FuNGI

Q0CKJ6

Protein Details

Accession

Q0CKJ6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
44-63	SASTKRQRLARRTSNLPNGS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 11, mito 5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027786 Nse4/EID IPR014854 Nse4_C IPR029225 Nse4_Nse3-bd
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0030915 C:Smc5-Smc6 complex GO:0006310 P:DNA recombination GO:0006281 P:DNA repair
Pfam	View protein in Pfam PF15412 Nse4-Nse3_bdg PF08743 Nse4_C

Amino Acid Sequences

MAPFSPARASTSHSISPGASSDKENHQNSTRVSKRNQQTAMSSSASTKRQRLARRTSNLPNGSQSRMPLTQQDRDRQYYDPDQDERERRRVRKGLRDLTRELNDSKTEFLQAGNHGLRNTIEKANEYFQNVKQTSDATIDSRLLVNAADLSYKKATQLGLGDNTARIDVDEFVSKCISFMRRAPGDSQAVPSSTQRRRGLGRSQGHPDDSDDDQGDGLNWNWLGHTACYRHNARPSVSGFLLGPLSVQKRTRQITQRRARERIDPSQAVRPQELQEGDLDKQETSNLTAMCAHINKLLAKTQAQGQDIVEQQLSALEEEPTDEMIQEVMARHNVADDGGVPLFHFCINPRSFGQSVENLFYVSFLVRDGTVGISVDSRQLPTLHASKPYAPSEAQKKGIQKHQSVFSLDFETWRDLIEVYGIKESIIEHRNEQEEQETTARGWYS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.29
3	0.29
4	0.27
5	0.26
6	0.22
7	0.22
8	0.26
9	0.33
10	0.42
11	0.43
12	0.46
13	0.47
14	0.51
15	0.52
16	0.58
17	0.57
18	0.55
19	0.58
20	0.63
21	0.66
22	0.7
23	0.7
24	0.63
25	0.61
26	0.58
27	0.57
28	0.5
29	0.42
30	0.36
31	0.38
32	0.41
33	0.41
34	0.41
35	0.43
36	0.48
37	0.57
38	0.62
39	0.67
40	0.7
41	0.72
42	0.76
43	0.78
44	0.81
45	0.75
46	0.68
47	0.65
48	0.59
49	0.56
50	0.49
51	0.42
52	0.37
53	0.35
54	0.34
55	0.35
56	0.37
57	0.41
58	0.45
59	0.52
60	0.53
61	0.55
62	0.56
63	0.5
64	0.51
65	0.51
66	0.5
67	0.47
68	0.44
69	0.44
70	0.5
71	0.56
72	0.56
73	0.58
74	0.61
75	0.59
76	0.67
77	0.7
78	0.71
79	0.73
80	0.78
81	0.78
82	0.78
83	0.8
84	0.74
85	0.73
86	0.68
87	0.61
88	0.52
89	0.45
90	0.38
91	0.33
92	0.31
93	0.23
94	0.21
95	0.18
96	0.17
97	0.16
98	0.15
99	0.21
100	0.2
101	0.21
102	0.2
103	0.21
104	0.21
105	0.21
106	0.24
107	0.2
108	0.19
109	0.2
110	0.23
111	0.25
112	0.27
113	0.27
114	0.27
115	0.27
116	0.36
117	0.34
118	0.32
119	0.29
120	0.28
121	0.26
122	0.24
123	0.23
124	0.14
125	0.15
126	0.15
127	0.15
128	0.14
129	0.13
130	0.1
131	0.09
132	0.07
133	0.06
134	0.06
135	0.07
136	0.07
137	0.11
138	0.12
139	0.12
140	0.12
141	0.13
142	0.13
143	0.13
144	0.16
145	0.16
146	0.17
147	0.18
148	0.18
149	0.16
150	0.16
151	0.14
152	0.11
153	0.08
154	0.07
155	0.06
156	0.07
157	0.11
158	0.11
159	0.12
160	0.13
161	0.13
162	0.12
163	0.14
164	0.15
165	0.13
166	0.16
167	0.23
168	0.24
169	0.26
170	0.27
171	0.29
172	0.3
173	0.28
174	0.28
175	0.21
176	0.2
177	0.2
178	0.21
179	0.24
180	0.25
181	0.32
182	0.32
183	0.34
184	0.37
185	0.41
186	0.46
187	0.47
188	0.49
189	0.45
190	0.49
191	0.47
192	0.45
193	0.4
194	0.34
195	0.27
196	0.22
197	0.19
198	0.14
199	0.12
200	0.11
201	0.11
202	0.1
203	0.07
204	0.06
205	0.06
206	0.05
207	0.05
208	0.05
209	0.06
210	0.07
211	0.07
212	0.1
213	0.11
214	0.13
215	0.19
216	0.22
217	0.24
218	0.29
219	0.32
220	0.3
221	0.33
222	0.33
223	0.31
224	0.28
225	0.25
226	0.2
227	0.18
228	0.16
229	0.1
230	0.09
231	0.08
232	0.09
233	0.11
234	0.13
235	0.15
236	0.22
237	0.25
238	0.33
239	0.4
240	0.48
241	0.56
242	0.64
243	0.71
244	0.72
245	0.75
246	0.7
247	0.68
248	0.65
249	0.62
250	0.6
251	0.53
252	0.48
253	0.5
254	0.51
255	0.45
256	0.39
257	0.33
258	0.27
259	0.29
260	0.27
261	0.19
262	0.18
263	0.18
264	0.18
265	0.18
266	0.17
267	0.13
268	0.12
269	0.13
270	0.11
271	0.1
272	0.13
273	0.11
274	0.11
275	0.12
276	0.12
277	0.14
278	0.14
279	0.13
280	0.12
281	0.14
282	0.14
283	0.15
284	0.18
285	0.18
286	0.18
287	0.19
288	0.22
289	0.26
290	0.25
291	0.25
292	0.22
293	0.24
294	0.24
295	0.25
296	0.19
297	0.13
298	0.12
299	0.12
300	0.12
301	0.08
302	0.08
303	0.06
304	0.06
305	0.08
306	0.08
307	0.08
308	0.07
309	0.07
310	0.06
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.07
315	0.07
316	0.08
317	0.09
318	0.08
319	0.09
320	0.09
321	0.08
322	0.07
323	0.06
324	0.08
325	0.08
326	0.08
327	0.07
328	0.07
329	0.08
330	0.08
331	0.08
332	0.07
333	0.16
334	0.17
335	0.21
336	0.22
337	0.27
338	0.27
339	0.29
340	0.32
341	0.29
342	0.3
343	0.3
344	0.28
345	0.23
346	0.22
347	0.2
348	0.16
349	0.11
350	0.08
351	0.06
352	0.07
353	0.06
354	0.07
355	0.07
356	0.07
357	0.08
358	0.08
359	0.08
360	0.08
361	0.09
362	0.12
363	0.12
364	0.12
365	0.13
366	0.14
367	0.15
368	0.19
369	0.25
370	0.24
371	0.28
372	0.3
373	0.33
374	0.39
375	0.4
376	0.38
377	0.34
378	0.39
379	0.43
380	0.47
381	0.47
382	0.45
383	0.5
384	0.54
385	0.62
386	0.63
387	0.61
388	0.61
389	0.63
390	0.63
391	0.6
392	0.54
393	0.48
394	0.44
395	0.37
396	0.32
397	0.28
398	0.27
399	0.22
400	0.21
401	0.19
402	0.15
403	0.15
404	0.17
405	0.17
406	0.16
407	0.18
408	0.18
409	0.16
410	0.17
411	0.18
412	0.21
413	0.24
414	0.25
415	0.25
416	0.31
417	0.36
418	0.36
419	0.37
420	0.33
421	0.3
422	0.32
423	0.31
424	0.27
425	0.23

Q0CKJ6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer