FuNGI

Q0CM71

Protein Details

Accession

Q0CM71

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
32-68	KADSTDRRDRDRSRERERRRRDRSRDRRRGDRDADGD	Basic
79-114	GSANGSHRSRKRSRSRDSDRHRRSRRDRYGDDYRSN	Basic
142-172	RSRRDERDDDRRARRDRKRSPSRDKSPELNE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
38-63	RRDRDRSRERERRRRDRSRDRRRGDR
78-105	HGSANGSHRSRKRSRSRDSDRHRRSRRD
140-165	SGRSRRDERDDDRRARRDRKRSPSRD

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR029123 RBM39_linker IPR006509 RBM39_SF IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:1990446 F:U1 snRNP binding GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF15519 RBM39linker PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12283 RRM1_RBM39_like cd12284 RRM2_RBM23_RBM39 cd12285 RRM3_RBM39_like

Amino Acid Sequences

MSGLDVEALLESTAAATPQESRRSQDRDDRSKADSTDRRDRDRSRERERRRRDRSRDRRRGDRDADGDEDMKSPRSEHGSANGSHRSRKRSRSRDSDRHRRSRRDRYGDDYRSNGDFYRGGGRARTRSRSPYDDRYYRPSGRSRRDERDDDRRARRDRKRSPSRDKSPELNEDERDRRTIFVQQLAARLRTKELIAFFEKVGPVKEAQIVKDRVSGRSKGVGYVEFKNEESVAPAIQLTGQKLLGIPIIAQLTEAEKNRQARNPEASSGSNHAAPFHRLYVGNIHFSITESDLQNVFEPFGELEFVQLQKDETGRSRGYGFVQFRDPNQAREALEKMNGFDLAGRAIRVGLGNDKFTPESNAQRMQSQGASQQNFQGSMFSGQGGRGVQAGGTNNFDRAGGRESEKGAGASALDDTDVAGVNFNNYSRDALMRKLARTDEPSEPSADDKQKILRPKTETKPLPVNVNMASRCVLLRNMFDPAEEEGESWIKELEDDVRAECEDKYGHVVHIALDPNSQGDIYLKFDRVQGGENAIKGLNGRFFGGRQITAQPVVDAVYSSLFSRTKAI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.06
2	0.06
3	0.06
4	0.12
5	0.19
6	0.27
7	0.28
8	0.33
9	0.41
10	0.48
11	0.53
12	0.58
13	0.62
14	0.64
15	0.7
16	0.69
17	0.65
18	0.65
19	0.61
20	0.61
21	0.58
22	0.56
23	0.59
24	0.62
25	0.65
26	0.68
27	0.72
28	0.72
29	0.76
30	0.78
31	0.78
32	0.82
33	0.85
34	0.88
35	0.92
36	0.93
37	0.93
38	0.94
39	0.94
40	0.95
41	0.95
42	0.96
43	0.96
44	0.93
45	0.93
46	0.9
47	0.9
48	0.84
49	0.83
50	0.76
51	0.69
52	0.64
53	0.55
54	0.48
55	0.38
56	0.34
57	0.26
58	0.23
59	0.19
60	0.17
61	0.18
62	0.24
63	0.26
64	0.25
65	0.32
66	0.34
67	0.36
68	0.41
69	0.45
70	0.41
71	0.46
72	0.5
73	0.52
74	0.55
75	0.63
76	0.69
77	0.71
78	0.79
79	0.82
80	0.87
81	0.89
82	0.91
83	0.92
84	0.91
85	0.92
86	0.91
87	0.91
88	0.91
89	0.91
90	0.92
91	0.9
92	0.85
93	0.82
94	0.84
95	0.81
96	0.75
97	0.67
98	0.59
99	0.51
100	0.47
101	0.39
102	0.3
103	0.23
104	0.2
105	0.24
106	0.22
107	0.21
108	0.25
109	0.29
110	0.35
111	0.42
112	0.46
113	0.44
114	0.51
115	0.56
116	0.6
117	0.62
118	0.63
119	0.66
120	0.67
121	0.66
122	0.65
123	0.66
124	0.63
125	0.61
126	0.6
127	0.61
128	0.63
129	0.69
130	0.7
131	0.72
132	0.75
133	0.77
134	0.75
135	0.76
136	0.76
137	0.75
138	0.77
139	0.76
140	0.77
141	0.79
142	0.82
143	0.82
144	0.83
145	0.85
146	0.87
147	0.88
148	0.91
149	0.92
150	0.92
151	0.9
152	0.85
153	0.81
154	0.76
155	0.74
156	0.69
157	0.62
158	0.55
159	0.53
160	0.52
161	0.46
162	0.42
163	0.35
164	0.29
165	0.27
166	0.3
167	0.26
168	0.26
169	0.29
170	0.28
171	0.33
172	0.34
173	0.35
174	0.3
175	0.28
176	0.25
177	0.22
178	0.21
179	0.19
180	0.18
181	0.19
182	0.21
183	0.21
184	0.2
185	0.21
186	0.21
187	0.19
188	0.19
189	0.15
190	0.13
191	0.13
192	0.18
193	0.17
194	0.18
195	0.25
196	0.26
197	0.25
198	0.31
199	0.31
200	0.31
201	0.33
202	0.33
203	0.27
204	0.32
205	0.31
206	0.26
207	0.27
208	0.25
209	0.25
210	0.26
211	0.27
212	0.22
213	0.22
214	0.21
215	0.19
216	0.16
217	0.14
218	0.11
219	0.09
220	0.07
221	0.07
222	0.06
223	0.08
224	0.09
225	0.08
226	0.09
227	0.09
228	0.08
229	0.09
230	0.09
231	0.08
232	0.07
233	0.06
234	0.06
235	0.07
236	0.06
237	0.06
238	0.06
239	0.08
240	0.11
241	0.12
242	0.12
243	0.15
244	0.2
245	0.22
246	0.26
247	0.27
248	0.29
249	0.35
250	0.35
251	0.33
252	0.32
253	0.3
254	0.28
255	0.28
256	0.25
257	0.2
258	0.18
259	0.17
260	0.15
261	0.16
262	0.16
263	0.13
264	0.14
265	0.12
266	0.13
267	0.19
268	0.19
269	0.19
270	0.18
271	0.17
272	0.15
273	0.16
274	0.16
275	0.1
276	0.11
277	0.1
278	0.11
279	0.11
280	0.11
281	0.11
282	0.1
283	0.09
284	0.07
285	0.07
286	0.06
287	0.05
288	0.06
289	0.05
290	0.05
291	0.06
292	0.06
293	0.06
294	0.06
295	0.06
296	0.07
297	0.08
298	0.08
299	0.09
300	0.14
301	0.14
302	0.15
303	0.15
304	0.16
305	0.18
306	0.23
307	0.22
308	0.2
309	0.25
310	0.25
311	0.25
312	0.33
313	0.32
314	0.27
315	0.27
316	0.29
317	0.24
318	0.26
319	0.27
320	0.18
321	0.2
322	0.19
323	0.18
324	0.15
325	0.14
326	0.12
327	0.1
328	0.09
329	0.08
330	0.08
331	0.07
332	0.06
333	0.06
334	0.07
335	0.07
336	0.07
337	0.11
338	0.12
339	0.14
340	0.14
341	0.16
342	0.16
343	0.16
344	0.19
345	0.17
346	0.21
347	0.24
348	0.28
349	0.28
350	0.29
351	0.29
352	0.27
353	0.25
354	0.2
355	0.22
356	0.24
357	0.25
358	0.24
359	0.26
360	0.25
361	0.25
362	0.24
363	0.18
364	0.13
365	0.13
366	0.13
367	0.1
368	0.09
369	0.09
370	0.11
371	0.1
372	0.09
373	0.08
374	0.07
375	0.07
376	0.09
377	0.11
378	0.1
379	0.14
380	0.14
381	0.14
382	0.14
383	0.14
384	0.12
385	0.12
386	0.15
387	0.14
388	0.16
389	0.18
390	0.19
391	0.2
392	0.2
393	0.18
394	0.15
395	0.13
396	0.1
397	0.08
398	0.07
399	0.06
400	0.05
401	0.05
402	0.04
403	0.05
404	0.05
405	0.05
406	0.05
407	0.05
408	0.06
409	0.07
410	0.07
411	0.08
412	0.09
413	0.1
414	0.1
415	0.14
416	0.15
417	0.17
418	0.24
419	0.27
420	0.27
421	0.3
422	0.31
423	0.32
424	0.35
425	0.38
426	0.37
427	0.37
428	0.37
429	0.35
430	0.33
431	0.32
432	0.35
433	0.34
434	0.29
435	0.27
436	0.33
437	0.36
438	0.44
439	0.47
440	0.47
441	0.49
442	0.58
443	0.63
444	0.67
445	0.66
446	0.64
447	0.67
448	0.63
449	0.62
450	0.54
451	0.5
452	0.43
453	0.45
454	0.39
455	0.32
456	0.3
457	0.24
458	0.23
459	0.21
460	0.21
461	0.16
462	0.19
463	0.19
464	0.22
465	0.22
466	0.21
467	0.22
468	0.21
469	0.21
470	0.18
471	0.17
472	0.15
473	0.17
474	0.16
475	0.15
476	0.13
477	0.1
478	0.1
479	0.11
480	0.12
481	0.13
482	0.14
483	0.15
484	0.16
485	0.17
486	0.18
487	0.17
488	0.16
489	0.14
490	0.14
491	0.18
492	0.17
493	0.17
494	0.18
495	0.18
496	0.17
497	0.21
498	0.23
499	0.18
500	0.18
501	0.18
502	0.17
503	0.17
504	0.15
505	0.1
506	0.1
507	0.11
508	0.16
509	0.2
510	0.21
511	0.21
512	0.23
513	0.26
514	0.26
515	0.27
516	0.24
517	0.27
518	0.28
519	0.27
520	0.27
521	0.24
522	0.23
523	0.21
524	0.22
525	0.19
526	0.17
527	0.19
528	0.18
529	0.19
530	0.26
531	0.28
532	0.26
533	0.25
534	0.28
535	0.3
536	0.31
537	0.31
538	0.24
539	0.2
540	0.2
541	0.17
542	0.14
543	0.11
544	0.1
545	0.1
546	0.11
547	0.15
548	0.15

Q0CM71

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer