FuNGI

Q0CHN3

Protein Details

Accession

Q0CHN3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
116-138	VDEKMDRRRKARREARELQERED	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
122-129	RRRKARRE

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 8.666, nucl 8.5, cyto 8.5, cyto_mito 7.833, mito_nucl 7.833

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003107 HAT IPR010491 PRP1_N IPR045075 Syf1-like IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf IPR019734 TPR_repeat
Gene Ontology	GO:0046540 C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex GO:0045292 P:mRNA cis splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF06424 PRP1_N PF13432 TPR_16 PF14559 TPR_19
PROSITE	View protein in PROSITE PS50005 TPR

Amino Acid Sequences

MASGRKDFLSQPAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPTPEQIQAALAKRAQLLGAAPPTAYGAGREKGGKDEKPEEEEEDERFQDPDNEVGLFAYGQFDQEDDEADRIYREVDEKMDRRRKARREARELQEREDYERKNPKIQQQFADLKRSLASVSEDDWANLPEVGDLTGKNRRAKQNLRQRFYAVPDSVIAGARDSAQYETTVADDGAGGDAQGADGTITNFADISAARDKVLQVRLDQAAMGSSADAASGSATSIDPKGYLTSLTQSEMKAGEVEIGDIKRVRVLLESVTKTNPKHAPGWIALARLEELAGRIVTARNIIAKGCELCPKSEDAWLENIRLNEGHNAKVIAANAIKNNDRSTRLWIEAMKLETEPRAKKNVLRQAILHIPQSVAIWKEAVNLEEDPNDARLLLAKAVEMIPLSVELWLALARLETPEKAQAVLNKARRAVPTSHEVWIAAARLQEQMGTFEKVNVMKRAVQSLARENAMLKREEWIAEAEKCEDEGAILTCGAIIRETLGWGLDEDDDRKDIWMEDAKSSIARGKYETARAIYAYALRVFVNRRSIWLAAADLERNHGTKEALWQVLEKAVEACPQSEELWLLLAKEKWQTGEIDEARRVLGRAFNQNPNNEDIWLAAVKLEADAQQTDQARELLATARREAGTDRVWIKSVAFERQLGNVDEALDLVNQGLQQFPKADKLWMMKGQIYEAQNKYPQAREAYGTGTRACPKSVPLWLLASRLEEKAGAVVKARSVLDRARLAVPKSPELWTESVRVERRANNIGQAKVLMAKALQEVPTSGLLWSESIWHLEPRAQRKARSLEAIKKVDNDPILFITVARIFWGERRLEKAMTWFEKAIVSDSDLGDGWAWYYKFLLQHGTEEKRADVISKCVATEPKHGEVWQSVAKDPANAHKSTEEILKMVASQIS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.39
3	0.31
4	0.28
5	0.25
6	0.19
7	0.15
8	0.12
9	0.12
10	0.12
11	0.12
12	0.07
13	0.09
14	0.1
15	0.11
16	0.15
17	0.15
18	0.16
19	0.2
20	0.23
21	0.25
22	0.29
23	0.3
24	0.29
25	0.32
26	0.34
27	0.32
28	0.38
29	0.37
30	0.32
31	0.31
32	0.28
33	0.26
34	0.3
35	0.3
36	0.26
37	0.24
38	0.26
39	0.25
40	0.26
41	0.24
42	0.19
43	0.17
44	0.18
45	0.2
46	0.18
47	0.17
48	0.17
49	0.18
50	0.17
51	0.16
52	0.13
53	0.15
54	0.16
55	0.19
56	0.22
57	0.22
58	0.29
59	0.36
60	0.37
61	0.39
62	0.45
63	0.47
64	0.5
65	0.52
66	0.47
67	0.45
68	0.44
69	0.4
70	0.37
71	0.34
72	0.29
73	0.27
74	0.24
75	0.24
76	0.23
77	0.22
78	0.19
79	0.18
80	0.17
81	0.16
82	0.16
83	0.11
84	0.1
85	0.09
86	0.07
87	0.08
88	0.08
89	0.08
90	0.09
91	0.09
92	0.11
93	0.11
94	0.12
95	0.12
96	0.12
97	0.12
98	0.11
99	0.12
100	0.11
101	0.11
102	0.12
103	0.17
104	0.25
105	0.3
106	0.41
107	0.49
108	0.53
109	0.59
110	0.67
111	0.71
112	0.74
113	0.79
114	0.79
115	0.8
116	0.85
117	0.86
118	0.87
119	0.81
120	0.74
121	0.72
122	0.62
123	0.59
124	0.57
125	0.5
126	0.48
127	0.56
128	0.55
129	0.55
130	0.6
131	0.63
132	0.65
133	0.69
134	0.64
135	0.63
136	0.69
137	0.64
138	0.67
139	0.57
140	0.48
141	0.42
142	0.39
143	0.3
144	0.22
145	0.22
146	0.15
147	0.16
148	0.18
149	0.18
150	0.18
151	0.18
152	0.17
153	0.15
154	0.13
155	0.11
156	0.08
157	0.09
158	0.09
159	0.09
160	0.09
161	0.12
162	0.19
163	0.24
164	0.3
165	0.37
166	0.44
167	0.53
168	0.62
169	0.68
170	0.73
171	0.78
172	0.77
173	0.73
174	0.68
175	0.63
176	0.59
177	0.57
178	0.47
179	0.37
180	0.32
181	0.3
182	0.28
183	0.25
184	0.19
185	0.11
186	0.11
187	0.1
188	0.1
189	0.1
190	0.1
191	0.09
192	0.1
193	0.1
194	0.1
195	0.09
196	0.1
197	0.08
198	0.07
199	0.07
200	0.06
201	0.07
202	0.06
203	0.05
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.03
209	0.03
210	0.04
211	0.04
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.06
216	0.06
217	0.06
218	0.06
219	0.09
220	0.12
221	0.13
222	0.13
223	0.14
224	0.15
225	0.21
226	0.25
227	0.23
228	0.2
229	0.24
230	0.25
231	0.24
232	0.23
233	0.17
234	0.13
235	0.12
236	0.11
237	0.06
238	0.05
239	0.04
240	0.04
241	0.04
242	0.04
243	0.03
244	0.03
245	0.03
246	0.04
247	0.04
248	0.06
249	0.07
250	0.07
251	0.07
252	0.07
253	0.08
254	0.08
255	0.09
256	0.09
257	0.12
258	0.13
259	0.15
260	0.16
261	0.15
262	0.16
263	0.15
264	0.15
265	0.11
266	0.1
267	0.1
268	0.08
269	0.09
270	0.1
271	0.1
272	0.11
273	0.12
274	0.12
275	0.11
276	0.11
277	0.11
278	0.09
279	0.11
280	0.14
281	0.2
282	0.23
283	0.23
284	0.26
285	0.29
286	0.28
287	0.34
288	0.34
289	0.3
290	0.3
291	0.3
292	0.32
293	0.29
294	0.35
295	0.3
296	0.27
297	0.24
298	0.22
299	0.2
300	0.15
301	0.14
302	0.08
303	0.07
304	0.07
305	0.06
306	0.06
307	0.06
308	0.07
309	0.07
310	0.08
311	0.08
312	0.08
313	0.09
314	0.09
315	0.09
316	0.11
317	0.12
318	0.13
319	0.18
320	0.18
321	0.18
322	0.19
323	0.21
324	0.21
325	0.22
326	0.22
327	0.17
328	0.23
329	0.23
330	0.24
331	0.23
332	0.22
333	0.19
334	0.18
335	0.18
336	0.17
337	0.17
338	0.17
339	0.16
340	0.16
341	0.15
342	0.17
343	0.16
344	0.12
345	0.12
346	0.13
347	0.13
348	0.16
349	0.17
350	0.17
351	0.19
352	0.2
353	0.22
354	0.22
355	0.27
356	0.28
357	0.28
358	0.29
359	0.27
360	0.26
361	0.26
362	0.25
363	0.19
364	0.16
365	0.15
366	0.15
367	0.2
368	0.21
369	0.21
370	0.25
371	0.26
372	0.29
373	0.38
374	0.44
375	0.43
376	0.41
377	0.39
378	0.38
379	0.43
380	0.41
381	0.33
382	0.25
383	0.2
384	0.19
385	0.19
386	0.15
387	0.1
388	0.08
389	0.08
390	0.07
391	0.1
392	0.1
393	0.1
394	0.1
395	0.1
396	0.11
397	0.11
398	0.11
399	0.09
400	0.09
401	0.09
402	0.07
403	0.06
404	0.07
405	0.07
406	0.07
407	0.07
408	0.06
409	0.07
410	0.07
411	0.07
412	0.06
413	0.05
414	0.04
415	0.04
416	0.05
417	0.04
418	0.04
419	0.03
420	0.04
421	0.04
422	0.04
423	0.03
424	0.03
425	0.03
426	0.05
427	0.05
428	0.05
429	0.06
430	0.09
431	0.09
432	0.1
433	0.11
434	0.13
435	0.18
436	0.24
437	0.28
438	0.27
439	0.29
440	0.3
441	0.3
442	0.31
443	0.27
444	0.24
445	0.24
446	0.24
447	0.24
448	0.22
449	0.21
450	0.17
451	0.16
452	0.14
453	0.1
454	0.08
455	0.07
456	0.07
457	0.07
458	0.08
459	0.07
460	0.09
461	0.1
462	0.11
463	0.1
464	0.1
465	0.12
466	0.14
467	0.17
468	0.16
469	0.16
470	0.17
471	0.18
472	0.2
473	0.19
474	0.19
475	0.19
476	0.22
477	0.23
478	0.2
479	0.2
480	0.18
481	0.21
482	0.21
483	0.19
484	0.14
485	0.14
486	0.14
487	0.15
488	0.15
489	0.13
490	0.13
491	0.14
492	0.14
493	0.13
494	0.12
495	0.12
496	0.11
497	0.09
498	0.06
499	0.06
500	0.06
501	0.05
502	0.05
503	0.05
504	0.05
505	0.05
506	0.05
507	0.04
508	0.03
509	0.04
510	0.04
511	0.04
512	0.04
513	0.04
514	0.05
515	0.05
516	0.06
517	0.05
518	0.06
519	0.07
520	0.08
521	0.08
522	0.08
523	0.08
524	0.08
525	0.08
526	0.09
527	0.13
528	0.14
529	0.14
530	0.15
531	0.15
532	0.15
533	0.15
534	0.17
535	0.13
536	0.12
537	0.13
538	0.17
539	0.19
540	0.22
541	0.24
542	0.22
543	0.21
544	0.2
545	0.19
546	0.16
547	0.14
548	0.12
549	0.11
550	0.1
551	0.1
552	0.11
553	0.13
554	0.16
555	0.21
556	0.19
557	0.21
558	0.23
559	0.23
560	0.21
561	0.2
562	0.17
563	0.13
564	0.14
565	0.13
566	0.1
567	0.12
568	0.12
569	0.12
570	0.12
571	0.11
572	0.1
573	0.1
574	0.15
575	0.17
576	0.17
577	0.17
578	0.17
579	0.17
580	0.19
581	0.18
582	0.13
583	0.1
584	0.09
585	0.12
586	0.12
587	0.12
588	0.1
589	0.11
590	0.12
591	0.11
592	0.11
593	0.08
594	0.09
595	0.09
596	0.09
597	0.1
598	0.1
599	0.11
600	0.13
601	0.13
602	0.13
603	0.14
604	0.15
605	0.13
606	0.22
607	0.23
608	0.24
609	0.24
610	0.24
611	0.23
612	0.23
613	0.22
614	0.14
615	0.15
616	0.15
617	0.24
618	0.28
619	0.36
620	0.4
621	0.42
622	0.43
623	0.42
624	0.39
625	0.31
626	0.26
627	0.18
628	0.16
629	0.13
630	0.11
631	0.07
632	0.07
633	0.06
634	0.06
635	0.07
636	0.06
637	0.07
638	0.08
639	0.08
640	0.13
641	0.14
642	0.15
643	0.15
644	0.14
645	0.13
646	0.12
647	0.12
648	0.13
649	0.16
650	0.17
651	0.17
652	0.19
653	0.19
654	0.2
655	0.2
656	0.2
657	0.18
658	0.22
659	0.23
660	0.21
661	0.22
662	0.22
663	0.21
664	0.22
665	0.23
666	0.22
667	0.22
668	0.23
669	0.23
670	0.26
671	0.28
672	0.24
673	0.22
674	0.18
675	0.17
676	0.15
677	0.14
678	0.11
679	0.08
680	0.07
681	0.05
682	0.06
683	0.05
684	0.05
685	0.07
686	0.07
687	0.08
688	0.11
689	0.12
690	0.17
691	0.18
692	0.19
693	0.22
694	0.26
695	0.31
696	0.33
697	0.34
698	0.31
699	0.31
700	0.32
701	0.32
702	0.3
703	0.32
704	0.29
705	0.31
706	0.32
707	0.34
708	0.35
709	0.32
710	0.34
711	0.31
712	0.31
713	0.29
714	0.27
715	0.29
716	0.29
717	0.28
718	0.25
719	0.24
720	0.27
721	0.27
722	0.26
723	0.22
724	0.22
725	0.25
726	0.29
727	0.27
728	0.24
729	0.28
730	0.28
731	0.29
732	0.27
733	0.26
734	0.23
735	0.22
736	0.2
737	0.16
738	0.14
739	0.16
740	0.17
741	0.14
742	0.14
743	0.15
744	0.15
745	0.18
746	0.19
747	0.16
748	0.17
749	0.2
750	0.24
751	0.25
752	0.27
753	0.29
754	0.33
755	0.34
756	0.36
757	0.37
758	0.35
759	0.35
760	0.34
761	0.3
762	0.3
763	0.31
764	0.28
765	0.27
766	0.26
767	0.32
768	0.33
769	0.36
770	0.37
771	0.38
772	0.42
773	0.44
774	0.43
775	0.44
776	0.46
777	0.43
778	0.39
779	0.35
780	0.3
781	0.27
782	0.25
783	0.18
784	0.12
785	0.12
786	0.14
787	0.16
788	0.16
789	0.13
790	0.14
791	0.15
792	0.17
793	0.16
794	0.13
795	0.11
796	0.11
797	0.11
798	0.1
799	0.11
800	0.1
801	0.12
802	0.14
803	0.14
804	0.15
805	0.2
806	0.27
807	0.31
808	0.41
809	0.44
810	0.46
811	0.53
812	0.6
813	0.6
814	0.63
815	0.63
816	0.62
817	0.67
818	0.69
819	0.62
820	0.59
821	0.55
822	0.51
823	0.46
824	0.38
825	0.31
826	0.26
827	0.26
828	0.22
829	0.2
830	0.19
831	0.17
832	0.16
833	0.14
834	0.13
835	0.12
836	0.16
837	0.22
838	0.23
839	0.24
840	0.3
841	0.33
842	0.34
843	0.35
844	0.38
845	0.42
846	0.42
847	0.42
848	0.37
849	0.35
850	0.36
851	0.35
852	0.3
853	0.22
854	0.21
855	0.2
856	0.19
857	0.2
858	0.17
859	0.17
860	0.14
861	0.13
862	0.11
863	0.13
864	0.13
865	0.11
866	0.13
867	0.15
868	0.17
869	0.19
870	0.25
871	0.21
872	0.28
873	0.36
874	0.41
875	0.42
876	0.41
877	0.4
878	0.36
879	0.35
880	0.32
881	0.26
882	0.26
883	0.29
884	0.28
885	0.28
886	0.3
887	0.35
888	0.35
889	0.41
890	0.42
891	0.4
892	0.42
893	0.42
894	0.41
895	0.38
896	0.4
897	0.36
898	0.32
899	0.29
900	0.31
901	0.31
902	0.3
903	0.31
904	0.35
905	0.35
906	0.33
907	0.35
908	0.32
909	0.33
910	0.33
911	0.36
912	0.28
913	0.23
914	0.24
915	0.21
916	0.2

Q0CHN3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer