.26
314	0.32
315	0.35
316	0.41
317	0.4
318	0.38
319	0.39
320	0.43
321	0.41
322	0.43
323	0.41
324	0.36
325	0.39
326	0.4
327	0.36
328	0.31
329	0.28
330	0.19
331	0.13
332	0.1
333	0.08
334	0.06
335	0.06
336	0.05
337	0.04
338	0.04
339	0.04
340	0.05
341	0.04
342	0.04
343	0.04
344	0.05
345	0.05
346	0.06
347	0.06
348	0.06
349	0.08
350	0.09
351	0.1
352	0.09
353	0.08
354	0.08
355	0.08
356	0.08
357	0.07
358	0.05
359	0.05
360	0.06
361	0.07
362	0.07
363	0.08
364	0.1
365	0.13
366	0.16
367	0.21
368	0.3
369	0.36
370	0.38
371	0.45
372	0.51
373	0.56
374	0.58
375	0.53
376	0.46
377	0.42
378	0.4
379	0.33
380	0.28
381	0.21
382	0.19
383	0.18
384	0.18
385	0.15
386	0.16
387	0.16
388	0.17
389	0.15
390	0.18
391	0.21
392	0.22
393	0.27
394	0.27
395	0.31
396	0.36
397	0.42
398	0.47
399	0.53
400	0.56
401	0.59
402	0.61
403	0.6
404	0.61
405	0.6
406	0.56
407	0.55
408	0.57
409	0.54
410	0.59
411	0.64
412	0.66
413	0.71
414	0.73
415	0.74
416	0.73
417	0.75
418	0.73
419	0.71
420	0.63
421	0.55
422	0.51
423	0.42
424	0.37
425	0.31
426	0.26
427	0.19
428	0.16
429	0.15
430	0.14
431	0.12
432	0.13
433	0.12
434	0.15
435	0.15
436	0.15
437	0.14
438	0.12
439	0.14
440	0.14
441	0.13
442	0.11
443	0.1
444	0.12
445	0.18
446	0.19
447	0.23
448	0.26
449	0.3
450	0.33
451	0.38
452	0.43
453	0.47
454	0.52
455	0.53
456	0.52
457	0.49
458	0.49
459	0.5
460	0.5
461	0.48
462	0.46
463	0.41
464	0.43
465	0.44
466	0.42
467	0.39
468	0.34
469	0.33
470	0.35
471	0.39
472	0.35
473	0.36
474	0.37
475	0.39
476	0.45
477	0.46
478	0.43
479	0.45
480	0.45
481	0.42
482	0.42
483	0.39
484	0.37
485	0.37
486	0.42
487	0.44
488	0.47
489	0.48
490	0.53
491	0.56
492	0.55
493	0.55
494	0.52
495	0.5
496	0.48
497	0.46
498	0.39
499	0.32
500	0.33
501	0.27
502	0.23
503	0.22
504	0.26
505	0.33
506	0.42
507	0.49
508	0.46
509	0.54
510	0.64
511	0.69
512	0.74
513	0.78
514	0.8
515	0.78
516	0.84
517	0.81
518	0.78
519	0.7
520	0.61
521	0.53
522	0.47
523	0.49
524	0.4
525	0.34
526	0.29
527	0.3
528	0.3
529	0.3
530	0.29
531	0.23
532	0.24
533	0.23
534	0.29
535	0.27
536	0.28
537	0.3
538	0.33
539	0.4
540	0.47
541	0.55
542	0.52
543	0.57
544	0.58
545	0.61
546	0.59
547	0.55
548	0.48
549	0.38
550	0.34
551	0.28
552	0.23
553	0.15
554	0.09
555	0.06
556	0.05
557	0.05
558	0.04
559	0.03
560	0.03
561	0.03
562	0.03
563	0.04
564	0.09
565	0.11
566	0.12
567	0.19
568	0.22
569	0.26
570	0.33
571	0.42
572	0.47
573	0.55
574	0.64
575	0.64
576	0.68
577	0.71
578	0.67
579	0.6
580	0.53
581	0.5
582	0.47
583	0.44
584	0.37
585	0.34
586	0.37
587	0.37
588	0.36
589	0.32
590	0.28
591	0.26
592	0.27
593	0.27
594	0.25
595	0.25
596	0.27
597	0.26
598	0.25
599	0.29
600	0.3
601	0.28
602	0.29
603	0.28
604	0.29
605	0.31
606	0.34
607	0.34
608	0.34
609	0.38
610	0.4
611	0.4
612	0.4
613	0.37
614	0.35
615	0.35
616	0.41
617	0.42
618	0.43
619	0.52
620	0.57
621	0.62
622	0.65
623	0.7
624	0.72
625	0.75
626	0.78
627	0.77
628	0.76
629	0.74
630	0.76
631	0.73
632	0.66
633	0.59
634	0.52

Q0CPX7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer