FuNGI

Q0CKU1

Protein Details

Accession

Q0CKU1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
65-89	VSPADRVQTRRSSRRKAEPSEIEKT	Hydrophilic
791-810	AAQREKSLWKLRKKAYPGSE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
76-93	SSRRKAEPSEIEKTPRRK

Subcellular Location(s)

mito 19, nucl 4, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045116 Clp1/Grc3 IPR032319 CLP1_P IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0005524 F:ATP binding GO:0051731 F:polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity GO:0016310 P:phosphorylation GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF16575 CLP1_P

Amino Acid Sequences

MKRKAEKQQSAAPVSAFAARKARQQAQIAATPEPVKPPSAVETTEEPPSKKARTSPEEDTPSQSVSPADRVQTRRSSRRKAEPSEIEKTPRRKTKTTPATPPEHLTDGTVGRESGIQTPVEEVSEPEGNDVPLDDADRYESPADTPALVEAFPLSKTRLNKSNIVYSDEHTLCVRIKEKLSLVVIGHYDVWVKRGVISLMGAKLHPSPRLYRVYAPSTHSLPVIKCVSGVDGAAEVEIKSCHSGIYRLRDLSPLYQRIWNGSNTSADKLTLKNAEPHARRTFSVLYTSTDDSLKRHLRPLHLEKQWSSAIKSLSQKGGKLRALICGPKGSGKSTFSRYLLNHLLSPAPQTEPSYCNTDGVAFLDLDPGQPEFAPMGQIYLAHLRSPVFGPPFSHPSLEGSQDGTVIRAHHIGASSPKDDPDHYVLAATDLMDRYRALLASYPQCPLIINYPGWIFGLGLEVATWLVRSLGLSDVIYMSEKGPAEVVEPLGQAAAAARIPLTTLPSQPTDFVSRSSAQLRSMQMQSYFHMTRPADVSTPLWLDQPMSRTRPFKVHYAGPHQGIRGIMVMGSQIHPDLLHEALDGSLVGVVAVESPNAILGHSEVPGLANGVMGKQPSPAEEGSEDAVMDEATEMVPTAPLASIDSGITRSPHEDLPYLFVGAGSCNPLDPKASHCLGLALVRSVNVAARQLELVTPIAASRIRDALQQGYGIVLVRGQLDNPNWALSEEYYAARAAEKRHRRFVDSSRKDKVDDGTDDSAHTSAILKDRIRRASHVPWMTVIEDNSRRQREAAQREKSLWKLRKKAYPGSESEGDW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.39
3	0.31
4	0.25
5	0.29
6	0.29
7	0.36
8	0.43
9	0.49
10	0.49
11	0.54
12	0.58
13	0.56
14	0.6
15	0.56
16	0.49
17	0.46
18	0.4
19	0.36
20	0.33
21	0.29
22	0.24
23	0.22
24	0.24
25	0.25
26	0.27
27	0.27
28	0.26
29	0.3
30	0.31
31	0.38
32	0.39
33	0.35
34	0.35
35	0.4
36	0.4
37	0.39
38	0.43
39	0.46
40	0.5
41	0.56
42	0.59
43	0.63
44	0.66
45	0.64
46	0.63
47	0.55
48	0.49
49	0.42
50	0.36
51	0.28
52	0.23
53	0.27
54	0.24
55	0.27
56	0.32
57	0.36
58	0.42
59	0.5
60	0.56
61	0.61
62	0.68
63	0.74
64	0.75
65	0.82
66	0.85
67	0.83
68	0.84
69	0.84
70	0.82
71	0.78
72	0.74
73	0.7
74	0.69
75	0.69
76	0.69
77	0.68
78	0.68
79	0.67
80	0.7
81	0.74
82	0.77
83	0.78
84	0.79
85	0.77
86	0.77
87	0.75
88	0.71
89	0.64
90	0.56
91	0.46
92	0.37
93	0.33
94	0.27
95	0.25
96	0.21
97	0.17
98	0.14
99	0.16
100	0.16
101	0.16
102	0.17
103	0.15
104	0.15
105	0.17
106	0.17
107	0.16
108	0.15
109	0.12
110	0.13
111	0.16
112	0.16
113	0.16
114	0.16
115	0.15
116	0.15
117	0.14
118	0.11
119	0.09
120	0.1
121	0.09
122	0.08
123	0.12
124	0.12
125	0.14
126	0.14
127	0.14
128	0.13
129	0.16
130	0.17
131	0.13
132	0.13
133	0.12
134	0.11
135	0.11
136	0.1
137	0.08
138	0.08
139	0.09
140	0.1
141	0.12
142	0.16
143	0.2
144	0.25
145	0.33
146	0.36
147	0.42
148	0.44
149	0.51
150	0.48
151	0.5
152	0.46
153	0.39
154	0.44
155	0.37
156	0.35
157	0.26
158	0.26
159	0.22
160	0.25
161	0.25
162	0.21
163	0.23
164	0.26
165	0.27
166	0.3
167	0.3
168	0.28
169	0.26
170	0.25
171	0.23
172	0.2
173	0.18
174	0.13
175	0.14
176	0.11
177	0.13
178	0.12
179	0.11
180	0.11
181	0.14
182	0.14
183	0.12
184	0.13
185	0.15
186	0.15
187	0.16
188	0.15
189	0.14
190	0.18
191	0.19
192	0.21
193	0.21
194	0.23
195	0.28
196	0.35
197	0.36
198	0.37
199	0.4
200	0.42
201	0.43
202	0.43
203	0.41
204	0.37
205	0.35
206	0.31
207	0.28
208	0.23
209	0.26
210	0.24
211	0.2
212	0.18
213	0.17
214	0.17
215	0.15
216	0.14
217	0.09
218	0.07
219	0.07
220	0.07
221	0.07
222	0.05
223	0.05
224	0.06
225	0.06
226	0.06
227	0.06
228	0.07
229	0.07
230	0.12
231	0.17
232	0.25
233	0.29
234	0.29
235	0.3
236	0.32
237	0.33
238	0.34
239	0.37
240	0.32
241	0.3
242	0.32
243	0.31
244	0.33
245	0.33
246	0.28
247	0.23
248	0.21
249	0.24
250	0.23
251	0.24
252	0.21
253	0.19
254	0.19
255	0.18
256	0.2
257	0.19
258	0.18
259	0.22
260	0.27
261	0.35
262	0.36
263	0.42
264	0.44
265	0.42
266	0.41
267	0.4
268	0.38
269	0.31
270	0.33
271	0.27
272	0.24
273	0.25
274	0.26
275	0.22
276	0.21
277	0.2
278	0.17
279	0.24
280	0.26
281	0.24
282	0.3
283	0.32
284	0.36
285	0.44
286	0.52
287	0.53
288	0.52
289	0.54
290	0.48
291	0.49
292	0.47
293	0.4
294	0.32
295	0.27
296	0.24
297	0.25
298	0.29
299	0.27
300	0.3
301	0.3
302	0.32
303	0.32
304	0.38
305	0.35
306	0.34
307	0.32
308	0.3
309	0.31
310	0.31
311	0.28
312	0.22
313	0.21
314	0.21
315	0.21
316	0.19
317	0.19
318	0.2
319	0.23
320	0.26
321	0.29
322	0.27
323	0.3
324	0.29
325	0.31
326	0.33
327	0.3
328	0.26
329	0.23
330	0.22
331	0.18
332	0.19
333	0.14
334	0.11
335	0.1
336	0.11
337	0.13
338	0.14
339	0.15
340	0.19
341	0.18
342	0.18
343	0.17
344	0.16
345	0.14
346	0.13
347	0.13
348	0.07
349	0.07
350	0.08
351	0.08
352	0.07
353	0.07
354	0.06
355	0.06
356	0.05
357	0.06
358	0.05
359	0.05
360	0.06
361	0.05
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.06
366	0.09
367	0.09
368	0.08
369	0.09
370	0.09
371	0.1
372	0.11
373	0.13
374	0.11
375	0.11
376	0.13
377	0.15
378	0.2
379	0.2
380	0.19
381	0.17
382	0.18
383	0.19
384	0.19
385	0.17
386	0.13
387	0.12
388	0.13
389	0.13
390	0.1
391	0.09
392	0.08
393	0.08
394	0.08
395	0.08
396	0.08
397	0.08
398	0.08
399	0.11
400	0.13
401	0.13
402	0.13
403	0.14
404	0.14
405	0.14
406	0.16
407	0.16
408	0.15
409	0.13
410	0.13
411	0.12
412	0.12
413	0.12
414	0.09
415	0.07
416	0.06
417	0.06
418	0.06
419	0.06
420	0.06
421	0.07
422	0.07
423	0.06
424	0.08
425	0.11
426	0.14
427	0.15
428	0.15
429	0.14
430	0.14
431	0.14
432	0.13
433	0.14
434	0.13
435	0.12
436	0.13
437	0.13
438	0.13
439	0.13
440	0.12
441	0.08
442	0.05
443	0.07
444	0.05
445	0.05
446	0.04
447	0.04
448	0.04
449	0.04
450	0.04
451	0.03
452	0.03
453	0.03
454	0.03
455	0.04
456	0.05
457	0.06
458	0.06
459	0.06
460	0.06
461	0.07
462	0.07
463	0.07
464	0.06
465	0.08
466	0.08
467	0.08
468	0.08
469	0.08
470	0.09
471	0.09
472	0.09
473	0.07
474	0.07
475	0.07
476	0.07
477	0.06
478	0.05
479	0.05
480	0.05
481	0.04
482	0.04
483	0.04
484	0.04
485	0.04
486	0.05
487	0.08
488	0.08
489	0.1
490	0.12
491	0.14
492	0.15
493	0.15
494	0.17
495	0.18
496	0.18
497	0.18
498	0.19
499	0.18
500	0.2
501	0.23
502	0.22
503	0.19
504	0.23
505	0.23
506	0.24
507	0.24
508	0.24
509	0.22
510	0.22
511	0.21
512	0.23
513	0.22
514	0.19
515	0.24
516	0.22
517	0.22
518	0.23
519	0.24
520	0.18
521	0.18
522	0.18
523	0.14
524	0.16
525	0.14
526	0.13
527	0.12
528	0.12
529	0.13
530	0.17
531	0.19
532	0.22
533	0.25
534	0.27
535	0.29
536	0.36
537	0.36
538	0.38
539	0.38
540	0.39
541	0.41
542	0.47
543	0.49
544	0.45
545	0.45
546	0.39
547	0.36
548	0.3
549	0.25
550	0.17
551	0.13
552	0.09
553	0.07
554	0.08
555	0.07
556	0.07
557	0.07
558	0.06
559	0.06
560	0.06
561	0.06
562	0.08
563	0.07
564	0.07
565	0.06
566	0.07
567	0.06
568	0.07
569	0.06
570	0.04
571	0.04
572	0.04
573	0.03
574	0.03
575	0.03
576	0.04
577	0.04
578	0.04
579	0.03
580	0.03
581	0.05
582	0.05
583	0.05
584	0.04
585	0.06
586	0.07
587	0.08
588	0.08
589	0.07
590	0.07
591	0.07
592	0.08
593	0.06
594	0.06
595	0.06
596	0.06
597	0.08
598	0.08
599	0.08
600	0.09
601	0.1
602	0.1
603	0.14
604	0.13
605	0.14
606	0.14
607	0.16
608	0.15
609	0.15
610	0.14
611	0.1
612	0.1
613	0.07
614	0.07
615	0.05
616	0.04
617	0.04
618	0.04
619	0.04
620	0.04
621	0.04
622	0.04
623	0.05
624	0.05
625	0.05
626	0.06
627	0.06
628	0.07
629	0.07
630	0.08
631	0.09
632	0.09
633	0.1
634	0.1
635	0.12
636	0.14
637	0.16
638	0.17
639	0.19
640	0.19
641	0.22
642	0.22
643	0.21
644	0.18
645	0.16
646	0.14
647	0.12
648	0.13
649	0.1
650	0.09
651	0.09
652	0.1
653	0.1
654	0.13
655	0.13
656	0.16
657	0.21
658	0.22
659	0.22
660	0.22
661	0.22
662	0.21
663	0.23
664	0.2
665	0.15
666	0.14
667	0.13
668	0.13
669	0.12
670	0.13
671	0.11
672	0.13
673	0.11
674	0.12
675	0.13
676	0.13
677	0.13
678	0.13
679	0.12
680	0.1
681	0.09
682	0.08
683	0.1
684	0.11
685	0.12
686	0.12
687	0.15
688	0.15
689	0.18
690	0.2
691	0.22
692	0.21
693	0.21
694	0.19
695	0.16
696	0.16
697	0.13
698	0.11
699	0.08
700	0.07
701	0.09
702	0.09
703	0.09
704	0.14
705	0.15
706	0.19
707	0.2
708	0.2
709	0.18
710	0.18
711	0.19
712	0.15
713	0.17
714	0.15
715	0.15
716	0.15
717	0.15
718	0.15
719	0.16
720	0.18
721	0.21
722	0.29
723	0.39
724	0.46
725	0.56
726	0.59
727	0.62
728	0.67
729	0.71
730	0.72
731	0.72
732	0.73
733	0.72
734	0.71
735	0.66
736	0.63
737	0.58
738	0.54
739	0.48
740	0.46
741	0.42
742	0.4
743	0.39
744	0.36
745	0.31
746	0.22
747	0.19
748	0.14
749	0.13
750	0.18
751	0.23
752	0.25
753	0.33
754	0.41
755	0.49
756	0.5
757	0.52
758	0.54
759	0.57
760	0.64
761	0.61
762	0.55
763	0.49
764	0.49
765	0.46
766	0.41
767	0.34
768	0.32
769	0.33
770	0.39
771	0.46
772	0.47
773	0.46
774	0.45
775	0.52
776	0.54
777	0.59
778	0.62
779	0.61
780	0.62
781	0.67
782	0.73
783	0.72
784	0.72
785	0.7
786	0.7
787	0.71
788	0.75
789	0.79
790	0.79
791	0.8
792	0.79
793	0.79
794	0.74
795	0.72

Q0CKU1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer