Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0CNW8

Protein Details
Accession Q0CNW8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
237-261YIKPAGEKAQRQKHRKEKNVLEVDMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
66-74GKRDAPKEA
86-88RRG
105-132RNNNREKPIEDGAQPPRRREGGGGRRDR
245-253AQRQKHRKE
267-303PRSGGGPGNGPRGRGGRGGRGARGGRGSGAPRGERGG
Subcellular Location(s) cyto 8.5, nucl 7, cyto_mito 7, mito 4.5, extr 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Amino Acid Sequences MADVRSKVCVRFYSLFPVDILEGSLDFCWNWCAFIWFHIFFGINLYELLEPAPPTRAVDRPQPRVGKRDAPKEAPSQPRPENNNSRRGGRFSGNEAAFRDRNAGRNNNREKPIEDGAQPPRRREGGGGRRDRQSRTGQTDSKKQVSQGWGGQSGEKEWDDERAGEKIAQNDENEPQTPAGEEEPAEKTKSYADYLAEKAAAGDLSAKPVRAPNEGSQADKKWAAAKEFKRNEEEEEYIKPAGEKAQRQKHRKEKNVLEVDMRFVEPPRSGGGPGNGPRGRGGRGGRGARGGRGSGAPRGERGGPAPVPVDEKNFPSLGAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.4
3 0.35
4 0.34
5 0.28
6 0.23
7 0.21
8 0.12
9 0.1
10 0.1
11 0.1
12 0.09
13 0.08
14 0.08
15 0.11
16 0.1
17 0.11
18 0.1
19 0.13
20 0.13
21 0.17
22 0.23
23 0.2
24 0.2
25 0.21
26 0.21
27 0.18
28 0.21
29 0.18
30 0.12
31 0.11
32 0.12
33 0.11
34 0.1
35 0.11
36 0.09
37 0.09
38 0.09
39 0.12
40 0.11
41 0.13
42 0.17
43 0.21
44 0.23
45 0.33
46 0.4
47 0.45
48 0.53
49 0.6
50 0.6
51 0.61
52 0.63
53 0.63
54 0.61
55 0.64
56 0.63
57 0.6
58 0.61
59 0.61
60 0.64
61 0.64
62 0.62
63 0.59
64 0.58
65 0.61
66 0.63
67 0.65
68 0.68
69 0.64
70 0.69
71 0.64
72 0.64
73 0.59
74 0.57
75 0.51
76 0.45
77 0.42
78 0.37
79 0.43
80 0.38
81 0.37
82 0.35
83 0.36
84 0.31
85 0.29
86 0.29
87 0.22
88 0.27
89 0.31
90 0.38
91 0.4
92 0.5
93 0.57
94 0.6
95 0.62
96 0.58
97 0.53
98 0.5
99 0.47
100 0.4
101 0.34
102 0.32
103 0.38
104 0.44
105 0.45
106 0.41
107 0.4
108 0.39
109 0.37
110 0.34
111 0.36
112 0.37
113 0.45
114 0.52
115 0.51
116 0.57
117 0.59
118 0.58
119 0.52
120 0.5
121 0.48
122 0.47
123 0.5
124 0.49
125 0.5
126 0.57
127 0.57
128 0.53
129 0.47
130 0.4
131 0.38
132 0.35
133 0.35
134 0.29
135 0.26
136 0.24
137 0.23
138 0.23
139 0.19
140 0.17
141 0.15
142 0.12
143 0.11
144 0.09
145 0.11
146 0.1
147 0.11
148 0.12
149 0.1
150 0.11
151 0.11
152 0.13
153 0.13
154 0.15
155 0.16
156 0.15
157 0.16
158 0.17
159 0.17
160 0.17
161 0.15
162 0.12
163 0.11
164 0.1
165 0.1
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.09
170 0.12
171 0.13
172 0.13
173 0.12
174 0.12
175 0.14
176 0.15
177 0.14
178 0.13
179 0.13
180 0.16
181 0.17
182 0.18
183 0.16
184 0.14
185 0.12
186 0.11
187 0.09
188 0.06
189 0.07
190 0.06
191 0.11
192 0.12
193 0.12
194 0.12
195 0.15
196 0.18
197 0.18
198 0.22
199 0.2
200 0.29
201 0.3
202 0.33
203 0.34
204 0.33
205 0.34
206 0.3
207 0.28
208 0.24
209 0.26
210 0.27
211 0.32
212 0.38
213 0.45
214 0.51
215 0.54
216 0.53
217 0.51
218 0.52
219 0.48
220 0.44
221 0.36
222 0.33
223 0.32
224 0.28
225 0.26
226 0.21
227 0.17
228 0.21
229 0.24
230 0.29
231 0.36
232 0.46
233 0.56
234 0.63
235 0.73
236 0.77
237 0.82
238 0.84
239 0.84
240 0.83
241 0.85
242 0.85
243 0.77
244 0.72
245 0.62
246 0.56
247 0.47
248 0.38
249 0.28
250 0.21
251 0.22
252 0.17
253 0.18
254 0.17
255 0.17
256 0.17
257 0.2
258 0.22
259 0.27
260 0.3
261 0.38
262 0.36
263 0.36
264 0.38
265 0.37
266 0.36
267 0.35
268 0.35
269 0.34
270 0.42
271 0.45
272 0.43
273 0.49
274 0.48
275 0.45
276 0.44
277 0.36
278 0.3
279 0.31
280 0.31
281 0.29
282 0.33
283 0.31
284 0.29
285 0.32
286 0.32
287 0.29
288 0.28
289 0.3
290 0.25
291 0.26
292 0.27
293 0.25
294 0.28
295 0.28
296 0.32
297 0.27
298 0.29
299 0.31
300 0.29